Covalent immobilization of luminescent oxygen indicators reduces cytotoxicity

Välimäki, H., Hyvärinen, T., Leivo, J., Iftikhar, H., Pekkanen-Mattila, M., Rajan, D. K., Verho, J., Kreutzer, J., Ryynänen, T., Pirhonen, J., Aalto-Setälä, K., Kallio, P., Narkilahti, S. & Lekkala, J., 1 kesäkuuta 2020, julkaisussa : BIOMEDICAL MICRODEVICES. 22, 2, 41.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Paclitaxel, carboplatin and 1,25-D3 inhibit proliferation of ovarian cancer cells in vitro

Kuittinen, T., Rovio, P., Luukkaala, T., Laurila, M., Grénman, S., Kallioniemi, A. & Mäenpää, J., 1 kesäkuuta 2020, julkaisussa : Anticancer Research. 40, 6, s. 3129-3138 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

All-Optical Electrophysiology Refines Populations of In Silico Human iPSC-CMs for Drug Evaluation

Paci, M., Passini, E., Klimas, A., Severi, S., Hyttinen, J., Rodriguez, B. & Entcheva, E., 19 toukokuuta 2020, julkaisussa : Biophysical Journal. 118, 10, s. 2596-2611 16 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Dissecting the in vivo dynamics of transcription locking due to positive supercoiling buildup

Palma, C. S. D., Kandavalli, V., Bahrudeen, M. N. M., Minoia, M., Chauhan, V., Dash, S. & Ribeiro, A. S., 1 toukokuuta 2020, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms. 1863, 5, 194515.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

High-content imaging and structure-based predictions reveal functional differences between Niemann-Pick C1 variants

Vanharanta, L., Peränen, J., Pfisterer, S. G., Enkavi, G., Vattulainen, I. & Ikonen, E., 1 toukokuuta 2020, julkaisussa : Traffic. 21, 5, s. 386-397 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Salivary cortisol reactivity to psychological stressors in infancy: A meta-analysis

Puhakka, I. J. A. & Peltola, M. J., 1 toukokuuta 2020, julkaisussa : PSYCHONEUROENDOCRINOLOGY. 115, 104603.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Utilizing Gelatinized Starchy Waste from Rice Noodle Factory as Substrate for L(+)-Lactic Acid Production by Amylolytic Lactic Acid Bacterium Enterococcus faecium K-1

Unban, K., Khanongnuch, R., Kanpiengjai, A., Shetty, K. & Khanongnuch, C., toukokuuta 2020, julkaisussa : Applied Biochemistry and Biotechnology.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Evaluation of scaffold microstructure and comparison of cell seeding methods using micro-computed tomography-based tools

Palmroth, A., Pitkänen, S., Hannula, M., Paakinaho, K., Hyttinen, J., Miettinen, S. & Kellomäki, M., 1 huhtikuuta 2020, julkaisussa : Journal of the Royal Society. Interface. 17, 165, 12 Sivumäärä, 20200102.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Mixed carbon substrates: a necessary nuisance or a missed opportunity?

Liu, N., Santala, S. & Stephanopoulos, G., 1 huhtikuuta 2020, julkaisussa : CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY. 62, s. 15-21 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The effect of start-up on energy recovery and compositional changes in brewery wastewater in bioelectrochemical systems

Haavisto, J. M., Kokko, M. E., Lakaniemi, A. M., Sulonen, M. L. K. & Puhakka, J. A., 1 huhtikuuta 2020, julkaisussa : BIOELECTROCHEMISTRY. 132, 8 Sivumäärä, 107402.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Utilizing Neurons for Digital Logic Circuits: A Molecular Communications Analysis

Adonias, G. L., Yastrebova, A., Barros, M. T., Koucheryavy, Y., Cleary, F. & Balasubramaniam, S., 1 huhtikuuta 2020, julkaisussa : IEEE Transactions on Nanobioscience. 19, 2, s. 224-236 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Sequential Collinear Photofragmentation and Atomic Absorption Spectroscopy for Online Laser Monitoring of Triatomic Metal Species

Viljanen, J., Kalmankoski, K., Contreras, V., Sarin, J. K., Sorvajärvi, T., Kinnunen, H., Enestam, S. & Toivonen, J., 18 tammikuuta 2020, julkaisussa : Sensors (Basel, Switzerland). 20, 2, 14 Sivumäärä, 533.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A concise synthesis of carbasugars isolated from Streptomyces lincolnensis

Holmstedt, S. & Candeias, N. R., 2020, julkaisussa : Tetrahedron. 131346.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Co-culture of human induced pluripotent stem cell-derived retinal pigment epithelial cells and endothelial cells on double collagen-coated honeycomb films

Rebelo Calejo, T., Vuorenpää, H., Vuorimaa-Laukkanen, E., Kallio, P., Aalto-Setälä, K., Miettinen, S., Skottman, H., Kellomäki, M. & Juuti-Uusitalo, K., 2020, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 101, s. 327-343 17 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Membrane-Dependent Binding and Entry Mechanism of Dopamine into Its Receptor

Lolicato, F., Juhola, H., Zak, A., Postila, P. A., Saukko, A., Rissanen, S., Enkavi, G., Vattulainen, I., Kepczynski, M. & Róg, T., 2020, julkaisussa : ACS Chemical Neuroscience.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Multiphoton microscopy of the dermoepidermal junction and automated identification of dysplastic tissues with deep learning

Huttunen, M. J., Hristu, R., Dumitru, A., Floroiu, I., Costache, M. & Stanciu, S. G., 2020, julkaisussa : Biomedical Optics Express. 11, 1, s. 186-199 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Pulmonary Surfactant Lipid Reorganization Induced by the Adsorption of the Oligomeric Surfactant Protein B Complex

Liekkinen, J., Enkavi, G., Javanainen, M., Olmeda, B., Pérez-Gil, J. & Vattulainen, I., 2020, julkaisussa : JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY. 432, 10, s. 3251-3268 18 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Surface Stabilization and Dissolution Rate Improvement of Amorphous Compacts with Thin Polymer Coatings: Can We Have It All?

Novakovic, D., Peltonen, L., Isomäki, A., Fraser-Miller, S. J., Nielsen, L. H., Laaksonen, T. & Strachan, C. J., 2020, julkaisussa : Molecular Pharmaceutics. 17, 4, s. 1248-1260 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The Na,K-ATPase acts upstream of phosphoinositide PI(4,5)P2 facilitating unconventional secretion of Fibroblast Growth Factor 2

Legrand, C., Saleppico, R., Sticht, J., Lolicato, F., Müller, H. M., Wegehingel, S., Dimou, E., Steringer, J. P., Ewers, H., Vattulainen, I., Freund, C. & Nickel, W., 2020, julkaisussa : Communications biology. 3, 1, 16 Sivumäärä, 141.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Tidal breathing flow profiles during sleep in wheezing children measured by impedance pneumography

Gracia-Tabuenca, J., Seppä, V-P., Jauhiainen, M., Paassilta, M., Viik, J. & Karjalainen, J., 2020, julkaisussa : Respiratory Physiology and Neurobiology. 271, 103312.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Toward Rigorous Materials Production: New Approach Methodologies Have Extensive Potential to Improve Current Safety Assessment Practices

Nymark, P., Bakker, M., Dekkers, S., Franken, R., Fransman, W., García-Bilbao, A., Greco, D., Gulumian, M., Hadrup, N., Halappanavar, S., Hongisto, V., Hougaard, K. S., Jensen, K. A., Kohonen, P., Koivisto, A. J., Dal Maso, M., Oosterwijk, T., Poikkimäki, M., Rodriguez-Llopis, I., Stierum, R., Sørli, J. B. & Grafström, R., 2020, julkaisussa : Small. 16, 6, 13 Sivumäärä, 1904749.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Enhanced Population Control in a Synthetic Bacterial Consortium by Interconnected Carbon Cross-Feeding

Losoi, P. S., Santala, V. P. & Santala, S. M., 20 joulukuuta 2019, julkaisussa : ACS Synthetic Biology. 8, 12, s. 2642-2650 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Data-driven multiscale modeling reveals the role of metabolic coupling for the spatio-temporal growth dynamics of yeast colonies

Intosalmi, J., Scott, A. C., Hays, M., Flann, N., Yli-Harja, O., Lähdesmäki, H., Dudley, A. M. & Skupin, A., 19 joulukuuta 2019, julkaisussa : BMC Molecular and Cell Biology. 20, 1, 13 Sivumäärä, 59.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Ensuring Quality Standards and Reproducible Research for Data Analysis Services in Oncology: A Cooperative Service Model

Emmert-Streib, F., Dehmer, M. & Yli-Harja, O., 17 joulukuuta 2019, julkaisussa : Frontiers in cell and developmental biology. 7, 349.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Environmental monitoring with distributed mesh networks: An overview and practical implementation perspective for urban scenario

Ometov, A., Bezzateev, S., Voloshina, N., Masek, P. & Komarov, M., 2 joulukuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 24, 19 Sivumäärä, 5548.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Key drivers of cloud response to surface-active organics

Lowe, S. J., Partridge, D. G., Davies, J. F., Wilson, K. R., Topping, D. & Riipinen, I., 1 joulukuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, 12 Sivumäärä, 5214.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Programmable responsive hydrogels inspired by classical conditioning algorithm

Zhang, H., Zeng, H., Priimägi, A. & Ikkala, O., 1 joulukuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, 3267.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The role of highly oxygenated organic molecules in the Boreal aerosol-cloud-climate system

Roldin, P., Ehn, M., Kurtén, T., Olenius, T., Rissanen, M. P., Sarnela, N., Elm, J., Rantala, P., Hao, L., Hyttinen, N., Heikkinen, L., Worsnop, D. R., Pichelstorfer, L., Xavier, C., Clusius, P., Öström, E., Petäjä, T., Kulmala, M., Vehkamäki, H., Virtanen, A., Riipinen, I. & Boy, M., 1 joulukuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, 4370.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Transcription closed and open complex formation coordinate expression of genes with a shared promoter region

Häkkinen, A., Oliveira, S. M. D., Neeli-Venkata, R. & Ribeiro, A. S., 1 joulukuuta 2019, julkaisussa : Journal of the Royal Society Interface. 16, 161, 11 Sivumäärä, 20190507.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Spectral object recognition in hyperspectral holography with complex-domain denoising

Shevkunov, I., Katkovnik, V., Claus, D., Pedrini, G., Petrov, N. V. & Egiazarian, K., 26 marraskuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 23, 10 Sivumäärä, 5188.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Phosphorylation of NFATC1 at PIM1 target sites is essential for its ability to promote prostate cancer cell migration and invasion

Eerola, S. K., Santio, N. M., Rinne, S., Kouvonen, P., Corthals, G. L., Scaravilli, M., Scala, G., Serra, A., Greco, D., Ruusuvuori, P., Latonen, L., Rainio, E. M., Visakorpi, T. & Koskinen, P. J., 15 marraskuuta 2019, julkaisussa : CELL COMMUNICATION AND SIGNALING. 17, 1, 148.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Statistical evaluation of barkhausen noise testing (BNT) for ground samples

Tomkowski, R., Sorsa, A., Santa-Aho, S., Lundin, P. & Vippola, M., 1 marraskuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 21, 4716.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Estimating RNA numbers in single cells by RNA fluorescent tagging and flow cytometry

Bahrudeen, M. N. M., Chauhan, V., Palma, C. S. D., Oliveira, S. M. D., Kandavalli, V. K. & Ribeiro, A. S., 22 lokakuuta 2019, julkaisussa : Journal of Microbiological Methods. 166, 105745.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Improved water services cooperation through clarification of rules and roles

Inha, L. M., Katko, T. S. & Rajala, R. P., 19 lokakuuta 2019, julkaisussa : Water (Switzerland). 11, 10, 2172.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effects of elevated pressures on the activity of acidophilic bioleaching microorganisms

Hajdu-Rahkama, R., Ahoranta, S., Lakaniemi, A-M. & Puhakka, J. A., 15 lokakuuta 2019, julkaisussa : Biochemical Engineering Journal. 150, 107286.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Controlled Orientations of Neighboring Tetracene Units by Mixed Self-Assembled Monolayers on Gold Nanoclusters for High-Yield and Long-Lived Triplet Excited States through Singlet Fission

Saegusa, T., Sakai, H., Nagashima, H., Kobori, Y., Tkachenko, N. V. & Hasobe, T., 18 syyskuuta 2019, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 141, 37, s. 14720-14727 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effects of nanofibrillated cellulose hydrogels on adipose tissue extract and hepatocellular carcinoma cell spheroids in freeze-drying

Auvinen, V-V., Merivaara, A., Kiiskinen, J., Paukkonen, H., Laurén, P., Hakkarainen, T., Koivuniemi, R., Sarkanen, R., Ylikomi, T., Laaksonen, T. & Yliperttula, M., 15 syyskuuta 2019, julkaisussa : Cryobiology.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

An efficient auxin-inducible degron system with low basal degradation in human cells

Li, S., Prasanna, X., Salo, V. T., Vattulainen, I. & Ikonen, E., 1 syyskuuta 2019, julkaisussa : Nature Methods. 16, 9, s. 866-869 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Behavior of the DPH fluorescence probe in membranes perturbed by drugs

Poojari, C., Wilkosz, N., Lira, R. B., Dimova, R., Jurkiewicz, P., Petka, R., Kepczynski, M. & Róg, T., 1 syyskuuta 2019, julkaisussa : Chemistry and Physics of Lipids. 223, 104784.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Pneumatic unidirectional cell stretching device for mechanobiological studies of cardiomyocytes

Kreutzer, J., Viehrig, M., Pölönen, R. P., Zhao, F., Ojala, M., Aalto-Setälä, K. & Kallio, P., 23 elokuuta 2019, julkaisussa : BIOMECHANICS AND MODELING IN MECHANOBIOLOGY.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Influence of ions to modulate hydrazone and oxime reaction kinetics to obtain dynamically cross-linked hyaluronic acid hydrogels

Wang, S., Nawale, G. N., Oommen, O. P., Hilborn, J. & Varghese, O. P., 21 elokuuta 2019, julkaisussa : Polymer Chemistry. 10, 31, s. 4322-4327 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Sodium channels enable fast electrical signaling and regulate phagocytosis in the retinal pigment epithelium

Johansson, J. K., Karema-Jokinen, V. I., Hakanen, S., Jylhä, A., Uusitalo, H., Vihinen-Ranta, M., Skottman, H., Ihalainen, T. O. & Nymark, S., 15 elokuuta 2019, julkaisussa : BMC BIOLOGY. 17, 1, 63.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Characterisation and in vitro and in vivo evaluation of supercritical-CO2-foamed β-TCP/PLCL composites for bone applications

Pitkänen, S., Paakinaho, K., Pihlman, H., Ahola, N., Hannula, M., Asikainen, S., Manninen, M., Morelius, M., Keränen, P., Hyttinen, J., Kellomäki, M., Laitinen-Vapaavuori, O. & Miettinen, S., 5 elokuuta 2019, julkaisussa : European cells & materials. 38, s. 35-50 16 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Alkane and wax ester production from lignin-related aromatic compounds

Salmela, M., Lehtinen, T., Efimova, E., Santala, S. & Santala, V., 1 elokuuta 2019, julkaisussa : Biotechnology and Bioengineering. 116, 8, s. 1934-1945 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparing deep belief networks with support vector machines for classifying gene expression data from complex disorders

Smolander, J., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 heinäkuuta 2019, julkaisussa : FEBS Open Bio. 9, 7, s. 1232-1248 17 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

An architectural understanding of natural sway frequencies in trees

Jackson, T., Shenkin, A., Moore, J., Bunce, A., van Emmerik, T., Kane, B., Burcham, D., James, K., Selker, J., Calders, K., Origo, N., Disney, M., Burt, A., Wilkes, P., Raumonen, P., Gonzalez de Tanago Menaca, J., Lau, A., Herold, M., Goodman, R. C., Fourcaud, T. & Malhi, Y., 28 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Journal of the Royal Society. Interface. 16, 155, 1 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Synthetic Design of Asymmetric miRNA with an Engineered 3′ Overhang to Improve Strand Selection

Kadekar, S., Nawale, G. N., Karlsson, K., Ålander, C., Oommen, O. P. & Varghese, O. P., 7 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Molecular Therapy - Nucleic Acids. 16, s. 597-604 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The Role of Temperature and Lipid Charge on Intake/Uptake of Cationic Gold Nanoparticles into Lipid Bilayers

Lolicato, F., Joly, L., Martinez-Seara, H., Fragneto, G., Scoppola, E., Baldelli Bombelli, F., Vattulainen, I., Akola, J. & Maccarini, M., 7 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Small. 15, 23, 1805046.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Methods for simultaneous robot-world-hand–eye calibration: A comparative study

Ali, I., Suominen, O., Gotchev, A. & Morales, E. R., 2 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 12, 2837.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Technical Note: Noise models for virtual clinical trials of digital breast tomosynthesis

Borges, L. R., Barufaldi, B., Caron, R. F., Bakic, P. R., Foi, A., Maidment, A. D. A. & Vieira, M. A. C., 1 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Medical Physics. 46, 6, s. 2683-2689 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Connection of Collimation, Asymmetric Beaming, and Independent Transmission-Reflection Processes in Concentric-Groove Gratings Supporting Spoof Surface Plasmons

Habib, M., Serebryannikov, A. E., Caglayan, H., Vandenbosch, G. A. E. & Ozbay, E., kesäkuuta 2019, julkaisussa : Plasmonics. 14, 3, s. 721-729 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bioimpedance Sensor Array for Long-Term Monitoring of Wound Healing from Beneath the Primary Dressings and Controlled Formation of H2O2 Using Low-Intensity Direct Current

Kekonen, A., Bergelin, M., Johansson, M., Kumar Joon, N., Bobacka, J. & Viik, J., 31 toukokuuta 2019, julkaisussa : Sensors. 19, 11

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Understanding the Role of Lipids in Signaling Through Atomistic and Multiscale Simulations of Cell Membranes

Manna, M., Nieminen, T. & Vattulainen, I., 6 toukokuuta 2019, julkaisussa : ANNUAL REVIEW OF BIOPHYSICS. 48, s. 421-439 19 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Reduced level of docosahexaenoic acid shifts GPCR neuroreceptors to less ordered membrane regions

Javanainen, M., Enkavi, G., Guixà-Gonzaléz, R., Kulig, W., Martinez-Seara, H., Levental, I. & Vattulainen, I., 1 toukokuuta 2019, julkaisussa : PLoS Computational Biology. 15, 5, e1007033.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effects of percutaneous transluminal angioplasty of superficial femoral artery on photoplethysmographic pulse transit times

Peltokangas, M., Suominen, V., Vakhitov, D., Korhonen, J., Verho, J., Mattila, V. M., Romsi, P., Lekkala, J., Vehkaoja, A. & Oksala, N., toukokuuta 2019, julkaisussa : IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics. 23, 3, s. 1058-1065

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Alpha radiation-induced luminescence by am-241 in aqueous nitric acid solution

Kerst, T., Malmbeck, R., lal Banik, N. L. & Toivonen, J., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 7, 1602.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Positioning information privacy in intelligent transportation systems: An overview and future perspective

Ometov, A., Bezzateev, S., Davydov, V., Shchesniak, A., Masek, P., Lohan, E. S. & Koucheryavy, Y., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Sensors. 19, 7, 1603.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Deep Learning in Image Cytometry: A Review

Gupta, A., Harrison, P. J., Wieslander, H., Pielawski, N., Kartasalo, K., Partel, G., Solorzano, L., Suveer, A., Klemm, A. H., Spjuth, O., Sintorn, I. M. & Wählby, C., huhtikuuta 2019, julkaisussa : Cytometry Part A. 95, 4, s. 366-380

Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

Synthetic metabolic pathway for the production of 1-alkenes from lignin-derived molecules

Luo, J., Lehtinen, T., Efimova, E., Santala, V. & Santala, S., 11 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Microbial Cell Factories. 18, 1, 13 Sivumäärä, 48.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Vertical stratification of bacteria and archaea in sediments of a small boreal humic lake

Rissanen, A. J., Peura, S., Mpamah, P. A., Taipale, S., Tiirola, M., Biasi, C., Mäki, A. & Nykänen, H., 1 maaliskuuta 2019, julkaisussa : FEMS Microbiology Letters. 366, 5

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Metabolic syndrome is associated with decreased heart rate variability in a sex-dependent manner: a comparison between 252 men and 249 women

Kangas, P., Tikkakoski, A., Uitto, M., Viik, J., Bouquin, H., Niemelä, O., Mustonen, J. & Pörsti, I., maaliskuuta 2019, julkaisussa : Clinical Physiology and Functional Imaging. 39, 2, s. 160-167 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Iterative unsupervised domain adaptation for generalized cell detection from brightfield z-stacks

Liimatainen, K., Kananen, L., Latonen, L. & Ruusuvuori, P., 15 helmikuuta 2019, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 20, 1, 80.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Regulation of asymmetries in the kinetics and protein numbers of bacterial gene expression

Startceva, S., Kandavalli, V. K., Visa, A. & Ribeiro, A. S., 1 helmikuuta 2019, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms. 1862, 2, s. 119-128 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Detection of Pancreatic Cancer by Urine Volatile Organic Compound Analysis

Nissinen, S. I., Roine, A., Hokkinen, L., Karjalainen, M., Venäläinen, M., Helminen, H., Niemi, R., Lehtimäki, T., Rantanen, T. & Oksala, N., tammikuuta 2019, julkaisussa : Anticancer Research. 39, 1, s. 73-79 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Advances in Human Stem Cell-Derived Neuronal Cell Culturing and Analysis

Ylä-Outinen, L., Tanskanen, J. M. A., Kapucu, F. E., Hyysalo, A., Hyttinen, J. A. K. & Narkilahti, S., 2019, In Vitro Neuronal Networks: From Culturing Methods to Neuro-Technological Applications. Springer New York LLC, s. 299-329 31 Sivumäärä (Advances in Neurobiology; painos 22).

