Signaalinkäsittelyn laitos
Tutkimusyksikkö: Laitos
- A1 Alkuperäisartikkeli
- Julkaistu
LDPC FEC Code Extension for Unequal Error Protection in DVB-T2 System: Design and Evaluation
Kondrad, L., Bouazizi, I. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : International Journal of Digital Multimedia Broadcasting. 2012, s. 1-11 11 Sivumäärä, 834924.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Effects of Mg2+ on in vivo transcriptional dynamics of the lar promoter
Kandhavelu, M., Lihavainen, E., Muthukrishnan, A., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A., 2012, julkaisussa : Biosystems. 107, 3, s. 129-134Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Dynamics of transcription driven by the tetA promoter, one event at a time, in live Escherichia coli cells
Muthukrishnan, A., Kandhavelu, M., Lloyd-Price, J., Kudasov, F., Chowdhury, S., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 40, 17, s. 8472-8483Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Phase retrieval via spatial light modulator phase modulation in 4f optical setup: Numerical inverse imaging with sparse regularization for phase and amplitude
Katkovnik, V. & Astola, J., 2012, julkaisussa : Journal of the Optical Society of America A: Optics Image Science and Vision. 29, 1, s. 105-116 12 SivumääräTutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Stagewise K-SVD to Design Efficient Dictionaries for Sparse Representations
Rusu, C. & Dumitrescu, B., 2012, julkaisussa : IEEE Signal Processing Letters. 19, 10, s. 631-634Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Probabilistic RNA partitioning generates transient increases in the normalized variance of RNA numbers in synchronized populations of Escherichia coli
Lloyd-Price, J., Lehtivaara, M., Kandhavelu, M., Chowdhury, S., Muthukrishnan, A-B., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Molecular Biosystems. 8, s. 565-571Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
"Quorum sensing" generated multistability and chaos in a synthetic genetic oscillator
Potapov, I., Zhurov, B. & Volkov, E., 2012, julkaisussa : Chaos. 22, 2, 023117.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Voice Conversion Using Dynamic Kernel Partial Least Squares Regression
Helander, E., Silen, H., Virtanen, T. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : IEEE Transactions on Audio Speech and Language Processing. 20, 3, s. 806-817Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Rate adaptation for dynamic adaptive streaming over HTTP in content distribution network
Liu, C., Bouazizi, I., Hannuksela, M. M. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : Signal Processing: Image Communication. 27, 4, s. 288-311Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Both Inhibition and Enhanced Expression of miR-31 Lead to Reduced Migration and Invasion of Pancreatic Cancer Cells
Laurila, E., Sandström, S., Rantanen, L., Autio, R. & Kallioniemi, A., 2012, julkaisussa : Genes Chromosomes and Cancer. 51, 6, s. 557-568Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Collective Network of Binary Classifier Framework for Polarimetric SAR Image Classification: An Evolutionary Approach
Kiranyaz, S., Ince, T., Uhlmann, S. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics, Part B: Cybernetics. 42, 4, s. 1169-1186Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Implementation of Dyadic Convolution Operators on Graphic Processors
Gajic, D. B., Stankovic, R. & Radmanovic, M., 2012, julkaisussa : International Journal of Reasoning-Based Intelligent Systems. 4, 1/2, s. 82-90Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
An integrative computational systems biology approach identifies differentially regulated dynamic transcriptome signatures which drive the initiation of human T helper cell differentiation
Äijö, T., Edelman, S., Lönnberg, T., Larjo, A., Kallionpää, H., Tuomela, S., Engström, E., Lahesmaa, R. & Lähdesmäki, H., 2012, julkaisussa : BMC Genomics. 13, 572.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Androgen-regulated miR-32 targets BTG2 and is overexpressed in castration-resistant prostate cancer
