A Bioscreening Technique for Ultraviolet Irradiation Protective Natural Substances

Tienaho, J., Poikulainen, E., Sarjala, T., Muilu-Mäkelä, R., Santala, V. & Karp, M., 2018, julkaisussa : Photochemistry and Photobiology. 94, 6, s. 1273-1280

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A BRCA1-interacting lncRNA regulates homologous recombination

Sharma, V., Khurana, S., Kubben, N., Abdelmohsen, K., Oberdoerffer, P., Gorospe, M. & Misteli, T., 1 marraskuuta 2015, julkaisussa : EMBO REPORTS. 16, 11, s. 1520-1534 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Acquiring respiration rate from photoplethysmographic signal by recursive bayesian tracking of intrinsic modes in time-frequency spectra

Pirhonen, M., Peltokangas, M. & Vehkaoja, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Sensors. 18, 6, 1693.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Alpha radiation-induced luminescence by am-241 in aqueous nitric acid solution

Kerst, T., Malmbeck, R., lal Banik, N. L. & Toivonen, J., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 7, 1602.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Alzheimer's disease and alpha-synuclein pathology in the olfactory bulbs of infants, children, teens and adults ≤ 40 years in Metropolitan Mexico City. APOE4 carriers at higher risk of suicide accelerate their olfactory bulb pathology

Calderón-Garcidueñas, L., González-Maciel, A., Reynoso-Robles, R., Kulesza, R. J., Mukherjee, P. S., Torres-Jardón, R., Rönkkö, T. & Doty, R. L., 1 lokakuuta 2018, julkaisussa : Environmental Research. 166, s. 348-362 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

An activity recognition framework deploying the random forest classifier and a single optical heart rate monitoring and triaxial accelerometer wrist-band

Mehrang, S., Pietilä, J. & Korhonen, I., 22 helmikuuta 2018, julkaisussa : Sensors. 18, 2, 613.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Analysis of free, mono- and diacetylated polyamines from human urine by LC-MS/MS

Häkkinen, M. R., Roine, A., Auriola, S., Tuokko, A., Veskimäe, E., Keinänen, T. A., Lehtimäki, T., Oksala, N. & Vepsäläinen, J., 15 joulukuuta 2013, julkaisussa : JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY B: ANALYTICAL TECHNOLOGIES IN THE BIOMEDICAL AND LIFE SCIENCES. 941, s. 81-89 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

An architectural understanding of natural sway frequencies in trees

Jackson, T., Shenkin, A., Moore, J., Bunce, A., van Emmerik, T., Kane, B., Burcham, D., James, K., Selker, J., Calders, K., Origo, N., Disney, M., Burt, A., Wilkes, P., Raumonen, P., Gonzalez de Tanago Menaca, J., Lau, A., Herold, M., Goodman, R. C., Fourcaud, T. & Malhi, Y., 28 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Journal of the Royal Society. Interface. 16, 155, 1 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

An efficient auxin-inducible degron system with low basal degradation in human cells

Li, S., Prasanna, X., Salo, V. T., Vattulainen, I. & Ikonen, E., 1 syyskuuta 2019, julkaisussa : Nature Methods. 16, 9, s. 866-869 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Antioxidant supplementation reduces genomic aberrations in human induced pluripotent stem cells

Ji, J., Sharma, V., Qi, S., Guarch, M. E., Zhao, P., Luo, Z., Fan, W., Wang, Y., Mbabaali, F., Neculai, D., Esteban, M. A., McPherson, J. D. & Batada, N. N., 14 tammikuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 2, 1, s. 44-51 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Apolipoprotein A-I mimetic peptide 4F blocks sphingomyelinase-induced LDL aggregation

Nguyen, S. D., Javanainen, M., Rissanen, S., Zhao, H., Huusko, J., Kivelä, A. M., Ylä-Herttuala, S., Navab, M., Fogelman, A. M., Vattulainen, I., Kovanen, P. T. & Öörni, K., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Journal of Lipid Research. 56, 6, s. 1206-1221 16 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A robust AMMI model for the analysis of genotype-by-environment data

Rodrigues, P. C., Monteiro, A. & Lourenço, V. M., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 1, s. 58-66 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

AROS has a context-dependent effect on SIRT1

Kokkola, T., Suuronen, T., Molnár, F., Määttä, J., Salminen, A., Jarho, E. M. & Lahtela-Kakkonen, M., 2 toukokuuta 2014, julkaisussa : FEBS Letters. 588, 9, s. 1523-1528 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Atomistic Molecular Dynamics Simulations of Mitochondrial DNA Polymerase γ: Novel Mechanisms of Function and Pathogenesis

Euro, L., Haapanen, O., Róg, T., Vattulainen, I., Suomalainen, A. & Sharma, V., 7 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Biochemistry. 56, 9, s. 1227-1238 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Azopolymer photopatterning for directional control of angiogenesis

Fedele, C., De Gregorio, M., Netti, P. A., Cavalli, S. & Attanasio, C., 1 marraskuuta 2017, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 63, s. 317-325 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

BACOM: In silico detection of genomic deletion types and correction of normal cell contamination in copy number data

Yu, G., Zhang, B., Bova, G. S., Xu, J., Shih, I. M. & Wang, Y., kesäkuuta 2011, julkaisussa : Bioinformatics. 27, 11, s. 1473-1480 8 Sivumäärä, btr183.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Behavior of the DPH fluorescence probe in membranes perturbed by drugs

Poojari, C., Wilkosz, N., Lira, R. B., Dimova, R., Jurkiewicz, P., Petka, R., Kepczynski, M. & Róg, T., 1 syyskuuta 2019, julkaisussa : Chemistry and Physics of Lipids. 223, 104784.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bioactive glass induced osteogenic differentiation of human adipose stem cells is dependent on cell attachment mechanism and mitogen-activated protein kinases

Ojansivu, M., Wang, X., Hyväri, L., Kellomäki, M., Hupa, L., Vanhatupa, S. & Miettinen, S., 2018, julkaisussa : European Cells and Materials. 35, s. 53-71 19 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bioactive glass ions as strong enhancers of osteogenic differentiation in human adipose stem cells

Ojansivu, M., Vanhatupa, S., Björkvik, L., Häkkänen, H., Kellomäki, M., Autio, R., Ihalainen, J. A., Hupa, L. & Miettinen, S., 15 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 21, s. 190-203 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bioimpedance Sensor Array for Long-Term Monitoring of Wound Healing from Beneath the Primary Dressings and Controlled Formation of H2O2 Using Low-Intensity Direct Current

Kekonen, A., Bergelin, M., Johansson, M., Kumar Joon, N., Bobacka, J. & Viik, J., 31 toukokuuta 2019, julkaisussa : Sensors. 19, 11

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Blood microRNA profile associates with the levels of serum lipids and metabolites associated with glucose metabolism and insulin resistance and pinpoints pathways underlying metabolic syndrome. The cardiovascular risk in Young Finns Study.