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bioactive glass-ceramics: From macro to nano

Massera, J., 2019, Nanostructured Biomaterials for Regenerative Medicine. Woodhead Publishing, s. 275-292 18 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Disease modeling of a mutation in α-actinin 2 guides clinical therapy in hypertrophic cardiomyopathy

Prondzynski, M., Lemoine, M. D., Zech, A. T. L., Horváth, A., Di Mauro, V., Koivumäki, J. T., Kresin, N., Busch, J., Krause, T., Krämer, E., Schlossarek, S., Spohn, M., Friedrich, F. W., Münch, J., Laufer, S. D., Redwood, C., Volk, A. E., Hansen, A., Mearini, G., Catalucci, D., Meyer, C., Christ, T., Patten, M., Eschenhagen, T. & Carrier, L., 2019, julkaisussa : EMBO Molecular Medicine. e11115.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Do bone geometric properties of the proximal femoral diaphysis reflect loading history, muscle properties, or body dimensions?

Niinimäki, S., Narra, N., Härkönen, L., Abe, S., Nikander, R., Hyttinen, J., Knüsel, C. J. & Sievänen, H., 2019, julkaisussa : American Journal of Human Biology. e23246.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

L1000 viewer: A search engine and Web interface for the LINCS data repository

Musa, A., Tripathi, S., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 2019, julkaisussa : Frontiers in Genetics. 10, JUN, 557.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Mechanical impact stimulation platform tailored for high-resolution light microscopy

Halonen, H. T., Hyttinen, J. A. K. & Ihalainen, T. O., 2019, julkaisussa : HEALTH AND TECHNOLOGY.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Metabolic profiling of water-soluble compounds from the extracts of dark septate endophytic fungi (DSE) isolated from scots pine (Pinus sylvestris L.) seedlings using UPLC–orbitrap–MS

Tienaho, J., Karonen, M., Muilu–Mäkelä, R., Wähälä, K., Denegri, E. L., Franzén, R., Karp, M., Santala, V. & Sarjala, T., 2019, julkaisussa : Molecules. 24, 12, 2330.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Optical wireless cochlear implants

Trevlakis, S. E., Boulogeorgos, A. A. A., Sofotasios, P. C., Muhaidat, S. & Karagiannidis, G. K., 2019, julkaisussa : Biomedical Optics Express. 10, 2, s. 707-730 24 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

O2-requiring molecular reporters of gene expression for anaerobic microorganisms

Guglielmetti, S., Santala, V., Mangayil, R., Ciranna, A. & Karp, M. T., 2019, julkaisussa : Biosensors and Bioelectronics. 123, s. 1-6 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Prostate cancer gene regulatory network inferred from RNA-seq data

Moore, D., Simoes, R. D. M., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 2019, julkaisussa : CURRENT GENOMICS. 20, 1, s. 38-48 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Proteome-transcriptome alignment of molecular portraits achieved by self-contained gene set analysis: Consensus colon cancer subtypes case study

Glazko, G., Zybailov, B., Emmert-Streib, F., Baranova, A. & Rahmatallah, Y., 2019, julkaisussa : PLoS ONE. 14, 8, e0221444.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Quality and Capacity Analysis of Molecular Communications in Bacterial Synthetic Logic Circuits

Martins, D. P., Barros, M. T. & Balasubramaniam, S., 2019, (Hyväksytty/In press) julkaisussa : IEEE Transactions on Nanobioscience.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Recurrent moderate-risk mutations in Finnish breast and ovarian cancer patients

Nurmi, A., Muranen, T. A., Pelttari, L. M., Kiiski, J. I., Heikkinen, T., Lehto, S., Kallioniemi, A., Schleutker, J., Bützow, R., Blomqvist, C., Aittomäki, K. & Nevanlinna, H., 2019, julkaisussa : International Journal of Cancer.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Robocasting of Bioactive SiO2-P2O5-CaO-MgO-Na2O-K2O Glass Scaffolds

Baino, F., Barberi, J., Fiume, E., Orlygsson, G., Massera, J. & Verné, E., 2019, julkaisussa : Journal of Healthcare Engineering. 2019, 5153136.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Synthesis of 6,12-disubstituted methanodibenzo[b,f ][1,5]dioxocins: Pyrrolidine catalyzed self-condensation of 2′-Hydroxyacetophenones

Assoah, B., Riihonen, V., Vale, J. R., Valkonen, A. & Candeias, N. R., 2019, julkaisussa : Molecules. 24, 13, 2405.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

SCIP: a single-cell image processor toolbox

Martins, L., Neeli-Venkata, R., Oliveira, S. M. D., Häkkinen, A., Ribeiro, A. S. & Fonseca, J. M., 15 joulukuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 24, s. 4318-4320 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Beaming random lasers with soliton control

Perumbilavil, S., Piccardi, A., Barboza, R., Buchnev, O., Kauranen, M., Strangi, G. & Assanto, G., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 1, 7 Sivumäärä, 3863.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Dynamic decoupling of biomass and wax ester biosynthesis in Acinetobacter baylyi by an autonomously regulated switch

Santala, S., Efimova, E. & Santala, V., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Metabolic Engineering Communications. 7, e00078.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Machine learning plastic deformation of crystals

Salmenjoki, H., Alava, M. J. & Laurson, L., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 1, 5307.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Normalization of force to muscle cross-sectional area: A helpful attempt to reduce data scattering in contractility studies?

Pecha, S., Koivumäki, J., Geelhoed, B., Kempe, R., Berk, E., Engel, A., Reichenspurner, H., Eschenhagen, T., Ravens, U., Kaumann, A. & Christ, T., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Acta Physiologica. 224, 4, 4 Sivumäärä, e13202.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structural basis of actin monomer re-charging by cyclase-Associated protein

Kotila, T., Kogan, K., Enkavi, G., Guo, S., Vattulainen, I., Goode, B. L. & Lappalainen, P., 1 joulukuuta 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 1, 1892.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bi-directional cell-pericellular matrix interactions direct stem cell fate

Ferreira, S. A., Motwani, M. S., Faull, P. A., Seymour, A. J., Yu, T. T. L., Enayati, M., Taheem, D. K., Salzlechner, C., Haghighi, T., Kania, E. M., Oommen, O. P., Ahmed, T., Loaiza, S., Parzych, K., Dazzi, F., Varghese, O. P., Festy, F., Grigoriadis, A. E., Auner, H. W., Snijders, A. P., Bozec, L. & Gentleman, E., joulukuuta 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 1, 12 Sivumäärä, 4049.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The importance of controlled mismatch of biomechanical compliances of implantable scaffolds and native tissue for articular cartilage regeneration

Gasik, M., Zühlke, A., Haaparanta, A-M., Muhonen, V., Laine, K., Bilotsky, Y., Kellomäki, M. & Kiviranta, I., 30 marraskuuta 2018, julkaisussa : Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. 6, NOV, 187.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Machine learning analysis of extreme events in optical fibre modulation instability

Närhi, M., Salmela, L., Toivonen, J., Billet, C., Dudley, J. M. & Genty, G., 22 marraskuuta 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 1, 1 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

M2M Communication Assessment in Energy-Harvesting and Wake-Up Radio Assisted Scenarios Using Practical Components

Rinne, J., Keskinen, J., Berger, P. R., Lupo, D. & Valkama, M., 16 marraskuuta 2018, julkaisussa : Sensors (Basel, Switzerland). 18, 11

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Molecular-Scale Ligand Effects in Small Gold-Thiolate Nanoclusters

Chevrier, D. M., Raich, L., Rovira, C., Das, A., Luo, Z., Yao, Q., Chatt, A., Xie, J., Jin, R., Akola, J. & Zhang, P., 14 marraskuuta 2018, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 140, 45, s. 15430-15436 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Understanding Dissolution and Crystallization with Imaging: A Surface Point of View

Novakovic, D., Isomäki, A., Pleunis, B., Fraser-Miller, S. J., Peltonen, L., Laaksonen, T. & Strachan, C. J., 5 marraskuuta 2018, julkaisussa : Molecular Pharmaceutics. 15, 11, s. 5361-5373 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Super-resolution microscopy for biological specimens: Lensless phase retrieval in noisy conditions

Shevkunov, I., Katkovnik, V., Petrov, N. V. & Egiazarian, K., 1 marraskuuta 2018, julkaisussa : Biomedical Optics Express. 9, 11, s. 5511-5523 13 Sivumäärä, #340805.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

How to minimize dye-induced perturbations while studying biomembrane structure and dynamics: PEG linkers as a rational alternative

Mobarak, E., Javanainen, M., Kulig, W., Honigmann, A., Sezgin, E., Aho, N., Eggeling, C., Rog, T. & Vattulainen, I., marraskuuta 2018, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 1860, 11, s. 2436-2445

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Alzheimer's disease and alpha-synuclein pathology in the olfactory bulbs of infants, children, teens and adults ≤ 40 years in Metropolitan Mexico City. APOE4 carriers at higher risk of suicide accelerate their olfactory bulb pathology

Calderón-Garcidueñas, L., González-Maciel, A., Reynoso-Robles, R., Kulesza, R. J., Mukherjee, P. S., Torres-Jardón, R., Rönkkö, T. & Doty, R. L., 1 lokakuuta 2018, julkaisussa : Environmental Research. 166, s. 348-362 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Novel osteoconductive β-tricalcium phosphate/poly(L-lactide-co-e-caprolactone) scaffold for bone regeneration: a study in a rabbit calvarial defect

Pihlman, H., Keränen, P., Paakinaho, K., Linden, J., Hannula, M., Manninen, I. K., Hyttinen, J., Manninen, M. & Laitinen-Vapaavuori, O., 1 lokakuuta 2018, julkaisussa : Journal of Materials Science: Materials in Medicine. 29, 10, 156.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Molecular Communications Pulse-based Jamming Model for Bacterial Biofilm Suppression

Martins, D. P., Leetanasaksakul, K., Barros, M. T., Thamchaipenet, A., Donnelly, W. & Balasubramaniam, S., lokakuuta 2018, julkaisussa : IEEE Transactions on Nanobioscience. 17, 4, s. 533-542 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Quantifying branch architecture of tropical trees using terrestrial LiDAR and 3D modelling

Lau, A., Bentley, L. P., Martius, C., Shenkin, A., Bartholomeus, H., Raumonen, P., Malhi, Y., Jackson, T. & Herold, M., lokakuuta 2018, julkaisussa : Trees - Structure and Function. 32, 5, s. 1219-1231 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Temperature control as key factor for optimal biohydrogen production from thermomechanical pulping wastewater

Dessì, P., Porca, E., Lakaniemi, A-M., Collins, G. & Lens, P. N. L., 15 syyskuuta 2018, julkaisussa : Biochemical Engineering Journal. 137, s. 214-221 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Assessment of mutation probabilities of KRAS G12 missense mutants and their long-timescale dynamics by atomistic molecular simulations and Markov state modeling

Pantsar, T., Rissanen, S., Dauch, D., Laitinen, T., Vattulainen, I. & Poso, A., 10 syyskuuta 2018, julkaisussa : PLoS Computational Biology. 14, 9, e1006458.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Computational modeling of electrophysiology and pharmacotherapy of atrial fibrillation: Recent advances and future challenges

Vagos, M. R. S. S., van Herck, I. G. M., Sundnes, J., Arevalo, H. J., Edwards, A. G. & Koivumäki, J. T., 4 syyskuuta 2018, julkaisussa : Frontiers in Physiology. 9, SEP, 1221.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparative analysis of tissue reconstruction algorithms for 3D histology

Kartasalo, K., Latonen, L., Vihinen, J., Visakorpi, T., Nykter, M. & Ruusuvuori, P., 1 syyskuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 17, s. 3013-3021 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Nocturnal Heart Rate Variability Spectrum Characterization in Preschool Children with Asthmatic Symptoms

Milagro, J., Gil, E., Lazaro, J., Seppae, V. P., Malmberg, L. P., Pelkonen, A. S., Kotaniemi-Syrjanen, A., Makela, M., Viik, J. & Bailon, R., syyskuuta 2018, julkaisussa : IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics. 22, 5, s. 1332-1340

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Physiologically-relevant levels of sphingomyelin, but not GM1, induces a β-sheet-rich structure in the amyloid-β(1-42) monomer

Owen, M. C., Kulig, W., Poojari, C., Rog, T. & Strodel, B., syyskuuta 2018, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 1860, 9, s. 1709-1720

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparison of food frequency questionnaire data and shopping records for the assessment of food intake

Kallonen, A., Nieminen, H., Das, S. & Sallinen, R., 27 elokuuta 2018, Proceedings of Seventh International Conference on Well-Being in the Information Society: Fighting Inequalities (WIS 2018). s. 25-30 (TUCS Lecture Notes; painos 28).

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Production of alkanes from CO2 by engineered bacteria

Lehtinen, T., Virtanen, H., Santala, S. & Santala, V., 21 elokuuta 2018, julkaisussa : Biotechnology for Biofuels. 11, 228.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The effect of S53P4-based borosilicate glasses and glass dissolution products on the osteogenic commitment of human adipose stem cells

Ojansivu, M., Mishra, A., Vanhatupa, S., Juntunen, M., Larionova, A., Massera, J. & Miettinen, S., 1 elokuuta 2018, julkaisussa : PLoS ONE. 13, 8, e0202740.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Selenate removal in biofilm systems: Effect of nitrate and sulfate on selenium removal efficiency, biofilm structure and microbial community

Tan, L. C., Espinosa-Ortiz, E. J., Nancharaiah, Y. V., van Hullebusch, E. D., Gerlach, R. & Lens, P. N., elokuuta 2018, julkaisussa : Journal of Chemical Technology and Biotechnology. 93, 8, s. 2380-2389

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Metabolic pairing of aerobic and anaerobic production in a one-pot batch cultivation

Salmela, M., Lehtinen, T., Efimova, E., Santala, S. & Mangayil, R., 3 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Biotechnology for Biofuels. 11, 1, 187.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Pectin and Mucin Enhance the Bioadhesion of Drug Loaded Nanofibrillated Cellulose Films

Laurén, P., Paukkonen, H., Lipiäinen, T., Dong, Y., Oksanen, T., Räikkönen, H., Ehlers, H., Laaksonen, P., Yliperttula, M. & Laaksonen, T., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Pharmaceutical Research. 35, 7, 145.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Segmentation of vessel structures from photoacoustic images with reliability assessment

Raumonen, P. & Tarvainen, T., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Biomedical Optics Express. 9, 7, s. 2887-2904 18 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Automatic optimization of an in silico model of human iPSC derived cardiomyocytes recapitulating calcium handling abnormalities

Paci, M., Pölönen, R-P., Cori, D., Penttinen, K., Aalto-Setälä, K., Severi, S. & Hyttinen, J., 26 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Frontiers in Physiology. 9, JUN, 709.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Monitoring of heart rate and inter-beat intervals with wrist plethysmography in patients with atrial fibrillation

Harju, J., Tarniceriu, A., Parak, J., Vehkaoja, A., Yli-Hankala, A. & Korhonen, I., 26 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Physiological Measurement. 39, 6, 065007.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structure and dynamics of a human myelin protein P2 portal region mutant indicate opening of the β barrel in fatty acid binding proteins

Laulumaa, S., Nieminen, T., Raasakka, A., Krokengen, O. C., Safaryan, A., Hallin, E. I., Brysbaert, G., Lensink, M. F., Ruskamo, S., Vattulainen, I. & Kursula, P., 25 kesäkuuta 2018, julkaisussa : BMC Structural Biology. 18, 1, 8.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effect of surfactant type and sonication energy on the electrical conductivity properties of nanocellulose-CNT nanocomposite films

Siljander, S., Keinänen, P., Räty, A., Ramakrishnan, K. R., Tuukkanen, S., Kunnari, V., Harlin, A., Vuorinen, J. & Kanerva, M., 20 kesäkuuta 2018, julkaisussa : International Journal of Molecular Sciences. 19, 6, 1819.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Acquiring respiration rate from photoplethysmographic signal by recursive bayesian tracking of intrinsic modes in time-frequency spectra

Pirhonen, M., Peltokangas, M. & Vehkaoja, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Sensors. 18, 6, 1693.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Altered polyamine profiles in colorectal cancer

Venäläinen, M. K., Roine, A. N., Häkkinen, M. R., Vepsäläinen, J. J., Kumpulainen, P. S., Kiviniemi, M. S., Lehtimäki, T., Oksala, N. K. & Rantanen, T. K., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Anticancer Research. 38, 6, s. 3601-3607 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Enhancing the usability of low-cost eye trackers for rehabilitation applications

Gavas, R. D., Roy, S., Chatterjee, D., Tripathy, S. R., Chakravarty, K. & Sinha, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : PLoS ONE. 13, 6, e0196348.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Evaluation of dry electrodes in canine heart rate monitoring

Virtanen, J., Somppi, S., Törnqvist, H., Jeyhani, V., Fiedler, P., Gizatdinova, Y., Majaranta, P., Väätäjä, H., Cardó, A. V., Lekkala, J., Tuukkanen, S., Surakka, V., Vainio, O. & Vehkaoja, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Sensors. 18, 6, 1757.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Photo-antimicrobial efficacy of zinc complexes of porphyrin and phthalocyanine activated by inexpensive consumer LED lamp

George, L., Hiltunen, A., Santala, V. & Efimov, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Journal of Inorganic Biochemistry. 183, s. 94-100 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cholesterol Protects the Oxidized Lipid Bilayer from Water Injury: An All-Atom Molecular Dynamics Study

Owen, M. C., Kulig, W., Rog, T., Vattulainen, I. & Strodel, B., kesäkuuta 2018, julkaisussa : Journal of Membrane Biology. 251, 3, s. 521-534 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The precision of the symmetry in Z-ring placement in Escherichia coli is hampered at critical temperatures

Neeli-Venkata, R., Oliveira, S. M. D., Martins, L., Startceva, S., Bahrudeen, M., Fonseca, J. M., Minoia, M. & Ribeiro, A. S., 18 toukokuuta 2018, julkaisussa : Physical Biology. 15, 5, 056002.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Crystallization Kinetics of an Amorphous Pharmaceutical Compound Using Fluorescence-Lifetime-Imaging Microscopy

Rautaniemi, K., Vuorimaa-Laukkanen, E., Strachan, C. J. & Laaksonen, T., 7 toukokuuta 2018, julkaisussa : Molecular Pharmaceutics. 15, 5, s. 1964-1971 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Switchable light reflectance in dilute magneto-optical colloids based on nickel ferrite nanowires

Sutka, A., Timusk, M., Joost, U., Ignatans, R. & Maiorov, M., 2 toukokuuta 2018, julkaisussa : e-Journal of Surface Science and Nanotechnology. 16, s. 119-121 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A review of connectivity map and computational approaches in pharmacogenomics

Musa, A., Ghoraie, L. S., Zhang, S. D., Glazko, G., Yli-Harja, O., Dehmer, M., Haibe-Kains, B. & Emmert-Streib, F., 1 toukokuuta 2018, julkaisussa : Briefings in Bioinformatics. 19, 3, s. 506-523 18 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Non-intersecting leaf insertion algorithm for tree structure models

Åkerblom, M., Raumonen, P., Casella, E., Disney, M. I., Danson, F. M., Gaulton, R., Schofield, L. A. & Kaasalainen, M., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170045.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Uncertainty in multispectral lidar signals caused by incidence angle effects

Kaasalainen, S., Åkerblom, M., Nevalainen, O., Hakala, T. & Kaasalainen, M., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170033.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Weighing trees with lasers: Advances, challenges and opportunities

Disney, M. I., Boni Vicari, M., Burt, A., Calders, K., Lewis, S. L., Raumonen, P. & Wilkes, P., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170048.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Driver Fusions and Their Implications in the Development and Treatment of Human Cancers

Gao, Q., Liang, W. W., Foltz, S. M., Mutharasu, G., Jayasinghe, R. G., Cao, S., Liao, W. W., Reynolds, S. M., Wyczalkowski, M. A., Yao, L., Yu, L., Sun, S. Q., Caesar-Johnson, S. J., Demchok, J. A., Felau, I., Kasapi, M., Ferguson, M. L., Hutter, C. M., Sofia, H. J., Tarnuzzer, R., Wang, Z., Yang, L., Zenklusen, J. C., Zhang, J. J., Chudamani, S., Liu, J., Lolla, L., Naresh, R., Pihl, T., Sun, Q., Wan, Y., Wu, Y., Cho, J., DeFreitas, T., Frazer, S., Gehlenborg, N., Getz, G., Heiman, D. I., Kim, J., Lawrence, M. S., Lin, P., Meier, S., Noble, M. S., Saksena, G., Voet, D., Zhang, H., Bernard, B., Chambwe, N., Dhankani, V. & Knijnenburg, T., 3 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Cell Reports. 23, 1, s. 227-238.e3

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The characterization of surgical smoke from various tissues and its implications for occupational safety

Karjalainen, M., Kontunen, A., Saari, S., Rönkkö, T., Lekkala, J., Roine, A. & Oksala, N., 1 huhtikuuta 2018, julkaisussa : PLoS ONE. 13, 4, e0195274.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Depletion of nuclear import protein karyopherin alpha 7 (KPNA7) induces mitotic defects and deformation of nuclei in cancer cells

Vuorinen, E. M., Rajala, N. K., Ihalainen, T. O. & Kallioniemi, A., 27 maaliskuuta 2018, julkaisussa : BMC Cancer. 18, 1, 325.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Functional Outcome of Human Adipose Stem Cell Injections in Rat Anal Sphincter Acute Injury Model

Kuismanen, K., Juntunen, M., Narra Girish, N., Tuominen, H., Huhtala, H., Nieminen, K., Hyttinen, J. & Miettinen, S., 1 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Stem Cells Translational Medicine. 7, 3, s. 295-304 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Soft hydrazone crosslinked hyaluronan- and alginate-based hydrogels as 3D supportive matrices for human pluripotent stem cell-derived neuronal cells

Karvinen, J., Joki, T., Ylä-Outinen, L., Koivisto, J. T., Narkilahti, S. & Kellomäki, M., 1 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Reactive and Functional Polymers. 124, s. 29-39 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

An activity recognition framework deploying the random forest classifier and a single optical heart rate monitoring and triaxial accelerometer wrist-band

Mehrang, S., Pietilä, J. & Korhonen, I., 22 helmikuuta 2018, julkaisussa : Sensors. 18, 2, 613.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

In a quest for engineering acidophiles for biomining applications: Challenges and opportunities

Gumulya, Y., Boxall, N. J., Khaleque, H. N., Santala, V., Carlson, R. P. & Kaksonen, A. H., 21 helmikuuta 2018, julkaisussa : Genes. 9, 2, 116.

Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

Improved fatty aldehyde and wax ester production by overexpression of fatty acyl-CoA reductases

Lehtinen, T., Efimova, E., Santala, S. & Santala, V., 8 helmikuuta 2018, julkaisussa : Microbial Cell Factories. 17, 1, 19.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Molecular mechanism for inhibition of twinfilin by phosphoinositides

Hakala, M., Kalimeri, M., Enkavi, G., Vattulainen, I. & Lappalainen, P., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 293, 13, s. 4818-4829 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A Bioscreening Technique for Ultraviolet Irradiation Protective Natural Substances

Tienaho, J., Poikulainen, E., Sarjala, T., Muilu-Mäkelä, R., Santala, V. & Karp, M., 2018, julkaisussa : Photochemistry and Photobiology. 94, 6, s. 1273-1280

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Archaea are prominent members of the prokaryotic communities colonizing common forest mushrooms

Rinta-Kanto, J. M., Pehkonen, K., Sinkko, H., Tamminen, M. V. & Timonen, S., 2018, julkaisussa : Canadian Journal of Microbiology. 64, 10, s. 716-726 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bioactive glass induced osteogenic differentiation of human adipose stem cells is dependent on cell attachment mechanism and mitogen-activated protein kinases

Ojansivu, M., Wang, X., Hyväri, L., Kellomäki, M., Hupa, L., Vanhatupa, S. & Miettinen, S., 2018, julkaisussa : European Cells and Materials. 35, s. 53-71 19 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Differential processing in modality-specific Mauthner cell dendrites

Medan, V., Mäki-Marttunen, T., Sztarker, J. & Preuss, T., 2018, julkaisussa : Journal of Physiology. 596, 4, s. 667-689

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effect of N/S ratio on anoxic thiosulfate oxidation in a fluidized bed reactor: Experimental and artificial neural network model analysis

Khanongnuch, R., Di Capua, F., Lakaniemi, A-M., Rene, E. R. & Lens, P. N. L., 2018, julkaisussa : Process Biochemistry. 68, s. 171-181

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Gloriosa superba Mediated Synthesis of Platinum and Palladium Nanoparticles for Induction of Apoptosis in Breast Cancer

Rokade, S. S., Joshi, K. A., Mahajan, K., Patil, S., Tomar, G., Dubal, D. S., Parihar, V. S., Kitture, R., Bellare, J. R. & Ghosh, S., 2018, julkaisussa : Bioinorganic Chemistry and Applications. 2018, 4924186.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Knitted 3D Scaffolds of Polybutylene Succinate Support Human Mesenchymal Stem Cell Growth and Osteogenesis

Ojansivu, M., Johansson, L., Vanhatupa, S., Tamminen, I., Hannula, M., Hyttinen, J., Kellomäki, M. & Miettinen, S., 2018, julkaisussa : Stem Cells International. 2018, 5928935.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Mapping microscale wetting variations on biological and synthetic water-repellent surfaces

Liimatainen, V., Vuckovac, M., Jokinen, V., Sariola, V., Hokkanen, M. J., Zhou, Q. & Ras, R. H. A., 1 joulukuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, 1, 1798.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Lessons from the human genome project: Modesty, honesty, and realism

Emmert-Streib, F., Dehmer, M. & Yli-Harja, O., 23 marraskuuta 2017, julkaisussa : Frontiers in Genetics. 8, NOV, 184.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Evaluation of optogenetic electrophysiology tools in human stem cell-derived cardiomyocytes

Björk, S., Ojala, E. A., Nordström, T., Ahola, A., Liljeström, M., Hyttinen, J., Kankuri, E. & Mervaala, E., 2 marraskuuta 2017, julkaisussa : Frontiers in Physiology. 8, NOV, 884.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Azopolymer photopatterning for directional control of angiogenesis

Fedele, C., De Gregorio, M., Netti, P. A., Cavalli, S. & Attanasio, C., 1 marraskuuta 2017, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 63, s. 317-325 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Excessive aggregation of membrane proteins in the Martini model

Javanainen, M., Martinez-Seara, H. & Vattulainen, I., 1 marraskuuta 2017, julkaisussa : PLoS ONE. 12, 11, e0187936.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparison of different coating techniques on the properties of FucoPol films

Ferreira, A. R. V., Haapanen, J., Mäkelä, J. M., Bratvold, J. E., Nilsen, O., Tuominen, M., Alves, V. D. & Coelhoso, I. M., 1 lokakuuta 2017, julkaisussa : International Journal of Biological Macromolecules. 103, s. 268-274 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Concerted regulation of npc2 binding to endosomal/lysosomal membranes by bis(monoacylglycero)phosphate and sphingomyelin

Enkavi, G., Mikkolainen, H., Güngör, B., Ikonen, E. & Vattulainen, I., 1 lokakuuta 2017, julkaisussa : PLoS Computational Biology. 13, 10, e1005831.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Strong FGFR3 staining is a marker for FGFR3 fusions in diffuse gliomas

Granberg, K. J., Annala, M., Lehtinen, B., Kesseli, J., Haapasalo, J., Ruusuvuori, P., Yli-Harja, O., Visakorpi, T., Haapasalo, H., Nykter, M. & Zhang, W., 1 syyskuuta 2017, julkaisussa : Neuro-Oncology. 19, 9, s. 1206-1216 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Inhibition of Aβ Amyloid Growth and Toxicity by Silybins: The Crucial Role of Stereochemistry

Sciacca, M. F. M., Romanucci, V., Zarrelli, A., Monaco, I., Lolicato, F., Spinella, N., Galati, C., Grasso, G., D'Urso, L., Romeo, M., Diomede, L., Salmona, M., Bongiorno, C., Di Fabio, G., La Rosa, C. & Milardi, D., 16 elokuuta 2017, julkaisussa : ACS Chemical Neuroscience. 8, 8, s. 1767-1778 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Nanofibrillar cellulose-alginate hydrogel coated surgical sutures as cell-carrier systems

Laurén, P., Somersalo, P., Pitkänen, I., Lou, Y. R., Urtti, A., Partanen, J., Seppälä, J., Madetoja, M., Laaksonen, T., Mäkitie, A. & Yliperttula, M., 1 elokuuta 2017, julkaisussa : PLoS ONE. 12, 8, e0183487.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

How management intensity and neighborhood composition affect the structure of beech (Fagus sylvatica L.) trees

Juchheim, J., Annighöfer, P., Ammer, C., Calders, K., Raumonen, P. & Seidel, D., 14 heinäkuuta 2017, julkaisussa : TREES-STRUCTURE AND FUNCTION. 31, 5, s. 1723–1735 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

sgnesR: An R package for simulating gene expression data from an underlying real gene network structure considering delay parameters

Tripathi, S., Lloyd-Price, J., Ribeiro, A., Yli-Harja, O., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 4 heinäkuuta 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, 1, 325.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Atomistic fingerprint of hyaluronan–CD44 binding

Vuorio, J., Vattulainen, I. & Martinez-Seara, H., 1 heinäkuuta 2017, julkaisussa : PLoS Computational Biology. 13, 7, e1005663.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The relationship between loading history and proximal femoral diaphysis cross-sectional geometry

Niinimäki, S., Narra, N., Härkönen, L., Abe, S., Nikander, R., Hyttinen, J., Knüsel, C. & Sievänen, H., 1 heinäkuuta 2017, julkaisussa : American Journal of Human Biology. 29, 4, e22965.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Dynamics of a True Moving Bed separation process: Linear model identification and advanced process control

Nogueira, I. B. R., Ribeiro, A. M., Martins, M. A. F., Rodrigues, A. E., Koivisto, H. & Loureiro, J. M., 30 kesäkuuta 2017, julkaisussa : Journal of Chromatography A. 1504

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Calcium Assists Dopamine Release by Preventing Aggregation on the Inner Leaflet of Presynaptic Vesicles

Mokkila, S., Postila, P. A., Rissanen, S., Juhola, H., Vattulainen, I. & Róg, T., 21 kesäkuuta 2017, julkaisussa : ACS Chemical Neuroscience. 8, 6, s. 1242-1250 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Androgen Receptor Deregulation Drives Bromodomain-Mediated Chromatin Alterations in Prostate Cancer

Urbanucci, A., Barfeld, S. J., Kytölä, V., Itkonen, H. M., Coleman, I. M., Vodák, D., Sjöblom, L., Sheng, X., Tolonen, T., Minner, S., Burdelski, C., Kivinummi, K. K., Kohvakka, A., Kregel, S., Takhar, M., Alshalalfa, M., Davicioni, E., Erho, N., Lloyd, P., Karnes, R. J., Ross, A. E., Schaeffer, E. M., Vander Griend, D. J., Knapp, S., Corey, E., Feng, F. Y., Nelson, P. S., Saatcioglu, F., Knudsen, K. E., Tammela, T. L. J., Sauter, G., Schlomm, T., Nykter, M., Visakorpi, T. & Mills, I. G., 6 kesäkuuta 2017, julkaisussa : Cell Reports. 19, 10, s. 2045-2059 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Phase partitioning of GM1 and its bodipy-labeled analog determine their different binding to Cholera Toxin

Rissanen, S., Grzybek, M., Orlowski, A., Róg, T., Cramariuc, O., Levental, I., Eggeling, C., Sezgin, E. & Vattulainen, I., 9 toukokuuta 2017, julkaisussa : Frontiers in Physiology. 8, MAY, 252.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Clinical association analysis of ependymomas and pilocytic astrocytomas reveals elevated FGFR3 and FGFR1 expression in aggressive ependymomas

Lehtinen, B., Raita, A., Kesseli, J., Annala, M., Nordfors, K., Yli-Harja, O., Zhang, W., Visakorpi, T., Nykter, M., Haapasalo, H. & Granberg, K. J., 3 toukokuuta 2017, julkaisussa : BMC Cancer. 17, 1, 310.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Long-chain GM1 gangliosides alter transmembrane domain registration through interdigitation

Manna, M., Javanainen, M., Martinez-Seara Monne, H., Gabius, H-J., Rog, T. & Vattulainen, I., 1 toukokuuta 2017, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1859, 5, s. 870-878 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Elucidation of Compression-Induced Surface Crystallization in Amorphous Tablets Using Sum Frequency Generation (SFG) Microscopy

Mah, P. T., Novakovic, D., Saarinen, J., van Landeghem, S., Peltonen, L., Laaksonen, T., Isomäki, A. & Strachan, C. J., toukokuuta 2017, julkaisussa : Pharmaceutical Research. 34, 5, s. 957-970 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Tunable Plasmonic Silver Nanodomes for Surface-Enhanced Raman Scattering

Kahraman, M., Ozbay, A., Yuksel, H., Solmaz, R., Demir, B. & Caglayan, H., 5 huhtikuuta 2017, (Hyväksytty/In press) julkaisussa : Plasmonics. s. 1-11 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Hexaphyrin as a Potential Theranostic Dye for Photothermal Therapy and 19F Magnetic Resonance Imaging

Higashino, T., Nakatsuji, H., Fukuda, R., Okamoto, H., Imai, H., Matsuda, T., Tochio, H., Shirakawa, M., Tkachenko, N. V., Hashida, M., Murakami, T. & Imahori, H., 24 maaliskuuta 2017, julkaisussa : ChemBioChem. 18, 10, s. 951-959 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Calcium Directly Regulates Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Headgroup Conformation and Recognition

Bilkova, E., Pleskot, R., Rissanen, S., Sun, S., Czogalla, A., Cwiklik, L., Róg, T., Vattulainen, I., Cremer, P. S., Jungwirth, P. & Coskun, Ü., 22 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 139, 11, s. 4019-4024 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Hierarchical Self-Assembly of Halogen-Bonded Block Copolymer Complexes into Upright Cylindrical Domains

Milani, R., Houbenov, N., Fernandez-Palacio, F., Cavallo, G., Luzio, A., Haataja, J., Giancane, G., Saccone, M., Priimägi, A., Metrangolo, P. & Ikkala, O., 9 maaliskuuta 2017, julkaisussa : CheM. 2, 3, s. 417-426 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Atomistic Molecular Dynamics Simulations of Mitochondrial DNA Polymerase γ: Novel Mechanisms of Function and Pathogenesis

Euro, L., Haapanen, O., Róg, T., Vattulainen, I., Suomalainen, A. & Sharma, V., 7 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Biochemistry. 56, 9, s. 1227-1238 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Twin-layer biosensor for real-time monitoring of alkane metabolism

Lehtinen, T., Santala, V. & Santala, S., 1 maaliskuuta 2017, julkaisussa : FEMS Microbiology Letters. 364, 6, fnx053.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Membrane cholesterol access into a G-protein-coupled receptor

Guixà-González, R., Albasanz, J. L., Rodriguez-Espigares, I., Pastor, M., Sanz, F., Martí-Solano, M., Manna, M., Martinez-Seara, H., Hildebrand, P. W., Martín, M. & Selent, J., 21 helmikuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, 14505.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Magnetic routing of light-induced waveguides

Izdebskaya, Y., Shvedov, V., Assanto, G. & Krolikowski, W., 15 helmikuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, 14452.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The use of mathematical modeling for the development of a low cost fuzzy gain schedule neutralization control system

Sislian, R., da Silva, F. V., Gedraite, R., Jokinen, H. & Rajan, D. K., 4 helmikuuta 2017, Transactions on Engineering Technologies: World Congress on Engineering and Computer Science 2015. Springer Singapore, s. 525-539 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Multivariate statistical analysis for the identification of potential seafood spoilage indicators

Kuuliala, L., Abatih, E., Ioannidis, A. G., Vanderroost, M., De Meulenaer, B., Ragaert, P. & Devlieghere, F., 1 helmikuuta 2017, julkaisussa : Food Control. 84, s. 49-60 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Polarization resolved photoluminescence in GaAs1−xBix/GaAs quantum wells

Balanta, M. A. G., Orsi Gordo, V., Carvalho, A. R. H., Puustinen, J., Alghamdi, H. M., Henini, M., Galeti, H. V. A., Guina, M. & Galvão Gobato, Y., helmikuuta 2017, julkaisussa : Journal of Luminescence. 182, s. 49-52 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

GSAR: Bioconductor package for Gene Set analysis in R

Rahmatallah, Y., Zybailov, B., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 24 tammikuuta 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, 1, 61.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Aligned Poly(ε-caprolactone) Nanofibers Guide the Orientation and Migration of Human Pluripotent Stem Cell-Derived Neurons, Astrocytes, and Oligodendrocyte Precursor Cells In Vitro

Hyysalo, A., Ristola, M., Joki, T., Honkanen, M., Vippola, M. & Narkilahti, S., 2017, julkaisussa : MACROMOLECULAR BIOSCIENCE. 17, 7, 1600517.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Dynamics and energetics of the mammalian phosphatidylinositol transfer protein phospholipid exchange cycle

Grabon, A., Orłowski, A., Tripathi, A., Vuorio, J., Javanainen, M., Róg, T., Lönnfors, M., McDermott, M. I., Siebert, G., Somerharju, P., Vattulainen, I. & Bankaitis, V. A., 2017, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 292, 35, s. 14438-14455 18 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Electrical Contacts in SOI MEMS Using Aerosol Jet Printing

Khorramdel, B., Torkkeli, A. & Mäntysalo, M., 2017, julkaisussa : IEEE Journal of the Electron Devices Society. 6, s. 34-40

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Extracting the strongest signals from omics data: Differentially expressed pathways and beyond

Glazko, G., Rahmatallah, Y., Zybailov, B. & Emmert-Streib, F., 2017, Methods in Molecular Biology. HUMANA PRESS INC, s. 125-159 35 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 1613).

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Metastasis detection from whole slide images using local features and random forests

Valkonen, M., Kartasalo, K., Liimatainen, K., Nykter, M., Latonen, L. & Ruusuvuori, P., 2017, julkaisussa : Cytometry Part A. 91, 6, s. 555-565

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Oxysterols Versus Cholesterol in Model Neuronal Membrane. I. The Case of 7-Ketocholesterol. The Langmuir Monolayer Study

Wnętrzak, A., Makyła-Juzak, K., Filiczkowska, A., Kulig, W. & Dynarowicz-Łątka, P., 2017, julkaisussa : Journal of Membrane Biology. 250, 5, s. 553–564

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Synthesis, Structural Characterization, Hirshfeld Surface and Antioxidant Activity Analysis of a Novel Organic Cation Antimonate Complex

Lahbib, I., Valkonen, A., Rzaigui, M. & Smirani, W., 2017, julkaisussa : Journal of Cluster Science. 28, 4, s. 2239–2252 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The Association Between Liver and Tumor [18F]FDG Uptake in Patients with Diffuse Large B Cell Lymphoma During Chemotherapy

Wu, X., Bhattarai, A., Korkola, P., Pertovaara, H., Eskola, H. & Kellokumpu-Lehtinen, P. L., 2017, julkaisussa : Molecular Imaging and Biology. 19, 5, s. 787–794 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The Integrin Receptor in Biologically Relevant Bilayers: Insights from Molecular Dynamics Simulations

Kalli, A. C., Rog, T., Vattulainen, I., Campbell, I. D. & Sansom, M. S. P., 2017, julkaisussa : Journal of Membrane Biology. 250, s. 337-351 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Transcription Initiation Controls Skewness of the Distribution of Intervals Between RNA Productions

Kandavalli, V., Startceva, S. & Sanches Ribeiro, A., 2017, 31st European Simulation and Modelling Conference: ESM'2017. Paulo J.S, G. (toim.). Portugal: EUROSIS, s. 397-403

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Abstract: Direction as a vibration loading parameter in bone tissue engineering

Halonen, H., Kyllönen, L., Ihalainen, T. O., Miettinen, S. & Hyttinen, J., 25 marraskuuta 2016.

