BACOM: In silico detection of genomic deletion types and correction of normal cell contamination in copy number data

Yu, G., Zhang, B., Bova, G. S., Xu, J., Shih, I. M. & Wang, Y., kesäkuuta 2011, julkaisussa : Bioinformatics. 27, 11, s. 1473-1480 8 Sivumäärä, btr183.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Two models for hydraulic cylinders in flexible multibody simulations

Ylinen, A., Mäkinen, J. & Kouhia, R., 2016, Computational Methods for Solids and Fluids: Multiscale Analysis, Probability Aspects and Model Reduction. Springer, s. 463-493 31 Sivumäärä (Computational Methods in Applied Sciences; painos 41).

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A novel epidemic model considering demographics and intercity commuting on complex dynamical networks

Yin, Q., Wang, Z., Xia, C., Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Jin, Z., 2020, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 386, 21 Sivumäärä, 125517.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Visibility-Aware Part Coding for Vehicle Viewing Angle Estimation

Yang, D., Qian, Y., Cai, D., Yan, S., Kämäräinen, J-K. & Chen, K., 1 elokuuta 2019, 9th International Conference on Information Science and Technology, ICIST 2019. IEEE, s. 65-70 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A full-potential linearized augmented plane wave study of the interaction of CO2 with α-Pu (020) surface nanolayers

Wang, J. & Ray, A. K., 2014, julkaisussa : Journal of Computational and Theoretical Nanoscience. 11, 7, s. 1710-1717 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Graph entropy based on the number of spanning forests of c-cyclic graphs

Wan, P., Tu, J., Dehmer, M., Zhang, S. & Emmert-Streib, F., 15 joulukuuta 2019, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 363, 124616.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Integral kernels for k-hypermonogenic functions

Vuojamo, V. & Eriksson, S-L., 2017, julkaisussa : Complex Variables and Elliptic Equations. 62, 9, s. 1-12 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Melting of copper clusters

Valkealahti, S. & Manninen, M., 1 tammikuuta 1993, julkaisussa : Computational Materials Science. 1, 2, s. 123-134 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Machine learning: How it can help nanocomputing

Uusitalo, M. A., Peltonen, J. & Ryhänen, T., elokuuta 2011, julkaisussa : Journal of Computational and Theoretical Nanoscience. 8, 8, s. 1347-1363 17 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

NetBioV: An R package for visualizing large network data in biology and medicine

Tripathi, S., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 2 huhtikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 19, s. 2834-2836 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

SamExploreR: Exploring reproducibility and robustness of RNA-seq results based on SAM files

Stupnikov, A., Tripathi, S., De Matos Simoes, R., McArt, D., Salto-Tellez, M., Glazko, G., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 21, s. 3345-3347 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cuts for 3-D magnetic scalar potentials: Visualizing unintuitive surfaces arising from trivial knots

Stockrahm, A., Lahtinen, V., Kangas, J. J. J. & Kotiuga, P. R., 2019, (Hyväksytty/In press) julkaisussa : Computers and Mathematics with Applications.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Introducing Multi-Convexity in Path Constrained Trajectory Optimization for Mobile Manipulators

Singh, A. K., Ahonen, A., Ghabcheloo, R. & Mueller, A., 2020, European Control Conference 2020, ECC 2020. IEEE, s. 1178-1185 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A robust AMMI model for the analysis of genotype-by-environment data

Rodrigues, P. C., Monteiro, A. & Lourenço, V. M., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 1, s. 58-66 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Gene Sets Net Correlations Analysis (GSNCA): A multivariate differential coexpression test for gene sets

Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 1 helmikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 3, s. 360-368 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Gene set analysis for self-contained tests: Complex null and specific alternative hypotheses

Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., joulukuuta 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 23, s. 3073-3080 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Homogeneous (α,k)-Polynomial Solutions of the Fractional Riesz System in Hyperbolic Space

Orelma, H. & Vieira, N., 2017, julkaisussa : Complex Analysis and Operator Theory. 11, 5, s. 1253–1267 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Sound Event Detection in the DCASE 2017 Challenge

Mesaros, A., Diment, A., Elizalde, B., Heittola, T., Vincent, E., Raj, B. & Virtanen, T., 1 kesäkuuta 2019, julkaisussa : IEEE/ACM Transactions on Audio Speech and Language Processing. 27, 6, s. 992-1006 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

SCIP: a single-cell image processor toolbox

Martins, L., Neeli-Venkata, R., Oliveira, S. M. D., Häkkinen, A., Ribeiro, A. S. & Fonseca, J. M., 15 joulukuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 24, s. 4318-4320 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Growth behavior and magnetic properties of spherical uranium oxide nanoclusters