Raitoharju, E., Seppälä, I., Oksala, N., Lyytikäinen, L. P., Raitakari, O., Viikari, J., Ala-Korpela, M., Soininen, P., Kangas, A. J., Waldenberger, M., Klopp, N., Illig, T., Leiviskä, J., Loo, B. M., Hutri-Kähönen, N., Kähönen, M., Laaksonen, R. & Lehtimäki, T., 25 kesäkuuta 2014, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 391, 1-2, s. 41-49 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Calcium Assists Dopamine Release by Preventing Aggregation on the Inner Leaflet of Presynaptic Vesicles

Mokkila, S., Postila, P. A., Rissanen, S., Juhola, H., Vattulainen, I. & Róg, T., 21 kesäkuuta 2017, julkaisussa : ACS Chemical Neuroscience. 8, 6, s. 1242-1250 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Calcium Directly Regulates Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Headgroup Conformation and Recognition

Bilkova, E., Pleskot, R., Rissanen, S., Sun, S., Czogalla, A., Cwiklik, L., Róg, T., Vattulainen, I., Cremer, P. S., Jungwirth, P. & Coskun, Ü., 22 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 139, 11, s. 4019-4024 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Calcium transients closely reflect prolonged action potentials in iPSC models of inherited cardiac arrhythmia

Spencer, C. I., Baba, S., Nakamura, K., Hua, E. A., Sears, M. A. F., Fu, C. C., Zhang, J., Balijepalli, S., Tomoda, K., Hayashi, Y., Lizarraga, P., Wojciak, J., Scheinman, M. M., Aalto-Setälä, K., Makielski, J. C., January, C. T., Healy, K. E., Kamp, T. J., Yamanaka, S. & Conklin, B. R., 12 elokuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 3, 2, s. 269-281 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cancer incidence and mortality in patients treated either with RAI or thyroidectomy for hyperthyroidism

Ryödi, E., Metso, S., Jaatinen, P., Huhtala, H., Saaristo, R., Välimäki, M. & Auvinen, A., 1 lokakuuta 2015, julkaisussa : Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 100, 10, s. 3710-3717 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Characterisation and in vitro and in vivo evaluation of supercritical-CO2-foamed β-TCP/PLCL composites for bone applications

Pitkänen, S., Paakinaho, K., Pihlman, H., Ahola, N., Hannula, M., Asikainen, S., Manninen, M., Morelius, M., Keränen, P., Hyttinen, J., Kellomäki, M., Laitinen-Vapaavuori, O. & Miettinen, S., 5 elokuuta 2019, julkaisussa : European cells & materials. 38, s. 35-50 16 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Characterizing rate limiting steps in transcription from RNA production times in live cells

Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 toukokuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 9, s. 1346-1352 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cholesterol oxidation products and their biological importance

Kulig, W., Cwiklik, L., Jurkiewicz, P., Rog, T. & Vattulainen, I., 2016, julkaisussa : Chemistry and Physics of Lipids. 199, s. 144-160 17 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cholesterol under oxidative stress: How lipid membranes sense oxidation as cholesterol is being replaced by oxysterols

Kulig, W., Olzyńska, A., Jurkiewicz, P., Kantola, A. M., Komulainen, S., Manna, M., Pourmousa, M., Vazdar, M., Cwiklik, L., Rog, T., Khelashvili, G., Harries, D., Telkki, V. V., Hof, M., Vattulainen, I. & Jungwirth, P., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Free Radical Biology and Medicine. 84, s. 30-41 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Co-culture of human induced pluripotent stem cell-derived retinal pigment epithelial cells and endothelial cells on double collagen-coated honeycomb films

Rebelo Calejo, T., Vuorenpää, H., Vuorimaa-Laukkanen, E., Kallio, P., Aalto-Setälä, K., Miettinen, S., Skottman, H., Kellomäki, M. & Juuti-Uusitalo, K., 2020, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 101, s. 327-343 17 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparative analysis of tissue reconstruction algorithms for 3D histology

Kartasalo, K., Latonen, L., Vihinen, J., Visakorpi, T., Nykter, M. & Ruusuvuori, P., 1 syyskuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 17, s. 3013-3021 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparative evaluation of gene set analysis approaches for RNA-Seq data

Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 5 joulukuuta 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, 1, 397.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparison of different coating techniques on the properties of FucoPol films

Ferreira, A. R. V., Haapanen, J., Mäkelä, J. M., Bratvold, J. E., Nilsen, O., Tuominen, M., Alves, V. D. & Coelhoso, I. M., 1 lokakuuta 2017, julkaisussa : International Journal of Biological Macromolecules. 103, s. 268-274 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Connection between absorption properties and conformational changes in Deinococcus radiodurans phytochrome

Takala, H., Lehtivuori, H., Hammarén, H., Hytönen, V. P. & Ihalainen, J. A., 18 marraskuuta 2014, julkaisussa : Biochemistry. 53, 45, s. 7076-7085 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Connection of Collimation, Asymmetric Beaming, and Independent Transmission-Reflection Processes in Concentric-Groove Gratings Supporting Spoof Surface Plasmons

Habib, M., Serebryannikov, A. E., Caglayan, H., Vandenbosch, G. A. E. & Ozbay, E., kesäkuuta 2019, julkaisussa : Plasmonics. 14, 3, s. 721-729 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Controlled Orientations of Neighboring Tetracene Units by Mixed Self-Assembled Monolayers on Gold Nanoclusters for High-Yield and Long-Lived Triplet Excited States through Singlet Fission

Saegusa, T., Sakai, H., Nagashima, H., Kobori, Y., Tkachenko, N. V. & Hasobe, T., 18 syyskuuta 2019, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 141, 37, s. 14720-14727 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Counterion condensation in short cationic peptides: Limiting mobilities beyond the Onsager-Fuoss theory

Wernersson, E., Heyda, J., Kubíčková, A., Křížek, T., Coufal, P. & Jungwirth, P., maaliskuuta 2012, julkaisussa : ELECTROPHORESIS. 33, 6, s. 981-989 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Detection of DNA hybridisation in a diluted serum matrix by surface plasmon resonance and film bulk acoustic resonators

Auer, S., Nirschl, M., Schreiter, M. & Vikholm-Lundin, I., toukokuuta 2011, julkaisussa : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 400, 5, s. 1387-1396 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Development and characterization of poly(ε-caprolactone) hollow fiber membranes for vascular tissue engineering

Diban, N., Haimi, S., Bolhuis-Versteeg, L., Teixeira, S., Miettinen, S., Poot, A., Grijpma, D. & Stamatialis, D., 1 heinäkuuta 2013, julkaisussa : Journal of Membrane Science. 438, s. 29-37 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Dissecting the in vivo dynamics of transcription locking due to positive supercoiling buildup

Palma, C. S. D., Kandavalli, V., Bahrudeen, M. N. M., Minoia, M., Chauhan, V., Dash, S. & Ribeiro, A. S., 1 toukokuuta 2020, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms. 1863, 5, 194515.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Distribution and dynamics of quinones in the lipid bilayer mimicking the inner membrane of mitochondria

Kaurola, P., Sharma, V., Vonk, A., Vattulainen, I. & Róg, T., 1 syyskuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 9, s. 2116-2122 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Dynamics and energetics of the mammalian phosphatidylinositol transfer protein phospholipid exchange cycle

Grabon, A., Orłowski, A., Tripathi, A., Vuorio, J., Javanainen, M., Róg, T., Lönnfors, M., McDermott, M. I., Siebert, G., Somerharju, P., Vattulainen, I. & Bankaitis, V. A., 2017, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 292, 35, s. 14438-14455 18 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Dynamics of a True Moving Bed separation process: Linear model identification and advanced process control

Nogueira, I. B. R., Ribeiro, A. M., Martins, M. A. F., Rodrigues, A. E., Koivisto, H. & Loureiro, J. M., 30 kesäkuuta 2017, julkaisussa : Journal of Chromatography A. 1504

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effect of N/S ratio on anoxic thiosulfate oxidation in a fluidized bed reactor: Experimental and artificial neural network model analysis

Khanongnuch, R., Di Capua, F., Lakaniemi, A-M., Rene, E. R. & Lens, P. N. L., 2018, julkaisussa : Process Biochemistry. 68, s. 171-181

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effects of σ factor competition are promoter initiation kinetics dependent

Kandavalli, V. K., Tran, H. & Ribeiro, A. S., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Gene Regulatory Mechanisms. 1859, 10, s. 1281-1288 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Efficient preparation and analysis of membrane and membrane protein systems

Javanainen, M. & Martinez-Seara, H., lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2468-2482

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Efficient preparation of shuffled DNA libraries through recombination (Gateway) cloning

Lehtonen, S. I., Taskinen, B., Ojala, E., Kukkurainen, S., Rahikainen, R., Riihimäki, T. A., Laitinen, O. H., Kulomaa, M. S. & Hytönen, V. P., 2015, julkaisussa : Protein Engineering Design and Selection. 28, 1, s. 23-28 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Efficient production of NV colour centres in nanodiamonds using high-energy electron irradiation

Dantelle, G., Slablab, A., Rondin, L., Lainé, F., Carrel, F., Bergonzo, P., Perruchas, S., Gacoin, T., Treussart, F. & Roch, J. F., syyskuuta 2010, julkaisussa : Journal of Luminescence. 130, 9, s. 1655-1658 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Electrophoretic mobilities of neutral analytes and electroosmotic flow markers in aqueous solutions of Hofmeister salts

Křížek, T., Kubíčková, A., Hladílková, J., Coufal, P., Heyda, J. & Jungwirth, P., 2014, julkaisussa : ELECTROPHORESIS. 35, 5, s. 617-624 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Environmental monitoring with distributed mesh networks: An overview and practical implementation perspective for urban scenario

Ometov, A., Bezzateev, S., Voloshina, N., Masek, P. & Komarov, M., 2 joulukuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 24, 19 Sivumäärä, 5548.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal fluorescence intensity data

Julkaisun otsikon käännös: : Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal flourescence intensity data
Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 tammikuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 31, 1, s. 69-75 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Evaluation of dry electrodes in canine heart rate monitoring

Virtanen, J., Somppi, S., Törnqvist, H., Jeyhani, V., Fiedler, P., Gizatdinova, Y., Majaranta, P., Väätäjä, H., Cardó, A. V., Lekkala, J., Tuukkanen, S., Surakka, V., Vainio, O. & Vehkaoja, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Sensors. 18, 6, 1757.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Evaluation of scaffold microstructure and comparison of cell seeding methods using micro-computed tomography-based tools

Palmroth, A., Pitkänen, S., Hannula, M., Paakinaho, K., Hyttinen, J., Miettinen, S. & Kellomäki, M., 1 huhtikuuta 2020, julkaisussa : Journal of the Royal Society. Interface. 17, 165, 12 Sivumäärä, 20200102.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Experimental determination and computational interpretation of biophysical properties of lipid bilayers enriched by cholesteryl hemisuccinate

Kulig, W., Jurkiewicz, P., Olzyńska, A., Tynkkynen, J., Javanainen, M., Manna, M., Rog, T., Hof, M., Vattulainen, I. & Jungwirth, P., 2015, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1848, 2, s. 422-432 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Functional and genetic analysis of the colon cancer network.

Emmert-Streib, F., de Matos Simoes, R., Glazko, G., McDade, S., Haibe-Kains, B., Holzinger, A., Dehmer, M. & Campbell, F., 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, Suppl 6, S6.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Functionalized lipids and surfactants for specific applications

Kepczynski, M. & Róg, T., lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2362-2379

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Gene expression analysis upon lncRNA DDSR1 knockdown in human fibroblasts

Jia, L., Sun, Z., Wu, X., Misteli, T. & Sharma, V., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Genomics Data. 6, s. 277-279 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Gene set analysis for self-contained tests: Complex null and specific alternative hypotheses

Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., joulukuuta 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 23, s. 3073-3080 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Gene Sets Net Correlations Analysis (GSNCA): A multivariate differential coexpression test for gene sets

Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 1 helmikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 3, s. 360-368 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Global analysis of human nonreceptor tyrosine kinase specificity using high-density peptide microarrays

Deng, Y., Alicea-Velázquez, N. L., Bannwarth, L., Lehtonen, S. I., Boggon, T. J., Cheng, H. C., Hytönen, V. P. & Turk, B. E., 3 lokakuuta 2014, julkaisussa : Journal of Proteome Research. 13, 10, s. 4339-4346 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Gloriosa superba Mediated Synthesis of Platinum and Palladium Nanoparticles for Induction of Apoptosis in Breast Cancer

Rokade, S. S., Joshi, K. A., Mahajan, K., Patil, S., Tomar, G., Dubal, D. S., Parihar, V. S., Kitture, R., Bellare, J. R. & Ghosh, S., 2018, julkaisussa : Bioinorganic Chemistry and Applications. 2018, 4924186.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

GSAR: Bioconductor package for Gene Set analysis in R

Rahmatallah, Y., Zybailov, B., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 24 tammikuuta 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, 1, 61.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Hexaphyrin as a Potential Theranostic Dye for Photothermal Therapy and 19F Magnetic Resonance Imaging

Higashino, T., Nakatsuji, H., Fukuda, R., Okamoto, H., Imai, H., Matsuda, T., Tochio, H., Shirakawa, M., Tkachenko, N. V., Hashida, M., Murakami, T. & Imahori, H., 24 maaliskuuta 2017, julkaisussa : ChemBioChem. 18, 10, s. 951-959 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Hierarchical Self-Assembly of Halogen-Bonded Block Copolymer Complexes into Upright Cylindrical Domains

Milani, R., Houbenov, N., Fernandez-Palacio, F., Cavallo, G., Luzio, A., Haataja, J., Giancane, G., Saccone, M., Priimägi, A., Metrangolo, P. & Ikkala, O., 9 maaliskuuta 2017, julkaisussa : CheM. 2, 3, s. 417-426 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

High-content imaging and structure-based predictions reveal functional differences between Niemann-Pick C1 variants

Vanharanta, L., Peränen, J., Pfisterer, S. G., Enkavi, G., Vattulainen, I. & Ikonen, E., 1 toukokuuta 2020, julkaisussa : Traffic. 21, 5, s. 386-397 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Histone H2B ubiquitin ligases RNF20 and RNF40 in androgen signaling and prostate cancer cell growth

Jääskeläinen, T., Makkonen, H., Visakorpi, T., Kim, J., Roeder, R. G. & Palvimo, J. J., 5 maaliskuuta 2012, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 350, 1, s. 87-98 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Hollow fibers of poly(lactide-co-glycolide) and poly(ε-caprolactone) blends for vascular tissue engineering applications

Diban, N., Haimi, S., Bolhuis-Versteeg, L., Teixeira, S., Miettinen, S., Poot, A., Grijpma, D. & Stamatialis, D., 2013, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 9, 5, s. 6450-6458 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

How the amyloid-β peptide and membranes affect each other: An extensive simulation study

Poojari, C., Kukol, A. & Strodel, B., helmikuuta 2013, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1828, 2, s. 327-339 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

How to minimize dye-induced perturbations while studying biomembrane structure and dynamics: PEG linkers as a rational alternative

Mobarak, E., Javanainen, M., Kulig, W., Honigmann, A., Sezgin, E., Aho, N., Eggeling, C., Rog, T. & Vattulainen, I., marraskuuta 2018, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 1860, 11, s. 2436-2445

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Human Adipose Stem Cells Differentiated on Braided Polylactide Scaffolds is a Potential Approach for Tendon Tissue Engineering

Vuornos, K., Björninen, M., Talvitie, E., Paakinaho, K., Kellomäki, M., Huhtala, H., Miettinen, S., Seppänen-Kaijansinkko, R. & Haimi, S., 1 maaliskuuta 2016, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 22, 5-6, s. 513-523 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Human adipose tissue extract induces angiogenesis and adipogenesis in vitro

Sarkanen, J. R., Kaila, V., Mannerström, B., Räty, S., Kuokkanen, H., Miettinen, S. & Ylikomi, T., 1 tammikuuta 2012, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 18, 1-2, s. 17-25 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Identification, prioritization, and evaluation of glycoproteins for aggressive prostate cancer using quantitative glycoproteomics and antibody-based assays on tissue specimens

Chen, J., Xi, J., Tian, Y., Bova, G. S. & Zhang, H., elokuuta 2013, julkaisussa : Proteomics. 13, 15, s. 2268-2277 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Identifying involvement of Lys251/Asp252 pair in electron transfer and associated proton transfer at the quinone reduction site of Rhodobacter capsulatus cytochrome bc1

Kuleta, P., Sarewicz, M., Postila, P., Róg, T. & Osyczka, A., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1857, 10, s. 1661-1668 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Improved water services cooperation through clarification of rules and roles

Inha, L. M., Katko, T. S. & Rajala, R. P., 19 lokakuuta 2019, julkaisussa : Water (Switzerland). 11, 10, 2172.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Influence of ions to modulate hydrazone and oxime reaction kinetics to obtain dynamically cross-linked hyaluronic acid hydrogels

Wang, S., Nawale, G. N., Oommen, O. P., Hilborn, J. & Varghese, O. P., 21 elokuuta 2019, julkaisussa : Polymer Chemistry. 10, 31, s. 4322-4327 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Inhibition of Aβ Amyloid Growth and Toxicity by Silybins: The Crucial Role of Stereochemistry

Sciacca, M. F. M., Romanucci, V., Zarrelli, A., Monaco, I., Lolicato, F., Spinella, N., Galati, C., Grasso, G., D'Urso, L., Romeo, M., Diomede, L., Salmona, M., Bongiorno, C., Di Fabio, G., La Rosa, C. & Milardi, D., 16 elokuuta 2017, julkaisussa : ACS Chemical Neuroscience. 8, 8, s. 1767-1778 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Interaction with serum albumin as a factor of the photodynamic efficacy of novel bacteriopurpurinimide derivatives

Akimova, A. V., Rychkov, G. N., Grin, M. A., Filippova, N. A., Golovina, G. V., Durandin, N. A., Vinogradov, A. M., Kokrashvili, T. A., Mironov, A. F., Shtil, A. A. & Kuzmin, V. A., 2015, julkaisussa : ACTA NATURAE. 7, 1, s. 109-116 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Iterative unsupervised domain adaptation for generalized cell detection from brightfield z-stacks

Liimatainen, K., Kananen, L., Latonen, L. & Ruusuvuori, P., 15 helmikuuta 2019, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 20, 1, 80.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Kinetics of bioconjugate nanoparticle label binding in a sandwich-type immunoassay

Näreoja, T., Ebner, A., Gruber, H. J., Taskinen, B., Kienberger, F., Hänninen, P. E., Hytönen, V. P., Hinterdorfer, P. & Härmä, H., 2014, julkaisussa : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 406, 2, s. 493-503 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Laser-induced primary and secondary hemostasis dynamics and mechanisms in relation to selective photothermolysis of port wine stains

Heger, M., Salles, I. I., Bezemer, R., Cloos, M. A., Mordon, S. R., Bégu, S., Deckmyn, H. & Beek, J. F., syyskuuta 2011, julkaisussa : JOURNAL OF DERMATOLOGICAL SCIENCE. 63, 3, s. 139-147 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Light-fuelled transport of large dendrimers and proteins

Koskela, J. E., Liljeström, V., Lim, J., Simanek, E. E., Ras, R. H. A., Priimagi, A. & Kostiainen, M. A., 14 toukokuuta 2014, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 136, 19, s. 6850-6853 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Long-chain GM1 gangliosides alter transmembrane domain registration through interdigitation

Manna, M., Javanainen, M., Martinez-Seara Monne, H., Gabius, H-J., Rog, T. & Vattulainen, I., 1 toukokuuta 2017, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1859, 5, s. 870-878 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

M2M Communication Assessment in Energy-Harvesting and Wake-Up Radio Assisted Scenarios Using Practical Components

Rinne, J., Keskinen, J., Berger, P. R., Lupo, D. & Valkama, M., 16 marraskuuta 2018, julkaisussa : Sensors (Basel, Switzerland). 18, 11

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Mechanisms of acceleration and retardation of water dynamics by ions

Stirnemann, G., Wernersson, E., Jungwirth, P. & Laage, D., 14 elokuuta 2013, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 135, 32, s. 11824-11831 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Methods for simultaneous robot-world-hand–eye calibration: A comparative study

Ali, I., Suominen, O., Gotchev, A. & Morales, E. R., 2 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 12, 2837.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Modeling of anaerobic degradation of solid slaughterhouse waste: Inhibition effects of long-chain fatty acids or ammonia

Lokshina, L. Y., Vavilin, V. A., Salminen, E. & Rintala, J., huhtikuuta 2003, julkaisussa : Applied Biochemistry and Biotechnology. 109, 1-3, s. 15-32 18 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Molecular mechanism for inhibition of twinfilin by phosphoinositides

Hakala, M., Kalimeri, M., Enkavi, G., Vattulainen, I. & Lappalainen, P., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 293, 13, s. 4818-4829 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Molecular mechanism of T-cell protein tyrosine phosphatase (TCPTP) activation by mitoxantrone

Ylilauri, M., Mattila, E., Nurminen, E. M., Käpylä, J., Niinivehmas, S. P., Määttä, J. A., Pentikäinen, U., Ivaska, J. & Pentikäinen, O. T., 2013, julkaisussa : Biochimica et biophysica acta: proteins and proteomics. 1834, 10, s. 1988-1997 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Molecular mechanisms of ion-specific effects on proteins

Rembert, K. B., Paterová, J., Heyda, J., Hilty, C., Jungwirth, P. & Cremer, P. S., 20 kesäkuuta 2012, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 134, 24, s. 10039-10046 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Molecular-Scale Ligand Effects in Small Gold-Thiolate Nanoclusters

Chevrier, D. M., Raich, L., Rovira, C., Das, A., Luo, Z., Yao, Q., Chatt, A., Xie, J., Jin, R., Akola, J. & Zhang, P., 14 marraskuuta 2018, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 140, 45, s. 15430-15436 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Morphological Differentiation Towards Neuronal Phenotype of SH-SY5Y Neuroblastoma Cells by Estradiol, Retinoic Acid and Cholesterol

Teppola, H., Sarkanen, J. R., Jalonen, T. O. & Linne, M-L., 2016, julkaisussa : Neurochemical Research. 41, 4, s. 731-747

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Multi-stable dynamics of the non-adiabatic repressilator

Potapov, I., Zhurov, B. & Volkov, E., 6 maaliskuuta 2015, julkaisussa : Journal of the Royal Society. Interface. 12, 104, 20141315.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Natural thermal adaptation increases heat shock protein levels and decreases oxidative stress

Oksala, N. K. J., Ekmekçi, F. G., Özsoy, E., Kirankaya, Ş., Kokkola, T., Emecen, G., Lappalainen, J., Kaarniranta, K. & Atalay, M., 1 tammikuuta 2014, julkaisussa : REDOX BIOLOGY. 3, s. 25-28 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

NetBioV: An R package for visualizing large network data in biology and medicine

Tripathi, S., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 2 huhtikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 19, s. 2834-2836 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Neuroprotective effect of RO-20-1724-a phosphodiesterase4 inhibitor against intracerebroventricular streptozotocin induced cognitive deficit and oxidative stress in rats

Sharma, V., Bala, A., Deshmukh, R., Bedi, K. L. & Sharma, P. L., huhtikuuta 2012, julkaisussa : PHARMACOLOGY BIOCHEMISTRY AND BEHAVIOR. 101, 2, s. 239-245 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Non-intersecting leaf insertion algorithm for tree structure models