Tutkimustuotos: Konferenssiesitys, posteri tai abstrakti

SamExploreR: Exploring reproducibility and robustness of RNA-seq results based on SAM files

Stupnikov, A., Tripathi, S., De Matos Simoes, R., McArt, D., Salto-Tellez, M., Glazko, G., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 21, s. 3345-3347 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Increased survival rate by local release of diclofenac in a murine model of recurrent oral carcinoma

Will, O. M., Purcz, N., Chalaris, A., Heneweer, C., Boretius, S., Purcz, L., Nikkola, L., Ashammakhi, N., Kalthoff, H., Glüer, C. C., Wiltfang, J., Açil, Y. & Tiwari, S., 12 lokakuuta 2016, julkaisussa : International Journal of Nanomedicine. 11, s. 5311-5321 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effects of σ factor competition are promoter initiation kinetics dependent

Kandavalli, V. K., Tran, H. & Ribeiro, A. S., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Gene Regulatory Mechanisms. 1859, 10, s. 1281-1288 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Identifying involvement of Lys251/Asp252 pair in electron transfer and associated proton transfer at the quinone reduction site of Rhodobacter capsulatus cytochrome bc1

Kuleta, P., Sarewicz, M., Postila, P., Róg, T. & Osyczka, A., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1857, 10, s. 1661-1668 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Lipid membranes: Theory and simulations bridged to experiments

Vattulainen, I. & Róg, T., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2251-2253 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Efficient preparation and analysis of membrane and membrane protein systems

Javanainen, M. & Martinez-Seara, H., lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2468-2482

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Functionalized lipids and surfactants for specific applications

Kepczynski, M. & Róg, T., lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2362-2379

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Controlling the motion of multiple objects on a Chladni plate

Zhou, Q., Sariola, V., Latifi, K. & Liimatainen, V., 9 syyskuuta 2016, julkaisussa : Nature Communications. 7, 12764.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Current densities and total contact currents during forest clearing tasks under 400kV power lines

Korpinen, L., Kuisti, H. & Elovaara, J., 1 syyskuuta 2016, julkaisussa : Bioelectromagnetics. 37, 6, s. 423-428

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Distribution and dynamics of quinones in the lipid bilayer mimicking the inner membrane of mitochondria

Kaurola, P., Sharma, V., Vonk, A., Vattulainen, I. & Róg, T., 1 syyskuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 9, s. 2116-2122 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Selenium: environmental significance, pollution, and biological treatment technologies

Tan, L. C., Nancharaiah, Y. V., van Hullebusch, E. D. & Lens, P. N. L., 1 syyskuuta 2016, julkaisussa : Biotechnology Advances. 34, 5, s. 886-907 22 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

Against dataism and for data sharing of big biomedical and clinical data with research parasites

Emmert-Streib, F., Dehmer, M. & Yli-Harja, O., 31 elokuuta 2016, julkaisussa : Frontiers in Genetics. 7, AUG, 154.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The role of the K-channel and the active-site tyrosine in the catalytic mechanism of cytochrome c oxidase

Sharma, V. & Wikström, M., elokuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1857, 8, s. 1111-1115

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Abstract: Direction as a vibration loading parameter in osteogenic differentiation of adipose stem cells

Halonen, H., Kyllönen, L., Ihalainen, T. O., Miettinen, S. & Hyttinen, J., 10 heinäkuuta 2016. 1 Sivumäärä.

Tutkimustuotos: Konferenssiesitys, posteri tai abstrakti

Bioluminescence-based system for rapid detection of natural transformation

Santala, V., Karp, M. & Santala, S., 1 heinäkuuta 2016, julkaisussa : FEMS Microbiology Letters. 363, 13, fnw125.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effect of particle size and dispersion status on cytotoxicity and genotoxicity of zinc oxide in human bronchial epithelial cells

Roszak, J., Catalán, J., Järventaus, H., Lindberg, H. K., Suhonen, S., Vippola, M., Stepnik, M. & Norppa, H., 1 heinäkuuta 2016, julkaisussa : Mutation Research: Genetic Toxicology and Environmental Mutagenesis. 805, s. 7-18 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Indocyanine Green-Loaded Liposomes for Light-Triggered Drug Release

Lajunen, T., Kontturi, L-S., Viitala, L., Manna, M., Cramariuc, O., Róg, T., Bunker, A., Laaksonen, T., Viitala, T., Murtomäki, L. & Urtti, A., 6 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Molecular Pharmaceutics. 13, 6, s. 2095-2107 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Robust statistical approaches for RSS-based floor detection in indoor localization

Razavi, A., Valkama, M. & Lohan, E. S., 1 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Sensors. 16, 6, 793.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Characterizing rate limiting steps in transcription from RNA production times in live cells

Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 toukokuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 9, s. 1346-1352 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The need for formally defining "modern medicine" by means of experimental design

Emmert-Streib, F., Tuomisto, L. & Yli-Harja, O., 20 huhtikuuta 2016, julkaisussa : Frontiers in Genetics. 7, APR, 60.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Human Adipose Stem Cells Differentiated on Braided Polylactide Scaffolds is a Potential Approach for Tendon Tissue Engineering

Vuornos, K., Björninen, M., Talvitie, E., Paakinaho, K., Kellomäki, M., Huhtala, H., Miettinen, S., Seppänen-Kaijansinkko, R. & Haimi, S., 1 maaliskuuta 2016, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 22, 5-6, s. 513-523 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Texture descriptors ensembles enable image-based classification of maturation of human stem cell-derived retinal pigmented epithelium

Nanni, L., Paci, M., Dos Santos, F. L. C., Skottman, H., Juuti-Uusitalo, K. & Hyttinen, J., 1 helmikuuta 2016, julkaisussa : PLoS ONE. 11, 2, e0149399.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cell-based bioreporter assay coupled to HPLC micro-fractionation in the evaluation of antimicrobial properties of the basidiomycete fungus Pycnoporus cinnabarinus

Järvinen, P., Nybond, S., Marcourt, L., Ferreira Queiroz, E., Wolfender, J. L., Mettälä, A., Karp, M., Vuorela, H., Vuorela, P., Hatakka, A. & Tammela, P., 21 tammikuuta 2016, julkaisussa : Pharmaceutical Biology. 54, 6, s. 1-8 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Biological and Bioelectrochemical Recovery of Critical and Scarce Metals

Nancharaiah, Y. V., Mohan, S. V. & Lens, P. N. L., 2016, julkaisussa : Trends in Biotechnology. 34, 2, s. 137-155 19 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cholesterol oxidation products and their biological importance

Kulig, W., Cwiklik, L., Jurkiewicz, P., Rog, T. & Vattulainen, I., 2016, julkaisussa : Chemistry and Physics of Lipids. 199, s. 144-160 17 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Improved properties for packaging materials by nanoscale surface modification and ALD barrier coating

Lahti, J., Lavonen, J., Lahtinen, K., Johansson, P., Seppänen, T. & Cameron, D. C., 2016, TAPPI International Conference on Nanotechnology for Renewable Materials 2016. TAPPI Press, Vuosikerta 2. s. 684-706 23 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Morphological Differentiation Towards Neuronal Phenotype of SH-SY5Y Neuroblastoma Cells by Estradiol, Retinoic Acid and Cholesterol

Teppola, H., Sarkanen, J. R., Jalonen, T. O. & Linne, M-L., 2016, julkaisussa : Neurochemical Research. 41, 4, s. 731-747

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Non-Brownian diffusion in lipid membranes: Experiments and simulations

Metzler, R., Jeon, J. H. & Cherstvy, A. G., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 215, s. 173–185

Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

Robustness of the process of nucleoid exclusion of protein aggregates in Escherichia coli

Neeli-Venkata, R., Martikainen, A., Gupta, A., Goncalves, N., Fonseca, J. & Ribeiro, A. S., 2016, julkaisussa : Journal of Bacteriology. 198, 6, s. 898-906 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Role of charged lipids in membrane structures: Insight given by simulations

Pöyry, S. & Vattulainen, I., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. s. 2322–2333 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Roll-to-roll application of photocatalytic TiO2 nanoparticles for printed functionality

Saarinen, J. J., Valtakari, D., Bollström, R., Stepien, M., Haapanen, J., Mäkelä, J. M. & Toivakka, M., 2016, Advanced Manufacturing, Electronics and Microsystems: TechConnect Briefs 2016. TechConnect, Vuosikerta 4. s. 47-50 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The biophysical properties of ethanolamine plasmalogens revealed by atomistic molecular dynamics simulations

Rog, T. & Koivuniemi, A., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 1, s. 97-103 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The Effects of Pharmacological Compounds on Beat Rate Variations in Human Long QT-Syndrome Cardiomyocytes

Kuusela, J., Kim, J., Räsänen, E. & Aalto-Setälä, K., 2016, julkaisussa : Stem Cell Reviews and Reports. 12, 6, s. 698–707 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Urinary thrombomodulin levels were significantly higher following occupational exposure to chemicals, in the presence of dipstick protein, but not in the presence of dipstick blood

Ruddock, M. W., De Matos Simoes, R., O'Rourke, D., Duggan, B., Stevenson, M., O'Kane, H. F., Curry, D., Abogunrin, F., Emmert-Streib, F., Reid, C. N., Maxwell, P., Arthur, K., Mallon, M., Carson, G., Kennedy, G. & Williamson, K. E., 2016, julkaisussa : Biology and Medicine. 8, 1, 1000260.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Validity of parameters in static linear testing of flexor tendon repair

Linnanmäki, L., Göransson, H., Havulinna, J., Sippola, P., Karjalainen, T. & Leppänen, O. V., 2016, julkaisussa : Journal of Biomechanics. 49, 13, s. 2785–2790

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A Comparative View on Easy to Deploy non-Integrating Methods for Patient-Specific iPSC Production

Manzini, S., Viiri, L. E., Marttila, S. & Aalto-Setälä, K., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Stem Cell Reviews and Reports. 11, 6, s. 900-908 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A new algorithm to improve assessment of cortical bone geometry in pQCT

Cervinka, T., Sievänen, H., Lala, D., Cheung, A. M., Giangregorio, L. & Hyttinen, J., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Bone. 81, s. 721-730 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bone morphogenetic protein-2 induces donor-dependent osteogenic and adipogenic differentiation in human adipose stem cells

Vanhatupa, S., Ojansivu, M., Autio, R., Juntunen, M. & Miettinen, S., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Stem Cells Translational Medicine. 4, 12, s. 1391-1402 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

European Code against Cancer 4th Edition: Medical exposures, including hormone therapy, and cancer

Friis, S., Kesminiene, A., Espina, C., Auvinen, A., Straif, K. & Schüz, J., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : CANCER EPIDEMIOLOGY. 39, s. S107-S119

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

European Code against Cancer 4th Edition: Ionising and non-ionising radiation and cancer

McColl, N., Auvinen, A., Kesminiene, A., Espina, C., Erdmann, F., de Vries, E., Greinert, R., Harrison, J. & Schüz, J., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : CANCER EPIDEMIOLOGY. 39, s. S93-S100

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

European Code against Cancer 4th Edition: Ultraviolet radiation and cancer

Greinert, R., de Vries, E., Erdmann, F., Espina, C., Auvinen, A., Kesminiene, A. & Schüz, J., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : CANCER EPIDEMIOLOGY. 39, s. S75-S83

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Gene expression analysis upon lncRNA DDSR1 knockdown in human fibroblasts

Jia, L., Sun, Z., Wu, X., Misteli, T. & Sharma, V., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Genomics Data. 6, s. 277-279 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Improving the Immunogenicity of the Mycobacterium bovis BCG Vaccine by Non-Genetic Bacterial Surface Decoration Using the Avidin-Biotin System

Liao, T. Y. A., Lau, A., Joseph, S., Hytönen, V. & Hmama, Z., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : PLoS ONE. 10, 12, e0145833.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Metabolic engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for removal of Clostridium butyricum growth inhibitors produced from lignocellulosic hydrolysates

Kannisto, M. S., Mangayil, R. K., Shrivastava-Bhattacharya, A., Pletschke, B. I., Karp, M. T. & Santala, V. P., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Biotechnology for Biofuels. 8, 1, 198.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Tuning the Plasmonic Extinction Resonances of Hexagonal Arrays of Ag Nanoparticles

Ravi, A., Luthra, A., Teixeira, F. L., Berger, P. R. & Coe, J. V., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Plasmonics. 10, 6, s. 1505-1512 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Simultaneous nutrient removal and lipid production with Chlorella vulgaris on sterilized and non-sterilized anaerobically pretreated piggery wastewater

Marjakangas, J. M., Chen, C. Y., Lakaniemi, A. M., Puhakka, J. A., Whang, L. M. & Chang, J. S., 5 marraskuuta 2015, julkaisussa : Biochemical Engineering Journal. 103, s. 177-184 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The Molecular Taxonomy of Primary Prostate Cancer

Abeshouse, A., Ahn, J., Akbani, R., Ally, A., Amin, S., Andry, C. D., Annala, M., Aprikian, A., Armenia, J., Arora, A., Auman, J. T., Balasundaram, M., Balu, S., Barbieri, C. E., Bauer, T., Benz, C. C., Bergeron, A., Beroukhim, R., Berrios, M., Bivol, A., Bodenheimer, T., Boice, L., Bootwalla, M. S., Borges Dos Reis, R., Boutros, P. C., Bowen, J., Bowlby, R., Boyd, J., Bradley, R. K., Breggia, A., Brimo, F., Bristow, C. A., Brooks, D., Broom, B. M., Bryce, A. H., Bubley, G., Burks, E., Butterfield, Y. S. N., Button, M., Canes, D., Carlotti, C. G., Carlsen, R., Carmel, M., Carroll, P. R., Carter, S. L., Cartun, R., Carver, B. S., Chan, J. M., Chang, M. T., Chen, Y., Cherniack, A. D., Chevalier, S., Chin, L., Cho, J., Chu, A., Chuah, E., Chudamani, S., Cibulskis, K., Ciriello, G., Clarke, A., Cooperberg, M. R., Corcoran, N. M., Costello, A. J., Cowan, J., Crain, D., Curley, E., David, K., Demchok, J. A., Demichelis, F., Dhalla, N., Dhir, R., Doueik, A., Drake, B., Dvinge, H., Dyakova, N., Felau, I., Ferguson, M. L., Frazer, S., Freedland, S., Fu, Y., Gabriel, S. B., Gao, J., Gardner, J., Gastier-Foster, J. M., Gehlenborg, N., Gerken, M., Gerstein, M. B., Getz, G., Godwin, A. K., Gopalan, A., Graefen, M., Graim, K., Gribbin, T., Guin, R., Gupta, M., Hadjipanayis, A., Haider, S., Hamel, L., Hayes, D. N., Heiman, D. I., Hess, J., Hoadley, K. A., Holbrook, A. H., Holt, R. A., Holway, A., Hovens, C. M., Hoyle, A. P., Huang, M., Hutter, C. M., Ittmann, M., Iype, L., Jefferys, S. R., Jones, C. D., Jones, S. J. M., Juhl, H., Kahles, A., Kane, C. J., Kasaian, K., Kerger, M., Khurana, E., Kim, J., Klein, R. J., Kucherlapati, R., Lacombe, L., Ladanyi, M., Lai, P. H., Laird, P. W., Lander, E. S., Latour, M., Lawrence, M. S., Lau, K., Lebien, T., Lee, D., Lee, S., Lehmann, K. V., Leraas, K. M., Leshchiner, I., Leung, R., Libertino, J. A., Lichtenberg, T. M., Lin, P., Linehan, W. M., Ling, S., Lippman, S. M., Liu, J., Liu, W., Lochovsky, L., Loda, M., Logothetis, C., Lolla, L., Longacre, T., Lu, Y., Luo, J., Ma, Y., Mahadeshwar, H. S., Mallery, D., Mariamidze, A., Marra, M. A., Mayo, M., McCall, S., McKercher, G., Meng, S., Mes-Masson, A. M., Merino, M. J., Meyerson, M., Mieczkowski, P. A., Mills, G. B., Shaw, K. R. M., Minner, S., Moinzadeh, A., Moore, R. A., Morris, S., Morrison, C., Mose, L. E., Mungall, A. J., Murray, B. A., Myers, J. B., Naresh, R., Nelson, J., Nelson, M. A., Nelson, P. S., Newton, Y., Noble, M. S., Noushmehr, H., Nykter, M., Pantazi, A., Parfenov, M., Park, P. J., Parker, J. S., Paulauskis, J., Penny, R., Perou, C. M., Piché, A., Pihl, T., Pinto, P. A., Prandi, D., Protopopov, A., Ramirez, N. C., Rao, A., Rathmell, W. K., Rätsch, G., Ren, X., Reuter, V. E., Reynolds, S. M., Rhie, S. K., Rieger-Christ, K., Roach, J., Robertson, A. G., Robinson, B., Rubin, M. A., Saad, F., Sadeghi, S., Saksena, G., Saller, C., Salner, A., Sanchez-Vega, F., Sander, C., Sandusky, G., Sauter, G., Sboner, A., Scardino, P. T., Scarlata, E., Schein, J. E., Schlomm, T., Schmidt, L. S., Schultz, N., Schumacher, S. E., Seidman, J., Neder, L., Seth, S., Sharp, A., Shelton, C., Shelton, T., Shen, H., Shen, R., Sherman, M., Sheth, M., Shi, Y., Shih, J., Shmulevich, I., Simko, J., Simon, R., Simons, J. V., Sipahimalani, P., Skelly, T., Sofia, H. J., Soloway, M. G., Song, X., Sorcini, A., Sougnez, C., Stepa, S., Stewart, C., Stewart, J., Stuart, J. M., Sullivan, T. B., Sun, C., Sun, H., Tam, A., Tan, D., Tang, J., Tarnuzzer, R., Tarvin, K., Taylor, B. S., Teebagy, P., Tenggara, I., Têtu, B., Tewari, A., Thiessen, N., Thompson, T., Thorne, L. B., Tirapelli, D. P., Tomlins, S. A., Trevisan, F. A., Troncoso, P., True, L. D., Tsourlakis, M. C., Tyekucheva, S., Van Allen, E., Van Den Berg, D. J., Veluvolu, U., Verhaak, R., Vocke, C. D., Voet, D., Wan, Y., Wang, Q., Wang, W., Wang, Z., Weinhold, N., Weinstein, J. N., Weisenberger, D. J., Wilkerson, M. D., Wise, L., Witte, J., Wu, C. C., Wu, J., Wu, Y., Xu, A. W., Yadav, S. S., Yang, L., Yang, L., Yau, C., Ye, H., Yena, P., Zeng, T., Zenklusen, J. C., Zhang, H., Zhang, J., Zhang, J., Zhang, W., Zhong, Y., Zhu, K. & Zmuda, E., 5 marraskuuta 2015, julkaisussa : Cell. 163, 4, s. 1011-1025 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A BRCA1-interacting lncRNA regulates homologous recombination

Sharma, V., Khurana, S., Kubben, N., Abdelmohsen, K., Oberdoerffer, P., Gorospe, M. & Misteli, T., 1 marraskuuta 2015, julkaisussa : EMBO REPORTS. 16, 11, s. 1520-1534 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparison of different cationized proteins as biomaterials for nanoparticle-based ocular gene delivery

Zorzi, G. K., Párraga, J. E., Seijo, B. & Sanchez, A., 1 marraskuuta 2015, julkaisussa : Colloids and Surfaces B: Biointerfaces. 135, s. 533-541 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Submolecular Plasticization Induced by Photons in Azobenzene Materials

Vapaavuori, J., Laventure, A., Bazuin, C. G., Lebel, O. & Pellerin, C., 28 lokakuuta 2015, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 137, 42, s. 13510-13517 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cancer incidence and mortality in patients treated either with RAI or thyroidectomy for hyperthyroidism

Ryödi, E., Metso, S., Jaatinen, P., Huhtala, H., Saaristo, R., Välimäki, M. & Auvinen, A., 1 lokakuuta 2015, julkaisussa : Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 100, 10, s. 3710-3717 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effects of single and fractionated irradiation on natural killer cell populations: Radiobiological characteristics of viability and cytotoxicity in vitro

Hietanen, T., Pitkänen, M., Kapanen, M. & Kellokumpu-Lehtinen, P. L., 1 lokakuuta 2015, julkaisussa : Anticancer Research. 35, 10, s. 5193-5200 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

ESD qualification data used as the basis for building electrostatic discharge protected areas

Tamminen, P., Viheriäkoski, T., Sydänheimo, L. & Ukkonen, L., 1 lokakuuta 2015, julkaisussa : Journal of Electrostatics. 77, s. 174-181 8 Sivumäärä, 3024.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Multiple novel prostate cancer susceptibility signals identified by fine-mapping of known risk loci among Europeans

Al Olama, A. A., Dadaev, T., Hazelett, D. J., Li, Q., Leongamornlert, D., Saunders, E. J., Stephens, S., Cieza-Borrella, C., Whitmore, I., Garcia, S. B., Giles, G. G., Southey, M. C., Fitzgerald, L., Gronberg, H., Wiklund, F., Aly, M., Henderson, B. E., Schumacher, F., Haiman, C. A., Schleutker, J., Wahlfors, T., Tammela, T. L., Nordestgaard, B. G., Key, T. J., Travis, R. C., Neal, D. E., Donovan, J. L., Hamdy, F. C., Pharoah, P., Pashayan, N., Khaw, K. T., Stanford, J. L., Thibodeau, S. N., Mcdonnell, S. K., Schaid, D. J., Maier, C., Vogel, W., Luedeke, M., Herkommer, K., Kibel, A. S., Cybulski, C., Wokolorczyk, D., Kluzniak, W., Cannon-Albright, L., Brenner, H., Butterbach, K., Arndt, V., Park, J. Y., Sellers, T., Lin, H. Y., Slavov, C., Kaneva, R., Mitev, V., Batra, J., Clements, J. A., Spurdle, A., Teixeira, M. R., Paulo, P., Maia, S., Pandha, H., Michael, A., Kierzek, A., Govindasami, K., Guy, M., Lophatonanon, A., Muir, K., Viñuela, A., Brown, A. A., Freedman, M., Conti, D. V., Easton, D., Coetzee, G. A., Eeles, R. A. & Kote-Jarai, Z., 1 lokakuuta 2015, julkaisussa : HUMAN MOLECULAR GENETICS. 24, 19, s. 5589-5602 14 Sivumäärä, ddv203.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Transcriptome sequencing reveals PCAT5 as a Novel ERG-Regulated long Noncoding RNA in prostate cancer

Ylipää, A., Kivinummi, K., Kohvakka, A., Annala, M., Latonen, L., Scaravilli, M., Kartasalo, K., Leppänen, S. P., Karakurt, S., Seppäla, J., Yli-Harja, O., Tammela, T. L. J., Zhang, W., Visakorpi, T. & Nykter, M., 1 lokakuuta 2015, julkaisussa : Cancer Research. 75, 19, s. 4026-4031 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Atomic-level characterization of transport cycle thermodynamics in the glycerol-3-phosphate: Phosphate antiporter

Moradi, M., Enkavi, G. & Tajkhorshid, E., 29 syyskuuta 2015, julkaisussa : Nature Communications. 6, 8393.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Reducing overdiagnosis by polygenic risk-stratified screening: Findings from the Finnish section of the ERSPC

Pashayan, N., Pharoah, P. D. P., Schleutker, J., Talala, K., Tammela, T. L. J., Määttänen, L., Harrington, P., Tyrer, J., Eeles, R., Duffy, S. W. & Auvinen, A., 29 syyskuuta 2015, julkaisussa : British Journal of Cancer. 113, 7, s. 1086-1093 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Intraprostatic inflammation is positively associated with serum PSA in men with PSA <4 ngml-1, normal DRE and negative for prostate cancer

Umbehr, M. H., Gurel, B., Murtola, T. J., Sutcliffe, S., Peskoe, S. B., Tangen, C. M., Goodman, P. J., Thompson, I. M., Lippman, S. M., Lucia, M. S., Parnes, H. L., Drake, C. G., Nelson, W. G., De Marzo, A. M. & Platz, E. A., 14 syyskuuta 2015, julkaisussa : PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES. 18, 3, s. 264-269 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effects of anode potentials on bioelectrogenic conversion of xylose and microbial community compositions

Kokko, M. E., Mäkinen, A. E., Sulonen, M. L. K. & Puhakka, J. A., 5 syyskuuta 2015, julkaisussa : Biochemical Engineering Journal. 101, s. 248-252 5 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Is Daylight-PDT a good treatment option during solar eclipse?

