TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto

TUTCRIS

Signaalinkäsittelyn laitos

Tutkimusyksikkö: Laitos

  1. A1 Alkuperäisartikkeli
  2. Julkaistu

    Loss of PTEN is associated with aggressive behavior in ERG-positive prostate cancer

    Leinonen, K. A., Saramäki, O. R., Furusato, B., Kimura, T., Takahashi, H., Egawa, S., Suzuki, H., Keiger, K., Hahm, S. H., Isaacs, W. B., Tolonen, T. T., Stenman, U-H., Tammela, T. L. J., Nykter, M., Bova, G. S. & Visakorpi, T., 2013, julkaisussa : Cancer Epidemiology Biomarkers and Prevention. 22, 12, s. 2333-2344 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Short-term and long-term memory deficits in handedness learning in mice with absent corpus callosum and reduced hippocampal commissure

    Ribeiro, A. S., Eales, B. A. & Biddle, F. G., 2013, julkaisussa : Behavioural Brain Research. 245, s. 145-151 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    Moving the Science of Behavioral Change into the 21st Century

    Saranummi, N., Spruijit-Mertz, D., Intille, S. S., Korhonen, I., Nilsen, W. J. & Pavel, M., 2013, julkaisussa : IEEE Pulse. 4, 5, s. 22-24 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  5. Julkaistu

    Active-set newton algorithm for overcomplete non-negative representations of audio

    Virtanen, T., Gemmeke, J. F. & Raj, B., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Audio Speech and Language Processing. 21, 11, s. 2277-2289 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    Bistability in a stochastic RNA-mediated gene network

    Lloyd-Price, J. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : Physical Review E. 88, 3, s. 1-8 8 Sivumäärä, 032714.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    The tumorigenic FGFR3-TACC3 gene fusion escapes miR-99a regulation in glioblastoma

    Parker, C., Annala, M., Cogdell, D., Granberg, K., Sun, Y., Ji, P., Li, X., Gumin, J., Zheng, H., Hu, L., Yli-Harja, O., Haapasalo, H., Visakorpi, T., Liu, X., Liu, C., Sawaya, R., Fuller, G., Chen, K., Lang, F., Nykter, M. & Zhang, W., 2013, julkaisussa : Journal of Clinical Investigation. 123, 2, s. 855-65 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  8. Julkaistu

    Online blind speech separation using multiple acoustic speaker tracking and time-frequency masking

    Pertilä, P., 2013, julkaisussa : Computer Speech and Language. 27, 3, s. 683-702 20 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  9. Julkaistu

    Automatic Music Transcription: Challenges and Future Directions

    Benetos, E., Dixon, S., Giannoulis, D., Kirchhoff, H. & Klapuri, A., 2013, julkaisussa : Journal of Intelligent Information Systems. 41, 3, s. 407-434 28 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  10. Julkaistu

    Effects of temperature on the dynamics of the LacI-TetR-CI repressilator

    Chandraseelan, J. G., Oliveira, S. M. D., Häkkinen, A., Tran, H., Potapov, I., Sala, A., Kandhavelu, M. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : Molecular Biosystems. 9, 12, s. 3117-3123 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  11. Julkaistu

    Effects of Rate-Limiting Steps in Transcription Initiation on Genetic Filter Motifs

    Häkkinen, A., Tran, H., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : PLoS ONE. 8, 8, s. 1-9 9 Sivumäärä, e70439.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    Personal Health Technologies in Employee Health Promotion: Usage Activity, Usefulness, and Health-Related Outcomes in a 1-Year Randomized Controlled Trial

    Mattila, E., Orsama, A-L., Ahtinen, A., Hopsu, L., Leino, T. & Korhonen, I., 2013, julkaisussa : JMIR Mhealth and Uhealth. 1, 2, s. 1-18 18 Sivumäärä, e16.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  13. Julkaistu

    POS3POLY-a MATLAB preprocessor for optimization with positive polynomials

    Sicleru, B. C. & Dumitrescu, B., 2013, julkaisussa : Optimization and Engineering. 14, 2, s. 251-273

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  14. Julkaistu

    Adaptive matching pursuit using coordinate descent and double residual minimization

    Onose, A. & Dumitrescu, B., 2013, julkaisussa : Signal Processing. 93, 11, s. 3143-3150 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    ZebIAT, an image analysis tool for registering zebrafish embryos and quantifying cancer metastasis

    Annila, T., Lihavainen, E., Marques, I. J., Williams, D. R., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 14, Suppl 10, 9 Sivumäärä, S5.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  16. Julkaistu

    Audio Pitch Shifting Using the Constant-Q Transform

    Schörkhuber, C., Klapuri, A. & Sontacchi, A., 2013, julkaisussa : Journal of the Audio Engineering Society. 61, 7-8, s. 562-572 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    A method for the design of Farrow-structure based variable fractional-delay FIR filters

    Eghbali, A., Johansson, H. & Saramäki, T., 2013, julkaisussa : Signal Processing. 93, 5, s. 1341-1348 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  18. Julkaistu

    Sparse Modeling for Lossless Audio Compression

    Ghido, F. & Tabus, I., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Audio Speech and Language Processing. 21, 1, s. 12-26

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  19. Julkaistu

    Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 7 (PCSK7) Is Essential for the Zebrafish Development and Bioavailability of Transforming Growth Factor beta1a (TGFbeta1a)

    Turpeinen, H., Oksanen, A., Kivinen, V., Kukkurainen, S., Uusimäki, A., Räme, M., Parikka, M., Hytönen, V. P., Nykter, M. & Pesu, M., 2013, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 288, 51, s. 36610-36623 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  20. Julkaistu

    Lossy and visually lossless compression of single-look SAR images

    Ponomarenko, N. N., Lukin, V. V., Kozhemiakin, R. A., Egiazarian, K. O. & Chobanu, M. K., 2013, julkaisussa : Telecommunications and Radio Engineering. 72, 8, s. 711-729 19 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  21. Julkaistu

    Advanced statistical tools for enhanced quality digital imaging with realistic capture models

    Pizurica, A., Portilla, J., Hirakawa, K. & Egiazarian, K., 2013, julkaisussa : Eurasip Journal on Advances in Signal Processing. 2013, s. 1-4 4 Sivumäärä, 140.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    Draft genome sequence of the hydrogen- and ethanol-producing anaerobic alkalithermophilic bacterium Caloramator celer.

    Ciranna, A., Larjo, A., Kivistö, A., Santala, V., Roos, C. & Karp, M., 2013, julkaisussa : Genome Announcements. 1, 4, s. 1-2 2 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    Critical assessment of automated flow cytometry data analysis techniques

    Aghaeepour, N., Finak, G., Hoos, H., Mosmann, T. R., Brinkman, R., Gottardo, R., Scheuermann, R. H., Dougall, D., Khodabakhshi, A. H., Mah, P., Obermoser, G., Spidlen, J., Taylor, I., Wuensch, S. A., Bramson, J., Eaves, C., Manninen, T., Huttunen, H., Ruusuvuori, P. & Nykter, M., 2013, julkaisussa : Nature Methods. 10, 3, s. 228-238 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    Lossy Depth Image Compression using Greedy Rate-Distortion Slope Optimization

    Schiopu, I. & Tabus, I., 2013, julkaisussa : IEEE Signal Processing Letters. 20, 11, s. 1066-1069 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  25. Julkaistu

    Cell segmentation by multi-resolution analysis and maximum likelihood estimation (MAMLE)

    Chowdhury, S., Kandhavelu, M., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 14, Suppl 10, s. 1-13 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  26. Julkaistu

    Passive temporal offset estimation of multichannel recordings of an ad-hoc microphone array

    Pertilä, P., Hämäläinen, M. S. & Mieskolainen, M., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Audio Speech and Language Processing. 21, 11, s. 2393-2402 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    Longitudinal analysis of pain in patients with metastatic prostate cancer using natural language processing of medical record text

