Dissecting the in vivo dynamics of transcription locking due to positive supercoiling buildup

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Tutkimusryhmä: Laboratory of Biosystem Dynamics-LBD, Biolääketieteen tekniikan tiedekunta, BioMediTech, Tampere University
Tekijät: Palma, C. S., Kandavalli, V., Bahrudeen, M. N., Minoia, M., Chauhan, V., Dash, S., Ribeiro, A. S.
Julkaisupäivä: 1 toukokuuta 2020
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms
Vuosikerta: 1863
Numero: 5
Artikkeli: 194515
ISSN (painettu): 1874-9399
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biophysics, Structural Biology, Biochemistry, Molecular Biology, Genetics
DOI - pysyväislinkit: 

Lisätietoja

jufoid=52526006

Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85080975088

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

High-content imaging and structure-based predictions reveal functional differences between Niemann-Pick C1 variants

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikka, University of Helsinki, Minerva Foundation Institute for Medical Research Helsinki, Computational Physics Laboratory
Tekijät: Vanharanta, L., Peränen, J., Pfisterer, S. G., Enkavi, G., Vattulainen, I., Ikonen, E.
Sivumäärä: 12
Sivut: 386-397
Julkaisupäivä: 1 toukokuuta 2020
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: Traffic
Vuosikerta: 21
Numero: 5
ISSN (painettu): 1398-9219
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Structural Biology, Biochemistry, Molecular Biology, Genetics, Cell Biology
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85083734743

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Pulmonary Surfactant Lipid Reorganization Induced by the Adsorption of the Oligomeric Surfactant Protein B Complex

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikka, Tutkimusryhmä: Biologinen fysiikka, University of Helsinki, Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Academy of Sciences of the Czech Republic, Universidad Complutense de Madrid, Research Institut “Hospital 2 de Octubre (imas12)”, MEMPHYS
Tekijät: Liekkinen, J., Enkavi, G., Javanainen, M., Olmeda, B., Pérez-Gil, J., Vattulainen, I.
Sivumäärä: 18
Sivut: 3251-3268
Julkaisupäivä: 2020
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
Vuosikerta: 432
Numero: 10
ISSN (painettu): 0022-2836
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Structural Biology, Molecular Biology
DOI - pysyväislinkit: 

Lisätietoja

EXT="Enkavi, Giray"

Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85082856561

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Sodium channels enable fast electrical signaling and regulate phagocytosis in the retinal pigment epithelium

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: BioMediTech, Tampere University, University of Jyvaskyla, Tampere University Hospital
Tekijät: Johansson, J. K., Karema-Jokinen, V. I., Hakanen, S., Jylhä, A., Uusitalo, H., Vihinen-Ranta, M., Skottman, H., Ihalainen, T. O., Nymark, S.
Julkaisupäivä: 15 elokuuta 2019
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC BIOLOGY
Vuosikerta: 17
Numero: 1
Artikkeli: 63
ISSN (painettu): 1741-7007
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2019): CiteScore 9,5 SJR 3,698 SNIP 1,604
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biotechnology, Structural Biology, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Physiology, Biochemistry, Genetics and Molecular Biology(all), Agricultural and Biological Sciences(all), Plant Science, Developmental Biology, Cell Biology
Sähköiset versiot: 
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85071165212

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Understanding the Role of Lipids in Signaling Through Atomistic and Multiscale Simulations of Cell Membranes

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A2 Katsausartikkeli
Yksiköt: Tutkimusryhmä: Biologinen fysiikka, Tutkimusalue: Laskennallinen fysiikka, Fysiikka, Indian Institute of Science Education and Research Bhopal, Helsinki University
Tekijät: Manna, M., Nieminen, T., Vattulainen, I.
Sivumäärä: 19
Sivut: 421-439
Julkaisupäivä: 6 toukokuuta 2019
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: ANNUAL REVIEW OF BIOPHYSICS
Vuosikerta: 48
ISSN (painettu): 1936-122X
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2019): CiteScore 18,3 SJR 7,456 SNIP 2,86
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biophysics, Structural Biology, Bioengineering, Biochemistry, Cell Biology

Lisätietoja

EXT="Manna, Moutusi"

Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85065827906

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Iterative unsupervised domain adaptation for generalized cell detection from brightfield z-stacks

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: BioMediTech, Tampere University of Applied Sciences, University of Eastern Finland
Tekijät: Liimatainen, K., Kananen, L., Latonen, L., Ruusuvuori, P.
Julkaisupäivä: 15 helmikuuta 2019
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Bioinformatics
Vuosikerta: 20
Numero: 1
Artikkeli: 80
ISSN (painettu): 1471-2105
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2019): CiteScore 4,6 SJR 1,626 SNIP 1,156
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Structural Biology, Biochemistry, Molecular Biology, Computer Science Applications, Applied Mathematics
Sähköiset versiot: 
DOI - pysyväislinkit: 

Lisätietoja

DUPL=47150514

Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85061610929

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Regulation of asymmetries in the kinetics and protein numbers of bacterial gene expression

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Tutkimusryhmä: Laboratory of Biosystem Dynamics-LBD, Biolääketieteen tekniikan tiedekunta, Signaalinkäsittely
Tekijät: Startceva, S., Kandavalli, V. K., Visa, A., Ribeiro, A. S.
Sivumäärä: 10
Sivut: 119-128
Julkaisupäivä: 1 helmikuuta 2019
Onko vertaisarvioitu: Kyllä
Varhainen verkossa julkaisun päivämäärä: 14 joulukuuta 2018

Julkaisutiedot

Lehti: Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms
Vuosikerta: 1862
Numero: 2
ISSN (painettu): 1874-9399
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2019): SJR 1,92 SNIP 1,066
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biophysics, Structural Biology, Biochemistry, Molecular Biology, Genetics
Sähköiset versiot: 
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85058814221

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structure and dynamics of a human myelin protein P2 portal region mutant indicate opening of the β barrel in fatty acid binding proteins

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikka, University of Oulu, European Spallation Source (ESS), University of Bergen, Univ Lille Nord de France, University of Helsinki
Tekijät: Laulumaa, S., Nieminen, T., Raasakka, A., Krokengen, O. C., Safaryan, A., Hallin, E. I., Brysbaert, G., Lensink, M. F., Ruskamo, S., Vattulainen, I., Kursula, P.
Julkaisupäivä: 25 kesäkuuta 2018
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Structural Biology
Vuosikerta: 18
Numero: 1
Artikkeli: 8
ISSN (painettu): 1472-6807
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2018): CiteScore 2,2 SJR 0,546 SNIP 0,408
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Structural Biology
Sähköiset versiot: 
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85049186598

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The precision of the symmetry in Z-ring placement in Escherichia coli is hampered at critical temperatures

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Tutkimusryhmä: Laboratory of Biosystem Dynamics-LBD, Biolääketieteen tekniikan tiedekunta, Faculdade de Ciencias e Tecnologia, New University of Lisbon
Tekijät: Neeli-Venkata, R., Oliveira, S. M., Martins, L., Startceva, S., Bahrudeen, M., Fonseca, J. M., Minoia, M., Ribeiro, A. S.
Julkaisupäivä: 18 toukokuuta 2018
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: Physical Biology
Vuosikerta: 15
Numero: 5
Artikkeli: 056002
ISSN (painettu): 1478-3967
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2018): CiteScore 1,93 SJR 1,066 SNIP 0,632
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biophysics, Structural Biology, Molecular Biology, Cell Biology
Sähköiset versiot: 
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85049839706

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparison of different coating techniques on the properties of FucoPol films

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikka, Tutkimusryhmä: Aerosolisynteesi, Campus FCT-UNL, Centre for Molecular Medicine Norway, Nordic European Molecular Biology Laboratory Partnership, University of Oslo, SP Technical Research Institute of Sweden, Universidade de Lisboa
Tekijät: Ferreira, A. R., Haapanen, J., Mäkelä, J. M., Bratvold, J. E., Nilsen, O., Tuominen, M., Alves, V. D., Coelhoso, I. M.
Sivumäärä: 7
Sivut: 268-274
Julkaisupäivä: 1 lokakuuta 2017
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: International Journal of Biological Macromolecules
Vuosikerta: 103
ISSN (painettu): 0141-8130
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2017): CiteScore 5,5 SJR 0,917 SNIP 1,328
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Structural Biology, Biochemistry, Molecular Biology
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85019938774

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

sgnesR: An R package for simulating gene expression data from an underlying real gene network structure considering delay parameters

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: BioMediTech, Biolääketieteen tekniikan tiedekunta, Signaalinkäsittely, Tutkimusryhmä: Laboratory of Biosystem Dynamics-LBD, Tutkimusryhmä: Computational Systems Biology, Tutkimusryhmä: Computational Medicine and Statistical Learning Laboratory (CMSL), Research group: Predictive Society and Data Analytics (PSDA), Harvard T.H. Chan School of Public Health, Harvard School of Public Health, Mathematics and Operations Research
Tekijät: Tripathi, S., Lloyd-Price, J., Ribeiro, A., Yli-Harja, O., Dehmer, M., Emmert-Streib, F.
Julkaisupäivä: 4 heinäkuuta 2017
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Bioinformatics
Vuosikerta: 18
Numero: 1
Artikkeli: 325
ISSN (painettu): 1471-2105
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2017): CiteScore 4,3 SJR 1,479 SNIP 0,907
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Structural Biology, Biochemistry, Molecular Biology, Computer Science Applications, Applied Mathematics
Sähköiset versiot: 
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85021637056

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

GSAR: Bioconductor package for Gene Set analysis in R

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Biolääketieteen tekniikan tiedekunta, Research group: Predictive Society and Data Analytics (PSDA), University of Arkansas for Medical Sciences, Computational Medicine and Statistical Learning Laboratory
Tekijät: Rahmatallah, Y., Zybailov, B., Emmert-Streib, F., Glazko, G.
Julkaisupäivä: 24 tammikuuta 2017
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Bioinformatics
Vuosikerta: 18
Numero: 1
Artikkeli: 61
ISSN (painettu): 1471-2105
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2017): CiteScore 4,3 SJR 1,479 SNIP 0,907
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Structural Biology, Biochemistry, Molecular Biology, Computer Science Applications, Applied Mathematics
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 85010460642

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effects of σ factor competition are promoter initiation kinetics dependent

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Signaalinkäsittelyn laitos, Tutkimusryhmä: Laboratory of Biosystem Dynamics-LBD
Tekijät: Kandavalli, V. K., Tran, H., Ribeiro, A. S.
Sivumäärä: 8
Sivut: 1281-1288
Julkaisupäivä: 1 lokakuuta 2016
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: Biochimica et Biophysica Acta: Gene Regulatory Mechanisms
Vuosikerta: 1859
Numero: 10
ISSN (painettu): 1874-9399
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2016): CiteScore 5,21 SJR 3,775 SNIP 1,311
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Biophysics, Genetics, Molecular Biology, Structural Biology
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84979503502

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Biogenesis of Nascent High Density Lipoprotein Particles

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Fysiikan laitos, Tutkimusryhmä: Biologinen fysiikka, VTT Technical Research Centre of Finland, VTT Tech Res Ctr Finland, VTT Technical Research Center Finland, MEMPHYS - Centre for Biomembrane Physics, University of Southern Denmark
Tekijät: Koivuniemi, A., Vattulainen, I.
Sivumäärä: 2
Sivut: 1153-1154
Julkaisupäivä: 9 heinäkuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: Structure
Vuosikerta: 23
Numero: 7
Artikkeli: 3212
ISSN (painettu): 0969-2126
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2015): CiteScore 4,89 SJR 4,659 SNIP 1,47
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Molecular Biology, Structural Biology
DOI - pysyväislinkit: 

Lisätietoja

EXT="Koivuniemi, Artturi"

Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84936770385

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Urothelial cancer gene regulatory networks inferred from large-scale RNAseq, Bead and Oligo gene expression data

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Signaalinkäsittelyn laitos, BioMediTech, Research Community on Data-to-Decision (D2D), BioMediTech - Institute of Biosciences and Medical Technology, Queen's University, Belfast, Northern Ireland
Tekijät: Matos Simoes, R. D., Dalleau, S., Williamson, K. E., Emmert-Streib, F.
Julkaisupäivä: 14 toukokuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Systems Biology
Vuosikerta: 9
Artikkeli: 21
ISSN (painettu): 1752-0509
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2015): CiteScore 5,4 SJR 1,549 SNIP 0,89
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Molecular Biology, Structural Biology, Applied Mathematics, Modelling and Simulation, Computer Science Applications
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84931068065

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A Bayesian approach for suppression of limited angular sampling artifacts in single particle 3D reconstruction

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Signaalinkäsittelyn laitos, Tutkimusryhmä: M2oBSI, BioMediTech, UC Davis, BioMediTech
Tekijät: Moriya, T., Acar, E., Cheng, R. H., Ruotsalainen, U.
Sivumäärä: 14
Sivut: 318–331
Julkaisupäivä: 3 huhtikuuta 2015
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: Journal of Structural Biology
Vuosikerta: 191
Numero: 3
ISSN (painettu): 1047-8477
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2015): CiteScore 6,2 SJR 3,448 SNIP 1,112
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Structural Biology
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84940614849

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparative evaluation of gene set analysis approaches for RNA-Seq data

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), University of Arkansas for Medical Sciences, Computational Biology and Machine Learning, Queen's University, Belfast, Northern Ireland
Tekijät: Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F., Glazko, G.
Julkaisupäivä: 5 joulukuuta 2014
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Bioinformatics
Vuosikerta: 15
Numero: 1
Artikkeli: 397
ISSN (painettu): 1471-2105
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2014): CiteScore 5,5 SJR 1,916 SNIP 1,199
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Applied Mathematics, Structural Biology, Biochemistry, Molecular Biology, Computer Science Applications
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84923922737

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

AROS has a context-dependent effect on SIRT1

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Multi-scaled biodata analysis and modelling (MultiBAM), Ita-Suomen yliopisto
Tekijät: Kokkola, T., Suuronen, T., Molnár, F., Määttä, J., Salminen, A., Jarho, E. M., Lahtela-Kakkonen, M.
Sivumäärä: 6
Sivut: 1523-1528
Julkaisupäivä: 2 toukokuuta 2014
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: FEBS Letters
Vuosikerta: 588
Numero: 9
ISSN (painettu): 0014-5793
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2014): CiteScore 5,9 SJR 1,859 SNIP 0,862
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Biophysics, Cell Biology, Genetics, Molecular Biology, Structural Biology
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84899643028

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Investigating the binding behaviour of two avidin-based testosterone binders using molecular recognition force spectroscopy

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Multi-scaled biodata analysis and modelling (MultiBAM), Johannes Kepler University, School of Management (JKK), Fimlab Laboratories Ltd, Center for Advanced Bioanalysis
Tekijät: Rangl, M., Leitner, M., Riihimäki, T., Lehtonen, S., Hytönen, V. P., Gruber, H. J., Kulomaa, M., Hinterdorfer, P., Ebner, A.
Sivumäärä: 6
Sivut: 92-97
Julkaisupäivä: helmikuuta 2014
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: Journal of Molecular Recognition
Vuosikerta: 27
Numero: 2
ISSN (painettu): 0952-3499
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2014): CiteScore 4,4 SJR 0,729 SNIP 0,882
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Structural Biology, Molecular Biology
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84892621500

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Functional and genetic analysis of the colon cancer network.

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), Queen’s University Belfast
Tekijät: Emmert-Streib, F., de Matos Simoes, R., Glazko, G., McDade, S., Haibe-Kains, B., Holzinger, A., Dehmer, M., Campbell, F.
Julkaisupäivä: 2014
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Bioinformatics
Vuosikerta: 15
Numero: Suppl 6
Artikkeli: S6
ISSN (painettu): 1471-2105
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2014): CiteScore 5,5 SJR 1,916 SNIP 1,199
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Molecular Biology, Computer Science Applications, Applied Mathematics, Structural Biology

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The structural motifs for substrate binding and dimerization of the α subunit of collagen prolyl 4-hydroxylase

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Prostate cancer research center (PCRC), Univ of Oulu, Centre for Structural Systems Biology
Tekijät: Anantharajan, J., Koski, M. K., Kursula, P., Hieta, R., Bergmann, U., Myllyharju, J., Wierenga, R. K.
Sivumäärä: 12
Sivut: 2107-2118
Julkaisupäivä: 3 joulukuuta 2013
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: Structure
Vuosikerta: 21
Numero: 12
ISSN (painettu): 0969-2126
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2013): CiteScore 5,4 SJR 5,137 SNIP 1,535
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Molecular Biology, Structural Biology
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84889591688

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Non-coding RNAs in DNA damage and repair

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A2 Katsausartikkeli
Yksiköt: Computational Science X (CompX), National Cancer Institute
Tekijät: Sharma, V., Misteli, T.
Sivumäärä: 8
Sivut: 1832-1839
Julkaisupäivä: 27 kesäkuuta 2013
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: FEBS Letters
Vuosikerta: 587
Numero: 13
ISSN (painettu): 0014-5793
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2013): CiteScore 7 SJR 2,356 SNIP 0,974
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Biophysics, Cell Biology, Genetics, Molecular Biology, Structural Biology
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84878919248

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Resonance assignments of the 56 kDa chimeric avidin in the biotin-bound and free forms

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Multi-scaled biodata analysis and modelling (MultiBAM), University of Helsinki Institute of Biotechnology, School of Management (JKK), BioMediTech
Tekijät: Tossavainen, H., Helppolainen, S. H., Määttä, J. A. E., Pihlajamaa, T., Hytönen, V. P., Kulomaa, M. S., Permi, P.
Sivumäärä: 4
Sivut: 35-38
Julkaisupäivä: huhtikuuta 2013
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BIOMOLECULAR NMR ASSIGNMENTS
Vuosikerta: 7
Numero: 1
ISSN (painettu): 1874-2718
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2013): CiteScore 0,5 SJR 0,401 SNIP 0,207
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Structural Biology, Biochemistry
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84874972758

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Characteristics of complex formation between monomeric and dimeric bisbenzimidazoles and AT-containing polynucleotide

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Frontier Photonics, Emanuel’ Institute of Biochemical Physics, Russian Academy of Sciences, N.N. Blokhin Russian Cancer Research Center, Russian Academy of Medical Sciences, Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences
Tekijät: Lisitsyna, E. S., Durandin, N. A., Ivanov, A. A., Streltsov, S. A., Susova, O. Y., Shtil, A. A., Zhuze, A. L., Kuzmin, V. A.
Sivumäärä: 5
Sivut: 823-827
Julkaisupäivä: marraskuuta 2012
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: MOLECULAR BIOLOGY
Vuosikerta: 46
Numero: 6
ISSN (painettu): 0026-8933
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2012): CiteScore 0,7 SJR 0,2 SNIP 0,176
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Structural Biology, Biophysics
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84870755549

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Organizational structure and the periphery of the gene regulatory network in B-cell lymphoma.

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), Prostate cancer research center (PCRC), Queen's University, Belfast, Northern Ireland, Computational Biology and Machine Learning Lab., Faculty of Medicine, Health and Life Sciences
Tekijät: de Matos Simoes, R., Tripathi, S., Emmert-Streib, F.
Julkaisupäivä: 14 toukokuuta 2012
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Systems Biology
Vuosikerta: 6
Artikkeli: 38
ISSN (painettu): 1752-0509
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2012): CiteScore 5,4 SJR 1,577 SNIP 1,009
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Molecular Biology, Structural Biology, Applied Mathematics, Modelling and Simulation, Computer Science Applications
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84865119369

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structural Measures for Network Biology Using QuACN

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Research Community on Data-to-Decision (D2D), Institute for Bioinformatics and Translational Research, Computational Biology and Machine Learning Lab., Faculty of Medicine, Health and Life Sciences, Queen's University, Belfast, Northern Ireland
Tekijät: Mueller, L. A. J., Kugler, K. G., Graber, A., Emmert-Streib, F., Dehmer, M.
Julkaisupäivä: 24 joulukuuta 2011
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Bioinformatics
Vuosikerta: 12
Numero: 1
Artikkeli: 492
ISSN (painettu): 1471-2105
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2011): CiteScore 5,7 SJR 1,662 SNIP 1,196
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Molecular Biology, Computer Science Applications, Applied Mathematics, Structural Biology
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 84155173344

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Inferring the conservative causal core of gene regulatory networks

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Queen's University, Belfast, Northern Ireland, Computational Biology and Machine Learning Lab., Faculty of Medicine, Health and Life Sciences
Tekijät: Altay, G., Emmert-Streib, F.
Julkaisupäivä: 28 syyskuuta 2010
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Systems Biology
Vuosikerta: 4
Artikkeli: 132
ISSN (painettu): 1752-0509
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2010): SJR 1,832 SNIP 1,057
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Molecular Biology, Structural Biology, Applied Mathematics, Modelling and Simulation, Computer Science Applications
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 77957141016

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Hierarchical coordination of periodic genes in the cell cycle of Saccharomyces cerevisiae

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Computational Biology and Machine Learning Lab., Faculty of Medicine, Health and Life Sciences, Queen's University, Belfast, Northern Ireland, Institute for Bioinformatics and Translational Research
Tekijät: Emmert-Streib, F., Dehmer, M.
Julkaisupäivä: 20 heinäkuuta 2009
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Systems Biology
Vuosikerta: 3
Artikkeli: 76
ISSN (painettu): 1752-0509
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2009): SJR 1,493 SNIP 0,974
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Molecular Biology, Structural Biology, Applied Mathematics, Modelling and Simulation, Computer Science Applications
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 68949220295

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Information processing in the transcriptional regulatory network of yeast: Functional robustness

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Computational Biology and Machine Learning, Queen's University, Belfast, Northern Ireland, Center for Mathematics Probability and Statistics
Tekijät: Emmert-Streib, F., Dehmer, M.
Julkaisupäivä: 19 maaliskuuta 2009
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Systems Biology
Vuosikerta: 3
Artikkeli: 35
ISSN (painettu): 1752-0509
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2009): SJR 1,493 SNIP 0,974
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Molecular Biology, Structural Biology, Applied Mathematics, Modelling and Simulation, Computer Science Applications
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 65649087188

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structural information content of networks: Graph entropy based on local vertex functionals

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: TU Vienna, Department of Biostatistics, Visiting Graduate Student in Department of Urban Design and Planning, University of Washington, Seattle, USA 1.1.2012-15.6.2012 (12.9.2011 alkaen), Department of Genome Sciences
Tekijät: Dehmer, M., Emmert-Streib, F.
Sivumäärä: 8
Sivut: 131-138
Julkaisupäivä: huhtikuuta 2008
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: Computational Biology and Chemistry
Vuosikerta: 32
Numero: 2
ISSN (painettu): 1476-9271
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2008): SJR 0,795 SNIP 0,683
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Biochemistry, Structural Biology, Analytical Chemistry, Physical and Theoretical Chemistry
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 40049085450

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A topological algorithm for identification of structural domains of proteins

Perustiedot

Tila: Julkaistu
OKM-julkaisutyyppi: A1 Alkuperäisartikkeli
Yksiköt: Stowers Institute for Medical Research, University of Kansas Medical Center
Tekijät: Emmert-Streib, F., Mushegian, A.
Julkaisupäivä: 3 heinäkuuta 2007
Onko vertaisarvioitu: Kyllä

Julkaisutiedot

Lehti: BMC Bioinformatics
Vuosikerta: 8
Artikkeli: 237
ISSN (painettu): 1471-2105
Luokitukset: 
  • Scopus rating (2007): SJR 1,973 SNIP 1,12
Alkuperäiskieli: Englanti
!!ASJC Scopus subject areas: Medicine(all), Structural Biology, Applied Mathematics
DOI - pysyväislinkit: 
Lähde: Scopus
Lähteen ID: 34547667016

Tutkimustuotosvertaisarvioitu