Vicentini, C., Tylcz, J. B., Betrouni, N., Mortier, L. & Mordon, S., 1 syyskuuta 2015, julkaisussa : PHOTODIAGNOSIS AND PHOTODYNAMIC THERAPY. 12, 3, s. 376-377 2 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Sotalol, but not digoxin is associated with decreased prostate cancer risk: A population-based case-control study

Kaapu, K. J., Ahti, J., Tammela, T. L. J., Auvinen, A. & Murtola, T. J., 1 syyskuuta 2015, julkaisussa : International Journal of Cancer. 137, 5, s. 1187-1195 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Surface Modified Biodegradable Electrospun Membranes as a Carrier for Human Embryonic Stem Cell-Derived Retinal Pigment Epithelial Cells

Sorkio, A., Porter, P. J., Juuti-Uusitalo, K., Meenan, B. J., Skottman, H. & Burke, G. A., 1 syyskuuta 2015, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 21, 17-18, s. 2301-2314 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Novel analysis software for detecting and classifying Ca2+ transient abnormalities in stem cell-derived cardiomyocytes

Penttinen, K., Siirtola, H., Àvalos-Salguero, J., Vainio, T., Juhola, M. & Aalto-Setälä, K., 26 elokuuta 2015, julkaisussa : PLoS ONE. 10, 8, e0135806.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Construction of therapeutically relevant human prostate epithelial fate map by utilising miRNA and mRNA microarray expression data

Rane, J. K., Ylipää, A., Adamson, R., Mann, V. M., Simms, M. S., Collins, A. T., Visakorpi, T., Nykter, M. & Maitland, N. J., 11 elokuuta 2015, julkaisussa : British Journal of Cancer. 113, 4, s. 611-615 5 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Human breast cancer cells educate macrophages toward the M2 activation status

Sousa, S., Brion, R., Lintunen, M., Kronqvist, P., Sandholm, J., Mönkkönen, J., Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Lauttia, S., Tynninen, O., Joensuu, H., Heymann, D. & Määttä, J. A., 5 elokuuta 2015, julkaisussa : BREAST CANCER RESEARCH. 17, 1, 101.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

His-tagged norovirus-like particles: A versatile platform for cellular delivery and surface display

Koho, T., Ihalainen, T. O., Stark, M., Uusi-Kerttula, H., Wieneke, R., Rahikainen, R., Blazevic, V., Marjomäki, V., Tampé, R., Kulomaa, M. S. & Hytönen, V. P., 21 heinäkuuta 2015, julkaisussa : European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics. 96, s. 22-31 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Kinetics of the cellular intake of a gene expression inducer at high concentrations

Tran, H., Oliveira, S. M. D. D., Goncalves, N. & Ribeiro, A. S., 20 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Molecular Biosystems. 11, 9, s. 2579-2587 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

In-vivo deformation measurements of the human heart by 3D Digital Image Correlation

Hokka, M., Mirow, N., Nagel, H., Irqsusi, M., Vogt, S. & Kuokkala, V. T., 16 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Journal of Biomechanics. 48, 10, s. 2217-2220 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bioactive glass ions as strong enhancers of osteogenic differentiation in human adipose stem cells

Ojansivu, M., Vanhatupa, S., Björkvik, L., Häkkänen, H., Kellomäki, M., Autio, R., Ihalainen, J. A., Hupa, L. & Miettinen, S., 15 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 21, s. 190-203 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Biogenesis of Nascent High Density Lipoprotein Particles

Koivuniemi, A. & Vattulainen, I., 9 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Structure. 23, 7, s. 1153-1154 2 Sivumäärä, 3212.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Lipid production by eukaryotic microorganisms isolated from palm oil mill effluent

Marjakangas, J. M., Lakaniemi, A. M., Koskinen, P. E. P., Chang, J. S. & Puhakka, J. A., 5 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Biochemical Engineering Journal. 99, s. 48-54 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

μCT based assessment of mechanical deformation of designed PTMC scaffolds

Narra, N., Blanquer, S. B. G., Haimi, S. P., Grijpma, D. W. & Hyttinen, J., 2 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Clinical Hemorheology and Microcirculation. 60, 1, s. 99-108 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A robust AMMI model for the analysis of genotype-by-environment data

Rodrigues, P. C., Monteiro, A. & Lourenço, V. M., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 1, s. 58-66 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bioluminescent whole-cell reporter gene assays as screening tools in the identification of antimicrobial natural product extracts

Nybond, S., Karp, M., Yrjönen, T. & Tammela, P., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Journal of Microbiological Methods. 114, s. 54-56 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cholesterol under oxidative stress: How lipid membranes sense oxidation as cholesterol is being replaced by oxysterols

Kulig, W., Olzyńska, A., Jurkiewicz, P., Kantola, A. M., Komulainen, S., Manna, M., Pourmousa, M., Vazdar, M., Cwiklik, L., Rog, T., Khelashvili, G., Harries, D., Telkki, V. V., Hof, M., Vattulainen, I. & Jungwirth, P., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Free Radical Biology and Medicine. 84, s. 30-41 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effects of remedies made in patient setup process on residual setup errors and margins in head and neck cancer radiotherapy based on 2D image guidance

Kapanen, M., Laaksomaa, M., Tulijoki, T., Kellokumpu-Lehtinen, P. L. & Hyödynmaa, S., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Reports of Practical Oncology and Radiotherapy. 20, 4, s. 292-298 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Single-cell kinetics of a repressilator when implemented in a single-copy plasmid

Oliveira, S. M. D., Chandraseelan, J. G., Häkkinen, A., Goncalves, N. S. M., Yli-Harja, O., Startceva, S. & S. Ribeiro, A., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Molecular Biosystems. 11, 7, s. 1939-1945 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The influence of SrO and CaO in silicate and phosphate bioactive glasses on human gingival fibroblasts

Massera, J., Kokkari, A., Närhi, T. & Hupa, L., 25 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Journal of Materials Science: Materials in Medicine. 26, 6, 196.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Dynamics of the peripheral membrane protein P2 from human myelin measured by neutron scattering: A Comparison between wild-type protein and a hinge mutant

Laulumaa, S., Nieminen, T., Lehtimäki, M., Aggarwal, S., Simons, M., Koza, M. M., Vattulainen, I., Kursula, P. & Natali, F., 11 kesäkuuta 2015, julkaisussa : PLoS ONE. 10, 6, e128954.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A genome-wide expression quantitative trait loci analysis of proprotein convertase subtilisin/kexin enzymes identifies a novel regulatory gene variant for FURIN expression and blood pressure

Turpeinen, H., Seppälä, I., Lyytikäinen, L. P., Raitoharju, E., Hutri-Kähönen, N., Levula, M., Oksala, N., Waldenberger, M., Klopp, N., Illig, T., Mononen, N., Laaksonen, R., Raitakari, O., Kähönen, M., Lehtimäki, T. & Pesu, M., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : HUMAN GENETICS. 134, 6, s. 627-636 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Apolipoprotein A-I mimetic peptide 4F blocks sphingomyelinase-induced LDL aggregation

Nguyen, S. D., Javanainen, M., Rissanen, S., Zhao, H., Huusko, J., Kivelä, A. M., Ylä-Herttuala, S., Navab, M., Fogelman, A. M., Vattulainen, I., Kovanen, P. T. & Öörni, K., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Journal of Lipid Research. 56, 6, s. 1206-1221 16 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

MIR-25 modulates invasivenessand dissemination of human prostate cancer cells via regulation of αv-and α6-integrin expression

Zoni, E., Van Der Horst, G., Van De Merbel, A. F., Chen, L., Rane, J. K., Pelger, R. C. M., Collins, A. T., Visakorpi, T., Snaar-Jagalska, B. E., Maitland, N. J. & Van Der Pluijm, G., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Cancer Research. 75, 11, s. 2326-2336 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structural analysis of treatment cycles representing transitions between nursing organizational units inferred from diabetes

Dehmer, M., Kurt, Z., Emmert-Streib, F., Them, C., Schulc, E. & Hofer, S., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : PLoS ONE. 10, 6, e0127152.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Using shRNA experiments to validate gene regulatory networks

Olsen, C., Fleming, K., Prendergast, N., Rubio, R., Emmert-Streib, F., Bontempi, G., Quackenbush, J. & Haibe-Kains, B., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Genomics Data. 4, s. 123-126 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Survival benefit of early androgen receptor inhibitor therapy in locally advanced prostate cancer: Long-term follow-up of the SPCG-6 study

Thomsen, F. B., Brasso, K., Christensen, I. J., Johansson, J. E., Angelsen, A., Tammela, T. L. J. & Iversen, P., 30 toukokuuta 2015, julkaisussa : EUROPEAN JOURNAL OF CANCER. 51, 10, s. 1283-1292 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

MiRNA profiles in lymphoblastoid cell lines of finnish prostate cancer families

Fischer, D., Wahlfors, T., Mattila, H., Oja, H., Tammela, T. L. J. & Schleutker, J., 28 toukokuuta 2015, julkaisussa : PLoS ONE. 10, 5, e0127427.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Fine-mapping the 2q37 and 17q11.2-q22 loci for novel genes and sequence variants associated with a genetic predisposition to prostate cancer

Laitinen, V. H., Rantapero, T., Fischer, D., Vuorinen, E. M., Tammela, T. L. J., Wahlfors, T. & Schleutker, J., 15 toukokuuta 2015, julkaisussa : International Journal of Cancer. 136, 10, s. 2316-2327 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The Finnish prostate cancer screening trial: Analyses on the screening failures

Kilpeläinen, T. P., Tammela, T. L. J., Malila, N., Hakama, M., Santti, H., Määttänen, L., Stenman, U. H., Kujala, P. & Auvinen, A., 15 toukokuuta 2015, julkaisussa : International Journal of Cancer. 136, 10, s. 2437-2443 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Urothelial cancer gene regulatory networks inferred from large-scale RNAseq, Bead and Oligo gene expression data

Matos Simoes, R. D., Dalleau, S., Williamson, K. E. & Emmert-Streib, F., 14 toukokuuta 2015, julkaisussa : BMC Systems Biology. 9, 21.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Antiarrhythmic effects of dantrolene in patients with catecholaminergic polymorphic ventricular tachycardia and replication of the responses using iPSC models

Penttinen, K., Swan, H., Vanninen, S., Paavola, J., Lahtinen, A. M., Kontula, K. & Aalto-Setälä, K., 1 toukokuuta 2015, julkaisussa : PLoS ONE. 10, 5, e0125366.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Biomimetic collagen I and IV double layer Langmuir-Schaefer films asmicroenvironment for human pluripotent stem cell derived retinal pigment epithelial cells

Sorkio, A. E., Vuorimaa-Laukkanen, E. P., Hakola, H. M., Liang, H., Ujula, T. A., Valle-Delgado, J. J., Österberg, M., Yliperttula, M. L. & Skottman, H., 1 toukokuuta 2015, julkaisussa : Biomaterials. 51, s. 257-269 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Family history in the finnish prostate cancer screening trial

Saarimäki, L., Tammela, T. L., Määttänen, L., Taari, K., Kujala, P. M., Raitanen, J. & Auvinen, A., 1 toukokuuta 2015, julkaisussa : International Journal of Cancer. 136, 9, s. 2172-2177 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Microarray analysis of differentially expressed genes in ovarian and fallopian tube epithelium from risk-reducing salpingo-oophorectomies

Veskimäe, K., Staff, S., Tabaro, F., Nykter, M., Isola, J. & Mäenpää, J., 1 toukokuuta 2015, julkaisussa : Genes Chromosomes and Cancer. 54, 5, s. 276-287 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Podocyte apoptosis is prevented by blocking the Toll-like receptor pathway

Saurus, P., Kuusela, S., Lehtonen, E., Hyvönen, M. E., Ristola, M., Fogarty, C. L., Tienari, J., Lassenius, M. I., Forsblom, C., Lehto, M., Saleem, M. A., Groop, P. H., Holthöfer, H. & Lehtonen, S., 1 toukokuuta 2015, julkaisussa : CELL DEATH AND DISEASE. 6, 5, e1752.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Sec14-nodulin proteins and the patterning of phosphoinositide landmarks for developmental control of membrane morphogenesis

Ghosh, R., De Campos, M. K. F., Huang, J., Huh, S. K., Orlowski, A., Yang, Y., Tripathi, A., Nile, A., Lee, H-C., Dynowski, M., Schäfer, H., Róg, T., Lete, M. G., Ahyayauch, H., Alonso, A., Vattulainen, I., Igumenova, T. I., Schaaf, G. & Bankaitis, V. A., 1 toukokuuta 2015, julkaisussa : Molecular Biology of the Cell. 26, 9, s. 1764-1781 18 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Transbilayer lipid interactions mediate nanoclustering of lipid-anchored proteins

Raghupathy, R., Anilkumar, A. A., Polley, A., Singh, P. P., Yadav, M., Johnson, C., Suryawanshi, S., Saikam, V., Sawant, S. D., Panda, A., Guo, Z., Vishwakarma, R. A., Rao, M. & Mayor, S., 23 huhtikuuta 2015, julkaisussa : Cell. 161, 3, s. 581-594 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Role of subunit III and its lipids in the molecular mechanism of cytochrome c oxidase

Sharma, V., Ala-Vannesluoma, P., Vattulainen, I., Wikström, M. & Róg, T., 17 huhtikuuta 2015, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1847, 8, s. 690-697 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

European code against cancer 4th edition: 12 ways to reduce your cancer risk

Schüz, J., Espina, C., Villain, P., Herrero, R., Leon, M. E., Minozzi, S., Romieu, I., Segnan, N., Wardle, J., Wiseman, M., Belardelli, F., Bettcher, D., Cavalli, F., Galea, G., Lenoir, G., Martin-Moreno, J. M., Nicula, F. A., Olsen, J. H., Patnick, J., Primic-Zakelj, M., Puska, P., Van Leeuwen, F. E., Wiestler, O., Zatonski, W., Guha, N., Kralikova, E., McNeill, A., Peruga, A., Anderson, A., Berrino, F., Boutron-Ruault, M. C., Cecchini, M., Key, T. J., Leitzmann, M., Norat, T., Powers, H. J., Scoccianti, C., Auvinen, A., de Vries, E., Erdmann, F., Greinert, R., Harrison, J., Kesminiene, A., McColl, N., Friis, S., Kogevinas, M., Saracci, R., Straif, K., Vainio, H., Almonte, M., Anttila, A., De Vuyst, H., Dillner, J., Franceschi, S., Gonzalez, P., Hall, A., Park, J. Y., Armaroli, P., Atkin, W., Dean, P. B., de Koning, H., Dillner, L., Kuipers, E., Lansdorp-Vogelaar, I., Paci, E., Regula, J., Suonio, E., Törnberg, S., Wood, L. F., Gaudin, N., Frie, K. G., Terrasse, V., Winstanley, K., Bellisario, C., Biagioli, E., Cinquini, M., Gianola, S., Lorenzo, M. G., von Karsa, L. & Lignini, T., 9 huhtikuuta 2015, julkaisussa : CANCER EPIDEMIOLOGY. 39, s. S1-S10

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A Bayesian approach for suppression of limited angular sampling artifacts in single particle 3D reconstruction

Moriya, T., Acar, E., Cheng, R. H. & Ruotsalainen, U., 3 huhtikuuta 2015, julkaisussa : Journal of Structural Biology. 191, 3, s. 318–331 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Early effects of adjuvant breast cancer radiotherapy on right ventricular systolic and diastolic function

Tuohinen, S. S., Skyttä, T., Virtanen, V., Luukkaala, T., Kellokumpu-Lehtinen, P. L. & Raatikainen, P., 1 huhtikuuta 2015, julkaisussa : Anticancer Research. 35, 4, s. 2141-2147 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Low-dose ionising radiation and cardiovascular diseases - Strategies for molecular epidemiological studies in Europe

Kreuzer, M., Auvinen, A., Cardis, E., Hall, J., Jourdain, J. R., Laurier, D., Little, M. P., Peters, A., Raj, K., Russell, N. S., Tapio, S., Zhang, W. & Gomolka, M., 1 huhtikuuta 2015, julkaisussa : MUTATION RESEARCH: REVIEWS IN MUTATION RESEARCH. 764, s. 90-100 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

O-glycan repertoires on a mucin-type reporter protein expressed in CHO cell pools transiently transfected with O-glycan core enzyme cDNAs

Liu, J., Jin, C., Cherian, R. M., Karlsson, N. G. & Holgersson, J., 1 huhtikuuta 2015, julkaisussa : Journal of Biotechnology. 199, s. 77-89 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Ageing-associated changes in the human DNA methylome: Genomic locations and effects on gene expression

Marttila, S., Kananen, L., Häyrynen, S., Jylhävä, J., Nevalainen, T., Hervonen, A., Jylhä, M., Nykter, M. & Hurme, M., 14 maaliskuuta 2015, julkaisussa : BMC Genomics. 16, 1, 179.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Multi-stable dynamics of the non-adiabatic repressilator

Potapov, I., Zhurov, B. & Volkov, E., 6 maaliskuuta 2015, julkaisussa : Journal of the Royal Society. Interface. 12, 104, 20141315.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Light emitting fabric technologies for photodynamic therapy

Mordon, S., Cochrane, C., Tylcz, J. B., Betrouni, N., Mortier, L. & Koncar, V., 1 maaliskuuta 2015, julkaisussa : PHOTODIAGNOSIS AND PHOTODYNAMIC THERAPY. 12, 1, s. 1-8 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The concurrent use of aromatase inhibitors and radiotherapy induces echocardiographic changes in patients with breast cancer

Skyttä, T., Tuohinen, S., Virtanen, V., Raatikainen, P. & Kellokumpu-Lehtinen, P. L., 1 maaliskuuta 2015, julkaisussa : Anticancer Research. 35, 3, s. 1559-1566 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Thermal transport characteristics of human skin measured in vivo using ultrathin conformal arrays of thermal sensors and actuators

Webb, R. C., Pielak, R. M., Bastien, P., Ayers, J., Niittynen, J., Kurniawan, J., Manco, M., Lin, A., Cho, N. H., Malyrchuk, V., Balooch, G. & Rogers, J. A., 6 helmikuuta 2015, julkaisussa : PLoS ONE. 10, 2, e0118131.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Integrated in vitro-in silico screening strategy for the discovery of antibacterial compounds

Nybond, S., Ghemtio, L., Nawrot, D. A., Karp, M., Xhaard, H. & Tammela, P., 1 helmikuuta 2015, julkaisussa : Assay and Drug Development Technologies. 13, 1, s. 25-33 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

