TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto

TUTCRIS

Signaalinkäsittelyn laitos

Tutkimusyksikkö: Laitos

  1. A1 Alkuperäisartikkeli
  2. Julkaistu

    LDPC FEC Code Extension for Unequal Error Protection in DVB-T2 System: Design and Evaluation

    Kondrad, L., Bouazizi, I. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : International Journal of Digital Multimedia Broadcasting. 2012, s. 1-11 11 Sivumäärä, 834924.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Effects of Mg2+ on in vivo transcriptional dynamics of the lar promoter

    Kandhavelu, M., Lihavainen, E., Muthukrishnan, A., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A., 2012, julkaisussa : Biosystems. 107, 3, s. 129-134

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    Dynamics of transcription driven by the tetA promoter, one event at a time, in live Escherichia coli cells

    Muthukrishnan, A., Kandhavelu, M., Lloyd-Price, J., Kudasov, F., Chowdhury, S., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 40, 17, s. 8472-8483

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  5. Julkaistu

    Phase retrieval via spatial light modulator phase modulation in 4f optical setup: Numerical inverse imaging with sparse regularization for phase and amplitude

    Katkovnik, V. & Astola, J., 2012, julkaisussa : Journal of the Optical Society of America A: Optics Image Science and Vision. 29, 1, s. 105-116 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    Stagewise K-SVD to Design Efficient Dictionaries for Sparse Representations

    Rusu, C. & Dumitrescu, B., 2012, julkaisussa : IEEE Signal Processing Letters. 19, 10, s. 631-634

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    Probabilistic RNA partitioning generates transient increases in the normalized variance of RNA numbers in synchronized populations of Escherichia coli

    Lloyd-Price, J., Lehtivaara, M., Kandhavelu, M., Chowdhury, S., Muthukrishnan, A-B., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Molecular Biosystems. 8, s. 565-571

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  8. Julkaistu

    "Quorum sensing" generated multistability and chaos in a synthetic genetic oscillator

    Potapov, I., Zhurov, B. & Volkov, E., 2012, julkaisussa : Chaos. 22, 2, 023117.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  9. Julkaistu

    Voice Conversion Using Dynamic Kernel Partial Least Squares Regression

    Helander, E., Silen, H., Virtanen, T. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : IEEE Transactions on Audio Speech and Language Processing. 20, 3, s. 806-817

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  10. Julkaistu

    Rate adaptation for dynamic adaptive streaming over HTTP in content distribution network

    Liu, C., Bouazizi, I., Hannuksela, M. M. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : Signal Processing: Image Communication. 27, 4, s. 288-311

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  11. Julkaistu

    Both Inhibition and Enhanced Expression of miR-31 Lead to Reduced Migration and Invasion of Pancreatic Cancer Cells

    Laurila, E., Sandström, S., Rantanen, L., Autio, R. & Kallioniemi, A., 2012, julkaisussa : Genes Chromosomes and Cancer. 51, 6, s. 557-568

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    Collective Network of Binary Classifier Framework for Polarimetric SAR Image Classification: An Evolutionary Approach

    Kiranyaz, S., Ince, T., Uhlmann, S. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics, Part B: Cybernetics. 42, 4, s. 1169-1186

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  13. Julkaistu

    Implementation of Dyadic Convolution Operators on Graphic Processors

    Gajic, D. B., Stankovic, R. & Radmanovic, M., 2012, julkaisussa : International Journal of Reasoning-Based Intelligent Systems. 4, 1/2, s. 82-90

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  14. Julkaistu

    An integrative computational systems biology approach identifies differentially regulated dynamic transcriptome signatures which drive the initiation of human T helper cell differentiation

    Äijö, T., Edelman, S., Lönnberg, T., Larjo, A., Kallionpää, H., Tuomela, S., Engström, E., Lahesmaa, R. & Lähdesmäki, H., 2012, julkaisussa : BMC Genomics. 13, 572.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    Androgen-regulated miR-32 targets BTG2 and is overexpressed in castration-resistant prostate cancer