Ma, L. & Ray, A. K., helmikuuta 2013, julkaisussa : Journal of Computational and Theoretical Nanoscience. 10, 2, s. 334-340 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Density functional theory study of FePdn (n = 2-14) clusters and interactions with small molecules

Ma, L., Wang, J., Hao, Y. & Wang, G., helmikuuta 2013, julkaisussa : Computational Materials Science. 68, s. 166-173 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparison of Human Head Phantoms with Different Complexities for Implantable Antenna Development

Ma, S., Ukkonen, L., Sydänheimo, L. & Björninen, T., 18 maaliskuuta 2019, 2018 International Applied Computational Electromagnetics Society (ACES) Symposium: 29 July-1 Aug. 2018, China. IEEE

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Introducing libeemd: a program package for performing the ensemble empirical mode decomposition

Luukko, P. J. J., Helske, J. & Räsänen, E., 1 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Computational Statistics. 31, 2, s. 545-557 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

An automated algorithm for reliable equation of state fitting of magnetic systems

Levämäki, H., Tian, L-Y., Vitos, L. & Ropo, M., 2019, julkaisussa : Computational Materials Science. 156, s. 121-128 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Modeling mass transfer in fracture flows with the time domain-random walk method

Kuva, J., Voutilainen, M. & Mattila, K., 2019, julkaisussa : COMPUTATIONAL GEOSCIENCES.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Circularly Polarized Textile Tag Antenna for Wearable Passive UHF RFID Systems

Kuang, Y., Ma, S., Ukkonen, L., Virkki, J. & Björninen, T., 18 maaliskuuta 2019, 2018 International Applied Computational Electromagnetics Society Symposium in China, ACES-China 2018. IEEE

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparative analysis of tissue reconstruction algorithms for 3D histology

Kartasalo, K., Latonen, L., Vihinen, J., Visakorpi, T., Nykter, M. & Ruusuvuori, P., 1 syyskuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 17, s. 3013-3021 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Van der Waals interactions are critical in Car-Parrinello molecular dynamics simulations of porphyrin-fullerene dyads

Karilainen, T., Cramariuc, O., Kuisma, M., Tappura, K. & Hukka, T. I., 2015, julkaisussa : Journal of Computational Chemistry. 36, 9, s. 612-621 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Satisfiability of modal inclusion logic: Lax and strict semantics

Hella, L., Kuusisto, A., Meier, A. & Vollmer, H., 1 lokakuuta 2019, julkaisussa : ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL LOGIC. 21, 1, 7.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal fluorescence intensity data

Julkaisun otsikon käännös: : Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal flourescence intensity data
Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 tammikuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 31, 1, s. 69-75 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Characterizing rate limiting steps in transcription from RNA production times in live cells

Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 toukokuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 9, s. 1346-1352 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Hypermonogenic solutions and plane waves of the Dirac operator in Rp×Rq

Guzmán Adán, A., Orelma, H. & Sommen, F., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 346, s. 1-14 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Resilient Cooperative Voltage Control for Distribution Network with High Penetration Distributed Energy Resources

Gusrialdi, A., Xu, Y., Qu, Z. & Simaan, M. A., 2020, European Control Conference 2020, ECC 2020. IEEE, s. 1533-1539 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Unite and conquer: Univariate and multivariate approaches for finding differentially expressed gene sets

Glazko, G. V. & Emmert-Streib, F., syyskuuta 2009, julkaisussa : Bioinformatics. 25, 18, s. 2348-2354 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The watching system as a generalization of identifying code

Ghorbani, M., Dehmer, M., Maimani, H., Maddah, S., Roozbayani, M. & Emmert-Streib, F., 2020, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 380, 7 Sivumäärä, 125302.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

On k-Hypermonogenic Functions and Their Mean Value Properties

Eriksson, S-L. & Orelma, H., 2016, julkaisussa : Complex Analysis and Operator Theory. 10, 2, s. 311-325 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Hypermonogenic Functions of Two Vector Variables

Eriksson, S. L., Orelma, H. & Vieira, N., 2018, julkaisussa : Complex Analysis and Operator Theory. 12, 2, s. 555–570 16 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A microscopic view of the mechanisms of active transport across the cellular membrane

Enkavi, G., Li, J., Wen, P., Thangapandian, S., Moradi, M., Jiang, T., Han, W. & Tajkhorshid, E., 2014, julkaisussa : Annual Reports in Computational Chemistry. 10, s. 77-125 49 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Universal construction mechanism for networks from one-dimensional symbol sequences