Åkerblom, M., Raumonen, P., Casella, E., Disney, M. I., Danson, F. M., Gaulton, R., Schofield, L. A. & Kaasalainen, M., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170045.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Novel derivatives of bacteriochlorophyll a: Complex formation with albumin and the mechanism of tumor cell photodamage

Akimova, A. V., Grin, M. A., Golovina, G. V., Kokrashvili, T. A., Vinogradov, A. M., Mironov, A. F., Rychkov, G. N., Shtil, A. A., Kuzmin, V. A. & Durandin, N. A., 2014, julkaisussa : DOKLADY BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS. 454, 1, s. 17-20 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Osteogenic medium is superior to growth factors in differentiation of human adipose stem cells towards boneforming cells in 3D culture

Tirkkonen, L., Haimi, S., Huttunen, S., Wolff, J., Pirhonen, E., Sándor, G. K. & Miettinen, S., 2012, julkaisussa : European Cells and Materials. 25, s. 144-158 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Oxidation half-reaction of aqueous nucleosides and nucleotides via photoelectron spectroscopy augmented by ab initio calculations

Schroeder, C. A., Pluharová, E., Seidel, R., Schroeder, W. P., Faubel, M., Slavíçek, P., Winter, B., Jungwirth, P. & Bradforth, S. E., 14 tammikuuta 2015, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 137, 1, s. 201-209 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Phosphorylation of NFATC1 at PIM1 target sites is essential for its ability to promote prostate cancer cell migration and invasion

Eerola, S. K., Santio, N. M., Rinne, S., Kouvonen, P., Corthals, G. L., Scaravilli, M., Scala, G., Serra, A., Greco, D., Ruusuvuori, P., Latonen, L., Rainio, E. M., Visakorpi, T. & Koskinen, P. J., 15 marraskuuta 2019, julkaisussa : CELL COMMUNICATION AND SIGNALING. 17, 1, 148.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Photo-antimicrobial efficacy of zinc complexes of porphyrin and phthalocyanine activated by inexpensive consumer LED lamp

George, L., Hiltunen, A., Santala, V. & Efimov, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Journal of Inorganic Biochemistry. 183, s. 94-100 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Physiologically-relevant levels of sphingomyelin, but not GM1, induces a β-sheet-rich structure in the amyloid-β(1-42) monomer

Owen, M. C., Kulig, W., Poojari, C., Rog, T. & Strodel, B., syyskuuta 2018, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 1860, 9, s. 1709-1720

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Polarization resolved photoluminescence in GaAs1−xBix/GaAs quantum wells

Balanta, M. A. G., Orsi Gordo, V., Carvalho, A. R. H., Puustinen, J., Alghamdi, H. M., Henini, M., Galeti, H. V. A., Guina, M. & Galvão Gobato, Y., helmikuuta 2017, julkaisussa : Journal of Luminescence. 182, s. 49-52 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Positioning information privacy in intelligent transportation systems: An overview and future perspective

Ometov, A., Bezzateev, S., Davydov, V., Shchesniak, A., Masek, P., Lohan, E. S. & Koucheryavy, Y., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Sensors. 19, 7, 1603.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Preparation of 5-substituted 2-carboxyindoles on solid support

Tois, J., Franzén, R., Aitio, O., Huikko, K. & Taskinen, J., 1 huhtikuuta 2000, julkaisussa : Tetrahedron Letters. 41, 14, s. 2443-2446 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Production of l-xylose from l-xylulose using Escherichia coli l-fucose isomerase

Usvalampi, A., Turunen, O., Valjakka, J., Pastinen, O., Leisola, M. & Nyyssölä, A., 5 tammikuuta 2012, julkaisussa : ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY. 50, 1, s. 71-76 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Recurrent thyroid cancers have more peritumoural lymphatic vasculature than nonrecurrent thyroid cancers

Hakala, T., Sand, J., Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Huhtala, H., Leinonen, R. & Kholová, I., 2014, julkaisussa : European Journal of Clinical Investigation. 44, 9, s. 825-832 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Regulation of asymmetries in the kinetics and protein numbers of bacterial gene expression

Startceva, S., Kandavalli, V. K., Visa, A. & Ribeiro, A. S., 1 helmikuuta 2019, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms. 1862, 2, s. 119-128 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Report from the 2nd Summer School in Computational Biology organized by the Queen's University of Belfast

Emmert-Streib, F., Zhang, S. D. & Hamilton, P., 2014, julkaisussa : Genomics Data. 2, s. 37-39 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Resonance assignments of the 56 kDa chimeric avidin in the biotin-bound and free forms

Tossavainen, H., Helppolainen, S. H., Määttä, J. A. E., Pihlajamaa, T., Hytönen, V. P., Kulomaa, M. S. & Permi, P., huhtikuuta 2013, julkaisussa : BIOMOLECULAR NMR ASSIGNMENTS. 7, 1, s. 35-38 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Responses of methane oxidation to temperature and water content in cover soil of a boreal landfill

Einola, J. K. M., Kettunen, R. H. & Rintala, J. A., toukokuuta 2007, julkaisussa : Soil Biology and Biochemistry. 39, 5, s. 1156-1164 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Revealing differences in gene network inference algorithms on the network level by ensemble methods

Altay, G. & Emmert-Streib, F., 25 toukokuuta 2010, julkaisussa : Bioinformatics. 26, 14, s. 1738-1744 7 Sivumäärä, btq259.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Robust statistical approaches for RSS-based floor detection in indoor localization

Razavi, A., Valkama, M. & Lohan, E. S., 1 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Sensors. 16, 6, 793.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Role of charged lipids in membrane structures: Insight given by simulations

Pöyry, S. & Vattulainen, I., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. s. 2322–2333 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Role of subunit III and its lipids in the molecular mechanism of cytochrome c oxidase

Sharma, V., Ala-Vannesluoma, P., Vattulainen, I., Wikström, M. & Róg, T., 17 huhtikuuta 2015, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1847, 8, s. 690-697 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

SamExploreR: Exploring reproducibility and robustness of RNA-seq results based on SAM files

Stupnikov, A., Tripathi, S., De Matos Simoes, R., McArt, D., Salto-Tellez, M., Glazko, G., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 21, s. 3345-3347 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

SCIP: a single-cell image processor toolbox

Martins, L., Neeli-Venkata, R., Oliveira, S. M. D., Häkkinen, A., Ribeiro, A. S. & Fonseca, J. M., 15 joulukuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 24, s. 4318-4320 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Sequential Collinear Photofragmentation and Atomic Absorption Spectroscopy for Online Laser Monitoring of Triatomic Metal Species

Viljanen, J., Kalmankoski, K., Contreras, V., Sarin, J. K., Sorvajärvi, T., Kinnunen, H., Enestam, S. & Toivonen, J., 18 tammikuuta 2020, julkaisussa : Sensors (Basel, Switzerland). 20, 2, 14 Sivumäärä, 533.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

sgnesR: An R package for simulating gene expression data from an underlying real gene network structure considering delay parameters

Tripathi, S., Lloyd-Price, J., Ribeiro, A., Yli-Harja, O., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 4 heinäkuuta 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, 1, 325.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Shiga-like toxin binds with high avidity to multivalent O-linked blood group P1 determinants on mucin-type fusion proteins

Maria Cherian, R., Gaunitz, S., Nilsson, A., Liu, J., Karlsson, N. G. & Holgersson, J., tammikuuta 2014, julkaisussa : GLYCOBIOLOGY. 24, 1, s. 26-38 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Small-molecule induction promotes corneal epithelial cell differentiation from human induced pluripotent stem cells

Mikhailova, A., Ilmarinen, T., Uusitalo, H. & Skottman, H., 11 helmikuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 2, 2, s. 219-231 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Soft hydrazone crosslinked hyaluronan- and alginate-based hydrogels as 3D supportive matrices for human pluripotent stem cell-derived neuronal cells

Karvinen, J., Joki, T., Ylä-Outinen, L., Koivisto, J. T., Narkilahti, S. & Kellomäki, M., 1 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Reactive and Functional Polymers. 124, s. 29-39 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Solution structure of nodularin: An inhibitor of serine/threonine- specific protein phosphatases

Annila, A., Lehtimäki, J., Mattila, K., Eriksson, J. E., Sivonen, K., Rantala, T. T. & Drakenberg, T., 1996, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 271, 28, s. 16695-16702 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Spectral object recognition in hyperspectral holography with complex-domain denoising

Shevkunov, I., Katkovnik, V., Claus, D., Pedrini, G., Petrov, N. V. & Egiazarian, K., 26 marraskuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 23, 10 Sivumäärä, 5188.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Stabilization of the peroxy intermediate in the oxygen splitting reaction of cytochrome cbb3

Sharma, V., Wikström, M. & Kaila, V. R. I., heinäkuuta 2011, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1807, 7, s. 813-818 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Statistical evaluation of barkhausen noise testing (BNT) for ground samples

Tomkowski, R., Sorsa, A., Santa-Aho, S., Lundin, P. & Vippola, M., 1 marraskuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 21, 4716.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structural information content of networks: Graph entropy based on local vertex functionals

Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., huhtikuuta 2008, julkaisussa : Computational Biology and Chemistry. 32, 2, s. 131-138 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structural Measures for Network Biology Using QuACN

Mueller, L. A. J., Kugler, K. G., Graber, A., Emmert-Streib, F. & Dehmer, M., 24 joulukuuta 2011, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 12, 1, 492.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structure and barrier properties of human embryonic stem cell-derived retinal pigment epithelial cells are affected by extracellular matrix protein coating

Sorkio, A., Hongisto, H., Kaarniranta, K., Uusitalo, H., Juuti-Uusitalo, K. & Skottman, H., 1 helmikuuta 2014, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 20, 3-4, s. 622-634 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structure-function analysis indicates that sumoylation modulates DNA-binding activity of STAT1

Grönholm, J., Vanhatupa, S., Ungureanu, D., Väliaho, J., Laitinen, T., Valjakka, J. & Silvennoinen, O., 2012, julkaisussa : BMC BIOCHEMISTRY. 13, 1, 20.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Submolecular Plasticization Induced by Photons in Azobenzene Materials

Vapaavuori, J., Laventure, A., Bazuin, C. G., Lebel, O. & Pellerin, C., 28 lokakuuta 2015, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 137, 42, s. 13510-13517 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Surface Modified Biodegradable Electrospun Membranes as a Carrier for Human Embryonic Stem Cell-Derived Retinal Pigment Epithelial Cells

Sorkio, A., Porter, P. J., Juuti-Uusitalo, K., Meenan, B. J., Skottman, H. & Burke, G. A., 1 syyskuuta 2015, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 21, 17-18, s. 2301-2314 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Surface science analysis and surface modification methods for biomaterials research

Kanninen, L., Jokinen, N., Lahtonen, K., Jussila, P., Ali-Löytty, H., Hirsimäki, M., Leppiniemi, J., Hytönen, V., Kulomaa, M., Ahola, N., Paakinaho, K., Kellomäki, M. & Valden, M., 1 tammikuuta 2010, julkaisussa : European Cells and Materials. 20, SUPPL. 3, s. 133 1 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Synthesis of chlorinated 5-hydroxy 4-methyl-2(5H)-furanones and mucochloric acid

Franzén, R. & Kronberg, L., 29 toukokuuta 1995, julkaisussa : Tetrahedron Letters. 36, 22, s. 3905-3908 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Synthesis, Structural Characterization, Hirshfeld Surface and Antioxidant Activity Analysis of a Novel Organic Cation Antimonate Complex

Lahbib, I., Valkonen, A., Rzaigui, M. & Smirani, W., 2017, julkaisussa : Journal of Cluster Science. 28, 4, s. 2239–2252 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The biophysical properties of ethanolamine plasmalogens revealed by atomistic molecular dynamics simulations

Rog, T. & Koivuniemi, A., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 1, s. 97-103 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The highly dynamic oligomeric structure of bradavidin II is unique among avidin proteins

Leppiniemi, J., Meir, A., Kahkonen, N., Kukkurainen, S., Maatta, J. A., Ojanen, M., Janis, J., Kulomaa, M. S., Livnah, O. & Hytonen, V. P., heinäkuuta 2013, julkaisussa : PROTEIN SCIENCE. 22, 7, s. 980-994 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The identity of the transient proton loading site of the proton-pumping mechanism of cytochrome c oxidase