VEGFR3 and CD31 as prognostic factors in renal cell cancer

Virman, J. P., Bono, P., Luukkaala, T., Sunela, K., Kujala, P. & Kellokumpu-Lehtinen, P. L., 1 helmikuuta 2015, julkaisussa : Anticancer Research. 35, 2, s. 921-927 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

UniProt: A hub for protein information

Bateman, A., Martin, M. J., O'Donovan, C., Magrane, M., Apweiler, R., Alpi, E., Antunes, R., Arganiska, J., Bely, B., Bingley, M., Bonilla, C., Britto, R., Bursteinas, B., Chavali, G., Cibrian-Uhalte, E., Da Silva, A., De Giorgi, M., Dogan, T., Fazzini, F., Gane, P., Castro, L. G., Garmiri, P., Hatton-Ellis, E., Hieta, R., Huntley, R., Legge, D., Liu, W., Luo, J., Macdougall, A., Mutowo, P., Nightingale, A., Orchard, S., Pichler, K., Poggioli, D., Pundir, S., Pureza, L., Qi, G., Rosanoff, S., Saidi, R., Sawford, T., Shypitsyna, A., Turner, E., Volynkin, V., Wardell, T., Watkins, X., Zellner, H., Cowley, A., Figueira, L., Li, W., McWilliam, H., Lopez, R., Xenarios, I., Bougueleret, L., Bridge, A., Poux, S., Redaschi, N., Aimo, L., Argoud-Puy, G., Auchincloss, A., Axelsen, K., Bansal, P., Baratin, D., Blatter, M. C., Boeckmann, B., Bolleman, J., Boutet, E., Breuza, L., Casal-Casas, C., De Castro, E., Coudert, E., Cuche, B., Doche, M., Dornevil, D., Duvaud, S., Estreicher, A., Famiglietti, L., Feuermann, M., Gasteiger, E., Gehant, S., Gerritsen, V., Gos, A., Gruaz-Gumowski, N., Hinz, U., Hulo, C., Jungo, F., Keller, G., Lara, V., Lemercier, P., Lieberherr, D., Lombardot, T., Martin, X., Masson, P., Morgat, A., Neto, T., Nouspikel, N., Paesano, S., Pedruzzi, I., Pilbout, S., Pozzato, M., Pruess, M., Rivoire, C., Roechert, B., Schneider, M., Sigrist, C., Sonesson, K., Staehli, S., Stutz, A., Sundaram, S., Tognolli, M., Verbregue, L., Veuthey, A. L., Wu, C. H., Arighi, C. N., Arminski, L., Chen, C., Chen, Y., Garavelli, J. S., Huang, H., Laiho, K., McGarvey, P., Natale, D. A., Suzek, B. E., Vinayaka, C. R., Wang, Q., Wang, Y., Yeh, L. S., Yerramalla, M. S. & Zhang, J., 28 tammikuuta 2015, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 43, D1, s. D204-D212

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Computational cancer biology: education is a natural key to many locks

Emmert-Streib, F., Zhang, S. D. & Hamilton, P., 15 tammikuuta 2015, julkaisussa : BMC Cancer. 15, 1, 7.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Oxidation half-reaction of aqueous nucleosides and nucleotides via photoelectron spectroscopy augmented by ab initio calculations

Schroeder, C. A., Pluharová, E., Seidel, R., Schroeder, W. P., Faubel, M., Slavíçek, P., Winter, B., Jungwirth, P. & Bradforth, S. E., 14 tammikuuta 2015, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 137, 1, s. 201-209 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A motion artifact generation and assessment system for the rapid testing of surface biopotential electrodes

Cömert, A. & Hyttinen, J., 1 tammikuuta 2015, julkaisussa : Physiological Measurement. 36, 1, s. 1-25 25 Sivumäärä, 1.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cost-effectiveness of prostate cancer screening: A simulation study based on ERSPC data

Heijnsdijk, E. A. M., De Carvalho, T. M. D., Auvinen, A., Zappa, M., Nelen, V., Kwiatkowski, M., Villers, A., Páez, A., Moss, S. M., Tammela, T. L. J., Recker, F., Denis, L., Carlsson, S. V., Wever, E. M., Bangma, C. H., Schröder, F. H., Roobol, M. J., Hugosson, J. & De Koning, H. J., 1 tammikuuta 2015, julkaisussa : JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE. 107, 1, dju366.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal fluorescence intensity data

Julkaisun otsikon käännös: : Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal flourescence intensity data
Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 tammikuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 31, 1, s. 69-75 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Adaptive autoregressive model for reduction of noise in SPECT

Takalo, R., Hytti, H., Ihalainen, H. & Sohlberg, A., 2015, julkaisussa : Computational and Mathematical Methods in Medicine. 2015, 494691.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Efficient preparation of shuffled DNA libraries through recombination (Gateway) cloning

Lehtonen, S. I., Taskinen, B., Ojala, E., Kukkurainen, S., Rahikainen, R., Riihimäki, T. A., Laitinen, O. H., Kulomaa, M. S. & Hytönen, V. P., 2015, julkaisussa : Protein Engineering Design and Selection. 28, 1, s. 23-28 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Experimental determination and computational interpretation of biophysical properties of lipid bilayers enriched by cholesteryl hemisuccinate

Kulig, W., Jurkiewicz, P., Olzyńska, A., Tynkkynen, J., Javanainen, M., Manna, M., Rog, T., Hof, M., Vattulainen, I. & Jungwirth, P., 2015, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1848, 2, s. 422-432 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

I microRNA nella placca aterosclerotica

Raitoharju, E., Oksala, N. & Lehtimäki, T., 2015, julkaisussa : Biochimica Clinica. 39, 1, s. 56-67 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Interaction with serum albumin as a factor of the photodynamic efficacy of novel bacteriopurpurinimide derivatives

Akimova, A. V., Rychkov, G. N., Grin, M. A., Filippova, N. A., Golovina, G. V., Durandin, N. A., Vinogradov, A. M., Kokrashvili, T. A., Mironov, A. F., Shtil, A. A. & Kuzmin, V. A., 2015, julkaisussa : ACTA NATURAE. 7, 1, s. 109-116 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Method with high-throughput screening potential for antioxidative substances using Escherichia coli biosensor katG'::lux

Tienaho, J., Sarjala, T., Franzén, R. & Karp, M., 2015, julkaisussa : Journal of Microbiological Methods. 118, s. 78-80 3 Sivumäärä, 4723.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Multifunctional ultrasmall nanoplatforms for vascular-targeted interstitial photodynamic therapy of brain tumors guided by real-time MRI

Bechet, D., Auger, F., Couleaud, P., Marty, E., Ravasi, L., Durieux, N., Bonnet, C., Plénat, F., Frochot, C., Mordon, S., Tillement, O., Vanderesse, R., Lux, F., Perriat, P., Guillemin, F. & Barberi-Heyob, M., 2015, julkaisussa : NANOMEDICINE: NANOTECHNOLOGY BIOLOGY AND MEDICINE. 11, 3, s. 657-670 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Switchavidin: Reversible biotin-avidin-biotin bridges with high affinity and specificity

Taskinen, B., Zauner, D., Lehtonen, S. I., Koskinen, M., Thomson, C., Kähkönen, N., Kukkurainen, S., Määttä, J. A. E., Ihalainen, T. O., Kulomaa, M. S., Gruber, H. J. & Hytönen, V. P., 17 joulukuuta 2014, julkaisussa : Bioconjugate Chemistry. 25, 12, s. 2233-2243 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparative evaluation of gene set analysis approaches for RNA-Seq data

Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 5 joulukuuta 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, 1, 397.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Rationally engineered synthetic coculture for improved biomass and product formation

Julkaisun otsikon käännös: : Rationally engineered synthetic coculture for improved biomass and product formation
Santala, S., Karp, M. & Santala, V., 3 joulukuuta 2014, julkaisussa : PLoS ONE. 9, 12, e113786.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

FRα: une cible pour la thérapie photodynamique prophylactique des métastases péritonéales ovariennes?

Azaïs, H., Moussaron, A., Bach, S. K., Bassil, A., Betrouni, N., Frochot, C., Collinet, P. & Mordon, S., 1 joulukuuta 2014, julkaisussa : BULLETIN DU CANCER. 101, 12, s. 1109-1113 5 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Interface matters: The stiffness route to stability of a thermophilic tetrameric malate dehydrogenase

Kalimeri, M., Girard, E., Madern, D. & Sterpone, F., 1 joulukuuta 2014, julkaisussa : PLoS ONE. 9, 12, e113895.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The talin-integrin interface under mechanical stress

Kukkurainen, S., Määttä, J. A., Saeger, J., Valjakka, J., Vogel, V. & Hytönen, V. P., 1 joulukuuta 2014, julkaisussa : Molecular Biosystems. 10, 12, s. 3217-3228 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Toward computational cumulative biology by combining models of biological datasets

Faisal, A., Peltonen, J., Georgii, E., Rung, J. & Kaski, S., 26 marraskuuta 2014, julkaisussa : PLoS ONE. 9, 11, e113053.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Connection between absorption properties and conformational changes in Deinococcus radiodurans phytochrome

Takala, H., Lehtivuori, H., Hammarén, H., Hytönen, V. P. & Ihalainen, J. A., 18 marraskuuta 2014, julkaisussa : Biochemistry. 53, 45, s. 7076-7085 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A framework for estimating radiation-related cancer risks in Japan from the 2011 Fukushima nuclear accident

Walsh, L., Zhang, W., Shore, R. E., Auvinen, A., Laurier, D., Wakeford, R., Jacob, P., Gent, N., Anspaugh, L. R., Schüz, J., Kesminiene, A., Van Deventer, E., Tritscher, A. & Del Rosarion Pérez, M., 1 marraskuuta 2014, julkaisussa : RADIATION RESEARCH. 182, 5, s. 556-572 17 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Estimation of optimal matching position for orthogonal kV setup images and minimal setup margins in radiotherapy of whole breast and lymph node areas

Laaksomaa, M., Kapanen, M., Skyttä, T., Peltola, S., Hyödynmaa, S. & Kellokumpu-Lehtinen, P. L., 1 marraskuuta 2014, julkaisussa : Reports of Practical Oncology and Radiotherapy. 19, 6, s. 369-375 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Statin use and breast cancer survival: A nationwide cohort study from Finland

Murtola, T. J., Visvanathan, K., Artama, M., Vainio, H. & Pukkala, E., 20 lokakuuta 2014, julkaisussa : PLoS ONE. 9, 10, e110231.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Global analysis of human nonreceptor tyrosine kinase specificity using high-density peptide microarrays

Deng, Y., Alicea-Velázquez, N. L., Bannwarth, L., Lehtonen, S. I., Boggon, T. J., Cheng, H. C., Hytönen, V. P. & Turk, B. E., 3 lokakuuta 2014, julkaisussa : Journal of Proteome Research. 13, 10, s. 4339-4346 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Different culture conditions modulate the immunological properties of adipose stem cells

Patrikoski, M., Sivula, J., Huhtala, H., Helminen, M., Salo, F., Mannerström, B. & Miettinen, S., 2 lokakuuta 2014, julkaisussa : Stem Cells Translational Medicine. 3, 10, s. 1220-1230 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Rapid, Brushless Self-assembly of a PS-b-PDMS Block Copolymer for Nanolithography

Rasappa, S., Schulte, L., Borah, D., Morris, M. A. & Ndoni, S., 1 lokakuuta 2014, julkaisussa : Colloids and Interface Science Communications. 2, s. 1-5 5 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A meta-analysis of 87,040 individuals identifies 23 new susceptibility loci for prostate cancer

Al Olama, A. A., Kote-Jarai, Z., Berndt, S. I., Conti, D. V., Schumacher, F., Han, Y., Benlloch, S., Hazelett, D. J., Wang, Z., Saunders, E., Leongamornlert, D., Lindstrom, S., Jugurnauth-Little, S., Dadaev, T., Tymrakiewicz, M., Stram, D. O., Rand, K., Wan, P., Stram, A., Sheng, X., Pooler, L. C., Park, K., Xia, L., Tyrer, J., Kolonel, L. N., Le Marchand, L., Hoover, R. N., Machiela, M. J., Yeager, M., Burdette, L., Chung, C. C., Hutchinson, A., Yu, K., Goh, C., Ahmed, M., Govindasami, K., Guy, M., Tammela, T. L. J., Auvinen, A., Wahlfors, T., Schleutker, J., Visakorpi, T., Leinonen, K. A., Xu, J., Aly, M., Donovan, J., Travis, R. C., Key, T. J., Siddiq, A., Canzian, F., Khaw, K. T., Takahashi, A., Kubo, M., Pharoah, P., Pashayan, N., Weischer, M., Nordestgaard, B. G., Nielsen, S. F., Klarskov, P., Røder, M. A., Iversen, P., Thibodeau, S. N., McDonnell, S. K., Schaid, D. J., Stanford, J. L., Kolb, S., Holt, S., Knudsen, B., Coll, A. H., Gapstur, S. M., Diver, W. R., Stevens, V. L., Maier, C., Luedeke, M., Herkommer, K., Rinckleb, A. E., Strom, S. S., Pettaway, C., Yeboah, E. D., Tettey, Y., Biritwum, R. B., Adjei, A. A., Tay, E., Truelove, A., Niwa, S., Chokkalingam, A. P., Cannon-Albright, L., Cybulski, C., Wokołorczyk, D., Kluzniak, W., Park, J., Sellers, T., Lin, H. Y., Isaacs, W. B., Partin, A. W., Brenner, H., Dieffenbach, A. K., Stegmaier, C., Chen, C., Giovannucci, E. L., Ma, J., Stampfer, M., Penney, K. L., Mucci, L., John, E. M., Ingles, S. A., Kittles, R. A., Murphy, A. B., Pandha, H., Michael, A., Kierzek, A. M., Blot, W., Signorello, L. B., Zheng, W., Albanes, D., Virtamo, J., Weinstein, S., Nemesure, B., Carpten, J., Leske, C., Wu, S. Y., Hennis, A., Kibel, A. S., Rybicki, B. A., Neslund-Dudas, C., Hsing, A. W., Chu, L., Goodman, P. J., Klein, E. A., Lilly Zheng, S., Batra, J., Clements, J., Spurdle, A., Teixeira, M. R., Paulo, P., Maia, S., Slavov, C., Kaneva, R., Mitev, V., Witte, J. S., Casey, G., Gillanders, E. M., Seminara, D., Riboli, E., Hamdy, F. C., Coetzee, G. A., Li, Q., Freedman, M. L., Hunter, D. J., Muir, K., Gronberg, H., Neal, D. E., Southey, M., Giles, G. G., Severi, G., Cook, M. B., Nakagawa, H., Wiklund, F., Kraft, P., Chanock, S. J., Henderson, B. E., Easton, D. F., Eeles, R. A. & Haiman, C. A., 26 syyskuuta 2014, julkaisussa : Nature Genetics. 46, 10, s. 1103-1109 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Mixotrophic cultivation of oleaginous Chlorella sp. KR-1 mediated by actual coal-fired flue gas for biodiesel production

Praveenkumar, R., Kim, B., Choi, E., Lee, K., Cho, S., Hyun, J. S., Park, J. Y., Lee, Y. C., Lee, H. U., Lee, J. S. & Oh, Y. K., 12 syyskuuta 2014, julkaisussa : Bioprocess and Biosystems Engineering. 37, 10, s. 2083-2094 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Pharmacokinetics of an injectable modified-release 2-hydroxyflutamide formulation in the human prostate gland using a semiphysiologically based biopharmaceutical model

Sjögren, E., Tammela, T. L., Lennernäs, B., Taari, K., Isotalo, T., Malmsten, L. Å., Axén, N. & Lennernäs, H., 2 syyskuuta 2014, julkaisussa : Molecular Pharmaceutics. 11, 9, s. 3097-3111 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Advanced Material-Based Sensing Structures

Tentzeris, M. M., Kim, S., Lakafosis, V., Lee, H., Le, T., Vyas, R., Mukala, S. & Traille, A., 25 elokuuta 2014, Handbook of Biomedical Telemetry. Wiley-Blackwell, s. 633-689 57 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Power Issues in Biomedical Telemetry

Tentzeris, M. M., Vyas, R., Wei, W., Kawahara, Y., Yang, L., Georgakopoulos, S., Lakafosis, V., Kim, S., Lee, H., Le, T., Mukala, S. & Traille, A., 25 elokuuta 2014, Handbook of Biomedical Telemetry. Wiley-Blackwell, s. 108-130 23 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cruciate ligament reconstruction and risk of knee osteoarthritis: The association between cruciate ligament injury and post-traumatic osteoarthritis. a population based nationwide study in Sweden, 1987-2009

Nordenvall, R., Bahmanyar, S., Adami, J., Mattila, V. M. & Felländer-Tsai, L., 22 elokuuta 2014, julkaisussa : PLoS ONE. 9, 8, e104681.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effect of Omeprazole Dose, Nonsteroidal Anti-inflammatory Agents, and Smoking on Repair Mechanisms in Acute Peptic Ulcer Bleeding

Rantanen, T., Udd, M., Honkanen, T., Miettinen, P., Kärjä, V., Rantanen, L., Julkunen, R., Mustonen, H., Paavonen, T. & Oksala, N., 20 elokuuta 2014, julkaisussa : Digestive Diseases and Sciences. 59, 11, s. 2666-2674 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Mapping of the chromosomal amplification 1p21-22 in bladder cancer

Scaravilli, M., Asero, P., Tammela, T. L., Visakorpi, T. & Saramäki, O. R., 18 elokuuta 2014, julkaisussa : BMC RESEARCH NOTES. 7, 1, 547.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Calcium transients closely reflect prolonged action potentials in iPSC models of inherited cardiac arrhythmia

Spencer, C. I., Baba, S., Nakamura, K., Hua, E. A., Sears, M. A. F., Fu, C. C., Zhang, J., Balijepalli, S., Tomoda, K., Hayashi, Y., Lizarraga, P., Wojciak, J., Scheinman, M. M., Aalto-Setälä, K., Makielski, J. C., January, C. T., Healy, K. E., Kamp, T. J., Yamanaka, S. & Conklin, B. R., 12 elokuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 3, 2, s. 269-281 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Claudins as prognostic factors for renal cell cancer

Virman, J. P., Soini, Y., Kujala, P., Luukkaala, T., Salminen, T., Sunela, K. & Kellokumpu-Lehtinen, P. L., 1 elokuuta 2014, julkaisussa : Anticancer Research. 34, 8, s. 4181-4188 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Molecular engineering of avidin and hydrophobin for functional self-assembling interfaces

Kurppa, K., Hytönen, V. P., Nakari-Setälä, T., Kulomaa, M. S. & Linder, M. B., 1 elokuuta 2014, julkaisussa : Colloids and Surfaces B: Biointerfaces. 120, s. 102-109 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

ERBB4 promoter polymorphism is associated with poor distant disease-free survival in high-risk early breast cancer

Kurppa, K. J., Rokavec, M., Sundvall, M., Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Joensuu, H., Brauch, H. & Elenius, K., 18 heinäkuuta 2014, julkaisussa : PLoS ONE. 9, 7, e102388.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Blood microRNA profile associates with the levels of serum lipids and metabolites associated with glucose metabolism and insulin resistance and pinpoints pathways underlying metabolic syndrome. The cardiovascular risk in Young Finns Study.

Raitoharju, E., Seppälä, I., Oksala, N., Lyytikäinen, L. P., Raitakari, O., Viikari, J., Ala-Korpela, M., Soininen, P., Kangas, A. J., Waldenberger, M., Klopp, N., Illig, T., Leiviskä, J., Loo, B. M., Hutri-Kähönen, N., Kähönen, M., Laaksonen, R. & Lehtimäki, T., 25 kesäkuuta 2014, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 391, 1-2, s. 41-49 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Chimeric avidin - NMR structure and dynamics of a 56 kDa homotetrameric thermostable protein

Tossavainen, H., Kukkurainen, S., Määttä, J. A. E., Kähkönen, N., Pihlajamaa, T., Hytönen, V. P., Kulomaa, M. S. & Permi, P., 24 kesäkuuta 2014, julkaisussa : PLoS ONE. 9, 6, e100564.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Hydration of the chloride ion in concentrated aqueous solutions using neutron scattering and molecular dynamics

Pluhařová, E., Fischer, H. E., Mason, P. E. & Jungwirth, P., 19 toukokuuta 2014, julkaisussa : Molecular Physics. 112, 9-10, s. 1230-1240 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Light-fuelled transport of large dendrimers and proteins

Koskela, J. E., Liljeström, V., Lim, J., Simanek, E. E., Ras, R. H. A., Priimagi, A. & Kostiainen, M. A., 14 toukokuuta 2014, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 136, 19, s. 6850-6853 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

RE: Prostate-specific antigen screening trials and prostate cancer deaths: The androgen deprivation connection

Carlsson, S., Roobol, M. J., Schröder, F. H., Hugosson, J. & Auvinen, A., 14 toukokuuta 2014, julkaisussa : JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE. 106, 5, dju079.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

AROS has a context-dependent effect on SIRT1

Kokkola, T., Suuronen, T., Molnár, F., Määttä, J., Salminen, A., Jarho, E. M. & Lahtela-Kakkonen, M., 2 toukokuuta 2014, julkaisussa : FEBS Letters. 588, 9, s. 1523-1528 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Chernobyl fallout and cancer incidence in Finland 1988-2007

Auvinen, A., Seppä, K., Pasanen, K., Kurttio, P., Patama, T., Pukkala, E., Heinävaara, S., Arvela, H., Verkasalo, P. & Hakulinen, T., 1 toukokuuta 2014, julkaisussa : International Journal of Cancer. 134, 9, s. 2253-2263 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Impact of epoetin-beta on anemia and health-related quality of life in cancer patients: A prospective observational study using the generic 15D instrument

Mäenpa, J., Puistola, U., Riska, H., Sintonen, H., Saarni, O., Juvonen, E. & Kellokumpu-Lehtinen, P. L., 1 toukokuuta 2014, julkaisussa : Anticancer Research. 34, 5, s. 2325-2330 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Interrelations of graph distance measures based on topological indices

Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Shi, Y., 23 huhtikuuta 2014, julkaisussa : PLoS ONE. 9, 4, e94985.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Hypermethylation of the GABRẼmiR-452̃miR-224 promoter in prostate cancer predicts biochemical recurrence after radical prostatectomy

Kristensen, H., Haldrup, C., Strand, S., Mundbjerg, K., Mortensen, M. M., Thorsen, K., Ostenfeld, M. S., Wild, P. J., Arsov, C., Goering, W., Visakorpi, T., Egevad, L., Lindberg, J., Grönberg, H., Høyer, S., Borre, M., Orntoft, T. F. & Sørensen, K. D., 15 huhtikuuta 2014, julkaisussa : Clinical Cancer Research. 20, 8, s. 2169-2181 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

NetBioV: An R package for visualizing large network data in biology and medicine

Tripathi, S., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 2 huhtikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 19, s. 2834-2836 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Assessment of metabolic flux distribution in the thermophilic hydrogen producer Caloramator celer as affected by external pH and hydrogen partial pressure

Julkaisun otsikon käännös: : Assessment of metabolic flux distribution in the thermophilic hydrogen producer Caloramator celer as affected by external pH and hydrogen partial pressure
Ciranna, A., Pawar, S. S., Santala, V., Karp, M. & van Niel, E. W. J., 28 maaliskuuta 2014, julkaisussa : Microbial Cell Factories. 13, 1, 48.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Rewiring the wax ester production pathway of acinetobacter baylyi ADP1

Julkaisun otsikon käännös: : Rewiring the Wax Ester Production Pathway of Acinetobacter baylyi ADP1
Santala, S., Efimova, E., Koskinen, P., Karp, M. T. & Santala, V., 21 maaliskuuta 2014, julkaisussa : ACS Synthetic Biology. 3, 3, s. 145-151 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A novel chimeric avidin with increased thermal stability using DNA shuffling

Taskinen, B., Airenne, T. T., Jänis, J., Rahikainen, R., Johnson, M. S., Kulomaa, M. S. & Hytönen, V. P., 14 maaliskuuta 2014, julkaisussa : PLoS ONE. 9, 3, e92058.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

KPNA7, a nuclear transport receptor, promotes malignant properties of pancreatic cancer cells in vitro

Laurila, E., Vuorinen, E., Savinainen, K., Rauhala, H. & Kallioniemi, A., 10 maaliskuuta 2014, julkaisussa : Experimental Cell Research. 322, 1, s. 159-167 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Network-based methods for computational diagnostics by means of R

Mueller, L. A. J., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 maaliskuuta 2014, Computational Medicine: Tools and Challenges. Springer-Verlag Wien, s. 185-197 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Quality of life of recently treated patients with breast cancer

Penttinen, H., Rautalin, M., Roine, R., Jahkola, T., Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Huovinen, R., Kautiainen, H., Järvenpää, S., Hakamies-Blomqvist, L., Blomqvist, C. & Saarto, T., 1 maaliskuuta 2014, julkaisussa : Anticancer Research. 34, 3, s. 1201-1206 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Association analysis of 9,560 prostate cancer cases from the International Consortium of Prostate Cancer Genetics confirms the role of reported prostate cancer associated SNPs for familial disease

Teerlink, C. C., Thibodeau, S. N., McDonnell, S. K., Schaid, D. J., Rinckleb, A., Maier, C., Vogel, W., Cancel-Tassin, G., Egrot, C., Cussenot, O., Foulkes, W. D., Giles, G. G., Hopper, J. L., Severi, G., Eeles, R., Easton, D., Kote-Jarai, Z., Guy, M., Cooney, K. A., Ray, A. M., Zuhlke, K. A., Lange, E. M., Fitzgerald, L. M., Stanford, J. L., Ostrander, E. A., Wiley, K. E., Isaacs, S. D., Walsh, P. C., Isaacs, W. B., Wahlfors, T., Tammela, T., Schleutker, J., Wiklund, F., Grönberg, H., Emanuelsson, M., Carpten, J., Bailey-Wilson, J., Whittemore, A. S., Oakley-Girvan, I., Hsieh, C. L., Catalona, W. J., Zheng, S. L., Jin, G., Lu, L., Xu, J., Camp, N. J. & Cannon-Albright, L. A., maaliskuuta 2014, julkaisussa : HUMAN GENETICS. 133, 3, s. 347-356 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Assessing interactions of two loci (rs4242382 and rs10486567) in familial prostate cancer: Statistical evaluation of epistasis

Chen, L. S., Fann, J. C. Y., Chiu, S. Y. H., Yen, A. M. F., Wahlfors, T., Tammela, T. L., Chen, H. H., Auvinen, A. & Schleutker, J., 25 helmikuuta 2014, julkaisussa : PLoS ONE. 9, 2, e89508.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Small-molecule induction promotes corneal epithelial cell differentiation from human induced pluripotent stem cells

Mikhailova, A., Ilmarinen, T., Uusitalo, H. & Skottman, H., 11 helmikuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 2, 2, s. 219-231 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Aberrant DNA methylation reprogramming during induced pluripotent stem cell generation is dependent on the choice of reprogramming factors

Planello, A. C., Ji, J., Sharma, V., Singhania, R., Mbabaali, F., Müller, F., Alfaro, J. A., Bock, C., De Carvalho, D. D. & Batada, N. N., 7 helmikuuta 2014, julkaisussa : Cell Regeneration. 3, 1, 4.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

MicroRNAs in atherosclerosis

Hosin, A. A., Prasad, A., Viiri, L. E., Davies, A. H. & Shalhoub, J., 6 helmikuuta 2014, julkaisussa : Journal of Vascular Research. 51, 5, s. 338-349 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Gene Sets Net Correlations Analysis (GSNCA): A multivariate differential coexpression test for gene sets

Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 1 helmikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 3, s. 360-368 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structure and barrier properties of human embryonic stem cell-derived retinal pigment epithelial cells are affected by extracellular matrix protein coating

Sorkio, A., Hongisto, H., Kaarniranta, K., Uusitalo, H., Juuti-Uusitalo, K. & Skottman, H., 1 helmikuuta 2014, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 20, 3-4, s. 622-634 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A 3D Alzheimer's disease culture model and the induction of P21-activated kinase mediated sensing in iPSC derived neurons

Zhang, D., Pekkanen-Mattila, M., Shahsavani, M., Falk, A., Teixeira, A. I. & Herland, A., helmikuuta 2014, julkaisussa : Biomaterials. 35, 5, s. 1420-1428 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Investigating the binding behaviour of two avidin-based testosterone binders using molecular recognition force spectroscopy

Rangl, M., Leitner, M., Riihimäki, T., Lehtonen, S., Hytönen, V. P., Gruber, H. J., Kulomaa, M., Hinterdorfer, P. & Ebner, A., helmikuuta 2014, julkaisussa : Journal of Molecular Recognition. 27, 2, s. 92-97 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Dry computational approaches for wet medical problems

Emmert-Streib, F., Zhang, S. D. & Hamilton, P., 25 tammikuuta 2014, julkaisussa : Journal of Translational Medicine. 12, 1, 26.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Antioxidant supplementation reduces genomic aberrations in human induced pluripotent stem cells

Ji, J., Sharma, V., Qi, S., Guarch, M. E., Zhao, P., Luo, Z., Fan, W., Wang, Y., Mbabaali, F., Neculai, D., Esteban, M. A., McPherson, J. D. & Batada, N. N., 14 tammikuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 2, 1, s. 44-51 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Activities at the Universal Protein Resource (UniProt)

Apweiler, R., Bateman, A., Martin, M. J., O'Donovan, C., Magrane, M., Alam-Faruque, Y., Alpi, E., Antunes, R., Arganiska, J., Casanova, E. B., Bely, B., Bingley, M., Bonilla, C., Britto, R., Bursteinas, B., Chan, W. M., Chavali, G., Cibrian-Uhalte, E., Da Silva, A., De Giorgi, M., Fazzini, F., Gane, P., Castro, L. G., Garmiri, P., Hatton-Ellis, E., Hieta, R., Huntley, R., Legge, D., Liu, W., Luo, J., MacDougall, A., Mutowo, P., Nightingale, A., Orchard, S., Pichler, K., Poggioli, D., Pundir, S., Pureza, L., Qi, G., Rosanoff, S., Sawford, T., Shypitsyna, A., Turner, E., Volynkin, V., Wardell, T., Watkins, X., Corbett, M., Donnelly, M., Van Rensburg, P., Goujon, M., McWilliam, H., Lopez, R., Xenarios, I., Bougueleret, L., Bridge, A., Poux, S., Redaschi, N., Aimo, L., Auchincloss, A., Axelsen, K., Bansal, P., Baratin, D., Binz, P. A., Blatter, M. C., Boeckmann, B., Bolleman, J., Boutet, E., Breuza, L., Casal-Casas, C., De Castro, E., Cerutti, L., Coudert, E., Cuche, B., Doche, M., Dornevil, D., Duvaud, S., Estreicher, A., Famiglietti, L., Feuermann, M., Gasteiger, E., Gehant, S., Gerritsen, V., Gos, A., Gruaz-Gumowski, N., Hinz, U., Hulo, C., James, J., Jungo, F., Keller, G., Lara, V., Lemercier, P., Lew, J., Lieberherr, D., Lombardot, T., Martin, X., Masson, P., Morgat, A., Neto, T., Paesano, S., Pedruzzi, I., Pilbout, S., Pozzato, M., Pruess, M., Rivoire, C., Roechert, B., Schneider, M., Sigrist, C., Sonesson, K., Staehli, S., Stutz, A., Sundaram, S., Tognolli, M., Verbregue, L., Veuthey, A. L., Wu, C. H., Arighi, C. N., Arminski, L., Chen, C., Chen, Y., Garavelli, J. S., Huang, H., Laiho, K., McGarvey, P., Natale, D. A., Suzek, B. E., Vinayaka, C. R., Wang, Q., Wang, Y., Yeh, L. S., Yerramalla, M. S. & Zhang, J., 1 tammikuuta 2014, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 42, D1

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Natural thermal adaptation increases heat shock protein levels and decreases oxidative stress

Oksala, N. K. J., Ekmekçi, F. G., Özsoy, E., Kirankaya, Ş., Kokkola, T., Emecen, G., Lappalainen, J., Kaarniranta, K. & Atalay, M., 1 tammikuuta 2014, julkaisussa : REDOX BIOLOGY. 3, s. 25-28 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

USP22 regulates oncogenic signaling pathways to drive lethal cancer progression

Schrecengost, R. S., Dean, J. L., Goodwin, J. F., Schiewer, M. J., Urban, M. W., Stanek, T. J., Sussman, R. T., Hicks, J. L., Birbe, R. C., Draganova-Tacheva, R. A., Visakorpi, T., DeMarzo, A. M., McMahon, S. B. & Knudsen, K. E., 1 tammikuuta 2014, julkaisussa : Cancer Research. 74, 1, s. 272-286 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Shiga-like toxin binds with high avidity to multivalent O-linked blood group P1 determinants on mucin-type fusion proteins

Maria Cherian, R., Gaunitz, S., Nilsson, A., Liu, J., Karlsson, N. G. & Holgersson, J., tammikuuta 2014, julkaisussa : GLYCOBIOLOGY. 24, 1, s. 26-38 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A Novel MMP12 Locus Is Associated with Large Artery Atherosclerotic Stroke Using a Genome-Wide Age-at-Onset Informed Approach

Traylor, M., Mäkelä, K. M., Kilarski, L. L., Holliday, E. G., Devan, W. J., Nalls, M. A., Wiggins, K. L., Zhao, W., Cheng, Y. C., Achterberg, S., Malik, R., Sudlow, C., Bevan, S., Raitoharju, E., Oksala, N., Thijs, V., Lemmens, R., Lindgren, A., Slowik, A., Maguire, J. M., Walters, M., Algra, A., Sharma, P., Attia, J. R., Boncoraglio, G. B., Rothwell, P. M., de Bakker, P. I. W., Bis, J. C., Saleheen, D., Kittner, S. J., Mitchell, B. D., Rosand, J., Meschia, J. F., Levi, C., Dichgans, M., Lehtimäki, T., Lewis, C. M. & Markus, H. S., 2014, julkaisussa : PLOS GENETICS. 10, 7, e1004469.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A prostate cancer susceptibility allele at 6q22 increases RFX6 expression by modulating HOXB13 chromatin binding

Huang, Q., Whitington, T., Gao, P., Lindberg, J. F., Yang, Y., Sun, J., Väisänen, M. R., Szulkin, R., Annala, M., Yan, J., Egevad, L. A., Zhang, K., Lin, R., Jolma, A., Nykter, M., Manninen, A., Wiklund, F., Vaarala, M. H., Visakorpi, T., Xu, J., Taipale, J. & Wei, G. H., 2014, julkaisussa : Nature Genetics. 46, 2, s. 126-135 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Autologous adipose stem cells in treatment of female stress urinary incontinence: Results of a pilot study

Kuismanen, K., Sartoneva, R., Haimi, S., Mannerström, B., Tomás, E., Miettinen, S. & Nieminen, K., 2014, julkaisussa : Stem Cells Translational Medicine. 3, 8, s. 936-941 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Common features of chromatin in aging and cancer: Cause or coincidence?

Zane, L., Sharma, V. & Misteli, T., 2014, julkaisussa : TRENDS IN CELL BIOLOGY. 24, 11, s. 686-694 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Electrophoretic mobilities of neutral analytes and electroosmotic flow markers in aqueous solutions of Hofmeister salts

Křížek, T., Kubíčková, A., Hladílková, J., Coufal, P., Heyda, J. & Jungwirth, P., 2014, julkaisussa : ELECTROPHORESIS. 35, 5, s. 617-624 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Enhancing our understanding of ways to analyze metagenomes

Emmert-Streib, F., 2014, julkaisussa : Frontiers in Genetics. 5, APR, Article 108.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Evidence-based analysis of a novel symbiotic and epiphytic cyanobacteria associated with Azolla by cyto and molecular taxonomy

Kannan, K., Vijayan, D., MubarakAli, D., Praveenkumar, R., Ahamed, A. P. & Thajuddin, N., 2014, julkaisussa : Biotechnology. 13, 2, s. 46-53 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Functional and genetic analysis of the colon cancer network.

Emmert-Streib, F., de Matos Simoes, R., Glazko, G., McDade, S., Haibe-Kains, B., Holzinger, A., Dehmer, M. & Campbell, F., 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, Suppl 6, S6.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Indocyanine green: Photosensitizer or chromophore? Still a debate

Giraudeau, C., Moussaron, A., Stallivieri, A., Mordon, S. & Frochot, C., 2014, julkaisussa : CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. 21, 16, s. 1871-1897 27 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Inference and validation of predictive gene networks from biomedical literature and gene expression data

Olsen, C., Fleming, K., Prendergast, N., Rubio, R., Emmert-Streib, F., Bontempi, G., Haibe-Kains, B. & Quackenbush, J., 2014, julkaisussa : Genomics. 103, 5-6, s. 329-336 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Kinetics of bioconjugate nanoparticle label binding in a sandwich-type immunoassay

Näreoja, T., Ebner, A., Gruber, H. J., Taskinen, B., Kienberger, F., Hänninen, P. E., Hytönen, V. P., Hinterdorfer, P. & Härmä, H., 2014, julkaisussa : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 406, 2, s. 493-503 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Metabolic engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for improved growth on gluconate and glucose

Kannisto, M., Aho, T., Karp, M. & Santala, V., 2014, julkaisussa : Applied and Environmental Microbiology. 80, 22, s. 7021-7027 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Murein lytic enzyme TgaA of Bifidobacterium bifidum MIMBb75 modulates dendritic cell maturation through its cysteine- and histidine-dependent amidohydrolase/peptidase (CHAP) amidase domain

Julkaisun otsikon käännös: : Murein Lytic Enzyme TgaA of Bifidobacterium bifidum MIMBb75 Modulates Dendritic Cell Maturation through Its Cysteine- and Histidine-Dependent Amidohydrolase/Peptidase (CHAP) Amidase Domain
Guglielmetti, S., Zanoni, I., Balzaretti, S., Miriani, M., Taverniti, V., de Noni, I., Presti, I., Stuknyte, M., Scarafoni, A., Arioli, S., Iametti, S., Bonomi, F., Mora, D., Karp, M. & Granucci, F., 2014, julkaisussa : Applied and Environmental Microbiology. 80, 17, s. 5170-5177 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Novel derivatives of bacteriochlorophyll a: Complex formation with albumin and the mechanism of tumor cell photodamage

Akimova, A. V., Grin, M. A., Golovina, G. V., Kokrashvili, T. A., Vinogradov, A. M., Mironov, A. F., Rychkov, G. N., Shtil, A. A., Kuzmin, V. A. & Durandin, N. A., 2014, julkaisussa : DOKLADY BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS. 454, 1, s. 17-20 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Novel in vitro cardiovascular constructs composed of vascular-like networks and cardiomyocytes

Vuorenpää, H., Ikonen, L., Kujala, K., Huttala, O., Sarkanen, J. R., Ylikomi, T., Aalto-Setälä, K. & Heinonen, T., 2014, julkaisussa : IN VITRO CELLULAR AND DEVELOPMENTAL BIOLOGY: ANIMAL. 50, 4, s. 275-286 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Optimal management of metastatic castration-resistant prostate cancer: Highlights from a European Expert Consensus Panel

Fitzpatrick, J. M., Bellmunt, J., Fizazi, K., Heidenreich, A., Sternberg, C. N., Tombal, B., Alcaraz, A., Bahl, A., Bracarda, S., Di Lorenzo, G., Efstathiou, E., Finn, S. P., Fosså, S., Gillessen, S., Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Lecouvet, F. E., Oudard, S., De Reijke, T. M., Robson, C. N., De Santis, M., Seruga, B. & De Wit, R., 2014, julkaisussa : EUROPEAN JOURNAL OF CANCER. 50, 9, s. 1617-1627 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Origins and functional consequences of somatic mitochondrial DNA mutations in human cancer

Ju, Y. S. E., Alexandrov, L. B., Gerstung, M., Martincorena, I., Nik-Zainal, S., Ramakrishna, M., Davies, H. R., Papaemmanuil, E., Gundem, G., Shlien, A., Bolli, N., Behjati, S., Tarpey, P. S., Nangalia, J., Massie, C. E., Butler, A. P., Teague, J. W., Vassiliou, G. S., Green, A. R., Du, M. Q., Unnikrishnan, A., Pimanda, J. E., Teh, B. T. E., Munshi, N., Greaves, M., Vyas, P., El-Naggar, A. K., Santarius, T., Collins, V. P., Grundy, R., Taylor, J. A., Hayes, D. N., Malkin, D., Foster, C. S., Warren, A. Y., Whitaker, H. C., Brewer, D., Eeles, R., Cooper, C., Neal, D., Visakorpi, T., Isaacs, W. B., Bova, G. S., Flanagan, A. M., Futreal, P. A., Lynch, A. G., Chinnery, P. F., McDermott, U., Stratton, M. R. & Campbell, P. J., 2014, julkaisussa : eLIFE. 3

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Prostate cancer risk and nonsteroidal antiinflammatory drug use in the Finnish prostate cancer screening trial.

