TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto

TUTCRIS

A review of connectivity map and computational approaches in pharmacogenomics

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Yksityiskohdat

AlkuperäiskieliEnglanti
Sivut506-523
Sivumäärä18
JulkaisuBriefings in Bioinformatics
Vuosikerta19
Numero3
DOI - pysyväislinkit
TilaJulkaistu - 1 toukokuuta 2018
OKM-julkaisutyyppiA1 Alkuperäisartikkeli

Tiivistelmä

Large-scale perturbation databases, such as ConnectivityMap (CMap) or Library of Integrated Network-based Cellular Signatures (LINCS), provide enormous opportunities for computational pharmacogenomics and drug design. A reason for this is that in contrast to classical pharmacology focusing at one target at a time, the transcriptomics profiles provided by CMap and LINCS open the door for systems biology approaches on the pathway and network level. In this article, we provide a review of recent developments in computational pharmacogenomics with respect to CMap and LINCS and related applications.

!!ASJC Scopus subject areas

Tutkimusalat

Julkaisufoorumi-taso

Tilastokeskuksen tieteenalat