    Jalava, S., Urbanucci, A., Latonen, L., Waltering, K., Sahu, B., Jänne, O., Seppälä, J., Lähdesmäki, H., Tammela, T. & Visakorpi, T., 2012, julkaisussa : Oncogene. 31, 41, s. 4460-4471

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  16. Julkaistu

    Mytoe: Automatic analysis of mitochondrial dynamics

    Lihavainen, E., Mäkelä, J., Spelbrink, J. N. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 7, s. 1050-1051

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Multimodal Extraction of Events and Information about the Recording Activity in User Generated Videos

    Cricri, F., Dabov, K., Curcio, I. D. D., Mate, S. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : Multimedia Tools and Applications.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  18. Julkaistu

    Effects of Codon Sequence on the Dynamics of Genetic Networks

    Potapov, I., Mäkelä, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Journal of Theoretical Biology. 315, s. 17-25

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  19. Julkaistu

    Iterative reweighted l(1) design of sparse FIR filters

    Rusu, C. & Dumitrescu, B., 2012, julkaisussa : Signal Processing. 92, 4, s. 905-911

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  20. Julkaistu

    pre-piRNA biogenesis mimics the pathway of miRNA

    Kandhavelu, M. & Kandhavelu, J., 2012, julkaisussa : Biochemical Systematics and Ecology. 43, s. 200-204 5 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  21. Julkaistu

    The Impact of Sampling Density Upon Cortical Network Analysis: Regions or Points

    Tohka, J., He, Y. & Evans, A. C., 2012, julkaisussa : Magnetic Resonance Imaging. 30, 7, s. 978-992

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    Dynamics of Transcription of Closely Spaced Promoters in Escherichia coli, One Event at a Time

    Martins, L., Mäkelä, J., Häkkinen, A., Kandhavelu, M., Yli-Harja, O., Fonseca, J. & Ribeiro, A., 2012, julkaisussa : Journal of Theoretical Biology. 301, s. 83-94

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    Variable Selection by sNML Criterion in Logistic Regression with an Application to a Risk-Adjustment Model for Hip Fracture Mortality

    Liski, A., Tabus, I., Sund, R. & Häkkinen, U., 2012, julkaisussa : Journal of Data Science. 10, 2, s. 321-343

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    ATF3 protects against atherosclerosis by suppressing 25-hydroxycholesterol-induced lipid body formation

    Gold, E. S., Ramsey, S. A., Sartain, M. J., Selinummi, J., Podolsky, I., Rodriguez, D. J., Moritz, R. L. & Aderem, A., 2012, julkaisussa : Journal of Experimental Medicine. 209, 4, s. 807-817

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  25. Julkaistu

    Inverse polynomial reconstruction method in DCT domain

    Dadkhahi, H., Gotchev, A. & Egiazarian, K., 2012, julkaisussa : Eurasip Journal on Advances in Signal Processing. 133

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  26. Julkaistu

    Sensor module for hydraulic boom state feedback control

    Honkakorpi, J., Vihonen, J. & Mattila, J., 2012, julkaisussa : International Journal of Fluid Power. 13, 3, s. 15-23

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    Multiview depth coding based on combined color/depth segmentation

    Ruiz-Hidalgo, J., Morros, J. R., Aflaki, P., Calderero, F. & Marques, F., 2012, julkaisussa : Journal of Visual Communication and Image Representation. 23, 1, s. 42-52

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    Identification of early gene expression changes during human Th17 cell differentiation

    Tuomela, S., Salo, V., Tripathi, S. K., Chen, Z., Laurila, K., Gupta, B., Äijö, T., Oikari, L., Stockinger, B., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 2012, julkaisussa : Blood. 119, 23, s. E151-E160

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Multimodal Semantics Extraction from User-Generated Videos

    Cricri, F., Dabov, K., Roininen, M., Mate, S., Curcio, I. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : Advances in Multimedia. 2012, s. 1-17 17 Sivumäärä, 292064.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Methods for depth-map filtering in view-plus-depth 3D video representation

    Smirnov, S., Gotchev, A. & Egiazarian, K., 2012, julkaisussa : Eurasip Journal on Advances in Signal Processing. 25, s. 1-21 21 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    Greedy Sparse RLS

    Dumitrescu, B., Onose, A., Helin, P. & Tabus, I., 2012, julkaisussa : IEEE Transactions on Signal Processing. 60, 5, s. 2194-2207

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  32. Julkaistu

    SGNS2 : a compartmentalized stochastic chemical kinetics simulator for dynamic cell populations

    Lloyd-Price, J., Gupta, A. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 22, s. 3004-3005

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    Asymmetric Disposal of Individual Protein Aggregates in Escherichia coli, One Aggregate at a Time

    Lloyd-Price, J., Häkkinen, A., Kandhavelu, M., Marques, I. J., Chowdhury, S., Lihavainen, E., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : Journal of Bacteriology. 197, 7, s. 1747-1752

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  34. Julkaistu

    Design of multiple-valued logic networks with regular structure by using spectral representations

    Stankovic, R., Astola, J. & Moraga, C., 2012, julkaisussa : Journal of Multiple-Valued Logic and Soft Computing. 19, 1-3, s. 251-269

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  35. Julkaistu

    Single-molecule dynamics of transcription of the lar promoter

    Kandhavelu, M., Häkkinen, A., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A., 2012, julkaisussa : Physical Biology. 9, 2, s. 1-7 7 Sivumäärä, 026004.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    Evolutionary RBF classifier for polarimetric SAR images

    Ince, T., Kiranyaz, S. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : Expert Systems with Applications. 39, 5, s. 4710-4717

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    High-accuracy wave field reconstruction: Decoupled inverse imaging with sparse modeling of phase and amplitude

    Katkovnik, V. & Astola, J., 2012, julkaisussa : Journal of the Optical Society of America A: Optics Image Science and Vision. 29, 1, s. 44-54

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  38. Julkaistu

    Chemical castration and anti-androgens induce differential gene expression in prostate cancer

    Lehmusvaara, S., Erkkilä, T., Urbanucci, A., Waltering, K., Seppälä, J., Larjo, A., Tuominen, V., Isola, J., Kujala, P., Lähdesmäki, H., Kaipia, A., Tammela, T. & Visakorpi, T., 2012, julkaisussa : Journal of Pathology. 227, 3, s. 336-345

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  39. Julkaistu

    Audio-video synchronous coding based on motion estimation in H.264

    Li, X., Chen, H., Chen, M. & Gabbouj, M., 2012, julkaisussa : Jilin Daxue Xuebao. 42, 5, s. 1321-1326

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  40. Julkaistu

    Comprehensive molecular portraits of human breast tumours

    Koboldt, D. C., Fulton, R. S., McLellan, M. D., Schmidt, H., Kalicki-Veizer, J., McMichael, J. F., Fulton, L. L., Dooling, D. J., Ding, L., Mardis, E. R., Wilson, R. K., Ally, A., Balasundaram, M., Butterfield, Y. S. N., Carlsen, R., Carter, C., Chu, A., Chuah, E., Chun, H-J. E. & Erkkilä, T., 2012, julkaisussa : Nature. 490, 7418, s. 61-70

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  41. Julkaistu

    Inter-Subject Correlation in fMRI: Method Validation against Stimulus-Model Based Analysis

    Pajula, J., Kauppi, J-P. & Tohka, J., 2012, julkaisussa : PLoS ONE. 7, 8, s. 1-22 22 Sivumäärä, e41196.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    BM3D Frames and Variational Image Deblurring

    Danielyan, A., Katkovnik, V. & Egiazarian, K., 2012, julkaisussa : IEEE Transactions on Image Processing. 21, 4, s. 1715-1728

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  43. Julkaistu

    Multichannel Audio Upmixing by Time-Frequency Filtering Using Non-Negative Tensor Factorization

    Nikunen, J., Virtanen, T. & Vilermo, M., 2012, julkaisussa : Journal of the Audio Engineering Society. 60, 10, s. 794-806

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    RNA-Binding Protein L1TD1 Interacts with LIN28 via RNA and is Required for Human Embryonic Stem Cell Self-Renewal and Cancer Cell Proliferation

    Närvä, E., Rahkonen, N., Reddy Emani, M., Lund, R., Pursiheimo, J-P., Nästi, J., Autio, R., Rasool, O., Denessiouk, K., Lähdesmäki, H., Rao, A. & Lahesmaa, R., 2012, julkaisussa : Stem Cells. 30, 3, s. 452-460

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Compressive sensing computational ghost imaging

    Katkovnik, V. & Astola, J., 2012, julkaisussa : Journal of the Optical Society of America A: Optics Image Science and Vision. 29, 8, s. 1556-1567

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    Insulin-like growth factor-binding protein 2-driven glioma progression is prevented by blocking a clinically significant integrin, integrin-linked kinase, and NF-kB network

    Holmes, K., Annala, M., Chua, C., Dunlap, S., Liu, Y., Hugen, N., Moore, L., Cogdell, D., Hu, L., Nykter, M., Hess, K., Fuller, G. & Zhang, W., 2012, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109, 9, s. 3475-3480

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  47. Julkaistu

    Power Consumption Analysis of Constant Bit Rate Video Transmission Over 3G Networks

    Ukhanova, A., Belyaev, E., Wang, L. & Forchhammer, S., 2012, julkaisussa : Computer Communications. 35, 14, s. 1695-1706

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  48. Julkaistu

    Regulation of Mean and Noise of the in Vivo Kinetics of Transcription Under the Control of the lac/ara-1 Promoter

    Kandhavelu, M., Lloyd-Price, J., Gupta, A., Muthukrishnan, A-B., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa : FEBS Letters. 586, 21, s. 3870-3875

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  49. Julkaistu

    Stereoscopic Depth Cues Outperform Monocular Ones on Autostereoscopic Display

    Mikkola, M., Jumisko-Pyykkö, S., Strohmeier, D., Boev, A. & Gotchev, A., 2012, julkaisussa : IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing. 6, 6, s. 698-709

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  50. Julkaistu

    Genetic variation may play crucial role in non-coding RNA Biogenesis

    Kandhavelu, J. & Kandhavelu, M., 2012, julkaisussa : American Journal of Molecular Biology. 2012, 2, s. 386-389 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  51. Julkaistu

    Androgen receptor (AR) aberrations in castration-resistant prostate cancer

    Waltering, K., Urbanucci, A. & Visakorpi, T., 2012, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 360, 1-2, s. 38-43

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  52. Julkaistu

    MED29, a component of the mediator complex, possesses both oncogenic and tumor suppressive characteristics in pancreatic cancer

    Kuuselo, R., Savinainen, K., Sandström, S., Autio, R. & Kallioniemi, A., 2011, julkaisussa : International Journal of Cancer. 129, 11, s. 2553-2565

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  53. Julkaistu

    A Linear Model for Transcription Factor Binding Affinity Prediction in Protein Binding Microarrays

    Annala, M., Laurila, K., Lähdesmäki, H. & Nykter, M., 2011, julkaisussa : PLoS ONE. 6, 5, s. 1-13 13 Sivumäärä, e20059.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  54. Julkaistu

    Stochastic approximation driven particle swarm optimization with simultaneous perturbation - Who will guide the guide?

    Kiranyaz, S., Ince, T. & Gabbouj, M., 2011, julkaisussa : Applied Soft Computing. 11, 2, s. 2334-2347

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  55. Julkaistu

    Personalized long-term ECG classification: A systematic approach

    Kiranyaz, S., Ince, T., Pulkkinen, J. & Gabbouj, M., 2011, julkaisussa : Expert Systems with Applications. 38, 4, s. 3220-3226

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  56. Julkaistu

    Musical Instrument Sound Multi-Excitation Model for Non-negative Spectrogram Factorization

    Carabias-Orti, J. J., Virtanen, T., Vera-Candeas, P., Ruiz-Reyes, N. & Canadas-Quesada, F. J., 2011, julkaisussa : IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing. 5, 6, s. 1144-1158

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  57. Julkaistu

    Wave Field Reconstruction From Multiple Plane Intensity-Only Data: Augmented Lagrangian Algorithm

    Migukin, A., Katkovnik, V. & Astola, J., 2011, julkaisussa : Journal of the Optical Society of America A: Optics Image Science and Vision. 28, 6, s. 993-1001

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  58. Julkaistu

    Point Pattern Matching for 2-D Point Sets with Regular Structure

    Manninen, T., Rönkkä, R. & Huttunen, H., 2011, julkaisussa : Lecture Notes in Computer Science. 6688, s. 156-165

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  59. Julkaistu

    Modeling Signal Transduction Leading to Synaptic Plasticity: Evaluation and Comparison of Five Models

    Manninen, T., Hituri, K., Toivari, E. & Linne, M-L., 2011, julkaisussa : Eurasip Journal on Bioinformatics and Systems Biology. 2011, s. 1-11 11 Sivumäärä, 797250.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  60. Julkaistu

    CORDIC instructions for LDPC decoding on SDR platforms

    Senthilvelan, M., Yu, M., Iancu, D., Sima, M. & Schulte, M., 2011, julkaisussa : Analog Integrated Circuits and Signal Processing. 69, 2-3, s. 191-206

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  61. Julkaistu

    Effects of Transmitters and Amyloid-Beta Peptide on Calcium Signals in Rat Cortical Astrocytes: Fura-2AM Measurements and Stochastic Model Simulations

    Toivari, E., Manninen, T., Nahata, A. K., Jalonen, T. O. & Linne, M-L., 2011, julkaisussa : PLoS ONE. 6, 3, s. 1-9 9 Sivumäärä, e17914.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  62. Julkaistu

    Complexity analysis of adaptive binary arithmetic coding software implementations

    Belyaev, E., Veselov, A., Turlikov, A. & Liu, K., 2011, julkaisussa : Lecture Notes in Computer Science. 6869, s. 598-607

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  63. Julkaistu

    Teleconsultation: Changes in technology and costs over a 12-year period

    Lamminen, J., Forsvik, H. J., Voipio, V. & Ruohonen, K., 2011, julkaisussa : Journal of Telemedicine and Telecare. 17, 8, s. 412-416

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  64. Julkaistu

    Multi-dimensional particle swarm optimization in dynamic environments

    Kiranyaz, S., Pulkkinen, J. & Gabbouj, M., 2011, julkaisussa : Expert Systems with Applications. 38, 3, s. 2212-2223

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  65. Julkaistu

    Integrative genomic characterization and a genomic staging system for gastrointestinal stromal tumors

    Ylipää, A., Hunt, K. K., Yang, J., Lazar, A. J. F., Torres, K. E., Lev, D. C., Nykter, M., Pollock, R. E., Trent, J. & Zhang, W., 2011, julkaisussa : Cancer. 117, 2, s. 380-389

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  66. Julkaistu

    Learning of paw preference in mice is strain dependent, gradual and based on short-term memory of previous reaches

    Ribeiro, A. S., Eales, B. A. & Biddle, F. G., 2011, julkaisussa : ANIMAL BEHAVIOUR. 81, 1, s. 249-257