Emmert-Streib, F., 15 lokakuuta 2012, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 219, 3, s. 1020-1030 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Evolutionary dynamics of the spatial Prisoner's Dilemma with self-inhibition

Emmert-Streib, F., 5 helmikuuta 2012, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 218, 11, s. 6482-6488 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Topological mappings between graphs, trees and generalized trees

Emmert-Streib, F. & Dehmer, M., 15 maaliskuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 186, 2, s. 1326-1333 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Information theoretic measures of UHG graphs with low computational complexity

Emmert-Streib, F. & Dehmer, M., 15 heinäkuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 190, 2, s. 1783-1794 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Algorithmic computation of knot polynomials of secondary structure elements of proteins

Emmert-Streib, F., 1 lokakuuta 2006, julkaisussa : Journal of Computational Biology. 13, 8, s. 1503-1512 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Modeling probability densities with sums of exponentials via polynomial approximation

Dumitrescu, B., Şicleru, B. C. & Avram, F., 2016, julkaisussa : Journal of Computational and Applied Mathematics. 292, s. 513–525

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Chipless graphene tag and dual-CP reader for Internet of Things

Dong, G., Shen, Y., He, H., Virkki, J. & Hu, S., 26 syyskuuta 2017, 2017 International Applied Computational Electromagnetics Society Symposium in China, ACES-China 2017. IEEE

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Graph distance measures based on topological indices revisited

Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Shi, Y., 18 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 266, s. 623-633 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A comparative analysis of multidimensional features of objects resembling sets of graphs

Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Gesell, T., 15 helmikuuta 2008, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 196, 1, s. 221-235 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

An efficient heuristic approach to detecting graph isomorphism based on combinations of highly discriminating invariants

Dehmer, M., Grabner, M., Mowshowitz, A. & Emmert-Streib, F., elokuuta 2013, julkaisussa : Advances in Computational Mathematics. 39, 2, s. 311-325 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structural similarity of directed universal hierarchical graphs: A low computational complexity approach

Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 joulukuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 194, 1, s. 7-20 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparing large graphs efficiently by margins of feature vectors

Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 15 toukokuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 188, 2, s. 1699-1710 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A similarity measure for graphs with low computational complexity

Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Kilian, J., 1 marraskuuta 2006, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 182, 1, s. 447-459 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

On efficient network similarity measures

Dehmer, M., Chen, Z., Shi, Y., Zhang, Y., Tripathi, S., Ghorbani, M., Mowshowitz, A. & Emmert-Streib, F., 1 joulukuuta 2019, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 362, 124521.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Relations and bounds for the zeros of graph polynomials using vertex orbits

Dehmer, M., Emmert-Streib, F., Mowshowitz, A., Ilić, A., Chen, Z., Yu, G., Feng, L., Ghorbani, M., Varmuza, K. & Tao, J., 1 syyskuuta 2020, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 380, 125239.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Entropy bounds for dendrimers

Chen, Z., Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Shi, Y., 1 syyskuuta 2014, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 242, s. 462-472 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Multichannel Blind Sound Source Separation using Spatial Covariance Model with Level and Time Differences and Non-Negative Matrix Factorization

Carabias Orti, J. J., Nikunen, J., Virtanen, T. & Vera-Candeas, P., syyskuuta 2018, julkaisussa : IEEE/ACM Transactions on Audio Speech and Language Processing. 26, 9, s. 1512-1527

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The different levels of magneto-mechanical coupling in energy conversion machines and devices

Belahcen, A., Kouhia, R. & Fonteyn, K., 2011, Proceedings of the 4th International Conference on Computational Methods for Coupled Problems in Science and Engineering, COUPLED PROBLEMS 2011. s. 472-483 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Optimal energy decay for the wave-heat system on a rectangular domain

Batty, C., Paunonen, L. & Seifert, D., 2019, julkaisussa : SIAM JOURNAL ON MATHEMATICAL ANALYSIS. 51, 2, s. 808-819 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Revealing differences in gene network inference algorithms on the network level by ensemble methods

Altay, G. & Emmert-Streib, F., 25 toukokuuta 2010, julkaisussa : Bioinformatics. 26, 14, s. 1738-1744 7 Sivumäärä, btq259.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Magnetic origin of the chemical balance in alloyed Fe-Cr stainless steels: First-principles and Ising model study

Airiskallio, E., Nurmi, E., Väyrynen, I. J., Kokko, K., Ropo, M., Punkkinen, M. P. J., Johansson, B. & Vitos, L., 2014, julkaisussa : Computational Materials Science. 92, s. 135-140 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu