Abraham, Bobin George ; Santala, Ville ; Tkachenko, Nikolai V. ; Karp, Matti. / Fluorescent protein-based FRET sensor for intracellular monitoring of redox status in bacteria at single cell level. Julkaisussa: Analytical and Bioanalytical Chemistry. 2014 ; Vuosikerta 406, Nro 28. Sivut 7195-7204.

Ahola, Niina ; Veiranto, Minna ; Männistö, Noora ; Karp, Matti ; Rich, Jaana ; Efimov, Alexander ; Seppälä, Jukka ; Kellomäki, Minna. / Processing and sustained in vitro release of rifampicin containing composites to enhance the treatment of osteomyelitis. Julkaisussa: Biomatter. 2012 ; Vuosikerta 2, Nro 4. Sivut 1-13.

Ahola, Niina ; Männistö, Noora ; Veiranto, Minna ; Karp, Matti ; Rich, Jaana ; Efimov, Alexander ; Seppälä, Jukka ; Kellomäki, Minna. / An in vitro study of composites of poly(L-lactide-co-e-caprolactone), ß-tricalcium phosphate and ciprofloxacin intended for local treatment of osteomyelitis. Julkaisussa: Biomatter. 2013 ; Vuosikerta 3, Nro 2. Sivut 1-13.

Arioli, Stefania ; Ragg, Enzio ; Scaglioni, Leonardo ; Fessas, Dimitros ; Signorelli, Marco ; Karp, Matti ; Daffoncio, Daniele ; De Noni, Ivano ; Mulas, Laura ; Oggioni, Marco ; Guglielmetti, Simone ; Mora, Diego. / Alkalizing reactions streamline cellular metabolism in acidogenic microorganisms. Julkaisussa: PLoS ONE. 2010 ; Vuosikerta 5, Nro 11, e15520. Sivut 1-8.

Bayr, Suvi ; Pakarinen, Outi ; Korppoo, Aki ; Liuksia, Saku ; Väisänen, Ari ; Kaparaju, Prasad ; Rintala, Jukka. / Effect of additives on process stability of mesophilic anaerobic monodigestion of pig slaughterhouse waste. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2012 ; Vuosikerta 120, Nro September. Sivut 106-113.

Bayr, Suvi ; Kaparaju, Prasad ; Rintala, Jukka. / Screening pretreatment methods to enhance thermophilic anaerobic digestion of pulp and paper mill wastewater treatment secondary sludge. Julkaisussa: Chemical Engineering Journal. 2013 ; Vuosikerta 223. Sivut 479-486.

Bayr, Suvi ; Rantanen, Marianne ; Kaparaju, Prasad ; Rintala, Jukka. / Mesophilic and thermophilic anaerobic co-digestion of rendering plant and slaughterhouse wastes. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2012 ; Vuosikerta 104, Nro January. Sivut 28-36.

Bayr, Suvi ; Rintala, Jukka. / Thermophilic anaerobic digestion of pulp and paper mill primary sludge and co-digestion of primary and secondary sludge. Julkaisussa: Water Research. 2012 ; Vuosikerta 46, Nro 15. Sivut 4713-4720.

Bermejo-Velasco, Daniel ; Varghese, Oommen P. ; P. Oommen, Oommen ; Hilborn, Jöns ; Nawale, Ganesh N. / Thiazolidine chemistry revisited: a fast, efficient and stable click-type reaction at physiological pH. Julkaisussa: Chemical Communications. 2018 ; Sivut 12507-12510.

Bevilaqua, D. ; Garcia Jr., O. ; Tuovinen, Olli H. / Oxidative dissolution of bornite by Acidithiobacillus ferrooxidans. Julkaisussa: Process Biochemistry. 2010 ; Vuosikerta 45, Nro 1. Sivut 101-106.

Bevilaqua, Denise ; Lahti-Tommila, Heidi ; Garcia Jr., Oswaldo ; Puhakka, Jaakko A. ; Tuovinen, Olli H. / Bacterial and chemical leaching of chalcopyrite concentrates as affected by the redox potential and ferric/ferrous iron ratio at 22 C. Julkaisussa: International Journal of Mineral Processing. 2014 ; Vuosikerta 132. Sivut 1-7.

Bevilaqua, Denise ; Lahti, Heidi ; Suegama, Patricia ; Garcia Jr., Oswaldo ; Benedetti, Assis ; Puhakka, Jaakko ; Tuovinen, Olli. / Effect of NA-chloride on the bioleaching of a chalcopyrite concentrate in shake flasks and stirred tank bioreactors. Julkaisussa: Hydrometallurgy. 2013 ; Vuosikerta 138. Sivut 1-13.

Bevilaqua, D. ; Garcia Jr, O. ; Suegama, P. H. ; Benedetti, A. V. ; Lahti, H. ; Puhakka, J. ; Tuovinen, O. H. / Avaliacao eletroquimica de residuos de biolixiviacao da calcopirita (CuFeS2) por acidithiobacillus ferrooxidans. XXIV ENTMME 2011, Encontro Nacional de Tratamento de Minerios e Metalurgia Extrativa, 16 a 19 de outubro de 2011, Salvador/Bahia. Encontro Nacional de Tratamento de Minerios e Metalurgia Extrativa, 2011. Sivut 1179-1186 (Encontro Nacional de Tratamento de Minerios e Metalurgia Extrativa).

Bhatti, Tariq M. ; Bigham, Jerry M. ; Vuorinen, Antti ; Tuovinen, Olli H. / Weathering of phlogopite in simulated bioleaching solutions. Julkaisussa: International Journal of Mineral Processing. 2011 ; Vuosikerta 98, Nro 1-2. Sivut 30-34.

Bhatti, Tariq M. ; Bigham, Jerry M. ; Vuorinen, Antti ; Tuovinen, Olli H. / Weathering of biotite in Acidithiobacillus ferrooxidans cultures. Julkaisussa: Geomicrobiology Journal. 2011 ; Vuosikerta 28, Nro 2. Sivut 130-134.

Bhatti, Tariq M. ; Bigham, Jerry M. ; Riekkola-Vanhanen, Merja ; Tuovinen, Olli H. / Altered mineralogy associated with stirred tank bioreactor leaching of a black schist ore. Julkaisussa: Hydrometallurgy. 2010 ; Vuosikerta 100, Nro 3-4. Sivut 181-184.

Bigham, Jerry M. ; Jones, F. Sandy ; Özkaya, Bestamin ; Sahinkaya, Erkan ; Puhakka, Jaakko A. ; Tuovinen, Olli H. / Characterization of jarosites produced by chemical synthesis over a temperature gradient from 2 to 40 °C. Julkaisussa: International Journal of Mineral Processing. 2010 ; Vuosikerta 94, Nro 3-4. Sivut 121-128.

Bomberg, Malin ; Munster, Uwe ; Pumpanen, Jukka ; Ilvesniemi, Hannu ; Heinonsalo, Jussi. / Archaeal communities in boreal forest tree rhizospheres respond to changing soil temperatures. Julkaisussa: Microbial Ecology. 2011 ; Vuosikerta 62, Nro 1. Sivut 205-217.

Butti, Sai Kishore ; Velvizhi, G. ; Sulonen, Mira L K ; Haavisto, Johanna M. ; Oguz Koroglu, Emre ; Yusuf Cetinkaya, Afsin ; Singh, Surya ; Arya, Divyanshu ; Annie Modestra, J. ; Vamsi Krishna, K. ; Verma, Anil ; Ozkaya, Bestami ; Lakaniemi, Aino-Maija ; Puhakka, Jaakko A. ; Venkata Mohan, S. / Microbial electrochemical technologies with the perspective of harnessing bioenergy : Maneuvering towards upscaling. Julkaisussa: Renewable and Sustainable Energy Reviews. 2016 ; Vuosikerta 53. Sivut 462-476.

Carver, Sarah M. ; Lepistö, Raghida ; Tuovinen, Olli H. / Hydrolysis and metabolism of cellulose by an anaerobic, thermophilic consortium. Third International Symposium on Energy from Biomass and Waste, Venice, Italy, 8-11 November 2010. 2010. Sivut 1-9

Carver, Sarah M. ; Nelson, Michael C. ; Lepistö, Raghida ; Yu, Zhongtang ; Tuovinen, Olli H. / Hydrogen and volatile fatty acid production during fermentation of cellulosic sustrates by a thermophilic consortium at 50 and 60 °C. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2012 ; Vuosikerta 104, Nro January. Sivut 424-431.

Carver, Sarah M. ; Hulatt, Chris J. ; Thomas, David N. ; Tuovinen, Olli H. / Thermophilic, anaerobic co-digestion of microalgal biomass and cellulose for H2 production. Julkaisussa: BIODEGRADATION. 2011 ; Vuosikerta 22, Nro 4. Sivut 805-814.

Carver, Sarah M. ; Vuoriranta, Pertti ; Tuovinen, Olli H. / A thermophilic microbial fuel cell design. Julkaisussa: Journal of Power Sources. 2011 ; Vuosikerta 196, Nro 8. Sivut 3757-3760.

Chen, Chin-Chao ; Sen, Biswarup ; Chuang, Yeong-Song ; Tsai, Chia-Jung ; Lay, Chyi-How. / Effect of effluent recycle ratio in a continuous anaerobic biohydrogen production system. Julkaisussa: Journal of Cleaner Production. 2012 ; Vuosikerta 32. Sivut 236-243.

Chu, Chen-Yeon ; Sen, Biswarup ; Lay, Chyi-How ; Lin, Yi-Chun ; Lin, Chiu-Yue. / Direct fermentation of sweet potato to produce maximal hydrogen and ethanol. Julkaisussa: Applied Energy. 2012 ; Vuosikerta 100. Sivut 10-18.

Ciranna, Alessandro ; Ferrari, Roberto ; Santala, Ville ; Karp, Matti. / Inhibitory effects of substrate and soluble end products on biohydrogen production of the alkalithermophile Caloramator celer : Kinetic, metabolic and transcription analyses. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2014 ; Vuosikerta 39, Nro 12. Sivut 6391-6401.

Ciranna, Alessandro ; Larjo, Antti ; Kivistö, Anniina ; Santala, Ville ; Roos, Christophe ; Karp, Matti. / Draft genome sequence of the hydrogen- and ethanol-producing anaerobic alkalithermophilic bacterium Caloramator celer. Julkaisussa: Genome Announcements. 2013 ; Vuosikerta 1, Nro 4. Sivut 1-2.

Ciranna, Alessandro ; Santala, Ville ; Karp, Matti. / Enhancing biohydrogen production of the alkalithermophile Thermobrachium celere. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2012 ; Vuosikerta 37, Nro 7. Sivut 5550-5558.

Ciranna, Alessandro ; Pawar, Sudhanshu S. ; Santala, Ville ; Karp, Matti ; van Niel, Ed W J. / Assessment of metabolic flux distribution in the thermophilic hydrogen producer Caloramator celer as affected by external pH and hydrogen partial pressure. Julkaisussa: Microbial Cell Factories. 2014 ; Vuosikerta 13, Nro 1.

Ciranna, Alessandro. / Biohydrogen production in extreme conditions: A comprehensive study of the fermentative metabolism of a polyextremophilic bacterium. Tampere : Tampere University of Technology, 2014. 220 Sivumäärä (Tampere University of Technology. Publication).

Dessì, Paolo ; Jain, Rohan ; Singh, Satyendra ; Seder-Colomina, Marina ; van Hullebusch, Eric D. ; Rene, Eldon R. ; Ahammad, Shaikh Ziauddin ; Carucci, Alessandra ; Lens, Piet N L. / Effect of temperature on selenium removal from wastewater by UASB reactors. Julkaisussa: Water Research. 2016 ; Vuosikerta 94. Sivut 146-154.

Di Capua, Francesco ; Papirio, Stefano ; Lens, Piet N L ; Esposito, Giovanni. / Chemolithotrophic denitrification in biofilm reactors. Julkaisussa: Chemical Engineering Journal. 2015 ; Vuosikerta 280. Sivut 643-657.

Di Capua, Francesco ; Ahoranta, Sarita H. ; Papirio, Stefano ; Lens, Piet N.L. ; Esposito, Giovanni. / Impacts of sulfur source and temperature on sulfur-driven denitrification by pure and mixed cultures of Thiobacillus. Julkaisussa: Process Biochemistry. 2016 ; Vuosikerta 51, Nro 10. Sivut 1576-1584.

Doan, Phuong ; Nguyen, Tien ; Yli-Harja, Olli ; Candeias, Nuno R ; Kandhavelu, Meenakshisundaram. / Effect of alkylaminophenols on growth inhibition and apoptosis of bone cancer cells. Julkaisussa: European Journal of Pharmaceutical Sciences. 2017 ; Vuosikerta 107. Sivut 208–216.

Efimova, E. ; Marjakangas, J.M. ; Lakaniemi, A.-M. ; Koskinen, P.E.P. ; Puhakka, J.A. / Lipid profile characterization of wastewaters from different origins. Julkaisussa: Water Science and Technology. 2013 ; Vuosikerta 68, Nro 11. Sivut 2505-2514.

Futagami, Taiki ; Morono, Yuki ; Terada, Takeshi ; Kaksonen, Anna H. ; Inagaki, Fumio. / Distribution of dehalogenation activity in subseafloor sediments of the Nankai Trough subduction zone. Julkaisussa: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 2013 ; Vuosikerta 368, Nro 1616. Sivut 1-15.

George Abraham, Bobin ; Tkachenko, Nikolai V. ; Santala, Ville ; Lemmetyinen, Helge ; Karp, Matti. / Bidirectional fluorescence resonance energy transfer (FRET) in mutated and chemically modified yellow fluorescent protein (YFP). Julkaisussa: Bioconjugate Chemistry. 2011 ; Vuosikerta 22, Nro 2. Sivut 227-234.

George Abraham, Bobin. / Fluorescent Protein Toolbox : Protein Engineering Broadens the Range of in vitro and in vivo Applications of Fluorescent Proteins. Tampere University of Technology, 2015. 92 Sivumäärä (Tampere University of Technology. Publication).

Gramp, Jonathan P. ; Bigham, Jerry M. ; Jones, F. Sandy ; Tuovinen, Olli H. / Formation of Fe-sulfides in cultures of sulfate-reducing bacteria. Julkaisussa: Journal of Hazardous Materials. 2010 ; Vuosikerta 175, Nro 1-3. Sivut 1062-1067.

Guglielmetti, Simone ; Balzaretti, Silvia ; Taverniti, Valentina ; Miriani, Matteo ; Milani, Christian ; Scarafoni, Alessio ; Corona, Silvia ; Ciranna, Alessandro ; Arioli, Stefania ; Santala, Ville ; Iametti, Stefania ; Bonomi, Francesco ; Ventura, Marco ; Mora, Diego ; Karp, Matti. / TgaA, a VirB1-like component belonging to a putative type IV secretion system of Bifidobacterium bifidum MIMBb75. Julkaisussa: Applied and Environmental Microbiology. 2014 ; Vuosikerta 80, Nro 17. Sivut 5161-5169.

Guglielmetti, Simone ; Taverniti, Valentina ; Minuzzo, Mario ; Arioli, Stefania ; Zanoni, Ivan ; Stuknyte, Milda ; Granucci, Francesca ; Karp, Matti ; Mora, Diego. / A dairy bacterium displays in vitro probiotic propesties for the pharyngeal mucosa by antagonizing group a streptococci and modulating the immune response. Julkaisussa: Infection and Immunity. 2010 ; Vuosikerta 78, Nro 11. Sivut 4734-4743.

Guglielmetti, Simone ; Taverniti, Valentina ; Minuzzo, Mario ; Arioli, Stefania ; Stuknyte, Milda ; Karp, Matti ; Mora, Diego. / Oral bacteria as potential probiotics for the pharyngeal mucosa. Julkaisussa: Applied and Environmental Microbiology. 2010 ; Vuosikerta 76, Nro 12. Sivut 3048-3058.

Guglielmetti, Simone ; Zanoni, Ivan ; Balzaretti, Silvia ; Miriani, Matteo ; Taverniti, Valentina ; de Noni, Ivano ; Presti, Ilaria ; Stuknyte, Milda ; Scarafoni, Alessio ; Arioli, Stefania ; Iametti, Stefania ; Bonomi, Francesco ; Mora, Diego ; Karp, Matti ; Granucci, Francesca. / Murein lytic enzyme TgaA of Bifidobacterium bifidum MIMBb75 modulates dendritic cell maturation through its cysteine- and histidine-dependent amidohydrolase/peptidase (CHAP) amidase domain. Julkaisussa: Applied and Environmental Microbiology. 2014 ; Vuosikerta 80, Nro 17. Sivut 5170-5177.

Gumulya, Yosephine ; Boxall, Naomi J. ; Khaleque, Himel N. ; Santala, Ville ; Carlson, Ross P. ; Kaksonen, Anna H. / In a quest for engineering acidophiles for biomining applications : Challenges and opportunities. Julkaisussa: Genes. 2018 ; Vuosikerta 9, Nro 2.

Halinen, Anna-Kaisa ; Beecroft, Nelli J. ; Määttä, Kirsi ; Nurmi, Pauliina ; Laukkanen, Katja ; Kaksonen, Anna H. ; Riekkola-Vanhanen, Marja ; Puhakka, Jaakko A. / Microbial community dynamics during a demonstration-scale bioheap leaching operation. Julkaisussa: Hydrometallurgy. 2012 ; Vuosikerta 125-126. Sivut 34-41.

Hänninen, Aleksi ; Salpavaara, Timo ; Lyyra, Inari ; Kroon, Mart ; Lekkala, Jukka ; Kellomäki, Minna. / Bioresorbable Conductive Wire with Minimal Metal Content. Julkaisussa: ACS Biomaterials Science & Engineering. 2018 ; Vuosikerta 5, Nro 2. Sivut 1134-1140.

Hassan, Syeda Sakira ; Farhan, Muhammad ; Mangayil, Rahul ; Huttunen, Heikki ; Aho, Tommi. / Bioprocess data mining using regularized regression and random forests. Julkaisussa: BMC Systems Biology. 2013 ; Vuosikerta 7, Nro Suppl 1.

Heiskanen, J. P. ; Manninen, V. M. ; Pankov, D. ; Omar, W. A. E. ; Kastinen, T. ; Hukka, T. I. ; Lemmetyinen, H. J. ; Hormi, O. E. O. / Aryl end-capped quaterthiophenes applied as anode interfacial layers in inverted organic solar cells. Julkaisussa: Thin Solid Films. 2015 ; Vuosikerta 574. Sivut 196-206.

Höhn, J. ; Lehtonen, E. ; Rasi, S. ; Rintala, J. / A geographical information system (GIS) based methodology for determination of potential biomasses and sites for biogas plants in southern Finland. Julkaisussa: Applied Energy. 2014 ; Vuosikerta 113. Sivut 1-10.

Hulatt, Chris J. ; Lakaniemi, Aino-Maija ; Puhakka, Jaakko A. ; Thomas, David N. / Energy Demands of Nitrogen Supply in Mass Cultivation of Two Commercially Important Microalgal Species, Chlorella vulgaris and Dunaliella tertiolecta. Julkaisussa: BioEnergy Research. 2012 ; Vuosikerta 5, Nro 3. Sivut 669-684.

Işildar, Arda ; van de Vossenberg, Jack ; Rene, Eldon R. ; van Hullebusch, Eric D. ; Lens, Piet N L. / Two-step bioleaching of copper and gold from discarded printed circuit boards (PCB). Julkaisussa: Waste Management. 2016 ; Vuosikerta 57. Sivut 149–157.

Isohanni, Pauliina ; Huehn, Stephan ; Aho, Tommi ; Alter, Thomas ; Lyhs, Ulrike. / Heat stress adaptation induces cross-protection against lethal acid stress conditions in Arcobacter butzleri but not in Campylobacter jejuni. Julkaisussa: Food Microbiology. 2013 ; Vuosikerta 34, Nro 2. Sivut 431-435.

Jaatinen, Sanna ; Lakaniemi, Aino-Maija ; Rintala, Jukka. / Use of diluted urine for cultivation of Chlorella vulgaris. Julkaisussa: Environmental Technology. 2016 ; Vuosikerta 37, Nro 9. Sivut 1159-1170.

Jäntti, Ville ; Ylinen, Tuomo ; Subramaniyam, Narayan Puthanmadam ; Kamata, Kotoe ; Yli-Hankala, Arvi ; Kauppinen, Pasi ; Sonkajärvi, Eila. / Electroencephalographic signals during anesthesia recorded from surface and depth electrodes. Julkaisussa: International Journal of Radiation Biology. 2018 ; Vuosikerta 94, Nro 10. Sivut 934-943.

Jokela, Petri ; Lepistö, Raghida. / Lamella dissolved air flotation treatment of fish farming effluents as a part of an integrated farming and effluent treatment concept. Julkaisussa: Environmental Technology. 2014 ; Vuosikerta 35, Nro 21. Sivut 2727-2733.

Kaartinen, Tommi ; Sormunen, Kai ; Rintala, Jukka. / Case study on sampling, processing and characterization of landfilled municipal solid waste in the view of landfill mining. Julkaisussa: Journal of Cleaner Production. 2013 ; Vuosikerta 55. Sivut 56-66.

Kaartinen, Tommi ; Laine-Ylijoki, Jutta ; Ahoranta, Sarita ; Korhonen, Tero ; Neitola, Raisa. / Arsenic Removal from Mine Waters with Sorption Techniques. Julkaisussa: Mine Water and the Environment. 2017 ; Vuosikerta 36, Nro 2. Sivut 199-208.

Kainulainen, Tuomo P. ; Sirviö, Juho A. ; Sethi, Jatin ; Hukka, Terttu I. ; Heiskanen, Juha P. / UV-Blocking Synthetic Biopolymer from Biomass-Based Bifuran Diester and Ethylene Glycol. Julkaisussa: Macromolecules. 2018 ; Vuosikerta 51, Nro 5. Sivut 1822-1829.

Kaksonen, Anna H. ; Robertson, W.J. ; Plumb, J.J. ; Wylie, J.T. ; Bastow, T.P. ; Douglas, G.B. ; Franzmann, P.D. ; Nevatalo, Laura ; Sahinkaya, H. ; Auvinen, H. ; Mäkinen, Annukka ; Lakaniemi, Aino-Maija ; Lavonen, Leena ; Kolli, Kristiina ; Özkaya, Bestemin ; Puhakka, Jaakko. / Sulfate-reducing fluidized-bed bioreactor processes for acidic metal- and sulfate-containing waters. SME Annual Meeting Feb. 28-Mar. 03, 2010, Phoenix, AZ, USA. 2010. Sivut 1-6

Kaksonen, Anna H. ; Lavonen, Leena ; Kuusenaho, Mari ; Kolli, Anni ; Närhi, Heli ; Vestola, Elina ; Puhakka, Jaakko A. ; Tuovinen, Olli H. / Bioleaching and recovery of metals from final slag waste of the copper smelting industry. Julkaisussa: Minerals Engineering. 2011 ; Vuosikerta 24, Nro 11. Sivut 1113-1121.

Kaksonen, Anna H. ; Särkijärvi, Silja ; Puhakka, Jaakko A. ; Peuraniemi, Esa ; Junnikkala, Saku ; Tuovinen, Olli H. / Chemical and bacterial leaching of metals from a smelter slag in acid solutions. Julkaisussa: Hydrometallurgy. 2016 ; Vuosikerta 159. Sivut 46-53.

Kaksonen, Anna H. ; Särkijärvi, Silja ; Peuraniemi, Esa ; Junnikkala, Saku ; Puhakka, Jaakko A. ; Tuovinen, Olli H. / Metal biorecovery in acid solutions from a copper smelter slag. Julkaisussa: Hydrometallurgy. 2017 ; Vuosikerta 168. Sivut 135-140.

Kaksonen, Anna H. ; Särkijärvi, Silja ; Puhakka, Jaakko A. ; Peuraniemi, Esa ; Junnikkala, Saku ; Tuovinen, Olli H. / Solid phase changes in chemically and biologically leached copper smelter slag. Julkaisussa: Minerals Engineering. 2017 ; Vuosikerta 106. Sivut 97-101.

Kandhavelu, M. ; Paturu, L. ; Mizar, A. ; Mahmudov, K.T. ; Kopylovich, M.N. ; Karp, M. ; Yli-Harja, O. ; Pombeiro, A.J.L. ; Ribeiro, Andre S. / Synthesis, characterization and antimicrobial activity of arylhydrazones of methylene active compounds. Julkaisussa: Pharmaceutical Chemistry Journal. 2012 ; Vuosikerta 46, Nro 3. Sivut 157-164.

Kannisto, Matti ; Aho, Tommi ; Karp, Matti ; Santala, Ville. / Metabolic engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for improved growth on gluconate and glucose. Julkaisussa: Applied and Environmental Microbiology. 2014 ; Vuosikerta 80, Nro 22. Sivut 7021-7027.

Kannisto, Matti ; Efimova, Elena ; Karp, Matti ; Santala, Ville. / Growth and wax ester production of an Acinetobacter baylyi ADP1 mutant deficient in exopolysaccharide capsule synthesis. Julkaisussa: Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 2016 ; Sivut 1-7.

Kaparaju, Prasad ; Rintala, Jukka. / Generation of heat and power from biogas for stationary applications: boilers, gas engines and turbines, combined heat and power (CHP) plants and fuel cells. The biogas handbook: Science, production and applications. Toimittaja / Arthur Wellinger ; Jerry Murphy ; David Baxter. Woodhead Publishing, 2013. Sivut 404-427

Kaparaju, Prasad ; Rasi, Saija ; Rintala, Jukka. / Biogas upgrading and compression. Bioenergy Production by Anaerobic Digestion: Using Agricultural Biomass and Organic Wastes. Toimittaja / Nicholas E. Korres ; Padraig O´Kiely ; John A.H. Benzie ; Jonathan S. West. London : Routledge, 2013. Sivut 152-182

Karadag, Dogan ; Puhakka, Jaakko A. / Effect of changing temperature on anaerobic hydrogen production and microbial community composition in an open-mixed culture bioreactor. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2010 ; Vuosikerta 35, Nro 20. Sivut 10954-10959.

Karadag, Dogan ; Puhakka, Jaakko A. / Enhancement of anaerobic hydrogen production by iron and nickel. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2010 ; Vuosikerta 35, Nro 16. Sivut 8554-8560.

Karadag, Dogan ; Özkaya, Bestami ; Ölmez, Esra ; Nissilä, Marika E. ; CakmakCi, Mehmet ; Yildiz, Senol ; Puhakka, Jaakko A. / Profiling of bacterial community in a full-scale aerobic composting plant. Julkaisussa: International Biodeterioration and Biodegradation. 2013 ; Vuosikerta 77. Sivut 85-90.

Karadag, Dogan ; Puhakka, Jaakko A. / Direction of glucose fermentation towards hydrogen or ethanol production through on-line pH control. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2010 ; Vuosikerta 35, Nro 19. Sivut 10245-10251.

Karp, M T ; Hemmilä, I ; Mäntsälä, P I ; Suominen, A. I. / Time-resolved europium fluorescence in enzyme activity measurements : a sensitive protease assay. Julkaisussa: Journal of applied biochemistry. 1983 ; Vuosikerta 5, Nro 6. Sivut 399-403.

Karp, Matti T. ; Raunio, Raimo P. ; Lövgren, Timo N-E. / Simultaneous extraction and combined bioluminescent assay of NAD+ and NADH. Julkaisussa: ANALYTICAL BIOCHEMISTRY. 1983 ; Vuosikerta 128, Nro 1. Sivut 175-180.

Keipi, Tiina ; Tolvanen, Katariina E.S. ; Tolvanen, Henrik ; Konttinen, Jukka. / Thermo-catalytic decomposition of methane : The effect of reaction parameters on process design and the utilization possibilities of the produced carbon. Julkaisussa: Energy Conversion and Management. 2016 ; Vuosikerta 126. Sivut 923-934.

Kinnunen, H.V. ; Koskinen, P.E.P. ; Rintala, J. / Mesophilic and thermophilic anaerobic laboratory-scale digestion of Nannochloropsis microalga residues. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2014 ; Vuosikerta 155. Sivut 314-322.

Kivistö, Anniina ; Santala, Ville ; Karp, Matti. / Hydrogen production from glycerol using halophilic fermentative bacteria. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2010 ; Vuosikerta 101. Sivut 8671-8677.

Kivistö, Anniina ; Larjo, Antti ; Ciranna, Alessandro ; Santala, Ville ; Roos, Christophe ; Karp, Matti. / Genome Sequence of Halanaerobium saccharolyticum subsp. saccharolyticum Strain DSM 6643T, a Halophilic Hydrogen-Producing Bacterium. Julkaisussa: Genome Announcements. 2013 ; Vuosikerta 1, Nro 2. Sivut 1-2.

Kivistö, Anniina ; Santala, Ville ; Karp, Matti. / Non-sterile process for biohydrogen and 1,3-propanediol production from raw glycerol. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2013 ; Vuosikerta 38, Nro 27. Sivut 11749-11755.

Kivistö, Anniina ; Santala, Ville ; Karp, Matti. / 1,3-Propanediol production and tolerance of a halophilic fermentative bacterium, Halanaerobium saccharolyticum subsp saccharolyticum. Julkaisussa: Journal of Biotechnology. 2012 ; Vuosikerta 158, Nro 4. Sivut 242-247.

Kivistö, Anniina ; Santala, Ville ; Karp, Matti. / Closing the 1,3-propanediol route enhances hydrogen production from glyserol by Halanaerobium saccharolyticum subsp. saccharolyticum. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2011 ; Vuosikerta 36, Nro 12. Sivut 7074-7080.

Kivistö, Anniina ; Karp, Matti T. / Halophilic anaerobic fermentative bacteria: Review. Julkaisussa: Journal of Biotechnology. 2011 ; Vuosikerta 152, Nro 4. Sivut 114-124.

Kivistö, Anniina ; Santala, Ville ; Karp, Matti. / Biohydrogen and 1,3-Propanediol production using halophilic fermentative bacteria. ESF-Bielefeld-CeBiTec Conference, Microbes and Industrial Biotechnology, Bielefeld, Germany, 21-24 November 2010, Booklet of Abstracts. 2010. Sivut 21-21

Kolehmainen, Raija E. ; Crochet, Ludivine M. ; Kortelainen, Nina M. ; Langwaldt, Jörg H. ; Puhakka, Jaakko A. / Biodegradation of aqueous organic matter over seasonal changes: bioreactor experiments with indigenous lake water bacteria. Julkaisussa: Journal of Environmental Engineering: ASCE. 2010 ; Vuosikerta 136, Nro 6. Sivut 607-615.

Köroglu, Emre Oguz ; Yilmaz Baysoy, Derya ; Cetinkaya, Afsin Y. ; Özkaya, Bestamin ; Cakmakci, Mehmet. / Novel design of a multitube microbial fuel cell (UM2FC) for energy recovery and treatment of membrane concentrates. Julkaisussa: Biomass & Bioenergy. 2014 ; Vuosikerta 69. Sivut 58-65.

Korpela, Matti T. ; Kurittu, Jussi S. ; Karvinen, Jarkko T. ; Karp, Matti T. / A recombinant Escherichia coli sensor strain for the detection of tetracyclines. Julkaisussa: Analytical Chemistry. 1998 ; Vuosikerta 70, Nro 21. Sivut 4457-4462.

Kumar, G. ; Lay, Chyi-How ; Chu, C.-Y. ; Wu, J.-H. ; Lee, S.-C. ; Lin, C.-Y. / Seed inocula for biohydrogen production from biodiesel solid residues. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2012 ; Vuosikerta 37, Nro 29. Sivut 15489-15495.

Lakaniemi, Aino-Maija ; Tuovinen, Olli H. ; Puhakka, Jaakko A. / Production of Electricity and Butanol from Microalgal Biomass in Microbial Fuel Cells. Julkaisussa: BioEnergy Research. 2012 ; Vuosikerta 5, Nro 2. Sivut 481-491.

Lakaniemi, Aino-Maija ; Nevatalo, Laura M ; Kaksonen, Anna H. ; Puhakka, Jaakko A. / Mine wastewater treatment using Phalaris arundinacea plant material hydrolyzate as substrate for sulfate-reducing bioreactor. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2010 ; Vuosikerta 101, Nro 11. Sivut 3931-3939.

Lakaniemi, Aino-Maija ; Intihar, Veera M. ; Tuovinen, Olli H. ; Puhakka, Jaakko A. / Growth of Dunaliella tertiolecta and associated bacteria in photobioreactors. Julkaisussa: Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 2012 ; Vuosikerta 39, Nro 9. Sivut 1357-1365.

Lakaniemi, Aino-Maija ; Intihar, Veera M. ; Tuovinen, Olli H. ; Puhakka, Jaakko A. / Growth of Chlorella vulgaris and associated bacteria in photobioreactors. Julkaisussa: Microbial Biotechnology. 2012 ; Vuosikerta 5, Nro 1. Sivut 69-78.

Lakaniemi, Aino-Maija ; Koskinen, Perttu E.P. ; Nevatalo, Laura M. ; Kaksonen, Anna H. ; Puhakka, Jaakko A. / Biogenic hydrogen and methane production from reed canary grass. Julkaisussa: Biomass & Bioenergy. 2011 ; Vuosikerta 35, Nro 2. Sivut 773-780.

Lakaniemi, Aino-Maija ; Tuovinen, Olli H. ; Puhakka, Jaakko A. / Anaerobic conversion of microalgal biomass to sustainable energy carriers - A review. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2013 ; Vuosikerta 135, Nro May. Sivut 222-231.

Lakaniemi, Aino-Maija ; Hulatt, Chris J. ; Wakeman, Kathryn D. ; Thomas, David N. ; Puhakka, Jaakko A. / Eukaryotic and prokaryotic microbial communities during microalgal biomass production. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2012 ; Vuosikerta 124, Nro November. Sivut 387-393.

Lakaniemi, Aino-Maija ; Hulatt, Christopher J. ; Thomas, David N. ; Tuovinen, Olli H. ; Puhakka, Jaakko A. / Biogenic hydrogen and methane production from Chlorella vulgaris and Dunaliella tertiolecta biomass. Julkaisussa: Biotechnology for Biofuels. 2011 ; Vuosikerta 4, Nro 1. Sivut 1-12.

Läntelä, J. ; Rasi, S. ; Lehtinen, J. ; Rintala, Jukka. / Landfill gas upgrading with pilot-scale water scrubber: Performance assessment with adsorption water recycling. Julkaisussa: Applied Energy. 2012 ; Vuosikerta 92, Nro April. Sivut 307-314.

Lappalainen, Juha O. ; Karp, Matti T. ; Juvonen, Risto ; Virta, Marko P. J. ; Nurmi, Johanna. / Comparison of the total mercury content in sediment samples with a mercury sensor bacteria test and Vibrio fischeri toxicity test. Julkaisussa: Environmental Toxicology. 2000 ; Vuosikerta 15, Nro 5. Sivut 443-448.

Lay, Chyi-How ; Sen, Biswarup ; Chen, Chin-Chao ; Wu, Jou-Hsien ; Lee, Shih-Chi ; Lin, Chiu-Yue. / Co-fermentation of water hyacinth and beverage wastewater in powder and pellet form for hydrogen production. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2013 ; Vuosikerta 135. Sivut 610-615.

Lehtinen, Tapio ; Efimova, Elena ; Tremblay, Pier Luc ; Santala, Suvi ; Zhang, Tian ; Santala, Ville. / Production of long chain alkyl esters from carbon dioxide and electricity by a two-stage bacterial process. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2017 ; Vuosikerta 243. Sivut 30-36.

Lehtinen, Tapio ; Efimova, Elena ; Santala, Suvi ; Santala, Ville. / Improved fatty aldehyde and wax ester production by overexpression of fatty acyl-CoA reductases. Julkaisussa: Microbial Cell Factories. 2018 ; Vuosikerta 17, Nro 1.

Lehtinen, Tapio ; Virtanen, Henri ; Santala, Suvi ; Santala, Ville. / Production of alkanes from CO2 by engineered bacteria. Julkaisussa: Biotechnology for Biofuels. 2018 ; Vuosikerta 11.

Lehtinen, Tapio. / Solar Fuels and Chemicals : Engineering Bacterial Platform for the Production of Long-Chain Hydrocarbons from Carbon Dioxide and Electricity. Tampere University of Technology, 2018. 75 Sivumäärä (Tampere University of Technology. Publication).

Li, Ya-Chieh ; Nissilä, Marika E. ; Wu, Shu-Yii ; Lin, Chiu-Yue ; Puhakka, Jaakko A. / Silage as source of bacteria and electrons for dark fermentative hydrogen production. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2012 ; Vuosikerta 37, Nro 20. Sivut 15518-15524.

Li, Chun ; Blencke, Hans-Matti ; Smith, L.Courtney ; Karp, Matti T. ; Stensvåg, Klara. / Two recombinant peptides, SpStrongylocins 1 and 2, from Strongylocentrotus purpuratus, show antimicrobial activity against Gram-positive and Gram-negative bacteria. Julkaisussa: Developmental and Comparative Immunology. 2010 ; Vuosikerta 34, Nro 3. Sivut 286-292.

Lindsasy, Matthew B.J. ; Wakeman, Kathryn D. ; Rowe, Owen F. ; Grail, Barry M. ; Ptacek, Carol J. ; Blowes, David W. ; Johnson, D. Barrie. / Microbiology and geochemistry of mine tailings amended with organic carbon for passive treatment of pore water. Julkaisussa: Geomicrobiology Journal. 2011 ; Vuosikerta 28, Nro 3. Sivut 229-241.

L.K. Sulonen, Mira ; Lakaniemi, Aino-Maija ; Kokko, Marika E. ; Puhakka, Jaakko A. / The effect of anode potential on bioelectrochemical and electrochemical tetrathionate degradation. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2017 ; Vuosikerta 226. Sivut 173-180.

Mäkinen, Annukka E. ; Lay, Chyi-How ; Nissilä, Marika E. ; Puhakka, Jaakko A. / Bioelectricity production on xylose with a compost enrichment culture. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2013 ; Vuosikerta 38, Nro 35. Sivut 15606-15612.

Mäkinen, Annukka E. ; Nissilä, Marika E. ; Puhakka, Jaakko A. / Dark fermentative hydrogen production from xylose by a hot spring enrichment culture. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2012 ; Vuosikerta 37, Nro 17. Sivut 12234-12240.

Mal, J. ; Nancharaiah, Y. V. ; Van Hullebusch, E. D. ; Lens, P. N. L. / Metal chalcogenide quantum dots : Biotechnological synthesis and applications. Julkaisussa: RSC Advances. 2016 ; Vuosikerta 6, Nro 47. Sivut 41477-41495.

Mangayil, Rahul ; Karp, Matti ; Santala, Ville. / Bioconversion of crude glycerol from biodiesel production to hydrogen. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2012 ; Vuosikerta 37, Nro 17. Sivut 12198-12204.

Mangayil, Rahul. / Biohydrogen Production: A Protein to Community Level Perspective Study. Tampere University of Technology, 2015. 89 Sivumäärä (Tampere University of Technology. Publication).

Mangayil, Rahul ; Aho, Tommi ; Karp, Matti ; Santala, Ville. / Improved bioconversion of crude glycerol to hydrogen by statistical optimization of media components. Julkaisussa: Renewable Energy. 2015 ; Vuosikerta 75. Sivut 583-589.

Mangayil, Rahul ; Santala, Ville ; Karp, Matti. / Fermentative hydrogen production from different sugars by Citrobacter sp. CMC-1 in batch culture. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2011 ; Vuosikerta 36. Sivut 15187-15194.

Männistö, Noora M. ; Ahola, Niina ; Karp, Matti T. ; Veiranto, Minna ; Kellomäki, Minna. / In vitro bioluminescence used as a method for real-time inhibition zone testing for antibiotic-releasing composites. Julkaisussa: British Microbiology Research Journal. 2014 ; Vuosikerta 4, Nro 2. Sivut 235-254.

Marjakangas, Jatta M. ; Lakaniemi, Aino Maija ; Koskinen, Perttu E. P. ; Chang, Jo Shu ; Puhakka, Jaakko A. / Lipid production by eukaryotic microorganisms isolated from palm oil mill effluent. Julkaisussa: Biochemical Engineering Journal. 2015 ; Vuosikerta 99. Sivut 48-54.

Marjakangas, Jatta M. ; Chen, Chun Yen ; Lakaniemi, Aino Maija ; Puhakka, Jaakko A. ; Whang, Liang Ming ; Chang, Jo Shu. / Simultaneous nutrient removal and lipid production with Chlorella vulgaris on sterilized and non-sterilized anaerobically pretreated piggery wastewater. Julkaisussa: Biochemical Engineering Journal. 2015 ; Vuosikerta 103. Sivut 177-184.

Marjakangas, Jatta M. ; Chen, Chun-Yen ; Lakaniemi, Aino-Maija ; Puhakka, Jaakko A. ; Whang, Liang-Ming ; Chang, Jo-Shu. / Selecting an indigenous microalgal strain for lipid production in anaerobically treated piggery wastewater. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2015 ; Vuosikerta 191. Sivut 369-376.

Mehrang, Saeed ; Jauhiainen, Milla ; Pietilä, Julia ; Puustinen, Juha ; Ruokolainen, Jari ; Nieminen, Hannu. / Identification of Parkinson's Disease Utilizing a Single Self-recorded 20-step Walking Test Acquired by Smartphone's Inertial Measurement Unit. 40th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, EMBC 2018. Vuosikerta 2018-July Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., 2018. Sivut 2913-2916

Nancharaiah, Yarlagadda V. ; Lens, Piet N. L. / Selenium biomineralization for biotechnological applications. Julkaisussa: Trends in Biotechnology. 2015 ; Vuosikerta 33, Nro 6. Sivut 323-330.

Nancharaiah, Y. V. ; Venkata Mohan, S. ; Lens, P.N.L. / Metals removal and recovery in bioelectrochemical systems : A review. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2015 ; Vuosikerta 195. Sivut 102-114.

Nevatalo, Laura M. ; Bijmans, Martin F.M. ; Lens, Piet N.L. ; Kaksonen, Anna H. ; Puhakka, Jaakko A. / The effect of sub-optimal temperature on specific sulfidogenic activity of mesophilic SRB in an H2-fed membrane bioreactor. Julkaisussa: Process Biochemistry. 2010 ; Vuosikerta 45, Nro 3. Sivut 363-368.

Nevatalo, Laura M. ; Mäkinen, Annukka E. ; Kaksonen, Anna H. ; Puhakka, Jaakko A. / Biological hydrogen slufide production in an ethanol-lactate fed fluidized-bed bioreactor. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2010 ; Vuosikerta 101, Nro 1. Sivut 276-284.

Nevatalo, Laura M. ; Bijmans, Martin F.M. ; Lens, Piet N.L. ; Kaksonen, Anna H. ; Puhakka, Jaakko A. / Hydrogenotrophic sulfate reduction in a gas-lift bioreactor operated at 9°C. Julkaisussa: Journal of Microbiology and Biotechnology. 2010 ; Vuosikerta 20, Nro 3. Sivut 615-621.

Nevatalo, Laura. / Bioreactor applications utilizing mesophilic sulfate-reducing bacteria for treatment of mine wastewaters at 9-35 oC. Tampere : Tampere University of Technology, 2010. 92 Sivumäärä (Tampere University of Technology. Publication).

Nissilä, Marika E. ; Lay, Chyi-How ; Puhakka, Jaakko A. / Dark fermentative hydrogen production from lignocellulosic hydrolyzates - A review. Julkaisussa: Biomass & Bioenergy. 2014 ; Vuosikerta 67. Sivut 145-159.

Nissilä, Marika E. ; Li, Ya-Chieh ; Wu, Shu-Yii ; Lin, Chiu-Yue ; Puhakka, Jaakko A. / Hydrogenic and methanogenic fermentation of birch and conifer pulps. Julkaisussa: Applied Energy. 2012 ; Vuosikerta 100, Nro December. Sivut 58-65.

Nissilä, Marika E. ; Li, Ya-Chieh ; Wu, Shu-Yi ; Puhakka, Jaakko A. / Dark fermentative hydrogen production from neutralized acid hydrolysates of conifer pulp. Julkaisussa: Applied Biochemistry and Biotechnology. 2012 ; Vuosikerta 168, Nro 8. Sivut 2160-2169.

Nissilä, Marika E. ; Tähti, Hanne P. ; Rintala, Jukka A. ; Puhakka, Jaakko A. / Thermophilic hydrogen production from cellulose with rumen fluid enrichment cultures: Effects of different heat treatments. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2011 ; Vuosikerta 36, Nro 2. Sivut 1482-1490.

Nissilä, Marika E. ; Tähti, Hanne P. ; Rintala, Jukka A. ; Puhakka, Jaakko A. / Effects of heat treatment on hydrogen production potential and microbial community of thermophilic compost enrichment cultures. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2011 ; Vuosikerta 102, Nro 6. Sivut 4501-4506.

Nissilä, M.E. ; Sulonen, M.L.K. ; Puhakka, J.A. / Enrichment of electrogens on xylose from anaerobi digester sample. Proceedings of 13th World Congress on Anaerobic Digestion, 25th-28th June 2013, Santiago de Compostela, Spain. IWA International Water Association, 2013. (Anaerobic Digestion World Congress).

Nurmi, Pauliina ; Özkaya, Bestamin ; Kaksonen, Anna H. ; Tuovinen, Olli H. ; Puhakka, Jaakko A. / Predictive modelling of Fe(III) precipitation in iron removal process for bioleaching circuits. Julkaisussa: Bioprocess and Biosystems Engineering. 2010 ; Vuosikerta 33, Nro 4. Sivut 449-456.

Nurmi, Pauliina ; Özkaya, Bestamin ; Sasaki, Keiko ; Kaksonen, Anna H. ; Riekkola-Vanhanen, Marja ; Tuovinen, Olli H. ; Puhakka, Jaakko A. / Biooxidation and precipitation for iron and sulfate removal from heap bioleaching effluent streams. Julkaisussa: Hydrometallurgy. 2010 ; Vuosikerta 101, Nro 1-2. Sivut 7-14.

Nybond, Susanna ; Karp, Matti ; Tammela, Päivi. / Antimicrobial assay optimization and validation for HTS in 384-well format using a bioluminescent E. coli K-12 strain. Julkaisussa: European Journal of Pharmaceutical Sciences. 2013 ; Vuosikerta 49, Nro 4. Sivut 782-789.

Nybond, Susanna ; Karp, Matti ; Yrjönen, Teijo ; Tammela, Päivi. / Bioluminescent whole-cell reporter gene assays as screening tools in the identification of antimicrobial natural product extracts. Julkaisussa: Journal of Microbiological Methods. 2015 ; Vuosikerta 114. Sivut 54-56.

Nybond, Susanna ; Ghemtio, Leo ; Nawrot, Dorota A. ; Karp, Matti ; Xhaard, Henri ; Tammela, Päivi. / Integrated in vitro-in silico screening strategy for the discovery of antibacterial compounds. Julkaisussa: Assay and Drug Development Technologies. 2015 ; Vuosikerta 13, Nro 1. Sivut 25-33.

Ojala, Johanna ; Wakeman, Kathryn ; Määttä, Kirsi ; Tiirola, Marja ; Puhakka, Jaakko. / TEVA-tutkimusprojekti jatkaa tekopohjavesitiedon täydentämistä. Julkaisussa: Vesitalous. 2010 ; Nro 5. Sivut 22-25.

Okonkwo, Onyinye ; Lakaniemi, Aino-Maija ; Santala, Ville ; Karp, Matti ; Mangayil, Rahul. / Quantitative Real-time PCR Monitoring Dynamics Of Thermotoga Neapolitana In Synthetic Co-Culture For Biohydrogen Production. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2018 ; Vuosikerta 43, Nro 6. Sivut 3133-3141.

Özkaya, Bestamin ; Cetinkaya, Afsin Yusuf ; Cakmakci, Mehmet ; Karadag, Dogan ; Sahinkaya, Erkan. / Electricity generation from young landfill leachate in a microbial fuel cell with a new electrode material. Julkaisussa: Bioprocess and Biosystems Engineering. 2013 ; Vuosikerta 36, Nro 4. Sivut 399-405.

Özkaya, Bestamin ; Akoglu, Busra ; Karadag, Dogan ; Aci, Gökcen ; Taskan, Ergin ; Hasar, Halil. / Bioelectricity production using a new electrode in a microbial fuel cell. Julkaisussa: Bioprocess and Biosystems Engineering. 2012 ; Vuosikerta 35, Nro 7. Sivut 1219-1227.

Papirio, S. ; Ylinen, A. ; Zou, G. ; Peltola, M. ; Esposito, G. ; Puhakka, J.A. / Fluidized-bed denitrification for mine waters. Part I: low pH and temperature operation. Julkaisussa: BIODEGRADATION. 2013 ; Sivut 1-11.

Papirio, S. ; Zou, G. ; Ylinen, A. ; Di Capua, F. ; Pirozzi, F. ; Puhakka, J.A. / Effect of arsenic on nitrification of simulated mining water. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2014 ; Vuosikerta 164. Sivut 149-154.

Papirio, Stefano. / Fluidized-bed bioreactor applications for the treatment of metal-, sulfate- and nitrate-contaminated mine waters. Università degli Studi di Cassino e del Lazio Meridionale, 2012. (Università degli Studi di Cassino e del Lazio Meridionale).

Pikkemaat, M.G. ; Rapallini, M.L.B.A. ; Karp, Matti T. ; Elferink, J.W.A. / Application of a luminescent bacterial biosensor for the detection of tetracyclines in routine analysis of poultry muscle samples. Julkaisussa: Food Additives and Contaminants Part A: Chemistry Analysis Control Exposure and Risk Assessment. 2010 ; Vuosikerta 27, Nro 8. Sivut 1112-1117.

Privalova, E. ; Rasi, Saija ; Mäki-Arvela, P. ; Eränen, K. ; Rintala, Jukka ; Murzin, D. Yu. ; Mikkola, J.-P. / CO2 capture from biogas : absorbent selection. Julkaisussa: RSC Advances. 2013 ; Vuosikerta 3, Nro 9. Sivut 2979-2994.

Puhakka, Jaakko. / IEA-HIA Task Semiannual Report 2010 from Finland. IEA, 2011. 4 Sivumäärä

Puhakka, Jaakko A. ; Karadag, Dogan ; Nissilä, Marika E. / Comparison of mesophilic and thermophilic anaerobic hydrogen production by hot spring enrichment culture. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2012 ; Vuosikerta 37, Nro 21. Sivut 16453-16459.

Raghuwanshi, Sanjeev ; Deswal, Deepa ; Karp, Matti ; Kuhad, Ramesh Chander. / Bioprocessing of enhanced cellulase production from a mutant of Trichoderma asperellum RCK2011 and its application in hydrolysis of cellulose. Julkaisussa: Fuel. 2014 ; Vuosikerta 124. Sivut 183-189.

Rasi, S. ; Seppälä, M. ; Rintala, J. / Organic silicon compounds in biogases produced from grass silage, grass and maize in laboratory batch assays. Julkaisussa: Energy. 2013 ; Vuosikerta 52. Sivut 137-142.

Rasi, S. ; Läntelä, J. ; Rintala, J. / Upgrading landfill gas using a high pressure water absorption process. Julkaisussa: Fuel. 2014 ; Vuosikerta 115. Sivut 539-543.

Rismani-Yazdi, Hamid ; Carver, Sarah M. ; Christy, Ann D. ; Yu, Zhongtang ; Bibby, Kyle ; Peccia, Jordan ; Tuovinen, Olli H. / Suppression of methanogenesis in cellulose-fed microbial fuel cells in relation to performance, metabolite formation, and microbial population. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2013 ; Vuosikerta 129. Sivut 281-288.

Rosholm, Tomi ; Gois, Pedro M. P. ; Franzen, Robert ; R. Candeias, Nuno. / Glycerol as an Efficient Medium for the Petasis Borono-Mannich Reaction. Julkaisussa: Chemistryopen. 2015 ; Vuosikerta 4, Nro 1. Sivut 39-46.

Ryynänen, Tomi ; Pekkanen-Mattila, Mari ; Shah, Disheet ; Kreutzer, Joose ; Kallio, Pasi ; Lekkala, Jukka ; Aalto-Setälä, Katriina. / Microelectrode array for noninvasive analysis of cardiomyocytes at the single-cell level. Julkaisussa: Japanese Journal of Applied Physics. 2018 ; Vuosikerta 57, Nro 11.

Salmela, Milla ; Sanmark, Hanna ; Efimova, Elena ; Efimov, Alexander ; Hytönen, Vesa P. ; Lamminmäki, Urpo ; Santala, Suvi ; Santala, Ville. / Molecular tools for selective recovery and detection of lignin-derived molecules. Julkaisussa: Green Chemistry. 2018 ; Vuosikerta 20, Nro 12. Sivut 2829-2839.

Santala, Suvi ; Efimova, Elena ; Karp, Matti ; Santala, Ville. / Real-Time monitoring of intracellular wax ester metabolism. Julkaisussa: Microbial Cell Factories. 2011 ; Vuosikerta 10, Nro 1. Sivut 1-8.

Santala, Suvi. / Developing Synthetic Biology Tools and Model Chassis: Production of Bioenergy and High-Value Molecules. Tampere University of Technology, 2015. 99 Sivumäärä (Tampere University of Technology. Publication).

Santala, Suvi ; Larjo, Antti ; Aho, Tommi ; Karp, Matti ; Santala, Ville. / Construction and Modelling of an Artificial Microecosystem. Eight International Workshop on Computational Systems Biology, WCSB 2011, June 6-8, Zurich, Switzerland. TICSP series. Toimittaja / Heinz Koeppl ; Jugoslava Acimovic ; Juha Kesseli ; Tuomo Mäki-Marttunen ; Antti Larjo ; Olli Yli-Harja. Zurich : WCSB 2011, 2011. Sivut 225-225 (International Workshop on Computational Systems Biology WCSB; 57).

Santala, Suvi ; Karp, Matti ; Santala, Ville. / Monitoring alkane degradation by single biobrick integration to an optimal cellular framework. Julkaisussa: ACS Synthetic Biology. 2012 ; Vuosikerta 1, Nro 2. Sivut 60-64.

Santala, Suvi ; Karp, Matti ; Santala, Ville. / Rationally engineered synthetic coculture for improved biomass and product formation. Julkaisussa: PLoS ONE. 2014 ; Vuosikerta 9, Nro 12.

Santala, Suvi ; Efimova, Elena ; Kivinen, Virpi ; Larjo, Antti ; Aho, Tommi ; Karp, Matti ; Santala, Ville. / Improved triacylglycerol production in Acinetobacter baylyi ADP1 by metabolic engineering. Julkaisussa: Microbial Cell Factories. 2011 ; Vuosikerta 10, Nro 36. Sivut 1-10.

Santala, Suvi ; Efimova, Elena ; Koskinen, Perttu ; Karp, Matti Tapani ; Santala, Ville. / Rewiring the wax ester production pathway of acinetobacter baylyi ADP1. Julkaisussa: ACS Synthetic Biology. 2014 ; Vuosikerta 3, Nro 3. Sivut 145-151.

Santala, Suvi ; Efimova, Elena ; Santala, Ville. / Dynamic decoupling of biomass and wax ester biosynthesis in Acinetobacter baylyi by an autonomously regulated switch. Julkaisussa: Metabolic Engineering Communications. 2018 ; Vuosikerta 7.

Sasaki, K. ; Takatsugi, K. ; Kaneko, K. ; Kozai, N. ; Ohnuki, T. ; Tuovinen, Olli H. ; Hirajima, T. / Characterization of secondary arsenic-bearing precipitates formed in the bioleaching of enargite by Acidithiobacillus ferrooxidans. Julkaisussa: Hydrometallurgy. 2010 ; Vuosikerta 104, Nro 3-4. Sivut 424-431.

Seppälä, Jenni ; Larjo, Antti ; Aho, Tommi ; Kivistö, Anniina ; Karp, Matti ; Santala, VIlle. / Modification of the Escherichia coli metabolic model LAF1260 based on anaerobic experiments. The 10th International Workshop on Computational Systems Biology, WCSB 2013, June 10-12, Tampere, Finland. Toimittaja / Reija Autio ; Ilya Shmulevich ; Korbinian Strimmer ; Carsten Wiuf ; Septimia Sarbu ; Olli Yli-Harja. 2013. Sivut 80-86 (International Workshop on Computational Systems Biology).

Seppälä, Jenni J. ; Larjo, Antti ; Aho, Tommi ; Yli-Harja, Olli ; Karp, Matti T. ; Santala, Ville. / Prospecting hydrogen production of Escherichia coli by metabolic network modeling. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2013 ; Vuosikerta 38, Nro 27. Sivut 11780-11789.

Seppälä, Mari ; Laine, Antti ; Rintala, Jukka. / Screening of novel plants for biogas production in northern conditions. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2013 ; Vuosikerta 139. Sivut 355-362.

Seppälä, Mari ; Pyykkönen, Ville ; Väisänen, Ari ; Rintala, Jukka. / Biomethane production from maize and liquid cow manure - Effect of share of maize, post-methanation potential and digestate characteristics. Julkaisussa: Fuel. 2013 ; Vuosikerta 107. Sivut 209-216.

Seppälä, Mari ; Pyykkönen, Ville ; Laine, Antti ; Rintala, Jukka. / Methane production from maize in Finland - Screening for different maize varieties and plant parts. Julkaisussa: Biomass & Bioenergy. 2012 ; Vuosikerta 46, Nro November. Sivut 282-290.

Seppälä, Jenni J. ; Puhakka, Jaakko A. ; Yli-Harja, Olli ; Karp, Matti T. ; Santala, Ville. / Fermentative hydrogen production by Clostridium butyricum and Escherichia coli in pure and cocultures. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2011 ; Vuosikerta 36, Nro 17. Sivut 10701-10708.

Seppälä, Jenni. / Application of Computational Methods for Fermentative Hydrogen Production. Tampere University of Technology, 2014. 116 Sivumäärä (Tampere University of Techonology. Publication).

Sharma, Krishna Kant ; Sharma, Sonia ; Karp, Matti ; Kuhad, Ramesh Chander. / Ligninolytic enzymes improve soil DNA purity: Solution to methodological challenges of soil metagenomics. Julkaisussa: Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic. 2012 ; Vuosikerta 83, Nro November. Sivut 73-79.

Singh Gaur, Rashmi ; Cai, Ling ; Tuovinen, Olli H. ; Mancl, Karen M. / Pretreatment of turkey fat-containing wastewater in coarse sand and gravel/coarse sand bioreactors. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2010 ; Vuosikerta 101, Nro 3. Sivut 1106-1110.

Sippola, Roosa J. ; Hadipour, Afshin ; Kastinen, Tuuva ; Vivo, Paola ; Hukka, Terttu I. ; Aernouts, Tom ; Heiskanen, Juha P. / Carbazole-based small molecule electron donors : Syntheses, characterization, and material properties. Julkaisussa: Dyes and Pigments. 2017 ; Vuosikerta 150. Sivut 79-88.

Sivula, Leena ; Oikari, Aimo ; Rintala, Jukka. / Toxicity of waste gasification bottom ash leachate. Julkaisussa: Waste Management. 2012 ; Vuosikerta 32, Nro 6. Sivut 1171-1178.

Sivula, Leena ; Sormunen, Kai ; Rintala, Jukka. / Leachate formation and characteristics from gasification and grate incineration bottom ash under landfill conditions. Julkaisussa: Waste Management. 2012 ; Vuosikerta 32, Nro 4. Sivut 780-788.

Smolander, Olli-Pekka ; Kandhavelu, Meenakshisundaram ; Mannerström, Henrik ; Lihavainen, Eero ; Kalaichelvan, Shanmugapriya ; Healy, Shannon ; Yli-Harja, Olli ; Karp, Matti ; Ribeiro, Andre S. / Cell-to-cell diversity in protein levels of a gene driven by a tetracycline inducible promoter. Julkaisussa: BMC Molecular Biology. 2011 ; Vuosikerta 12. Sivut 1-27.

Smolander, Olli-Pekka ; Kandhavelu, Meenakshisundaram ; Mannerström, Henrik ; Lihavainen, Eero ; Kalaichelvan, Shanmugapriya ; Healy, Shannon ; Yli-Harja, Olli ; Karp, Matti ; Ribeiro, Andre S. / Dynamics of Gene Expression under Tetracycline Inducible Promoters. Eight International Workshop on Computational Systems Biology, WCSB 2011, June 6-8, Zurich, Switzerland. TICSP series. Toimittaja / Heinz Koeppl ; Jugoslava Acimovic ; Juha Kesseli ; Tuomo Mäki-Marttunen ; Antti Larjo ; Olli Yli-Harja. Zurich : WCSB 2011, 2011. Sivut 227-227 (International Workshop on Computational Systems Biology WCSB; 57).

Sormunen, Kai ; Laurila, Tuomas ; Rintala, Jukka. / Determination of waste decay rate for a large Finnish landfill by calibrating methane generation models on the basis of methane recovery and emissions. Julkaisussa: Waste Management and Research. 2013 ; Vuosikerta 31, Nro 10. Sivut 979-985.

Stuani, Lucille ; Lechaplais, Christophe ; Salminen, Aaro V. ; Segurens, Beatrice ; Durot, Maxime ; Castelli, Vanina ; Pinet, Agnes ; Labadie, Karine ; Cruveiller, Stephane ; Weissenbach, Jean ; de Berardinis, Veronique ; Salanoubat, Marcel ; Perret, Alain. / Novel metabolic features in Acinetobacter baylyi ADP1 revealed by a multiomics approach. Julkaisussa: Metabolomics. 2014.

Suominen, A I ; Karp, M T ; Mäntsälä, P I. / Fractionation of DNA with Sephacryl S-1000(R). Julkaisussa: Biochemistry Research International. 1984 ; Vuosikerta 8, Nro 2. Sivut 209-215.

Sutinen, Maiju ; Kontunen, Anton ; Karjalainen, Markus ; Kiiski, Juha ; Hannus, Jill ; Tolonen, Teemu ; Roine, Antti ; Oksala, Niku. / Identification of breast tumors from diathermy smoke by differential ion mobility spectrometry. Julkaisussa: European Journal of Surgical Oncology. 2019 ; Vuosikerta 45, Nro 2. Sivut 141-146.

Tähti, Hanne ; Kaparaju, Prasad ; Rintala, Jukka. / Hydrogen and methane production in extreme thermophilic conditions in two-stage (upflow anaerobic sludge bed) UASB reactor system. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2013 ; Vuosikerta 38, Nro 12. Sivut 4997-5002.

Tampio, Elina ; Marttinen, Sanna ; Rintala, Jukka. / Liquid fertilizer products from anaerobic digestion of food waste : Mass, nutrient and energy balance of four digestate liquid treatment systems. Julkaisussa: Journal of Cleaner Production. 2016 ; Vuosikerta 125. Sivut 22–32.

Tao, Jing ; Mancl, Karen M. ; Tuovinen, Olli H. / Attenuation of pollutants in sanitary sewer overflow: Comparative evaluation of treatment with fixed media bioreactors. Julkaisussa: Bioresource Technology. 2010 ; Vuosikerta 101, Nro 6. Sivut 1781-1786.

Tarniceriu, Adrian ; Harju, Jarkko ; Yousefi, Zeinab Rezaei ; Vehkaoja, Antti ; Parak, Jakub ; Yli-Hankala, Arvi ; Korhonen, Ilkka. / The Accuracy of Atrial Fibrillation Detection from Wrist Photoplethysmography. A Study on Post-Operative Patients. 40th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, EMBC 2018. Vuosikerta 2018-July IEEE, 2018. Sivut 4844-4847

Taskan, Ergin ; Özkaya, Bestemin ; Hasar, Halil. / Combination of a novel electrode material and artificial mediators to enhance power generation in an MFC. Julkaisussa: Water Science and Technology. 2015 ; Vuosikerta 71, Nro 3. Sivut 320-328.

Tauriainen, S. M. ; Virta, M. P. J. ; Karp, M. T. / Detecting bioavailable toxic metals and metalloids from natural water samples using luminescent sensor bacteria. Julkaisussa: Water Research. 2000 ; Vuosikerta 34, Nro 10. Sivut 2661-2666.

Taverniti, Valentina ; Minuzzo, Mario ; Arioli, Stefania ; Junttila, Ilkka ; Hämäläinen, Sanna ; Turpeinen, Hannu ; Mora, Diego ; Karp, Matti ; Pesu, Marko ; Guglielmetti, Simone. / In Vitro functional and immunomodulatory properties of the Lactobacillus helveticus MIMLh5-Streptococcus salivarius ST3 association that are relevant to the development of a Pharyngeal probiotic product. Julkaisussa: Applied and Environmental Microbiology. 2012 ; Vuosikerta 78, Nro 12. Sivut 4209-4216.

Taverniti, Valentina ; Stuknyte, Milda ; Minuzzo, Mario ; Arioli, Stefania ; De Noni, Ivano ; Scabiosi, Christian ; Cordova, Zuzet Martinez ; Junttila, Ilkka ; Hämäläinen, Sanna ; Turpeinen, Hannu ; Mora, Diego ; Karp, Matti ; Pesu, Marko ; Guglielmetti, Simone. / S-Layer protein mediates the stimulatory effect of lactobacillus helveticus MIMLh5 on innate immunity. Julkaisussa: Applied and Environmental Microbiology. 2013 ; Vuosikerta 79, Nro 4. Sivut 1221-1231.

Tienaho, Jenni ; Sarjala, Tytti ; Franzén, Robert ; Karp, Matti. / Method with high-throughput screening potential for antioxidative substances using Escherichia coli biosensor katG'::lux. Julkaisussa: Journal of Microbiological Methods. 2015 ; Vuosikerta 118. Sivut 78-80.

Tienaho, Jenni ; Poikulainen, Emmi ; Sarjala, Tytti ; Muilu-Mäkelä, Riina ; Santala, Ville ; Karp, Matti. / A Bioscreening Technique for Ultraviolet Irradiation Protective Natural Substances. Julkaisussa: Photochemistry and Photobiology. 2018 ; Vuosikerta 94, Nro 6. Sivut 1273-1280.

Tolvanen, Katariina. / Molecular methods for studying mixed hydrogen-fermenting microbial communities. Tampere : Tampere University of Technology, 2010. (Tampereen teknillinen yliopisto. Julkaisu).

Tolvanen, Katariina E.S. ; Karp, Matti T. / Molecular methods for characterizing mixed microbial communities in hydrogen-fermenting systems. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2011 ; Vuosikerta 36, Nro 9. Sivut 5280-5288.

Tolvanen, Katariina E. S. ; Mangayil, Rahul K. ; Karp, Matti T. ; Santala, Ville P. / Simple enrichment system for hydrogen producers. Julkaisussa: Applied and Environmental Microbiology. 2011 ; Vuosikerta 77, Nro 12. Sivut 4246-4248.

Tolvanen, Katariina E.S. ; Santala, Ville P. ; Karp, Matti T. / [FeFe]-hydrogenase gene quantification and melting curve analysis from hydrogen-fermenting bioreactor samples. Julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 2010 ; Vuosikerta 35, Nro 8. Sivut 3433-3439.

Tolvanen, Henrik ; Keipi, Tiina ; Raiko, Risto. / A study on raw, torrefied, and steam-exploded wood: Fine grinding, drop-tube reactor combustion tests in N2/O2 and CO2/O2 atmospheres, particle geometry analysis, and numerical kinetics modeling. Julkaisussa: Fuel. 2016 ; Vuosikerta 176. Sivut 153-164.

Välimaa, Anna-Liisa ; Kivistö, Anniina T. ; Leskinen, Piia I. ; Karp, Matti T. / A novel biosensor for the detection of zearalenone family mycotoxins in milk. Julkaisussa: Journal of Microbiological Methods. 2010 ; Vuosikerta 80, Nro 1. Sivut 44-48.

Välimaa, Anna-Liisa. / In vitro bioassays in bioactivity and residue assessments. Tampere : Tampere University of Technology, 2010. (Tampereen teknillinen yliopisto. Julkaisu).

Vestola, Elina A. ; Kuusenaho, Mari K. ; Närhi, Heli M. ; Tuovinen, Olli H. ; Puhakka, Jaakko A. ; Plumb, Jason J. ; Kaksonen, Anna H. / Acid bioleaching of solid waste materials from copper, steel and recycling industries. Julkaisussa: Hydrometallurgy. 2010 ; Vuosikerta 103, Nro 1-4. Sivut 74-79.

Virolainen, Nina ; Välimaa, Anna-Liisa. / Kehittämishanke: Tenttiin lukemisesta jatkuvaan oppimiseen - Tapausesimerkkinä Tampereen teknillisen yliopiston Nanobioteknologian opintojakso. Tunnista, kehitä, arvioi - vaikuttavia käytäntöjä opetuksen ja opetussuunnitelman kehittämiseen. Uutisia opetuksen kehittämisestä Oulun yliopiston laitoksilla. Toimittaja / Petra Rutanen ; Aimo Rahkonen ; Suvi Jutila. 2010. Sivut 33-40

Virolainen, Nina ; Guglielmetti, Simone ; Arioli, Stefania ; Karp, Matti. / Bioluminescence-based identification of nisin producers - A rapid and simple screening method for nisinogenic bacteria in food samples. Julkaisussa: International Journal of Food Microbiology. 2012 ; Vuosikerta 158, Nro 12. Sivut 126-132.

Virolainen, Nina ; Karp, Matti. / Biosensors, Antibiotics and Food. Bioluminescence: Fundamentals and Applications in Biotechnology - Volume 2. Toimittaja / Gerald Thouand ; Robert Marks. Springer, 2014. Sivut 153-185 (Advances in biochemical engineering : biotechnology).

Wakeman, Kathryn D. ; Erving, Leena ; Riekkola-Vanhanen, Merja L. ; Puhakka, Jaakko A. / Silage supports sulfate reduction in the treatment of metals- and sulfate-containing waste waters. Julkaisussa: Water Research. 2010 ; Vuosikerta 44, Nro 17. Sivut 4932-4939.

Wakeman, Kathryn D. ; Honkavirta, Petra ; Puhakka, Jaakko A. / Bioleaching of flotation by-products of talc production permits the separation of nickel and cobalt from iron and arsenic. Julkaisussa: Process Biochemistry. 2011 ; Vuosikerta 46. Sivut 1589-1598.

Wang, Hong ; Tolvanen, Katariina ; Lehtomäki, Annimari ; Puhakka, Jaakko ; Rintala, Jukka. / Microbial community structure in anaerobic co-digestion of grass silage and cow manure in a laboratory continuously stirred tank reactor. Julkaisussa: BIODEGRADATION. 2010 ; Vuosikerta 21, Nro 1. Sivut 135-146.

Warwick, Michael E A ; Kaunisto, Kimmo ; Barreca, Davide ; Carraro, Giorgio ; Gasparotto, Alberto ; Maccato, Chiara ; Bontempi, Elza ; Sada, Cinzia ; Ruoko, Tero-Petri ; Turner, Stuart ; Van Tendeloo, Gustaaf. / Vapor phase processing of α-Fe2O3 photoelectrodes for water splitting : An insight into the structure/property interplay. Julkaisussa: ACS Applied Materials and Interfaces. 2015 ; Vuosikerta 7, Nro 16. Sivut 8667-8676.

Warwick, M. E. A. ; Barreca, D. ; Bontempi, E. ; Carraro, G. ; Gasparotto, A. ; Maccato, C. ; Kaunisto, K. ; Ruoko, T. -P. ; Lemmetyinen, H. ; Sada, C. ; Goenuellue, Y. ; Mathur, S. / Pt-functionalized Fe2O3 photoanodes for solar water splitting : the role of hematite nano-organization and the platinum redox state. Julkaisussa: Physical Chemistry Chemical Physics. 2015 ; Vuosikerta 17, Nro 19. Sivut 12899-12907.

Zou, G. ; Zengling, W. ; Xiaokang, L. ; Laichang, Z. ; Renman, R. ; Papirio, S. ; Puhakka, J. / Column bioleaching of low grade copper sulfide ore at extreme conditions for most mineral processing bacteria. Julkaisussa: Advanced Materials Research. 2013 ; Vuosikerta 825. Sivut 318-321.

Zou, Gang ; Ylinen, Anna ; Di Capua, Francesco ; Papirio, Stefano ; Lakaniemi, Aino-Maija ; Puhakka, Jaakko. / Impact of heavy metals on denitrification of simulated mining wastewaters. Julkaisussa: Advanced Materials Research. 2013 ; Vuosikerta 825. Sivut 500-503.

Zou, G. ; Papirio, S. ; Ylinen, A. ; Di Capua, F. ; Lakaniemi, A.M. ; Puhakka, J.A. / Fluidized-bed denitrification for mine waters. Part II: effects of Ni and Co. Julkaisussa: BIODEGRADATION. 2014 ; Vuosikerta 25. Sivut 417-423.

Zou, Gang ; Papirio, Stefano ; Lai, Xiaokang ; Wu, Zengling ; Zou, Laichang ; Puhakka, Jaakko ; Ruan, Renman. / Column leaching of low-grade sulfide ore from Zijinshan copper mine. Julkaisussa: International Journal of Mineral Processing. 2015 ; Vuosikerta 139. Sivut 11-16.