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  67. Julkaistu

    Required levels of catalysis for emergence of autocatalytic sets in models of chemical reaction systems

    Hordijk, W., Kauffman, S. A. & Steel, M., 2011, julkaisussa : International Journal of Molecular Sciences. 12, 5, s. 3085-3101

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  68. Julkaistu

    Dynamic Queries with Relevance Feedback for Content Based Image Retrieval

    Birinci, M., Guldogan, E. & Gabbouj, M., 2011, julkaisussa : Lecture Notes in Computer Science. 6761, s. 547-554

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  69. Julkaistu

    Prediction and Transmission Optimization of Video Guaranteeing a Bounded Zapping-Delay in DVB-H

    Vadakital, V. K. M. & Gabbouj, M., 2011, julkaisussa : IEEE Transactions on Broadcasting. 57, 2, s. 231-245

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  70. Julkaistu

    Uniform Motion Blur in Poissonian Noise: Blur/Noise Tradeoff

    Boracchi, G. & Foi, A., 2011, julkaisussa : IEEE Transactions on Image Processing. 20, 2, s. 592-598

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  71. Julkaistu

    Cell-to-cell diversity in protein levels of a gene driven by a tetracycline inducible promoter

    Smolander, O-P., Kandhavelu, M., Mannerström, H., Lihavainen, E., Kalaichelvan, S., Healy, S., Yli-Harja, O., Karp, M. & Ribeiro, A. S., 2011, julkaisussa : BMC Molecular Biology. 12, s. 1-27 27 Sivumäärä, 21.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  72. Julkaistu

    Stochastic sequence-level model of coupled transcription and translation in prokaryotes

    Mäkelä, J., Lloyd-Price, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2011, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 12, s. 1-33 33 Sivumäärä, 121.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  73. Julkaistu

    Circulating Plasma MiR-141 Is a Novel Biomarker for Metastatic Colon Cancer and Predicts Poor Prognosis

    Cheng, H., Zhang, L., Cogdell, D. E., Zheng, H., Schetter, A. J., Nykter, M., Harris, C. C., Chen, K., Hamilton, S. R. & Zhang, W., 2011, julkaisussa : PLoS ONE. 6, 3, s. 1-8 8 Sivumäärä, e17745.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  74. Julkaistu

    Copy number variation and selection during reprogramming to pluripotency

    Hussein, S. M., Batada, N. N., Vuoristo, S., Ching, R. W., Autio, R., Narva, E., Ng, S., Sourour, M., Hämäläinen, R., Olsson, C., Lundin, K., Mikkola, M., Trokovic, R., Peitz, M., Bruestle, O., Bazett-Jones, D. P., Alitalo, K., Lahesmaa, R., Nagy, A. & Otonkoski, T., 2011, julkaisussa : Nature. 471, 7336, s. 58-62

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  75. Julkaistu

    A Beta-mixture model for dimensionality reduction, sample classification and analysis

    Laurila, K., Osre, B., Andersen, C. L., Lamy, P., Orntoft, T., Yli-Harja, O. & Wiuf, C., 2011, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 12, s. 1-6 6 Sivumäärä, 215.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  76. Julkaistu

    In Vivo Kinetics of Transcription initiation of the Lar Promoter in Escherichia coli. Evidence for a Sequential Mechanism with Two Rate-Limiting Steps

    Kandhavelu, M., Mannerström, H., Gupta, A., Häkkinen, A., Lloyd-Price, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2011, julkaisussa : BMC Systems Biology. 5, s. 1-9 9 Sivumäärä, 149.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  77. Julkaistu

    Improved triacylglycerol production in Acinetobacter baylyi ADP1 by metabolic engineering

    Santala, S., Efimova, E., Kivinen, V., Larjo, A., Aho, T., Karp, M. & Santala, V., 2011, julkaisussa : Microbial Cell Factories. 10, 36, s. 1-10 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  78. Julkaistu

    Probing Stochastic Phenotype Switching as a Survival Strategy in Fluctuating Environments

    Ribeiro, A. S. & Häkkinen, A., 2011, julkaisussa : International Journal of Computational Intelligence in Control. 3, 1, s. 9-15

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  79. Julkaistu

    Recursive FIR filter structures on FPGA

    Lehto, R., Tauren, T. & Vainio, O., 2011, julkaisussa : Microprocessors and Microsystems. 35, 7, s. 595-602

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  80. Julkaistu

    Three-Dimensional Media for Mobile Devices

    Gotchev, A., Akar, G. B., Capin, T., Strohmeier, D. & Boev, A., 2011, julkaisussa : Proceedings of the IEEE. 99, 4, s. 708-741

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  81. Julkaistu

    Cancer Systems Biology: Signal Processing for Cancer Research

    Yli-Harja, O., Ylipää, A., Nykter, M. & Zhang, W., 2011, julkaisussa : Chinese Journal of Cancer. 30, 4, s. 221-225

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  82. Julkaistu

    An Efficient Algorithm for the optimization of FIR Filters Synthesized Using the Multistage Frequency-Response Masking Approach

    Yli-Kaakinen, J. & Saramäki, T., 2011, julkaisussa : Circuits, Systems and Signal Processing. 30, 1, s. 157-183

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  83. Julkaistu

    Implementation of Linear-Phase FIR Filters for a Rational Sampling-Rate Conversion Utilizing the Coefficient Symmetry

    Bregovic, R., Yu, Y. J., Saramäki, T. & Lim, Y. C., 2011, julkaisussa : IEEE Transactions on Circuits and Systems. Part 1: Regular Papers. 58, 3, s. 548-561

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  84. Julkaistu

    A systems biological approach to identify key transcription factors and their genomic neighborhoods in human sarcomas

    Ylipää, A., Yli-Harja, O., Zhang, W. & Nykter, M., 2011, julkaisussa : Chinese Journal of Cancer. 30, 1, s. 27-40

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  85. Julkaistu

    Computational study of noise in a large signal transduction network

    Intosalmi, J., Manninen, T., Ruohonen, K. & Linne, M-L., 2011, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 12, s. 1-8 8 Sivumäärä, 252.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  86. Julkaistu

    Methodology for design of Antialiasing Filters for Autostereoscopic Displays

    Boev, A., Bregovic, R. & Gotchev, A., 2011, julkaisussa : IET Signal Processing. 5, 3, s. 333-343

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  87. Julkaistu

    Self-Similarity Measure for Assessment of Image Visual Quality

    Ponomarenko, N., Jin, L., Lukin, V. & Egiazarian, K., 2011, julkaisussa : Lecture Notes in Computer Science. 6915, s. 459-470

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  88. Julkaistu

    Lysophosphatidic acid and sphingosine-1-phosphate promote morphogenesis and block invasion of prostate cancer cells in three-dimensional organotypic models

    Härmä, V., Knuuttila, M., Virtanen, J., Mirtti, T., Kohonen, P., Kovanen, P., Happonen, A., Kaewphan, S., Ahonen, I., Kallioniemi, O., Grafström, R., Lötjönen, J. & Nees, M., 2011, julkaisussa : Oncogene. 31, s. 2075-2089

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  89. Julkaistu

    Dynamics of genetic toggle switch at the nucleotide and codon levels

    Potapov, I., Lloyd-Price, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2011, julkaisussa : Physical Review E. 84, 3, s. 1-9 9 Sivumäärä, 031903.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  90. Julkaistu

    Modeling of Neuronal Growth In Vitro: Comparison of Simulation Tools NETMORPH and CX3D

    Acimovic, J., Mäki-Marttunen, T., Havela, R., Teppola, H. & Linne, M-L., 2011, julkaisussa : Eurasip Journal on Bioinformatics and Systems Biology. 2011, s. 1-13 13 Sivumäärä, 616382.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  91. Julkaistu

    Systems analysis identifies an essential role for SHANK-associated RH domain-interacting protein (SHARPIN) in macrophage Toll-like receptor 2 (TLR2) responses

    Zak, D. E., Schmitz, F., Gold, E. S., Diercks, A. H., Peschon, J. J., Valvo, J. S., Niemistö, A., Podolsky, I., Fallen, S. G., Suen, R., Stolyar, T., Johnson, C. D., Kennedy, K. A., Hamilton, M. K., Siggs, O. M., Beutler, B. & Aderem, A., 2011, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108, 28, s. 11536-11541

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  92. Julkaistu
  93. Julkaistu

    Genomic and molecular characterization of malignant peripheral nerve sheath tumor identifies the IGF1R pathway as a primary target for treatment

    Yang, J., Ylipää, A., Sun, Y., Zheng, H., Chen, K., Nykter, M., Trent, J., Ratner, N., Lev, D. C. & Zhang, W., 2011, julkaisussa : Clinical Cancer Research. 17, 24, s. 7563-7573

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  94. Julkaistu

    Diversity of temporal correlations between genes in models of noisy and noiseless gene networks

    Ribeiro, A. S., Lloyd-Price, J., Chowdhury, S. & Yli-Harja, O., 2011, julkaisussa : Biosystems. 104, 2-3, s. 136-144

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  95. Julkaistu

    Analysis of a multi-wavelength multi-camera phase-shifting profilometric system for real-time operation

    Stoykova, E., Gotchev, A. & Sainov, V., 2011, julkaisussa : Optics Communications. 284, 1, s. 88-97

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  96. Julkaistu

    An Algorithm for the Stochastic Simulation of Gene Expression and Heterogeneous Population Dynamics

    Charlebois, D. A., Intosalmi, J., Fraser, D. & Kaern, M., 2011, julkaisussa : Communications in Computational Physics. 9, 1, s. 89-112 24 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  97. Julkaistu

    The miR-15a-miR-16-1 locus is homozygously deleted in a subset of prostate cancers

    Porkka, K. P., Oggm, E-L., Saramäki, O. R., Vessella, R. L., Pukkila, H., Lähdesmäki, H., van Weerden, W. M., Wolf, M., Kallioniemi, O. P., Jenster, G. & Visakorpi, T., 2011, julkaisussa : Genes Chromosomes and Cancer. 50, 7, s. 499-509

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  98. Julkaistu

    Optimal Inversion of the Anscombe Transformation in Low-Count Poisson Image Denoising

    Mäkitalo, M. & Foi, A., 2011, julkaisussa : IEEE Transactions on Image Processing. 20, 1, s. 99-109 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  99. Julkaistu

    3DTV Broadcasting and Distribution Systems

    Hur, N., Lee, H., Lee, G. S., Lee, S. J., Gotchev, A. & Park, S-I., 2011, julkaisussa : IEEE Transactions on Broadcasting. 57, 2, s. 395-407

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  100. Julkaistu

    Optimal estimation

    Rissanen, J., 2011, julkaisussa : Lecture Notes in Computer Science. 6925, s. 37-37

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  101. Julkaistu

    Performance on the AX-PET Demonstrator

    Beltrame, P., Bolle, E., Braem, A., Casella, C., Chesi, E., Clinthorne, N., De Leo, R., Dissetori, G., Djambazov, L., Fanti, V., Joram, C., Kagan, H., Lustermann, W., Meddi, F., Nappi, E., Nessi-Tedaldi, F., Oliver, J. F., Pauss, T., Rafecas, M., Renker, D., Rudge, A., Ruotsalainen, U., Schinzel, D., Schneider, T., Seguinot, J., Solevi, P., Stapnes, S., Tuna, U. & Weilhammer, P., 2011, julkaisussa : Nuclear Physics B. 215, 1, s. 34-36

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

ID: 22336