Kaila, V. R. I., Sharma, V. & Wikström, M., tammikuuta 2011, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1807, 1, s. 80-84 5 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The role of the K-channel and the active-site tyrosine in the catalytic mechanism of cytochrome c oxidase

Sharma, V. & Wikström, M., elokuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1857, 8, s. 1111-1115

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Transcription closed and open complex formation coordinate expression of genes with a shared promoter region

Häkkinen, A., Oliveira, S. M. D., Neeli-Venkata, R. & Ribeiro, A. S., 1 joulukuuta 2019, julkaisussa : Journal of the Royal Society Interface. 16, 161, 11 Sivumäärä, 20190507.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Trans-interaction of nephrin and Neph1/Neph3 induces cell adhesion that associates with decreased tyrosine phosphorylation of nephrin

Heikkilä, E., Ristola, M., Havana, M., Jones, N., Holthöfer, H. & Lehtonen, S., 1 toukokuuta 2011, julkaisussa : BIOCHEMICAL JOURNAL. 435, 3, s. 619-628 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Tunable Plasmonic Silver Nanodomes for Surface-Enhanced Raman Scattering

Kahraman, M., Ozbay, A., Yuksel, H., Solmaz, R., Demir, B. & Caglayan, H., 5 huhtikuuta 2017, (Hyväksytty/In press) julkaisussa : Plasmonics. s. 1-11 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Tuning the Plasmonic Extinction Resonances of Hexagonal Arrays of Ag Nanoparticles

Ravi, A., Luthra, A., Teixeira, F. L., Berger, P. R. & Coe, J. V., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Plasmonics. 10, 6, s. 1505-1512 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Uncertainty in multispectral lidar signals caused by incidence angle effects

Kaasalainen, S., Åkerblom, M., Nevalainen, O., Hakala, T. & Kaasalainen, M., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170033.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Unite and conquer: Univariate and multivariate approaches for finding differentially expressed gene sets

Glazko, G. V. & Emmert-Streib, F., syyskuuta 2009, julkaisussa : Bioinformatics. 25, 18, s. 2348-2354 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Using shRNA experiments to validate gene regulatory networks

Olsen, C., Fleming, K., Prendergast, N., Rubio, R., Emmert-Streib, F., Bontempi, G., Quackenbush, J. & Haibe-Kains, B., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Genomics Data. 4, s. 123-126 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Utilizing Gelatinized Starchy Waste from Rice Noodle Factory as Substrate for L(+)-Lactic Acid Production by Amylolytic Lactic Acid Bacterium Enterococcus faecium K-1

Unban, K., Khanongnuch, R., Kanpiengjai, A., Shetty, K. & Khanongnuch, C., 2020, julkaisussa : Applied Biochemistry and Biotechnology.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Visualizing functional motions of membrane transporters with molecular dynamics simulations

Shaikh, S. A., Li, J., Enkavi, G., Wen, P. C., Huang, Z. & Tajkhorshid, E., 29 tammikuuta 2013, julkaisussa : Biochemistry. 52, 4, s. 569-587 19 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Weighing trees with lasers: Advances, challenges and opportunities

Disney, M. I., Boni Vicari, M., Burt, A., Calders, K., Lewis, S. L., Raumonen, P. & Wilkes, P., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170048.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Non-Brownian diffusion in lipid membranes: Experiments and simulations

Metzler, R., Jeon, J. H. & Cherstvy, A. G., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 215, s. 173–185

Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

Utilization of Grignard reagents in solid-phase synthesis: A review of the literature

Franzén, R. G., 28 tammikuuta 2000, julkaisussa : Tetrahedron. 56, 5, s. 685-691 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

Lipid membranes: Theory and simulations bridged to experiments

Vattulainen, I. & Róg, T., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2251-2253 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Advances in Human Stem Cell-Derived Neuronal Cell Culturing and Analysis

Ylä-Outinen, L., Tanskanen, J. M. A., Kapucu, F. E., Hyysalo, A., Hyttinen, J. A. K. & Narkilahti, S., 2019, In Vitro Neuronal Networks: From Culturing Methods to Neuro-Technological Applications. Springer New York LLC, s. 299-329 31 Sivumäärä (Advances in Neurobiology; painos 22).

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Biophysics of lipid bilayers containing oxidatively modified phospholipids: Insights from fluorescence and EPR experiments and from MD simulations

Jurkiewicz, P., Olzyńska, A., Cwiklik, L., Conte, E., Jungwirth, P., Megli, F. M. & Hof, M., lokakuuta 2012, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1818, 10, s. 2388-2402 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Endocrine prevention and treatment of prostate cancer

Tammela, T. L. J., 5 syyskuuta 2012, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 360, 1-2, s. 59-67 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Lipid hydration and mobility: An interplay between fluorescence solvent relaxation experiments and molecular dynamics simulations

Jurkiewicz, P., Cwiklik, L., Jungwirth, P. & Hof, M., tammikuuta 2012, julkaisussa : Biochimie. 94, 1, s. 26-32 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Modification of olivomycin A at the side chain of the aglycon yields the derivative with perspective antitumor characteristics

Tevyashova, A. N., Shtil, A. A., Olsufyeva, E. N., Luzikov, Y. N., Reznikova, M. I., Dezhenkova, L. G., Isakova, E. B., Bukhman, V. M., Durandin, N. A., Vinogradov, A. M., Kuzmin, V. A. & Preobrazhenskaya, M. N., 15 joulukuuta 2011, julkaisussa : BIOORGANIC AND MEDICINAL CHEMISTRY. 19, 24, s. 7387-7393 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Non-coding RNAs in DNA damage and repair

Sharma, V. & Misteli, T., 27 kesäkuuta 2013, julkaisussa : FEBS Letters. 587, 13, s. 1832-1839 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Understanding the Role of Lipids in Signaling Through Atomistic and Multiscale Simulations of Cell Membranes

Manna, M., Nieminen, T. & Vattulainen, I., 6 toukokuuta 2019, julkaisussa : ANNUAL REVIEW OF BIOPHYSICS. 48, s. 421-439 19 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu