TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto


Signaalinkäsittelyn laitos

Tutkimusyksikkö: Laitos

  1. A1 Alkuperäisartikkeli
  2. Julkaistu

    Loss of PTEN is associated with aggressive behavior in ERG-positive prostate cancer

    Leinonen, K. A., Saramäki, O. R., Furusato, B., Kimura, T., Takahashi, H., Egawa, S., Suzuki, H., Keiger, K., Hahm, S. H., Isaacs, W. B., Tolonen, T. T., Stenman, U-H., Tammela, T. L. J., Nykter, M., Bova, G. S. & Visakorpi, T., 2013, julkaisussa : Cancer Epidemiology Biomarkers and Prevention. 22, 12, s. 2333-2344 12 Sivumäärä


  3. Julkaistu

    Short-term and long-term memory deficits in handedness learning in mice with absent corpus callosum and reduced hippocampal commissure

    Ribeiro, A. S., Eales, B. A. & Biddle, F. G., 2013, julkaisussa : Behavioural Brain Research. 245, s. 145-151 7 Sivumäärä


  4. Julkaistu

    Moving the Science of Behavioral Change into the 21st Century

    Saranummi, N., Spruijit-Mertz, D., Intille, S. S., Korhonen, I., Nilsen, W. J. & Pavel, M., 2013, julkaisussa : IEEE Pulse. 4, 5, s. 22-24 3 Sivumäärä


  5. Julkaistu

    Active-set newton algorithm for overcomplete non-negative representations of audio

    Virtanen, T., Gemmeke, J. F. & Raj, B., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Audio Speech and Language Processing. 21, 11, s. 2277-2289 13 Sivumäärä


  6. Julkaistu

    Bistability in a stochastic RNA-mediated gene network

    Lloyd-Price, J. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : Physical Review E. 88, 3, s. 1-8 8 Sivumäärä, 032714.


  7. Julkaistu

    The tumorigenic FGFR3-TACC3 gene fusion escapes miR-99a regulation in glioblastoma

    Parker, C., Annala, M., Cogdell, D., Granberg, K., Sun, Y., Ji, P., Li, X., Gumin, J., Zheng, H., Hu, L., Yli-Harja, O., Haapasalo, H., Visakorpi, T., Liu, X., Liu, C., Sawaya, R., Fuller, G., Chen, K., Lang, F., Nykter, M. & Zhang, W., 2013, julkaisussa : Journal of Clinical Investigation. 123, 2, s. 855-65 11 Sivumäärä


  8. Julkaistu

    Online blind speech separation using multiple acoustic speaker tracking and time-frequency masking

    Pertilä, P., 2013, julkaisussa : Computer Speech and Language. 27, 3, s. 683-702 20 Sivumäärä


  9. Julkaistu

    Automatic Music Transcription: Challenges and Future Directions

    Benetos, E., Dixon, S., Giannoulis, D., Kirchhoff, H. & Klapuri, A., 2013, julkaisussa : Journal of Intelligent Information Systems. 41, 3, s. 407-434 28 Sivumäärä


  10. Julkaistu

    Effects of temperature on the dynamics of the LacI-TetR-CI repressilator

    Chandraseelan, J. G., Oliveira, S. M. D., Häkkinen, A., Tran, H., Potapov, I., Sala, A., Kandhavelu, M. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : Molecular Biosystems. 9, 12, s. 3117-3123 7 Sivumäärä


  11. Julkaistu

    Effects of Rate-Limiting Steps in Transcription Initiation on Genetic Filter Motifs

    Häkkinen, A., Tran, H., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : PLoS ONE. 8, 8, s. 1-9 9 Sivumäärä, e70439.


  12. Julkaistu

    Personal Health Technologies in Employee Health Promotion: Usage Activity, Usefulness, and Health-Related Outcomes in a 1-Year Randomized Controlled Trial

    Mattila, E., Orsama, A-L., Ahtinen, A., Hopsu, L., Leino, T. & Korhonen, I., 2013, julkaisussa : JMIR Mhealth and Uhealth. 1, 2, s. 1-18 18 Sivumäärä, e16.


  13. Julkaistu

    POS3POLY-a MATLAB preprocessor for optimization with positive polynomials

    Sicleru, B. C. & Dumitrescu, B., 2013, julkaisussa : Optimization and Engineering. 14, 2, s. 251-273


  14. Julkaistu

    Adaptive matching pursuit using coordinate descent and double residual minimization

    Onose, A. & Dumitrescu, B., 2013, julkaisussa : Signal Processing. 93, 11, s. 3143-3150 8 Sivumäärä


  15. Julkaistu

    ZebIAT, an image analysis tool for registering zebrafish embryos and quantifying cancer metastasis

    Annila, T., Lihavainen, E., Marques, I. J., Williams, D. R., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 14, Suppl 10, 9 Sivumäärä, S5.


  16. Julkaistu

    Audio Pitch Shifting Using the Constant-Q Transform

    Schörkhuber, C., Klapuri, A. & Sontacchi, A., 2013, julkaisussa : Journal of the Audio Engineering Society. 61, 7-8, s. 562-572 11 Sivumäärä


  17. Julkaistu

    A method for the design of Farrow-structure based variable fractional-delay FIR filters

    Eghbali, A., Johansson, H. & Saramäki, T., 2013, julkaisussa : Signal Processing. 93, 5, s. 1341-1348 8 Sivumäärä


  18. Julkaistu

    Sparse Modeling for Lossless Audio Compression

    Ghido, F. & Tabus, I., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Audio Speech and Language Processing. 21, 1, s. 12-26


  19. Julkaistu

    Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 7 (PCSK7) Is Essential for the Zebrafish Development and Bioavailability of Transforming Growth Factor beta1a (TGFbeta1a)

    Turpeinen, H., Oksanen, A., Kivinen, V., Kukkurainen, S., Uusimäki, A., Räme, M., Parikka, M., Hytönen, V. P., Nykter, M. & Pesu, M., 2013, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 288, 51, s. 36610-36623 14 Sivumäärä


  20. Julkaistu

    Lossy and visually lossless compression of single-look SAR images

    Ponomarenko, N. N., Lukin, V. V., Kozhemiakin, R. A., Egiazarian, K. O. & Chobanu, M. K., 2013, julkaisussa : Telecommunications and Radio Engineering. 72, 8, s. 711-729 19 Sivumäärä


  21. Julkaistu

    Advanced statistical tools for enhanced quality digital imaging with realistic capture models

    Pizurica, A., Portilla, J., Hirakawa, K. & Egiazarian, K., 2013, julkaisussa : Eurasip Journal on Advances in Signal Processing. 2013, s. 1-4 4 Sivumäärä, 140.


  22. Julkaistu

    Draft genome sequence of the hydrogen- and ethanol-producing anaerobic alkalithermophilic bacterium Caloramator celer.

    Ciranna, A., Larjo, A., Kivistö, A., Santala, V., Roos, C. & Karp, M., 2013, julkaisussa : Genome Announcements. 1, 4, s. 1-2 2 Sivumäärä


  23. Julkaistu

    Critical assessment of automated flow cytometry data analysis techniques

    Aghaeepour, N., Finak, G., Hoos, H., Mosmann, T. R., Brinkman, R., Gottardo, R., Scheuermann, R. H., Dougall, D., Khodabakhshi, A. H., Mah, P., Obermoser, G., Spidlen, J., Taylor, I., Wuensch, S. A., Bramson, J., Eaves, C., Manninen, T., Huttunen, H., Ruusuvuori, P. & Nykter, M., 2013, julkaisussa : Nature Methods. 10, 3, s. 228-238 11 Sivumäärä


  24. Julkaistu

    Lossy Depth Image Compression using Greedy Rate-Distortion Slope Optimization

    Schiopu, I. & Tabus, I., 2013, julkaisussa : IEEE Signal Processing Letters. 20, 11, s. 1066-1069 4 Sivumäärä


  25. Julkaistu

    Cell segmentation by multi-resolution analysis and maximum likelihood estimation (MAMLE)

    Chowdhury, S., Kandhavelu, M., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 14, Suppl 10, s. 1-13 13 Sivumäärä


  26. Julkaistu

    Passive temporal offset estimation of multichannel recordings of an ad-hoc microphone array

    Pertilä, P., Hämäläinen, M. S. & Mieskolainen, M., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Audio Speech and Language Processing. 21, 11, s. 2393-2402 10 Sivumäärä


  27. Julkaistu

    Longitudinal analysis of pain in patients with metastatic prostate cancer using natural language processing of medical record text

    Heintzelman, N. H., Taylor, R. J., Simonsen, L., Lustig, R., Anderko, D., Haythornthwaite, J. A., Childs, L. C. & Bova, G. S., 2013, julkaisussa : Journal of the American Medical Informatics Association. 20, 5, s. 898-905 8 Sivumäärä


  28. Julkaistu

    Constructing Benchmark Databases and Protocols for Medical Image Analysis: Diabetic Retinopathy

    Kauppi, T., Kämäräinen, J-K., Lensu, L., Kalesnykiene, V., Sorri, I., Uusitalo, H. & Kälviäinen, H., 2013, julkaisussa : Computational and Mathematical Methods in Medicine. 2013, s. 1-15 15 Sivumäärä, 368514.


  29. Julkaistu

    Digital image reconstruction by using row pre-distortion and third-order moment function estimation

    Astola, J. T., Egiazarian, K. O. & Totsky, A. V., 2013, julkaisussa : Telecommunications and Radio Engineering. 72, 6, s. 485-494 10 Sivumäärä


  30. Julkaistu

    Karyotypically abnormal human ESCs are sensitive to HDAC inhibitors and show altered regulation of genes linked to cancers and neurological diseases

    Lund, R. J., Reddy Emani, M., Barbaric, I., Kivinen, V., Jones, M., Baker, D., Gokhale, P., Nykter, M., Lahesmaa, R. & Andrews, P. W., 2013, julkaisussa : Stem Cell Research. 11, 3, s. 1022-1036 15 Sivumäärä


  31. Julkaistu

    A Novel Method for Splitting Clumps of Convex Objects Incorporating Image Intensity and Using Rectangular Window-Based Concavity Point-Pair Search

    Farhan, M., Yli-Harja, O. & Niemistö, A., 2013, julkaisussa : Pattern Recognition. 46, 3, s. 741-751 11 Sivumäärä


  32. Julkaistu

    Phase retrieval in 4f optical system: background compensation and sparse regularization of object with binary amplitude

    Migukin, A., Agour, M. & Katkovnik, V., 2013, julkaisussa : Applied Optics. 52, 1, s. A269-A280 12 Sivumäärä, 173116.


  33. Julkaistu

    The AX-PET experiment: A demonstrator for an axial Positron Emission Tomograph

    Bolle, E., Casella, C., Chesi, E., De Leo, R., Dissertori, G., Fanti, V., Gillam, J. E., Heller, M., Joram, C., Lustermann, W., Nappi, E., Oliver, J. F., Pauss, F., Rafecas, M., Rudge, A., Ruotsalainen, U., Schinzel, D., Schneider, T., Seguinot, J., Solevi, P., Stapnes, S., Tuna, U. & Weilhammer, P., 2013, julkaisussa : Nuclear instruments and Methods in Physics Research Section A: Accelerators Spectrometers Detectors and Associated Equipment. 718, s. 126-129 4 Sivumäärä


  34. Julkaistu

    On the human ability to discriminate audio ambiances from similar locations of an urban environment

    Korpi, D., Heittola, T., Partala, T., Eronen, A., Mesaros, A. & Virtanen, T., 2013, julkaisussa : Personal and Ubiquitous Computing. 17, 4


  35. Julkaistu

    Modelling non-stationary noise with spectral factorisation in automatic speech recognition

    Hurmalainen, A., Gemmeke, J. F. & Virtanen, T., 2013, julkaisussa : Computer Speech and Language. 27, 3, s. 763-779 17 Sivumäärä


  36. Julkaistu

    CellAging: a tool to study segregation and partitioning in division in cell lineages of Escherichia coli

    Häkkinen, A., Muthukrishnan, A., Mora, A., Fonseca, J. M. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : Bioinformatics. 29, 13, s. 1708-1709 2 Sivumäärä


  37. Julkaistu

    Integrated analyses identify a master microRNA regulatory network for the mesenchymal subtype in serous ovarian cancer

    Yang, D., Sun, Y., Hu, L., Zheng, H., Ji, P., Pecot, C. V., Zhao, Y., Reynolds, S., Cheng, H., Rupaimoole, R., Cogdell, D., Nykter, M., Broaddus, R., Rodriguez-Aguayo, C., Lopez-Berestein, G., Liu, J., Shmulevich, I., Sood, A. K., Chen, K. & Zhang, W., 2013, julkaisussa : Cancer Cell. 23, 2, s. 186-199 14 Sivumäärä


  38. Julkaistu

    A Low-Complexity Bit-Plane Entropy Coding and Rate Control for 3-D DWT Based Video Coding

    Belyaev, E., Egiazarian, K. & Gabbouj, M., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Multimedia. 15, 8, s. 1786-1799 14 Sivumäärä


  39. Julkaistu

    Multi-scale Gaussian representation and outline-learning based cell image segmentation

    Farhan, M., Ruusuvuori, P., Emmenlauer, M., Rämö, P., Dehio, C. & Yli-Harja, O., 2013, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 14, SUPPL10, s. 1-14 14 Sivumäärä, S6.


  40. Julkaistu

    Nonlocal Transform-Domain Filter for Volumetric Data Denoising and Reconstruction

    Maggioni, M., Katkovnik, V., Egiazarian, K. & Foi, A., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Image Processing. 22, 1, s. 119-133 15 Sivumäärä


  41. Julkaistu

    In vivo single-molecule kinetics of activation and subsequent activity of the arabinose promoter

    Mäkelä, J., Kandhavelu, M., Oliveira, S. M. D., Chandraseelan, J. G., Lloyd-Price, J., Peltonen, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 41, 13, s. 6544-6552 9 Sivumäärä


  42. Julkaistu

    Can we reduce SPECT acquisition time using MAP-EM reconstruction?

    Tuna, U., Sohlberg, A. & Ruotsalainen, U., 2013, julkaisussa : Journal of Pattern Recognition and Intelligent Systems. 1, 3, s. 54-63 10 Sivumäärä


  43. Julkaistu

    Context Coding of Depth Map Images Under the Piecewise-Constant Image Model Representation

    Tabus, I., Schiopu, I. & Astola, J., 2013, julkaisussa : IEEE Transactions on Image Processing. 22, 11, s. 4195-4210 16 Sivumäärä


  44. Julkaistu

    Dissecting genealogy and cell cycle as sources of cell-to-cell variability in MAPK signaling using high-throughput lineage tracking

    Ricicova, M., Hamidi, M., Quiring, A., Niemistö, A., Emberly, E. & Hansen, C. L., 2013, julkaisussa : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110, 28, s. 11403-11408 6 Sivumäärä


  45. Julkaistu

    Balance between Noise and Information Flow Maximizes Set Complexity of Network Dynamics

    Mäki-Marttunen, T., Kesseli, J. & Nykter, M., 2013, julkaisussa : PLoS ONE. 8, 3, s. 1-15 15 Sivumäärä, e56523.


  46. Julkaistu

    Subjective quality assessment of asymmetric stereoscopic 3D video

    Aflaki, P., Hannuksela, M. M. & Gabbouj, M., 2013, julkaisussa : Signal, Image and Video Processing. s. 1-15 15 Sivumäärä


  47. Julkaistu

    Transcriptional Analysis Reveals Gender-Specific Changes in the Aging of the Human Immune System

    Marttila, S., Jylhävä, J., Nevalainen, T., Nykter, M., Jylhä, M., Hervonen, A., Tserel, L., Peterson, P. & Hurme, M., 2013, julkaisussa : PLoS ONE. 8, 6, s. 1-8 8 Sivumäärä, e66229.


  48. Julkaistu

    Global Chromatin State Analysis Reveals Lineage-Specific Enhancers during the Initation of Human T helper 1 and T helper 2 Cell Polarization

    Hawkins, D. R., Larjo, A., Tripathi, S. K., Wagner, U., Luu, Y., Lönnberg, T., Raghav, S. K., Lee, L. K., Lund, R., Ren, B., Lähdesmäki, H. & Lahesmaa, R., 2013, julkaisussa : Immunity. 38, 6, s. 1271-1284 13 Sivumäärä


  49. Julkaistu

    An Efficient Adaptive Binary Arithmetic Coder With Low Memory Requirement

    Belyaev, E., Egiazarian, K., Gabbouj, M. & Turlikov, A., 2013, julkaisussa : IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing. 7, 6, s. 1053-1061 9 Sivumäärä


  50. Julkaistu

    Sparse ptychographical coherent diffractive imaging from noisy measurements

    Katkovnik, V. & Astola, J., 2013, julkaisussa : Journal of the Optical Society of America A: Optics Image Science and Vision. 30, 3, s. 367-379 13 Sivumäärä


  51. Julkaistu

    Client-Driven Joint Cache Management and Rate Adaptation for Dynamic Adaptive Streaming over HTTP

    Liu, C., Hannuksela, M. M. & Gabbouj, M., 2013, julkaisussa : International Journal of Digital Multimedia Broadcasting. 16 Sivumäärä, 471683.


ID: 22336