    Heintzelman, N. H., Taylor, R. J., Simonsen, L., Lustig, R., Anderko, D., Haythornthwaite, J. A., Childs, L. C. & Bova, G. S., 2013, julkaisussa : Journal of the American Medical Informatics Association. 20, 5, s. 898-905 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    Constructing Benchmark Databases and Protocols for Medical Image Analysis: Diabetic Retinopathy

    Kauppi, T., Kämäräinen, J-K., Lensu, L., Kalesnykiene, V., Sorri, I., Uusitalo, H. & Kälviäinen, H., 2013, julkaisussa : Computational and Mathematical Methods in Medicine. 2013, s. 1-15 15 Sivumäärä, 368514.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Digital image reconstruction by using row pre-distortion and third-order moment function estimation

    Astola, J. T., Egiazarian, K. O. & Totsky, A. V., 2013, julkaisussa : Telecommunications and Radio Engineering. 72, 6, s. 485-494 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Karyotypically abnormal human ESCs are sensitive to HDAC inhibitors and show altered regulation of genes linked to cancers and neurological diseases

    Lund, R. J., Reddy Emani, M., Barbaric, I., Kivinen, V., Jones, M., Baker, D., Gokhale, P., Nykter, M., Lahesmaa, R. & Andrews, P. W., 2013, julkaisussa : Stem Cell Research. 11, 3, s. 1022-1036 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    A Novel Method for Splitting Clumps of Convex Objects Incorporating Image Intensity and Using Rectangular Window-Based Concavity Point-Pair Search

    Farhan, M., Yli-Harja, O. & Niemistö, A., 2013, julkaisussa : Pattern Recognition. 46, 3, s. 741-751 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  32. Julkaistu

    Phase retrieval in 4f optical system: background compensation and sparse regularization of object with binary amplitude

    Migukin, A., Agour, M. & Katkovnik, V., 2013, julkaisussa : Applied Optics. 52, 1, s. A269-A280 12 Sivumäärä, 173116.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    The AX-PET experiment: A demonstrator for an axial Positron Emission Tomograph

    Bolle, E., Casella, C., Chesi, E., De Leo, R., Dissertori, G., Fanti, V., Gillam, J. E., Heller, M., Joram, C., Lustermann, W., Nappi, E., Oliver, J. F., Pauss, F., Rafecas, M., Rudge, A., Ruotsalainen, U., Schinzel, D., Schneider, T., Seguinot, J., Solevi, P., Stapnes, S., Tuna, U. & Weilhammer, P., 2013, julkaisussa : Nuclear instruments and Methods in Physics Research Section A: Accelerators Spectrometers Detectors and Associated Equipment. 718, s. 126-129 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  34. Julkaistu

    On the human ability to discriminate audio ambiances from similar locations of an urban environment

    Korpi, D., Heittola, T., Partala, T., Eronen, A., Mesaros, A. & Virtanen, T., 2013, julkaisussa : Personal and Ubiquitous Computing. 17, 4

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  35. Julkaistu

    Modelling non-stationary noise with spectral factorisation in automatic speech recognition

    Hurmalainen, A., Gemmeke, J. F. & Virtanen, T., 2013, julkaisussa : Computer Speech and Language. 27, 3, s. 763-779 17 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    CellAging: a tool to study segregation and partitioning in division in cell lineages of Escherichia coli

    Häkkinen, A., Muthukrishnan, A., Mora, A., Fonseca, J. M. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : Bioinformatics. 29, 13, s. 1708-1709 2 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    Integrated analyses identify a master microRNA regulatory network for the mesenchymal subtype in serous ovarian cancer

    Yang, D., Sun, Y., Hu, L., Zheng, H., Ji, P., Pecot, C. V., Zhao, Y., Reynolds, S., Cheng, H., Rupaimoole, R., Cogdell, D., Nykter, M., Broaddus, R., Rodriguez-Aguayo, C., Lopez-Berestein, G., Liu, J., Shmulevich, I., Sood, A. K., Chen, K. & Zhang, W., 2013, julkaisussa : Cancer Cell. 23, 2, s. 186-199 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  38. Julkaistu

    A Low-Complexity Bit-Plane Entropy Coding and Rate Control for 3-D DWT Based Video Coding

    Belyaev, E., Egiazarian, K. & Gabbouj, M., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Multimedia. 15, 8, s. 1786-1799 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  39. Julkaistu

    Multi-scale Gaussian representation and outline-learning based cell image segmentation

    Farhan, M., Ruusuvuori, P., Emmenlauer, M., Rämö, P., Dehio, C. & Yli-Harja, O., 2013, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 14, SUPPL10, s. 1-14 14 Sivumäärä, S6.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  40. Julkaistu

    Nonlocal Transform-Domain Filter for Volumetric Data Denoising and Reconstruction

    Maggioni, M., Katkovnik, V., Egiazarian, K. & Foi, A., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Image Processing. 22, 1, s. 119-133 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  41. Julkaistu

    In vivo single-molecule kinetics of activation and subsequent activity of the arabinose promoter

    Mäkelä, J., Kandhavelu, M., Oliveira, S. M. D., Chandraseelan, J. G., Lloyd-Price, J., Peltonen, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 41, 13, s. 6544-6552 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    Can we reduce SPECT acquisition time using MAP-EM reconstruction?

    Tuna, U., Sohlberg, A. & Ruotsalainen, U., 2013, julkaisussa : Journal of Pattern Recognition and Intelligent Systems. 1, 3, s. 54-63 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  43. Julkaistu

    Context Coding of Depth Map Images Under the Piecewise-Constant Image Model Representation

    Tabus, I., Schiopu, I. & Astola, J., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Image Processing. 22, 11, s. 4195-4210 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    Dissecting genealogy and cell cycle as sources of cell-to-cell variability in MAPK signaling using high-throughput lineage tracking

    Ricicova, M., Hamidi, M., Quiring, A., Niemistö, A., Emberly, E. & Hansen, C. L., 2013, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110, 28, s. 11403-11408 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Balance between Noise and Information Flow Maximizes Set Complexity of Network Dynamics

    Mäki-Marttunen, T., Kesseli, J. & Nykter, M., 2013, julkaisussa : PLoS ONE. 8, 3, s. 1-15 15 Sivumäärä, e56523.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    Subjective quality assessment of asymmetric stereoscopic 3D video

    Aflaki, P., Hannuksela, M. M. & Gabbouj, M., 2013, julkaisussa : Signal, Image and Video Processing. s. 1-15 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  47. Julkaistu

    Transcriptional Analysis Reveals Gender-Specific Changes in the Aging of the Human Immune System

    Marttila, S., Jylhävä, J., Nevalainen, T., Nykter, M., Jylhä, M., Hervonen, A., Tserel, L., Peterson, P. & Hurme, M., 2013, julkaisussa : PLoS ONE. 8, 6, s. 1-8 8 Sivumäärä, e66229.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  48. Julkaistu

    Global Chromatin State Analysis Reveals Lineage-Specific Enhancers during the Initation of Human T helper 1 and T helper 2 Cell Polarization

    Hawkins, D. R., Larjo, A., Tripathi, S. K., Wagner, U., Luu, Y., Lönnberg, T., Raghav, S. K., Lee, L. K., Lund, R., Ren, B., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 2013, julkaisussa : Immunity. 38, 6, s. 1271-1284 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  49. Julkaistu

    An Efficient Adaptive Binary Arithmetic Coder With Low Memory Requirement

    Belyaev, E., Egiazarian, K., Gabbouj, M. & Turlikov, A., 2013, julkaisussa : IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing. 7, 6, s. 1053-1061 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  50. Julkaistu

    Sparse ptychographical coherent diffractive imaging from noisy measurements

    Katkovnik, V. & Astola, J., 2013, julkaisussa : Journal of the Optical Society of America A: Optics Image Science and Vision. 30, 3, s. 367-379 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  51. Julkaistu

    Client-Driven Joint Cache Management and Rate Adaptation for Dynamic Adaptive Streaming over HTTP

    Liu, C., Hannuksela, M. M. & Gabbouj, M., 2013, julkaisussa : International Journal of Digital Multimedia Broadcasting. 16 Sivumäärä, 471683.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

ID: 22336