TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto

TUTCRIS

Construction of a computational data analysis pipeline using a workflow system

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Yksityiskohdat

AlkuperäiskieliEnglanti
OtsikkoProceedings of the Seventh International Workshop on Computational Systems Biology, WCSB 2010, Luxembourg, June 16-18, 2010. TICSP Series
ToimittajatMatti Nykter, Pekka Ruusuvuori, Carsten Carlberg, Olli Yli-Harja
Sivut4 p
TilaJulkaistu - 2010
OKM-julkaisutyyppiA4 Artikkeli konferenssijulkaisussa

Tiivistelmä

We present how we used a workflow system to create a computational pipeline for storing, preprocessing and statistically analyzing gene expression microarray data together with public annotation information. The pipeline demonstrates that the used workflow system can facilitate reuse and documentation of the analysis methods which are adaptable to changing integrative data analysis approaches.

Julkaisufoorumi-taso

Latausten tilastot

Ei tietoja saatavilla