Jalava, S., Urbanucci, A., Latonen, L., Waltering, K., Sahu, B., Jänne, O., Seppälä, J., Lähdesmäki, H., Tammela, T. & Visakorpi, T., 2012, julkaisussa : Oncogene. 31, 41, s. 4460-4471Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Mytoe: Automatic analysis of mitochondrial dynamics
Lihavainen, E., Mäkelä, J., Spelbrink, J. N. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 7, s. 1050-1051Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Multimodal Extraction of Events and Information about the Recording Activity in User Generated Videos
Cricri, F., Dabov, K., Curcio, I. D. D., Mate, S. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : Multimedia Tools and Applications.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Effects of Codon Sequence on the Dynamics of Genetic Networks
Potapov, I., Mäkelä, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Journal of Theoretical Biology. 315, s. 17-25Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Iterative reweighted l(1) design of sparse FIR filters
Rusu, C. & Dumitrescu, B., 2012, julkaisussa : Signal Processing. 92, 4, s. 905-911Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
pre-piRNA biogenesis mimics the pathway of miRNA
Kandhavelu, M. & Kandhavelu, J., 2012, julkaisussa : Biochemical Systematics and Ecology. 43, s. 200-204 5 SivumääräTutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
The Impact of Sampling Density Upon Cortical Network Analysis: Regions or Points
Tohka, J., He, Y. & Evans, A. C., 2012, julkaisussa : Magnetic Resonance Imaging. 30, 7, s. 978-992Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Dynamics of Transcription of Closely Spaced Promoters in Escherichia coli, One Event at a Time
Martins, L., Mäkelä, J., Häkkinen, A., Kandhavelu, M., Yli-Harja, O., Fonseca, J. & Ribeiro, A., 2012, julkaisussa : Journal of Theoretical Biology. 301, s. 83-94Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Variable Selection by sNML Criterion in Logistic Regression with an Application to a Risk-Adjustment Model for Hip Fracture Mortality
Liski, A., Tabus, I., Sund, R. & Häkkinen, U., 2012, julkaisussa : Journal of Data Science. 10, 2, s. 321-343Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
ATF3 protects against atherosclerosis by suppressing 25-hydroxycholesterol-induced lipid body formation
Gold, E. S., Ramsey, S. A., Sartain, M. J., Selinummi, J., Podolsky, I., Rodriguez, D. J., Moritz, R. L. & Aderem, A., 2012, julkaisussa : Journal of Experimental Medicine. 209, 4, s. 807-817Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Inverse polynomial reconstruction method in DCT domain
Dadkhahi, H., Gotchev, A. & Egiazarian, K., 2012, julkaisussa : Eurasip Journal on Advances in Signal Processing. 133Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Sensor module for hydraulic boom state feedback control
Honkakorpi, J., Vihonen, J. & Mattila, J., 2012, julkaisussa : International Journal of Fluid Power. 13, 3, s. 15-23Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Multiview depth coding based on combined color/depth segmentation
Ruiz-Hidalgo, J., Morros, J. R., Aflaki, P., Calderero, F. & Marques, F., 2012, julkaisussa : Journal of Visual Communication and Image Representation. 23, 1, s. 42-52Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Identification of early gene expression changes during human Th17 cell differentiation
Tuomela, S., Salo, V., Tripathi, S. K., Chen, Z., Laurila, K., Gupta, B., Äijö, T., Oikari, L., Stockinger, B., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 2012, julkaisussa : Blood. 119, 23, s. E151-E160Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Multimodal Semantics Extraction from User-Generated Videos
Cricri, F., Dabov, K., Roininen, M., Mate, S., Curcio, I. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : Advances in Multimedia. 2012, s. 1-17 17 Sivumäärä, 292064.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Methods for depth-map filtering in view-plus-depth 3D video representation
Smirnov, S., Gotchev, A. & Egiazarian, K., 2012, julkaisussa : Eurasip Journal on Advances in Signal Processing. 25, s. 1-21 21 SivumääräTutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Greedy Sparse RLS
