SCIP: a single-cell image processor toolbox
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Biolääketieteen tekniikan tiedekunta, Campus FCT-UNL
Tekijät: Martins, L., Neeli-Venkata, R., Oliveira, S. M., Häkkinen, A., Ribeiro, A. S., Fonseca, J. M.
Sivumäärä: 3
Sivut: 4318-4320
Julkaisupäivä: 15 joulukuuta 2018
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 34
Numero: 24
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2018): CiteScore 9,7 SJR 4,549 SNIP 1,908
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistics and Probability, Biochemistry, Molecular Biology, Computer Science Applications, Computational Theory and Mathematics, Computational Mathematics
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
High-Reynolds-number turbulent cavity flow using the lattice Boltzmann method
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikka, Duke University, State University of Santa Catarina, Centro S3, University Tor Vergata, Jyväskylän yliopisto, Pontifical Catholic University of Paraná
Tekijät: Hegele, L. A., Scagliarini, A., Sbragaglia, M., Mattila, K. K., Philippi, P. C., Puleri, D. F., Gounley, J., Randles, A.
Sivumäärä: 13
Julkaisupäivä: 4 lokakuuta 2018
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 98
Numero: 4
Artikkeli: 043302
ISSN (painettu): 2470-0045
Luokitukset: - Scopus rating (2018): CiteScore 4,3 SJR 0,992 SNIP 1,188
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability, Condensed Matter Physics
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85054599510
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Comparative analysis of tissue reconstruction algorithms for 3D histology
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Biolääketieteen tekniikan tiedekunta, Kone- ja tuotantotekniikka, Signaalinkäsittely, Tutkimusryhmä: Data-analytiikka ja optimointi, Tampere University Hospital, Faculty of Medicine and Life Sciences, BioMediTech, Fimlab Laboratories Ltd, BioMediTech Institute
Tekijät: Kartasalo, K., Latonen, L., Vihinen, J., Visakorpi, T., Nykter, M., Ruusuvuori, P.
Sivumäärä: 9
Sivut: 3013-3021
Julkaisupäivä: 1 syyskuuta 2018
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 34
Numero: 17
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2018): CiteScore 9,7 SJR 4,549 SNIP 1,908
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistics and Probability, Biochemistry, Molecular Biology, Computer Science Applications, Computational Theory and Mathematics, Computational Mathematics
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85055091427
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Nonlinear continuous-wave optical propagation in nematic liquid crystals: Interplay between reorientational and thermal effects
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fotoniikka, Politechnika Warszawska, University “Roma Tre”, NooEL-Nonlinear Optics
Tekijät: Alberucci, A., Laudyn, U. A., Piccardi, A., Kwasny, M., Klus, B., Karpierz, M. A., Assanto, G.
Julkaisupäivä: 11 heinäkuuta 2017
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 96
Numero: 1
Artikkeli: 012703
ISSN (painettu): 2470-0045
Luokitukset: - Scopus rating (2017): CiteScore 4,3 SJR 0,979 SNIP 0,953
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability, Condensed Matter Physics
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85026478719
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
SamExploreR: Exploring reproducibility and robustness of RNA-seq results based on SAM files
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Signaalinkäsittelyn laitos, BioMediTech, Queen's University, Belfast, Northern Ireland, University of Arkansas for Medical Sciences, Nankai University
Tekijät: Stupnikov, A., Tripathi, S., De Matos Simoes, R., McArt, D., Salto-Tellez, M., Glazko, G., Dehmer, M., Emmert-Streib, F.
Sivumäärä: 3
Sivut: 3345-3347
Julkaisupäivä: 1 marraskuuta 2016
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 32
Numero: 21
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2016): CiteScore 10,8 SJR 5,21 SNIP 2,336
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistics and Probability, Medicine(all), Biochemistry, Molecular Biology, Computer Science Applications, Computational Theory and Mathematics, Computational Mathematics
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84994666672
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Search reliability and search efficiency of combined Lévy-Brownian motion: Long relocations mingled with thorough local exploration
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Tutkimusalue: Laskennallinen fysiikka, Technische Universitat Munchen, Universita degli Studi di Padova, Italy, School of Mathematical Sciences, Institute for Physics and Astronomy, Universitat Potsdam
Tekijät: Palyulin, V. V., Chechkin, A. V., Klages, R., Metzler, R.
Julkaisupäivä: 8 syyskuuta 2016
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical
Vuosikerta: 49
Numero: 39
Artikkeli: 394002
ISSN (painettu): 1751-8113
Luokitukset: - Scopus rating (2016): CiteScore 3,7 SJR 0,935 SNIP 0,941
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability, Modelling and Simulation, Mathematical Physics, Physics and Astronomy(all)
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84989172145
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Introducing libeemd: a program package for performing the ensemble empirical mode decomposition
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Tutkimusryhmä: Kvanttikontrolli ja -dynamiikka, Tutkimusalue: Laskennallinen fysiikka, University of Jyväskylä
Tekijät: Luukko, P. J. J., Helske, J., Räsänen, E.
Sivumäärä: 13
Sivut: 545-557
Julkaisupäivä: 1 kesäkuuta 2016
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Computational Statistics
Vuosikerta: 31
Numero: 2
ISSN (painettu): 0943-4062
Luokitukset: - Scopus rating (2016): CiteScore 2 SJR 0,706 SNIP 0,951
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistics and Probability, Computational Mathematics, Statistics, Probability and Uncertainty
EXT="Luukko, P. J. J."
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84963783252
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Characterizing rate limiting steps in transcription from RNA production times in live cells
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Tutkimusryhmä: Laboratory of Biosystem Dynamics-LBD, Signaalinkäsittelyn laitos
Tekijät: Häkkinen, A., Ribeiro, A. S.
Sivumäärä: 7
Sivut: 1346-1352
Julkaisupäivä: 1 toukokuuta 2016
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 32
Numero: 9
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2016): CiteScore 10,8 SJR 5,21 SNIP 2,336
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Molecular Biology, Computational Theory and Mathematics, Computer Science Applications, Computational Mathematics, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84966359423
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Diffusion through thin membranes: Modeling across scales
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikka, Fysiikan laitos, Tutkimusalue: Laskennallinen fysiikka, University of Jyväskylä, University of Eastern Finland, University of Helsinki, University of Oxford, ITMO University
Tekijät: Aho, V., Mattila, K., Kühn, T., Kekäläinen, P., Pulkkinen, O., Minussi, R. B., Vihinen-Ranta, M., Timonen, J.
Julkaisupäivä: 12 huhtikuuta 2016
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 93
Numero: 4
Artikkeli: 043309
ISSN (painettu): 1539-3755
Luokitukset: - Scopus rating (2016): CiteScore 1,95 SJR 1,271 SNIP 1,732
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Condensed Matter Physics, Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability
INT=fys,"Mattila, Keijo"
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84963620205
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
First-principles data set of 45,892 isolated and cation-coordinated conformers of 20 proteinogenic amino acids
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Fritz Haber Institute of the Max Planck Society, COMP Centre of Excellence, Department of Applied Physics, Aalto University, Aalto University, Duke University
Tekijät: Ropo, M., Schneider, M., Baldauf, C., Blum, V.
Julkaisupäivä: 16 helmikuuta 2016
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Scientific Data
Vuosikerta: 3
Artikkeli: 160009
ISSN (painettu): 2052-4463
Luokitukset: - Scopus rating (2016): CiteScore 4,7 SJR 3,261 SNIP 2,208
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Education, Library and Information Sciences, Computer Science Applications, Information Systems, Statistics, Probability and Uncertainty, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84961184519
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Using multi-step proposal distribution for improved MCMC convergence in Bayesian network structure learning
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Signaalinkäsittelyn laitos, Aalto University, Department of Computer Science and Information Systems
Tekijät: Larjo, A., Lähdesmäki, H.
Julkaisupäivä: 27 joulukuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Eurasip Journal on Bioinformatics and Systems Biology
Vuosikerta: 2015
Numero: 1
Artikkeli: 6
ISSN (painettu): 1687-4145
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 1,8 SJR 0,314 SNIP 0,371
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Medicine(all), Computer Science(all), Signal Processing, Statistics and Probability, General
EXT="Lähdesmäki, Harri"
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84932633872
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Hermitian one-particle density matrix through a semiclassical gradient expansion
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Tutkimusryhmä: Kvanttikontrolli ja -dynamiikka, Tutkimusalue: Laskennallinen fysiikka, Computational Science X (CompX), Université Ferhat
Tekijät: Bencheikh, K., Räsänen, E.
Julkaisupäivä: 9 joulukuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical
Vuosikerta: 49
Numero: 1
Artikkeli: 015205
ISSN (painettu): 1751-8113
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 3,5 SJR 1,028 SNIP 1,04
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Mathematical Physics, Physics and Astronomy(all), Statistical and Nonlinear Physics, Modelling and Simulation, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84961361098
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Forecasting mortality rate by singular spectrum analysis
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), Statistical Research and Training Center (SRTC), Shahid Beheshti University
Tekijät: Mahmoudvand, R., Alehosseini, F., Rodrigues, P. C.
Sivumäärä: 14
Sivut: 193-206
Julkaisupäivä: 1 marraskuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: REVSTAT STATISTICAL JOURNAL
Vuosikerta: 13
Numero: 3
ISSN (painettu): 1645-6726
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 2,6 SJR 1,333 SNIP 2,109
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84947785922
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Quantifying the non-ergodicity of scaled Brownian motion
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Institute for Physics and Astronomy, University of Potsdam, Akhiezer Institute for Theoretical Physics, Kharkov Institute of Physics and Technology, Institute for Physics AndAstronomy, Humboldt-Universität zu Berlin, Shahid Beheshti University
Tekijät: Safdari, H., Cherstvy, A. G., Chechkin, A. V., Thiel, F., Sokolov, I. M., Metzler, R.
Julkaisupäivä: 18 syyskuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical
Vuosikerta: 48
Numero: 37
Artikkeli: 375002
ISSN (painettu): 1751-8113
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 3,5 SJR 1,028 SNIP 1,04
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Mathematical Physics, Physics and Astronomy(all), Statistical and Nonlinear Physics, Modelling and Simulation, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84940069543
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Parity-time-symmetric solitons in trapped Bose-Einstein condensates and the influence of varying complex potentials: A variational approach
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Tutkimusryhmä: Epälineaarinen optiikka, Frontier Photonics, Universidade do Porto, Univ Roma Tre, Roma Tre University, Dept Elect Engn, NooEL, Cochin University of Science and Technology, Centro de Física Do Porto
Tekijät: Devassy, L., Jisha, C. P., Alberucci, A., Kuriakose, V. C.
Sivumäärä: 12
Julkaisupäivä: 19 elokuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 92
Numero: 2
Artikkeli: 022914
ISSN (painettu): 1539-3755
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 1,89 SJR 1,183 SNIP 2,283
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Condensed Matter Physics, Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84939612865
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Ageing first passage time density in continuous time random walks and quenched energy landscapes
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Institute for Physics and Astronomy, University of Potsdam, National Institute of Chemistry Ljubljana
Tekijät: Krüsemann, H., Godec, A., Metzler, R.
Julkaisupäivä: 17 heinäkuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical
Vuosikerta: 48
Numero: 28
Artikkeli: 285001
ISSN (painettu): 1751-8113
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 3,5 SJR 1,028 SNIP 1,04
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Mathematical Physics, Physics and Astronomy(all), Statistical and Nonlinear Physics, Modelling and Simulation, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84937118398
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Signal focusing through active transport
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Institute for Physics and Astronomy, University of Potsdam, Laboratory for Molecular Modeling, National Institute of Chemistry Ljubljana
Tekijät: Godec, A., Metzler, R.
Sivumäärä: 6
Julkaisupäivä: 2 heinäkuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 92
Numero: 1
Artikkeli: 010701
ISSN (painettu): 1539-3755
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 1,89 SJR 1,183 SNIP 2,283
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Condensed Matter Physics, Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84937010360
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
A robust AMMI model for the analysis of genotype-by-environment data
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), Centro de Matemática e Aplicações (CMA, NOVA University of Lisbon
Tekijät: Rodrigues, P. C., Monteiro, A., Lourenço, V. M.
Sivumäärä: 9
Sivut: 58-66
Julkaisupäivä: 1 heinäkuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 32
Numero: 1
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 9,7 SJR 4,97 SNIP 2,16
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Molecular Biology, Computational Theory and Mathematics, Computer Science Applications, Computational Mathematics, Statistics and Probability, Medicine(all)
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84959872026
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Investigation of an entropic stabilizer for the lattice-Boltzmann method
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikka, Department of Petroleum Engineering, State University of Santa Catarina, Federal University of Santa Catarina
Tekijät: Mattila, K. K., Hegele, L. A., Philippi, P. C.
Julkaisupäivä: 19 kesäkuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 91
Numero: 6
Artikkeli: 063010
ISSN (painettu): 1539-3755
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 1,89 SJR 1,183 SNIP 2,283
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Condensed Matter Physics, Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability
INT=fys,"Mattila, Keijo K."
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84936946902
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Optimization and universality of Brownian search in a basic model of quenched heterogeneous media
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Institute for Physics and Astronomy, University of Potsdam, National Institute of Chemistry Ljubljana
Tekijät: Godec, A., Metzler, R.
Julkaisupäivä: 21 toukokuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 91
Numero: 5
Artikkeli: 052134
ISSN (painettu): 1539-3755
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 1,89 SJR 1,183 SNIP 2,283
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Condensed Matter Physics, Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84930652975
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Ergodicity breaking, ageing, and confinement in generalized diffusion processes with position and time dependent diffusivity
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Institute for Physics and Astronomy, University of Potsdam
Tekijät: Cherstvy, A. G., Metzler, R.
Julkaisupäivä: 15 toukokuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment
Vuosikerta: 2015
Numero: 5
Artikkeli: P05010
ISSN (painettu): 1742-5468
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 3,7 SJR 0,689 SNIP 0,829
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistics and Probability, Statistical and Nonlinear Physics, Statistics, Probability and Uncertainty
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84930653082
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Aging scaled Brownian motion
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Tutkimusalue: Laskennallinen fysiikka, Max-Planck Institute for the Physics of Complex Systems, Institute for Physics and Astronomy, University of Potsdam, Nordic Institute for Theoretical Physics NORDITA, Shahid Beheshti University, Kharkov Institute of Physics and Technology
Tekijät: Safdari, H., Chechkin, A. V., Jafari, G. R., Metzler, R.
Julkaisupäivä: 7 huhtikuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 91
Numero: 4
Artikkeli: 042107
ISSN (painettu): 1539-3755
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 1,89 SJR 1,183 SNIP 2,283
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Condensed Matter Physics, Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84929095545
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Conformational properties of complex polymers: Rosette versus star-like structures
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Institute for Physics and Astronomy, University of Potsdam, Institute for Condensed Matter Physics, National Academy of Sciences of Ukraine
Tekijät: Blavatska, V., Metzler, R.
Julkaisupäivä: 7 huhtikuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical
Vuosikerta: 48
Numero: 13
Artikkeli: 135001
ISSN (painettu): 1751-8113
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 3,5 SJR 1,028 SNIP 1,04
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Mathematical Physics, Physics and Astronomy(all), Statistical and Nonlinear Physics, Modelling and Simulation, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84930681628
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Dynamics of intracranial electroencephalographic recordings from epilepsy patients using univariate and bivariate recurrence networks
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Elektroniikan ja tietoliikennetekniikan laitos, Tutkimusryhmä: Laskennallisen biofysiikan ja kuvantamisen ryhmä, BioMediTech, Integrated Technologies for Tissue Engineering Research (ITTE), BioMediTech
Tekijät: Subramaniyam, N. P., Hyttinen, J.
Julkaisupäivä: 27 helmikuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 91
Numero: 2
Artikkeli: 022927
ISSN (painettu): 1539-3755
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 1,89 SJR 1,183 SNIP 2,283
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Condensed Matter Physics, Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84924359654
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal fluorescence intensity data
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Signaalinkäsittelyn laitos, Tutkimusryhmä: Laboratory of Biosystem Dynamics-LBD, Multi-scaled biodata analysis and modelling (MultiBAM)
Tekijät: Häkkinen, A., Ribeiro, A. S.
Sivumäärä: 7
Sivut: 69-75
Julkaisupäivä: 1 tammikuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 31
Numero: 1
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 9,7 SJR 4,97 SNIP 2,16
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Molecular Biology, Computational Theory and Mathematics, Computer Science Applications, Computational Mathematics, Statistics and Probability, Medicine(all)
Contribution: organisation=sgn,FACT1=1<br/>Portfolio EDEND: 2014-09-15<br/>Publisher name: Oxford University Press
Lähde: researchoutputwizard
Lähteen ID: 396
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Majorization-minimization for manifold embedding
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), Aalto University
Tekijät: Yang, Z., Peltonen, J., Kaski, S.
Sivumäärä: 10
Sivut: 1088-1097
Julkaisupäivä: 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Journal of Machine Learning Research
Vuosikerta: 38
ISSN (painettu): 1532-4435
Luokitukset: - Scopus rating (2015): CiteScore 4,5 SJR 1,431 SNIP 2,032
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Control and Systems Engineering, Software, Statistics and Probability, Artificial Intelligence
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84954311496
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
NetBioV: An R package for visualizing large network data in biology and medicine
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), Prostate cancer research center (PCRC), Queen's University, Belfast, Northern Ireland, Universität der Bundeswehr München, Computational Biology and Machine Learning
Tekijät: Tripathi, S., Dehmer, M., Emmert-Streib, F.
Sivumäärä: 3
Sivut: 2834-2836
Julkaisupäivä: 2 huhtikuuta 2014
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 30
Numero: 19
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2014): CiteScore 9 SJR 4,171 SNIP 1,838
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Molecular Biology, Computational Theory and Mathematics, Computer Science Applications, Computational Mathematics, Statistics and Probability, Medicine(all)
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84911403383
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Gene Sets Net Correlations Analysis (GSNCA): A multivariate differential coexpression test for gene sets
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), University of Arkansas for Medical Sciences, Computational Biology and Machine Learning, Queen's University, Belfast, Northern Ireland
Tekijät: Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F., Glazko, G.
Sivumäärä: 9
Sivut: 360-368
Julkaisupäivä: 1 helmikuuta 2014
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 30
Numero: 3
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2014): CiteScore 9 SJR 4,171 SNIP 1,838
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Molecular Biology, Computational Theory and Mathematics, Computer Science Applications, Computational Mathematics, Statistics and Probability, Medicine(all)
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84893275855
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Structured orthogonal families of one and two strata prime basis factorial models
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), ISLA Campus Lisbon, Laureate International Universities, Campus FCT-UNL
Tekijät: Rodrigues, P. C., Moreira, E. E., Jesus, V. M., Mexia, J. T.
Sivumäärä: 12
Sivut: 603-614
Julkaisupäivä: 2014
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Statistical Papers
Vuosikerta: 55
Numero: 3
ISSN (painettu): 0932-5026
Luokitukset: - Scopus rating (2014): CiteScore 1,7 SJR 1,037 SNIP 1,55
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistics and Probability, Statistics, Probability and Uncertainty
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84903887341
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Information retrieval perspective to meta-visualization
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), Aalto University
Tekijät: Peltonen, J., Lin, Z.
Sivumäärä: 16
Sivut: 165-180
Julkaisupäivä: 2013
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Journal of Machine Learning Research
Vuosikerta: 29
ISSN (painettu): 1532-4435
Luokitukset: - Scopus rating (2013): CiteScore 6,2 SJR 1,235 SNIP 2,293
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Artificial Intelligence, Software, Control and Systems Engineering, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84908485499
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Gene set analysis for self-contained tests: Complex null and specific alternative hypotheses
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Prostate cancer research center (PCRC), University of Arkansas for Medical Sciences, Computational Biology and Machine Learning, Queen's University, Belfast, Northern Ireland
Tekijät: Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F., Glazko, G.
Sivumäärä: 8
Sivut: 3073-3080
Julkaisupäivä: joulukuuta 2012
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 28
Numero: 23
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2012): CiteScore 10,5 SJR 5,275 SNIP 2,051
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Molecular Biology, Computational Theory and Mathematics, Computer Science Applications, Computational Mathematics, Statistics and Probability, Medicine(all)
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84870441671
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
A comparison between joint regression analysis and the AMMI model: A case study with barley
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), Depto. de Matemática, NOVA University of Lisbon, Dept. of Mathematical and Statistical Methods
Tekijät: Pereira, D. G., Rodrigues, P. C., Mejza, S., Mexia, J. T.
Sivumäärä: 15
Sivut: 193-207
Julkaisupäivä: helmikuuta 2012
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: JOURNAL OF STATISTICAL COMPUTATION AND SIMULATION
Vuosikerta: 82
Numero: 2
ISSN (painettu): 0094-9655
Luokitukset: - Scopus rating (2012): CiteScore 1 SJR 0,604 SNIP 1,041
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Applied Mathematics, Statistics and Probability, Modelling and Simulation, Statistics, Probability and Uncertainty
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84856990001
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
A stochastic model for survival of early prostate cancer with adjustments for leadtime, length bias, and over-detection
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Prostate cancer research center (PCRC), National Taiwan University, Finnish Cancer Institute, Taipei Medical University, McMaster University
Tekijät: Wu, G. H. M., Auvinen, A., Yen, A. M. F., Hakama, M., Walter, S. D., Chen, H. H.
Sivumäärä: 25
Sivut: 20-44
Julkaisupäivä: tammikuuta 2012
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Biometrical Journal
Vuosikerta: 54
Numero: 1
ISSN (painettu): 0323-3847
Luokitukset: - Scopus rating (2012): CiteScore 2,3 SJR 1,132 SNIP 0,883
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistics and Probability, Medicine(all), Statistics, Probability and Uncertainty
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84862974650
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Clustering-based method for developing a genomic copy number alteration signature for predicting the metastatic potential of prostate cancer
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Prostate cancer research center (PCRC), Albert Einstein College of Medicine of Yeshiva University, NYU Langone Medical Center, Baylor College of Medicine, Johns Hopkins School of Medicine, Department of Surgery
Tekijät: Pearlman, A., Campbell, C., Brooks, E., Genshaft, A., Shajahan, S., Ittman, M., Bova, G. S., Melamed, J., Holcomb, I., Schneider, R. J., Ostrer, H.
Julkaisupäivä: 2012
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: JOURNAL OF PROBABILITY AND STATISTICS
Artikkeli: 873570
ISSN (painettu): 1687-952X
Luokitukset: - Scopus rating (2012): CiteScore 0,5 SJR 0,166 SNIP 0,46
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84864941918
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Reorientational versus Kerr dark and gray solitary waves using modulation theory
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Frontier Photonics, Univ Roma Tre, Roma Tre University, Dept Elect Engn, NooEL, University “Roma Tre”, University of Wollongong, Department of Electrical Engineering, University of Edinburgh
Tekijät: Assanto, G., Marchant, T. R., Minzoni, A. A., Smyth, N. F.
Julkaisupäivä: 9 joulukuuta 2011
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 84
Numero: 6
Artikkeli: 066602
ISSN (painettu): 1539-3755
Luokitukset: - Scopus rating (2011): CiteScore 2,28 SJR 1,48 SNIP 0
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Condensed Matter Physics, Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84555189254
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
BACOM: In silico detection of genomic deletion types and correction of normal cell contamination in copy number data
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Prostate cancer research center (PCRC), Virginia Tech, Johns Hopkins School of Medicine, Wake Forest University School of Medicine
Tekijät: Yu, G., Zhang, B., Bova, G. S., Xu, J., Shih, I. M., Wang, Y.
Sivumäärä: 8
Sivut: 1473-1480
Julkaisupäivä: kesäkuuta 2011
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 27
Numero: 11
Artikkeli: btr183
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2011): CiteScore 8,9 SJR 4,118 SNIP 1,83
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Molecular Biology, Computational Theory and Mathematics, Computer Science Applications, Computational Mathematics, Statistics and Probability, Medicine(all)
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 79957859881
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Dynamics of coupled repressilators: The role of mRNA kinetics and transcription cooperativity
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Mathematical modelling with wide societal impact (MathImpact), Department of Theoretical Physics, Lebedev Physical Institute, IUPUI
Tekijät: Potapov, I., Volkov, E., Kuznetsov, A.
Julkaisupäivä: 4 maaliskuuta 2011
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 83
Numero: 3
Artikkeli: 031901
ISSN (painettu): 1539-3755
Luokitukset: - Scopus rating (2011): CiteScore 2,28 SJR 1,48 SNIP 0
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Condensed Matter Physics, Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 79953153880
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Generative modeling for maximizing precision and recall in information visualization
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), Aalto University, University of Helsinki
Tekijät: Peltonen, J., Kaski, S.
Sivumäärä: 9
Sivut: 579-587
Julkaisupäivä: 2011
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Journal of Machine Learning Research
Vuosikerta: 15
ISSN (painettu): 1532-4435
Luokitukset: - Scopus rating (2011): CiteScore 7,7 SJR 1,18 SNIP 2,912
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Artificial Intelligence, Software, Control and Systems Engineering, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84862299625
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Revealing differences in gene network inference algorithms on the network level by ensemble methods
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: School of Medicine, Computational Biology and Machine Learning
Tekijät: Altay, G., Emmert-Streib, F.
Sivumäärä: 7
Sivut: 1738-1744
Julkaisupäivä: 25 toukokuuta 2010
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 26
Numero: 14
Artikkeli: btq259
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2010): SJR 3,661 SNIP 1,886
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Molecular Biology, Computational Theory and Mathematics, Computer Science Applications, Computational Mathematics, Statistics and Probability, Medicine(all)
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 77954484005
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Exploratory analysis of spatiotemporal patterns of cellular automata by clustering compressibility
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Computational Biology and Machine Learning Lab., Faculty of Medicine, Health and Life Sciences, Queen's University, Belfast, Northern Ireland
Tekijät: Emmert-Streib, F.
Julkaisupäivä: 8 helmikuuta 2010
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physical Review E
Vuosikerta: 81
Numero: 2
Artikkeli: 026103
ISSN (painettu): 1539-3755
Luokitukset: - Scopus rating (2010): SJR 1,692 SNIP 1,213
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Condensed Matter Physics, Statistical and Nonlinear Physics, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 76749153776
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Unite and conquer: Univariate and multivariate approaches for finding differentially expressed gene sets
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: University of Rochester Medical Center, Computational Biology and Machine Learning, Queen's University, Belfast, Northern Ireland
Tekijät: Glazko, G. V., Emmert-Streib, F.
Sivumäärä: 7
Sivut: 2348-2354
Julkaisupäivä: syyskuuta 2009
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Bioinformatics
Vuosikerta: 25
Numero: 18
ISSN (painettu): 1367-4803
Luokitukset: - Scopus rating (2009): SJR 3,111 SNIP 1,834
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Molecular Biology, Computational Theory and Mathematics, Computer Science Applications, Computational Mathematics, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 69849105388
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Fault tolerance of information processing in gene networks
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Computational Biology and Machine Learning, School of Biomedical Sciences, Department of Biostatistics, TU Vienna
Tekijät: Emmert-Streib, F., Dehmer, M.
Sivumäärä: 8
Sivut: 541-548
Julkaisupäivä: 15 helmikuuta 2009
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Lehti: Physica A: Statistical Mechanics and Its Applications
Vuosikerta: 388
Numero: 4
ISSN (painettu): 0378-4371
Luokitukset: - Scopus rating (2009): SJR 0,829 SNIP 1,026
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Condensed Matter Physics, Statistics and Probability
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 57349185507
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu
Performance of Variable Partial Factor approach in a slope design
Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A4 Artikkeli konferenssijulkaisussa
Yksiköt: Rakennustekniikka
Tekijät: Knuuti, M., Länsivaara, T.
Julkaisupäivä: 2019
Otsikko: 13th International Conference on Applications of Statistics and Probability in Civil Engineering(ICASP13), Seoul, South Korea, May 26-30, 2019
!!ASJC Scopus subject areas: Civil and Structural Engineering, Statistics and Probability
Tutkimustuotos › › vertaisarvioitu