Dumitrescu, B., Onose, A., Helin, P. & Tabus, I., 2012, julkaisussa : IEEE Transactions on Signal Processing. 60, 5, s. 2194-2207Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
SGNS2 : a compartmentalized stochastic chemical kinetics simulator for dynamic cell populations
Lloyd-Price, J., Gupta, A. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 22, s. 3004-3005Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Asymmetric Disposal of Individual Protein Aggregates in Escherichia coli, One Aggregate at a Time
Lloyd-Price, J., Häkkinen, A., Kandhavelu, M., Marques, I. J., Chowdhury, S., Lihavainen, E., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Journal of Bacteriology. 197, 7, s. 1747-1752Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Design of multiple-valued logic networks with regular structure by using spectral representations
Stankovic, R., Astola, J. & Moraga, C., 2012, julkaisussa : Journal of Multiple-Valued Logic and Soft Computing. 19, 1-3, s. 251-269Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Single-molecule dynamics of transcription of the lar promoter
Kandhavelu, M., Häkkinen, A., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A., 2012, julkaisussa : Physical Biology. 9, 2, s. 1-7 7 Sivumäärä, 026004.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Evolutionary RBF classifier for polarimetric SAR images
Ince, T., Kiranyaz, S. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : Expert Systems with Applications. 39, 5, s. 4710-4717Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
High-accuracy wave field reconstruction: Decoupled inverse imaging with sparse modeling of phase and amplitude
Katkovnik, V. & Astola, J., 2012, julkaisussa : Journal of the Optical Society of America A: Optics Image Science and Vision. 29, 1, s. 44-54Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Chemical castration and anti-androgens induce differential gene expression in prostate cancer
Lehmusvaara, S., Erkkilä, T., Urbanucci, A., Waltering, K., Seppälä, J., Larjo, A., Tuominen, V., Isola, J., Kujala, P., Lähdesmäki, H., Kaipia, A., Tammela, T. & Visakorpi, T., 2012, julkaisussa : Journal of Pathology. 227, 3, s. 336-345Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Audio-video synchronous coding based on motion estimation in H.264
Li, X., Chen, H., Chen, M. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : Jilin Daxue Xuebao. 42, 5, s. 1321-1326Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Comprehensive molecular portraits of human breast tumours
Koboldt, D. C., Fulton, R. S., McLellan, M. D., Schmidt, H., Kalicki-Veizer, J., McMichael, J. F., Fulton, L. L., Dooling, D. J., Ding, L., Mardis, E. R., Wilson, R. K., Ally, A., Balasundaram, M., Butterfield, Y. S. N., Carlsen, R., Carter, C., Chu, A., Chuah, E., Chun, H-J. E. & Erkkilä, T., 2012, julkaisussa : Nature. 490, 7418, s. 61-70Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Inter-Subject Correlation in fMRI: Method Validation against Stimulus-Model Based Analysis
Pajula, J., Kauppi, J-P. & Tohka, J., 2012, julkaisussa : PLoS ONE. 7, 8, s. 1-22 22 Sivumäärä, e41196.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
BM3D Frames and Variational Image Deblurring
Danielyan, A., Katkovnik, V. & Egiazarian, K., 2012, julkaisussa : IEEE Transactions on Image Processing. 21, 4, s. 1715-1728Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Multichannel Audio Upmixing by Time-Frequency Filtering Using Non-Negative Tensor Factorization
Nikunen, J., Virtanen, T. & Vilermo, M., 2012, julkaisussa : Journal of the Audio Engineering Society. 60, 10, s. 794-806Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
RNA-Binding Protein L1TD1 Interacts with LIN28 via RNA and is Required for Human Embryonic Stem Cell Self-Renewal and Cancer Cell Proliferation
Närvä, E., Rahkonen, N., Reddy Emani, M., Lund, R., Pursiheimo, J-P., Nästi, J., Autio, R., Rasool, O., Denessiouk, K., Lähdesmäki, H., Rao, A. & Lahesmaa, R., 2012, julkaisussa : Stem Cells. 30, 3, s. 452-460Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Compressive sensing computational ghost imaging
Katkovnik, V. & Astola, J., 2012, julkaisussa : Journal of the Optical Society of America A: Optics Image Science and Vision. 29, 8, s. 1556-1567Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Insulin-like growth factor-binding protein 2-driven glioma progression is prevented by blocking a clinically significant integrin, integrin-linked kinase, and NF-kB network
Holmes, K., Annala, M., Chua, C., Dunlap, S., Liu, Y., Hugen, N., Moore, L., Cogdell, D., Hu, L., Nykter, M., Hess, K., Fuller, G. & Zhang, W., 2012, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109, 9, s. 3475-3480Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Power Consumption Analysis of Constant Bit Rate Video Transmission Over 3G Networks
Ukhanova, A., Belyaev, E., Wang, L. & Forchhammer, S., 2012, julkaisussa : Computer Communications. 35, 14, s. 1695-1706Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Regulation of Mean and Noise of the in Vivo Kinetics of Transcription Under the Control of the lac/ara-1 Promoter
Kandhavelu, M., Lloyd-Price, J., Gupta, A., Muthukrishnan, A-B., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : FEBS Letters. 586, 21, s. 3870-3875Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Stereoscopic Depth Cues Outperform Monocular Ones on Autostereoscopic Display
Mikkola, M., Jumisko-Pyykkö, S., Strohmeier, D., Boev, A. & Gotchev, A., 2012, julkaisussa : IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing. 6, 6, s. 698-709Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Genetic variation may play crucial role in non-coding RNA Biogenesis
Kandhavelu, J. & Kandhavelu, M., 2012, julkaisussa : American Journal of Molecular Biology. 2012, 2, s. 386-389 4 SivumääräTutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Androgen receptor (AR) aberrations in castration-resistant prostate cancer
Waltering, K., Urbanucci, A. & Visakorpi, T., 2012, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 360, 1-2, s. 38-43Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
MED29, a component of the mediator complex, possesses both oncogenic and tumor suppressive characteristics in pancreatic cancer
Kuuselo, R., Savinainen, K., Sandström, S., Autio, R. & Kallioniemi, A., 2011, julkaisussa : International Journal of Cancer. 129, 11, s. 2553-2565Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
A Linear Model for Transcription Factor Binding Affinity Prediction in Protein Binding Microarrays
Annala, M., Laurila, K., Lähdesmäki, H. & Nykter, M., 2011, julkaisussa : PLoS ONE. 6, 5, s. 1-13 13 Sivumäärä, e20059.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Stochastic approximation driven particle swarm optimization with simultaneous perturbation - Who will guide the guide?
Kiranyaz, S., Ince, T. & Gabbouj, M., 2011, julkaisussa : Applied Soft Computing. 11, 2, s. 2334-2347Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Personalized long-term ECG classification: A systematic approach
Kiranyaz, S., Ince, T., Pulkkinen, J. & Gabbouj, M., 2011, julkaisussa : Expert Systems with Applications. 38, 4, s. 3220-3226Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Musical Instrument Sound Multi-Excitation Model for Non-negative Spectrogram Factorization
Carabias-Orti, J. J., Virtanen, T., Vera-Candeas, P., Ruiz-Reyes, N. & Canadas-Quesada, F. J., 2011, julkaisussa : IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing. 5, 6, s. 1144-1158Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Wave Field Reconstruction From Multiple Plane Intensity-Only Data: Augmented Lagrangian Algorithm
Migukin, A., Katkovnik, V. & Astola, J., 2011, julkaisussa : Journal of the Optical Society of America A: Optics Image Science and Vision. 28, 6, s. 993-1001Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Point Pattern Matching for 2-D Point Sets with Regular Structure
Manninen, T., Rönkkä, R. & Huttunen, H., 2011, julkaisussa : Lecture Notes in Computer Science. 6688, s. 156-165Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Modeling Signal Transduction Leading to Synaptic Plasticity: Evaluation and Comparison of Five Models
Manninen, T., Hituri, K., Toivari, E. & Linne, M-L., 2011, julkaisussa : Eurasip Journal on Bioinformatics and Systems Biology. 2011, s. 1-11 11 Sivumäärä, 797250.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
CORDIC instructions for LDPC decoding on SDR platforms
Senthilvelan, M., Yu, M., Iancu, D., Sima, M. & Schulte, M., 2011, julkaisussa : Analog Integrated Circuits and Signal Processing. 69, 2-3, s. 191-206Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Effects of Transmitters and Amyloid-Beta Peptide on Calcium Signals in Rat Cortical Astrocytes: Fura-2AM Measurements and Stochastic Model Simulations
Toivari, E., Manninen, T., Nahata, A. K., Jalonen, T. O. & Linne, M-L., 2011, julkaisussa : PLoS ONE. 6, 3, s. 1-9 9 Sivumäärä, e17914.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Complexity analysis of adaptive binary arithmetic coding software implementations
Belyaev, E., Veselov, A., Turlikov, A. & Liu, K., 2011, julkaisussa : Lecture Notes in Computer Science. 6869, s. 598-607Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Teleconsultation: Changes in technology and costs over a 12-year period
Lamminen, J., Forsvik, H. J., Voipio, V. & Ruohonen, K., 2011, julkaisussa : Journal of Telemedicine and Telecare. 17, 8, s. 412-416Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Multi-dimensional particle swarm optimization in dynamic environments
Kiranyaz, S., Pulkkinen, J. & Gabbouj, M., 2011, julkaisussa : Expert Systems with Applications. 38, 3, s. 2212-2223Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Integrative genomic characterization and a genomic staging system for gastrointestinal stromal tumors
Ylipää, A., Hunt, K. K., Yang, J., Lazar, A. J. F., Torres, K. E., Lev, D. C., Nykter, M., Pollock, R. E., Trent, J. & Zhang, W., 2011, julkaisussa : Cancer. 117, 2, s. 380-389Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Learning of paw preference in mice is strain dependent, gradual and based on short-term memory of previous reaches
Ribeiro, A. S., Eales, B. A. & Biddle, F. G., 2011, julkaisussa : ANIMAL BEHAVIOUR. 81, 1, s. 249-257Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Required levels of catalysis for emergence of autocatalytic sets in models of chemical reaction systems
Hordijk, W., Kauffman, S. A. & Steel, M., 2011, julkaisussa : International Journal of Molecular Sciences. 12, 5, s. 3085-3101Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Dynamic Queries with Relevance Feedback for Content Based Image Retrieval
Birinci, M., Guldogan, E. & Gabbouj, M., 2011, julkaisussa : Lecture Notes in Computer Science. 6761, s. 547-554Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Prediction and Transmission Optimization of Video Guaranteeing a Bounded Zapping-Delay in DVB-H
Vadakital, V. K. M. & Gabbouj, M., 2011, julkaisussa : IEEE Transactions on Broadcasting. 57, 2, s. 231-245Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Uniform Motion Blur in Poissonian Noise: Blur/Noise Tradeoff
Boracchi, G. & Foi, A., 2011, julkaisussa : IEEE Transactions on Image Processing. 20, 2, s. 592-598Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Cell-to-cell diversity in protein levels of a gene driven by a tetracycline inducible promoter
Smolander, O-P., Kandhavelu, M., Mannerström, H., Lihavainen, E., Kalaichelvan, S., Healy, S., Yli-Harja, O., Karp, M. & Ribeiro, A. S., 2011, julkaisussa : BMC Molecular Biology. 12, s. 1-27 27 Sivumäärä, 21.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Stochastic sequence-level model of coupled transcription and translation in prokaryotes
Mäkelä, J., Lloyd-Price, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2011, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 12, s. 1-33 33 Sivumäärä, 121.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Circulating Plasma MiR-141 Is a Novel Biomarker for Metastatic Colon Cancer and Predicts Poor Prognosis
Cheng, H., Zhang, L., Cogdell, D. E., Zheng, H., Schetter, A. J., Nykter, M., Harris, C. C., Chen, K., Hamilton, S. R. & Zhang, W., 2011, julkaisussa : PLoS ONE. 6, 3, s. 1-8 8 Sivumäärä, e17745.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Copy number variation and selection during reprogramming to pluripotency
Hussein, S. M., Batada, N. N., Vuoristo, S., Ching, R. W., Autio, R., Narva, E., Ng, S., Sourour, M., Hämäläinen, R., Olsson, C., Lundin, K., Mikkola, M., Trokovic, R., Peitz, M., Bruestle, O., Bazett-Jones, D. P., Alitalo, K., Lahesmaa, R., Nagy, A. & Otonkoski, T., 2011, julkaisussa : Nature. 471, 7336, s. 58-62Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
A Beta-mixture model for dimensionality reduction, sample classification and analysis
Laurila, K., Osre, B., Andersen, C. L., Lamy, P., Orntoft, T., Yli-Harja, O. & Wiuf, C., 2011, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 12, s. 1-6 6 Sivumäärä, 215.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
In Vivo Kinetics of Transcription initiation of the Lar Promoter in Escherichia coli. Evidence for a Sequential Mechanism with Two Rate-Limiting Steps
Kandhavelu, M., Mannerström, H., Gupta, A., Häkkinen, A., Lloyd-Price, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2011, julkaisussa : BMC Systems Biology. 5, s. 1-9 9 Sivumäärä, 149.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Improved triacylglycerol production in Acinetobacter baylyi ADP1 by metabolic engineering
Santala, S., Efimova, E., Kivinen, V., Larjo, A., Aho, T., Karp, M. & Santala, V., 2011, julkaisussa : Microbial Cell Factories. 10, 36, s. 1-10 10 SivumääräTutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Probing Stochastic Phenotype Switching as a Survival Strategy in Fluctuating Environments
Ribeiro, A. S. & Häkkinen, A., 2011, julkaisussa : International Journal of Computational Intelligence in Control. 3, 1, s. 9-15Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Recursive FIR filter structures on FPGA
Lehto, R., Tauren, T. & Vainio, O., 2011, julkaisussa : Microprocessors and Microsystems. 35, 7, s. 595-602Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Three-Dimensional Media for Mobile Devices
Gotchev, A., Akar, G. B., Capin, T., Strohmeier, D. & Boev, A., 2011, julkaisussa : Proceedings of the IEEE. 99, 4, s. 708-741Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Cancer Systems Biology: Signal Processing for Cancer Research
Yli-Harja, O., Ylipää, A., Nykter, M. & Zhang, W., 2011, julkaisussa : Chinese Journal of Cancer. 30, 4, s. 221-225Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
An Efficient Algorithm for the optimization of FIR Filters Synthesized Using the Multistage Frequency-Response Masking Approach
Yli-Kaakinen, J. & Saramäki, T., 2011, julkaisussa : Circuits, Systems and Signal Processing. 30, 1, s. 157-183Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Implementation of Linear-Phase FIR Filters for a Rational Sampling-Rate Conversion Utilizing the Coefficient Symmetry
Bregovic, R., Yu, Y. J., Saramäki, T. & Lim, Y. C., 2011, julkaisussa : IEEE Transactions on Circuits and Systems. Part 1: Regular Papers. 58, 3, s. 548-561Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
A systems biological approach to identify key transcription factors and their genomic neighborhoods in human sarcomas
Ylipää, A., Yli-Harja, O., Zhang, W. & Nykter, M., 2011, julkaisussa : Chinese Journal of Cancer. 30, 1, s. 27-40Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Computational study of noise in a large signal transduction network
Intosalmi, J., Manninen, T., Ruohonen, K. & Linne, M-L., 2011, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 12, s. 1-8 8 Sivumäärä, 252.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Methodology for design of Antialiasing Filters for Autostereoscopic Displays
Boev, A., Bregovic, R. & Gotchev, A., 2011, julkaisussa : IET Signal Processing. 5, 3, s. 333-343Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Self-Similarity Measure for Assessment of Image Visual Quality
Ponomarenko, N., Jin, L., Lukin, V. & Egiazarian, K., 2011, julkaisussa : Lecture Notes in Computer Science. 6915, s. 459-470Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Lysophosphatidic acid and sphingosine-1-phosphate promote morphogenesis and block invasion of prostate cancer cells in three-dimensional organotypic models
Härmä, V., Knuuttila, M., Virtanen, J., Mirtti, T., Kohonen, P., Kovanen, P., Happonen, A., Kaewphan, S., Ahonen, I., Kallioniemi, O., Grafström, R., Lötjönen, J. & Nees, M., 2011, julkaisussa : Oncogene. 31, s. 2075-2089Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Dynamics of genetic toggle switch at the nucleotide and codon levels
Potapov, I., Lloyd-Price, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2011, julkaisussa : Physical Review E. 84, 3, s. 1-9 9 Sivumäärä, 031903.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Modeling of Neuronal Growth In Vitro: Comparison of Simulation Tools NETMORPH and CX3D
Acimovic, J., Mäki-Marttunen, T., Havela, R., Teppola, H. & Linne, M-L., 2011, julkaisussa : Eurasip Journal on Bioinformatics and Systems Biology. 2011, s. 1-13 13 Sivumäärä, 616382.Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Systems analysis identifies an essential role for SHANK-associated RH domain-interacting protein (SHARPIN) in macrophage Toll-like receptor 2 (TLR2) responses
Zak, D. E., Schmitz, F., Gold, E. S., Diercks, A. H., Peschon, J. J., Valvo, J. S., Niemistö, A., Podolsky, I., Fallen, S. G., Suen, R., Stolyar, T., Johnson, C. D., Kennedy, K. A., Hamilton, M. K., Siggs, O. M., Beutler, B. & Aderem, A., 2011, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108, 28, s. 11536-11541Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Automatic detection of changes in the dynamics of delayed stochastic gene networks and in vivo production of RNA molecules in Escherichia coli
Mäkelä, J., Huttunen, H., Kandhavelu, M., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2011, julkaisussa : Bioinformatics. 27, 19, s. 2714-2720Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Genomic and molecular characterization of malignant peripheral nerve sheath tumor identifies the IGF1R pathway as a primary target for treatment
Yang, J., Ylipää, A., Sun, Y., Zheng, H., Chen, K., Nykter, M., Trent, J., Ratner, N., Lev, D. C. & Zhang, W., 2011, julkaisussa : Clinical Cancer Research. 17, 24, s. 7563-7573Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Diversity of temporal correlations between genes in models of noisy and noiseless gene networks
Ribeiro, A. S., Lloyd-Price, J., Chowdhury, S. & Yli-Harja, O., 2011, julkaisussa : Biosystems. 104, 2-3, s. 136-144Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Analysis of a multi-wavelength multi-camera phase-shifting profilometric system for real-time operation
Stoykova, E., Gotchev, A. & Sainov, V., 2011, julkaisussa : Optics Communications. 284, 1, s. 88-97Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
An Algorithm for the Stochastic Simulation of Gene Expression and Heterogeneous Population Dynamics
Charlebois, D. A., Intosalmi, J., Fraser, D. & Kaern, M., 2011, julkaisussa : Communications in Computational Physics. 9, 1, s. 89-112 24 SivumääräTutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
The miR-15a-miR-16-1 locus is homozygously deleted in a subset of prostate cancers
Porkka, K. P., Oggm, E-L., Saramäki, O. R., Vessella, R. L., Pukkila, H., Lähdesmäki, H., van Weerden, W. M., Wolf, M., Kallioniemi, O. P., Jenster, G. & Visakorpi, T., 2011, julkaisussa : Genes Chromosomes and Cancer. 50, 7, s. 499-509Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Optimal Inversion of the Anscombe Transformation in Low-Count Poisson Image Denoising
Mäkitalo, M. & Foi, A., 2011, julkaisussa : IEEE Transactions on Image Processing. 20, 1, s. 99-109 11 SivumääräTutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
3DTV Broadcasting and Distribution Systems
Hur, N., Lee, H., Lee, G. S., Lee, S. J., Gotchev, A. & Park, S-I., 2011, julkaisussa : IEEE Transactions on Broadcasting. 57, 2, s. 395-407Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Optimal estimation
Rissanen, J., 2011, julkaisussa : Lecture Notes in Computer Science. 6925, s. 37-37Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
- Julkaistu
Performance on the AX-PET Demonstrator
Beltrame, P., Bolle, E., Braem, A., Casella, C., Chesi, E., Clinthorne, N., De Leo, R., Dissetori, G., Djambazov, L., Fanti, V., Joram, C., Kagan, H., Lustermann, W., Meddi, F., Nappi, E., Nessi-Tedaldi, F., Oliver, J. F., Pauss, T., Rafecas, M., Renker, D., Rudge, A., Ruotsalainen, U., Schinzel, D., Schneider, T., Seguinot, J., Solevi, P., Stapnes, S., Tuna, U. & Weilhammer, P., 2011, julkaisussa : Nuclear Physics B. 215, 1, s. 34-36Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
ID: 22336