Veitonmäki, T., Murtola, T. J., Määttänen, L., Taari, K., Stenman, U. H., Tammela, T. L. & Auvinen, A., 2014, julkaisussa : British Journal of Cancer. 111, 7, s. 1421-1431 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Recurrent thyroid cancers have more peritumoural lymphatic vasculature than nonrecurrent thyroid cancers

Hakala, T., Sand, J., Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Huhtala, H., Leinonen, R. & Kholová, I., 2014, julkaisussa : European Journal of Clinical Investigation. 44, 9, s. 825-832 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Relevance of different prior knowledge sources for inferring gene interaction networks

Olsen, C., Bontempi, G., Emmert-Streib, F., Quackenbush, J. & Haibe-Kains, B., 2014, julkaisussa : Frontiers in Genetics. 5, JUN, Article 177.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Report from the 2nd Summer School in Computational Biology organized by the Queen's University of Belfast

Emmert-Streib, F., Zhang, S. D. & Hamilton, P., 2014, julkaisussa : Genomics Data. 2, s. 37-39 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Talin-bound NPLY motif recruits integrin-signaling adapters to regulate cell spreading and mechanosensing

Pinon, P., Pärssinen, J., Vazquez, P., Bachmann, M., Rahikainen, R., Jacquier, M. C., Azizi, L., Määttä, J. A., Bastmeyer, M., Hytönen, V. P. & Wehrle-Haller, B., 2014, julkaisussa : Journal of Cell Biology. 205, 2, s. 265-281 17 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

TgaA, a VirB1-like component belonging to a putative type IV secretion system of Bifidobacterium bifidum MIMBb75

Julkaisun otsikon käännös: : TgaA, a VirB1-Like Component Belonging to a Putative Type IV Secretion System of Bifidobacterium bifidum MIMBb75.
Guglielmetti, S., Balzaretti, S., Taverniti, V., Miriani, M., Milani, C., Scarafoni, A., Corona, S., Ciranna, A., Arioli, S., Santala, V., Iametti, S., Bonomi, F., Ventura, M., Mora, D. & Karp, M., 2014, julkaisussa : Applied and Environmental Microbiology. 80, 17, s. 5161-5169 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The gene regulatory network for breast cancer: Integrated regulatory landscape of cancer hallmarks

Emmert-Streib, F., Simoes, R. D. M., Mullan, P., Haibe-Kains, B. & Dehmer, M., 2014, julkaisussa : Frontiers in Genetics. 5, FEB, Article 15.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Untangling statistical and biological models to understand network inference: The need for a genomics network ontology

Emmert-Streib, F., Dehmer, M. & Haibe-Kains, B., 2014, julkaisussa : Frontiers in Genetics. 5, AUG, article 229.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Large-scale evaluation of molecular descriptors by means of clustering

Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Tripathi, S., 31 joulukuuta 2013, julkaisussa : PLoS ONE. 8, 12, e83956.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Analysis of free, mono- and diacetylated polyamines from human urine by LC-MS/MS

Häkkinen, M. R., Roine, A., Auriola, S., Tuokko, A., Veskimäe, E., Keinänen, T. A., Lehtimäki, T., Oksala, N. & Vepsäläinen, J., 15 joulukuuta 2013, julkaisussa : JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY B: ANALYTICAL TECHNOLOGIES IN THE BIOMEDICAL AND LIFE SCIENCES. 941, s. 81-89 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Netmes: Assessing gene network inference algorithms by network-based measures

Altay, G., Kurt, Z., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 7 joulukuuta 2013, julkaisussa : Evolutionary Bioinformatics. 10

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The structural motifs for substrate binding and dimerization of the α subunit of collagen prolyl 4-hydroxylase

Anantharajan, J., Koski, M. K., Kursula, P., Hieta, R., Bergmann, U., Myllyharju, J. & Wierenga, R. K., 3 joulukuuta 2013, julkaisussa : Structure. 21, 12, s. 2107-2118 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Association of neuroimmune guidance cue netrin-1 and its chemorepulsive receptor UNC5B with atherosclerotic plaque expression signatures and stability in human(s) Tampere Vascular Study (TVS)

Oksala, N., Pärssinen, J., Seppälä, I., Raitoharju, E., Ivana, K., Hernesniemi, J., Lyytikäinen, L. P., Levula, M., Mäkelä, K. M., Sioris, T., Kähönen, M., Laaksonen, R., Hytönen, V. & Lehtimäki, T., joulukuuta 2013, julkaisussa : Circulation: Cardiovascular Genetics. 6, 6, s. 579-587 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

MicroRNAs in the atherosclerotic plaque

Raitoharju, E., Oksala, N. & Lehtimäki, T., joulukuuta 2013, julkaisussa : Clinical Chemistry. 59, 12, s. 1708-1721 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The diverse role of miR-31 in regulating cancer associated phenotypes

Laurila, E. M. & Kallioniemi, A., joulukuuta 2013, julkaisussa : Genes Chromosomes and Cancer. 52, 12, s. 1103-1113 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Membrane permeation induced by aggregates of human islet amyloid polypeptides

Poojari, C., Xiao, D., Batista, V. S. & Strodel, B., 19 marraskuuta 2013, julkaisussa : Biophysical Journal. 105, 10, s. 2323-2332 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Chk1 targeting reactivates PP2A tumor suppressor activity in cancer cells

Khanna, A., Kauko, O., Böckelman, C., Laine, A., Schreck, I., Partanen, J. I., Szwajda, A., Bormann, S., Bilgen, T., Helenius, M., Pokharel, Y. R., Pimanda, J., Russel, M. R., Haglund, C., Cole, K. A., Klefström, J., Aittokallio, T., Weiss, C., Ristimäki, A., Visakorpi, T. & Westermarck, J., 15 marraskuuta 2013, julkaisussa : Cancer Research. 73, 22, s. 6757-6769 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Stability of transmembrane amyloid β-peptide and membrane integrity tested by molecular modeling of site-specific Aβ42 mutations

Poojari, C. & Strodel, B., 7 marraskuuta 2013, julkaisussa : PLoS ONE. 8, 11, e78399.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bi-weekly paclitaxel and capecitabine as a second- Or third-line treatment for advanced breast cancer: A pilot study

Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Tuunanen, T., Kautio, A. L., Lehtinen, I. & Tanner, M., marraskuuta 2013, julkaisussa : Anticancer Research. 33, 11, s. 4941-4945 5 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Zebavidin - An Avidin-Like Protein from Zebrafish

Taskinen, B., Zmurko, J., Ojanen, M., Kukkurainen, S., Parthiban, M., Määttä, J. A. E., Leppiniemi, J., Jänis, J., Parikka, M., Turpeinen, H., Rämet, M., Pesu, M., Johnson, M. S., Kulomaa, M. S., Airenne, T. T. & Hytönen, V. P., 24 lokakuuta 2013, julkaisussa : PLoS ONE. 8, 10, e77207.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Reversible biofunctionalization of surfaces with a switchable mutant of avidin

Pollheimer, P., Taskinen, B., Scherfler, A., Gusenkov, S., Creus, M., Wiesauer, P., Zauner, D., Schöfberger, W., Schwarzinger, C., Ebner, A., Tampé, R., Stutz, H., Hytönen, V. P. & Gruber, H. J., 16 lokakuuta 2013, julkaisussa : Bioconjugate Chemistry. 24, 10, s. 1656-1668 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Exogenously added BMP-6, BMP-7 and VEGF may not enhance the osteogenic differentiation of human adipose stem cells

Kyllönen, L., Haimi, S., Säkkinen, J., Kuokkanen, H., Mannerström, B., Sándor, G. K. B. & Miettinen, S., lokakuuta 2013, julkaisussa : GROWTH FACTORS. 31, 5, s. 141-153 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Fallout from the Chernobyl accident and overall cancer incidence in Finland

Kurttio, P., Seppä, K., Pasanen, K., Patama, T., Auvinen, A., Pukkala, E., Heinävaara, S., Arvela, H. & Hakulinen, T., lokakuuta 2013, julkaisussa : CANCER EPIDEMIOLOGY. 37, 5, s. 585-592 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Fine mapping of 11q13.5 identifies regions associated with prostate cancer and prostate cancer death

Nurminen, R., Lehtonen, R., Auvinen, A., Tammela, T. L. J., Wahlfors, T. & Schleutker, J., lokakuuta 2013, julkaisussa : EUROPEAN JOURNAL OF CANCER. 49, 15, s. 3335-3343 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Genome-wide association study identifies 3 genomic loci significantly associated with serum levels of homoarginine: The atheroremo consortium

Kleber, M. E., Seppälä, I., Pilz, S., Hoffmann, M. M., Tomaschitz, A., Oksala, N., Raitoharju, E., Lyytikäinen, L. P., Mäkelä, K. M., Laaksonen, R., Kähönen, M., Raitakari, O. T., Huang, J., Kienreich, K., Fahrleitner-Pammer, A., Drechsler, C., Krane, V., Boehm, B. O., Koenig, W., Wanner, C., Lehtimäki, T., März, W. & Meinitzer, A., lokakuuta 2013, julkaisussa : Circulation: Cardiovascular Genetics. 6, 5, s. 505-513 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

BMP4 inhibits the proliferation of breast cancer cells and induces an MMP-dependent migratory phenotype in MDA-MB-231 cells in 3D environment

Ampuja, M., Jokimäki, R., Juuti-Uusitalo, K., Rodriguez-Martinez, A., Alarmo, E. L. & Kallioniemi, A., 22 syyskuuta 2013, julkaisussa : BMC Cancer. 13, 429.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The nucleolus as a stress response organelle

Lindström, M. S. & Latonen, L., 1 syyskuuta 2013, Proteins of the Nucleolus: Regulation, Translocation, & Biomedical Functions. Springer Netherlands, Vuosikerta 9789400758186. s. 251-273 23 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Aneuploidy facilitates oncogenic transformation via specific genetic alterations, including Twist2 upregulation

Högnäs, G., Hämälistö, S., Rilla, K., Laine, J. O., Vilkki, V., Murumägi, A., Edgren, H., Kallioniemi, O. & Ivaska, J., syyskuuta 2013, julkaisussa : Carcinogenesis. 34, 9, s. 2000-2009 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Efficiency of 5-ALA mediated photodynamic therapy on hypoxic prostate cancer: A preclinical study on the dunning R3327-AT2 rat tumor model

Bozzini, G., Colin, P., Betrouni, N., Maurage, C. A., Leroy, X., Simonin, S., Martin-Schmitt, C., Villers, A. & Mordon, S., syyskuuta 2013, julkaisussa : PHOTODIAGNOSIS AND PHOTODYNAMIC THERAPY. 10, 3, s. 296-303 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Site-specific cancer risk in the Baltic cohort of Chernobyl cleanup workers, 1986-2007

Rahu, K., Hakulinen, T., Smailyte, G., Stengrevics, A., Auvinen, A., Inskip, P. D., Boice, J. D. & Rahu, M., syyskuuta 2013, julkaisussa : EUROPEAN JOURNAL OF CANCER. 49, 13, s. 2926-2933 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Somatic alterations contributing to metastasis of a castration-resistant prostate cancer

Nickerson, M. L., Im, K. M., Misner, K. J., Tan, W., Lou, H., Gold, B., Wells, D. W., Bravo, H. C., Fredrikson, K. M., Harkins, T. T., Milos, P., Zbar, B., Linehan, W. M., Yeager, M., Andresson, T., Dean, M. & Bova, G. S., syyskuuta 2013, julkaisussa : HUMAN MUTATION. 34, 9, s. 1231-1241 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Guggulsterone sensitizes glioblastoma cells to Sonic hedgehog inhibitor SANT-1 induced apoptosis in a Ras/NFκB dependent manner

Dixit, D., Ghildiyal, R., Anto, N. P., Ghosh, S., Sharma, V. & Sen, E., 19 elokuuta 2013, julkaisussa : Cancer Letters. 336, 2, s. 347-358 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Mechanisms of acceleration and retardation of water dynamics by ions

Stirnemann, G., Wernersson, E., Jungwirth, P. & Laage, D., 14 elokuuta 2013, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 135, 32, s. 11824-11831 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Identification, prioritization, and evaluation of glycoproteins for aggressive prostate cancer using quantitative glycoproteomics and antibody-based assays on tissue specimens

Chen, J., Xi, J., Tian, Y., Bova, G. S. & Zhang, H., elokuuta 2013, julkaisussa : Proteomics. 13, 15, s. 2268-2277 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Stress Proteins and Heat Shock Proteins: Role in Muscle Building and Sports Nutrition

Venojärvi, M., Oksala, N., Kinnunen, S. & Atalay, M., elokuuta 2013, Nutrition and Enhanced Sports Performance: Muscle Building, Endurance, and Strength. Elsevier Inc., s. 229-235 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Somatic mutation profiling and associations with prognosis and trastuzumab benefit in early breast cancer

Loi, S., Michiels, S., Lambrechts, D., Fumagalli, D., Claes, B., Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Bono, P., Kataja, V., Piccart, M. J., Joensuu, H. & Sotiriou, C., 3 heinäkuuta 2013, julkaisussa : JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE. 105, 13, s. 960-967 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Development and characterization of poly(ε-caprolactone) hollow fiber membranes for vascular tissue engineering

Diban, N., Haimi, S., Bolhuis-Versteeg, L., Teixeira, S., Miettinen, S., Poot, A., Grijpma, D. & Stamatialis, D., 1 heinäkuuta 2013, julkaisussa : Journal of Membrane Science. 438, s. 29-37 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Genetic markers associated with early cancer-specific mortality following prostatectomy

Liu, W., Xie, C. C., Thomas, C. Y., Kim, S. T., Lindberg, J., Egevad, L., Wang, Z., Zhang, Z., Sun, J., Sun, J., Koty, P. P., Kader, A. K., Cramer, S. D., Bova, G. S., Zheng, S. L., Grönberg, H., Isaacs, W. B. & Xu, J., 1 heinäkuuta 2013, julkaisussa : Cancer. 119, 13, s. 2405-2412 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Elevated concentration of oxidized LDL together with poor cardiorespiratory and abdominal muscle fitness predicts metabolic syndrome in young men

Kosola, J., Vaara, J. P., Ahotupa, M., Kyröläinen, H., Santtila, M., Oksala, N., Atalay, M. & Vasankari, T., heinäkuuta 2013, julkaisussa : METABOLISM: CLINICAL AND EXPERIMENTAL. 62, 7, s. 992-999 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The highly dynamic oligomeric structure of bradavidin II is unique among avidin proteins

Leppiniemi, J., Meir, A., Kahkonen, N., Kukkurainen, S., Maatta, J. A., Ojanen, M., Janis, J., Kulomaa, M. S., Livnah, O. & Hytonen, V. P., heinäkuuta 2013, julkaisussa : PROTEIN SCIENCE. 22, 7, s. 980-994 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Non-coding RNAs in DNA damage and repair

Sharma, V. & Misteli, T., 27 kesäkuuta 2013, julkaisussa : FEBS Letters. 587, 13, s. 1832-1839 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Healthy human CSF promotes glial differentiation of hESC-derived neural cells while retaining spontaneous activity in existing neuronal networks

Kiiski, H., Äänismaa, R., Tenhunen, J., Hagman, S., Ylä-Outinen, L., Aho, A., Yli-Hankala, A., Bendel, S., Skottman, H. & Narkilahti, S., 15 kesäkuuta 2013, julkaisussa : Biology Open. 2, 6, s. 605-612 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Movement of NH3 through the human urea transporter B: A new gas channel

Ryan Geyer, R., Musa-Aziz, R., Enkavi, G., Mahinthichaichan, P., Tajkhorshid, E. & Boron, W. F., 15 kesäkuuta 2013, julkaisussa : AMERICAN JOURNAL OF PHYSIOLOGY-RENAL PHYSIOLOGY. 304, 12, s. 1447-1457 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Endovenous laser treatment of the great saphenous vein: Measurement of the pullback speed of the fiber by magnetic tracking

Mordon, S. R., Vuylsteke, M. E., Mahieu, P. & Betrouni, N., kesäkuuta 2013, julkaisussa : IRBM. 34, 3, s. 252-256 5 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Weekly paclitaxel-An effective treatment for advanced breast cancer

Kellokumpu-Lehtinen, P., Tuunanen, T., Asola, R., Elomaa, L., Heikkinen, M., Kokko, R., Järvenpää, R., Lehtinen, I., Maiche, A., Kaleva-Kerola, J., Huusko, M., Möykkynen, K. & Ala-Luhtala, T., kesäkuuta 2013, julkaisussa : Anticancer Research. 33, 6, s. 2623-2628 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Prostate cancer mortality in the finnish randomized screening trial

Kilpeläinen, T. P., Tammela, T. L., Malila, N., Hakama, M., Santti, H., Määttänen, L., Stenman, U. H., Kujala, P. & Auvinen, A., 15 toukokuuta 2013, julkaisussa : JOURNAL OF THE NATIONAL CANCER INSTITUTE. 105, 10, s. 719-725 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Interfacing cellular networks of S. cerevisiae and E. coli: Connecting dynamic and genetic information

Matos Simoes, R. D., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 11 toukokuuta 2013, julkaisussa : BMC Genomics. 14, 1, 324.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Overview of Public Cancer Databases, Resources, and Visualization Tools

Emmert-Streib, F., De Matos Simoes, R., Tripathi, S. & Dehmer, M., 8 huhtikuuta 2013, Statistical Diagnostics for Cancer: Analyzing High-Dimensional Data. Wiley-VCH, Vuosikerta 3. s. 27-40 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Statistical Diagnostics for Cancer: Analyzing High-Dimensional Data

Emmert-Streib, F. (toim.) & Dehmer, M. (toim.), 8 huhtikuuta 2013, Wiley-VCH. 292 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Ensuring the statistical soundness of competitive gene set approaches: Gene filtering and genome-scale coverage are essential

Tripathi, S., Glazko, G. V. & Emmert-Streib, F., huhtikuuta 2013, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 41, 7

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Genetic heterogeneity in Finnish hereditary prostate cancer using ordered subset analysis

Simpson, C. L., Cropp, C. D., Wahlfors, T., George, A., Jones, M. S., Harper, U., Ponciano-Jackson, D., Tammela, T., Schleutker, J. & Bailey-Wilson, J. E., huhtikuuta 2013, julkaisussa : EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS. 21, 4, s. 437-443 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Identification of 23 new prostate cancer susceptibility loci using the iCOGS custom genotyping array

Eeles, R. A., Olama, A. A. A., Benlloch, S., Saunders, E. J., Leongamornlert, D. A., Tymrakiewicz, M., Ghoussaini, M., Luccarini, C., Dennis, J., Jugurnauth-Little, S., Dadaev, T., Neal, D. E., Hamdy, F. C., Donovan, J. L., Muir, K., Giles, G. G., Severi, G., Wiklund, F., Gronberg, H., Haiman, C. A., Schumacher, F., Henderson, B. E., Le Marchand, L., Lindstrom, S., Kraft, P., Hunter, D. J., Gapstur, S., Chanock, S. J., Berndt, S. I., Albanes, D., Andriole, G., Schleutker, J., Weischer, M., Canzian, F., Riboli, E., Key, T. J., Travis, R. C., Campa, D., Ingles, S. A., John, E. M., Hayes, R. B., Pharoah, P. D. P., Pashayan, N., Khaw, K. T., Stanford, J. L., Ostrander, E. A., Signorello, L. B., Thibodeau, S. N., Schaid, D., Maier, C., Vogel, W., Kibel, A. S., Cybulski, C., Lubinski, J., Cannon-Albright, L., Brenner, H., Park, J. Y., Kaneva, R., Batra, J., Spurdle, A. B., Clements, J. A., Teixeira, M. R., Dicks, E., Lee, A., Dunning, A. M., Baynes, C., Conroy, D., Maranian, M. J., Ahmed, S., Govindasami, K., Guy, M., Wilkinson, R. A., Sawyer, E. J., Morgan, A., Dearnaley, D. P., Horwich, A., Huddart, R. A., Khoo, V. S., Parker, C. C., Van As, N. J., Woodhouse, C. J., Thompson, A., Dudderidge, T., Ogden, C., Cooper, C. S., Lophatananon, A., Cox, A., Southey, M. C., Hopper, J. L., English, D. R., Aly, M., Adolfsson, J., Xu, J., Zheng, S. L., Yeager, M., Kaaks, R., Diver, W. R., Gaudet, M. M., Stern, M. C., Corral, R., Joshi, A. D., Shahabi, A., Wahlfors, T., Tammela, T. L. J., Auvinen, A., Virtamo, J., Klarskov, P., Nordestgaard, B. G., Røder, M. A., Nielsen, S. F., Bojesen, S. E., Siddiq, A., Fitzgerald, L. M., Kolb, S., Kwon, E. M., Karyadi, D. M., Blot, W. J., Zheng, W., Cai, Q., McDonnell, S. K., Rinckleb, A. E., Drake, B., Colditz, G., Wokolorczyk, D., Stephenson, R. A., Teerlink, C., Muller, H., Rothenbacher, D., Sellers, T. A., Lin, H. Y., Slavov, C., Mitev, V., Lose, F., Srinivasan, S., Maia, S., Paulo, P., Lange, E., Cooney, K. A., Antoniou, A. C., Vincent, D., Bacot, F., Tessier, D. C., Kote-Jarai, Z. & Easton, D. F., huhtikuuta 2013, julkaisussa : Nature Genetics. 45, 4, s. 385-391 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Obesity and physical inactivity are related to impaired physical health of breast cancer survivors

Elme, A., Utriainen, M., Kellokumpu-Lehtinen, P., Palva, T., Luoto, R., Nikander, R., Huovinen, R., Kautiainen, H., Järvenpää, S., Penttinen, H. M., Vehmanen, L., Jääskeläinen, A. S., Ruohola, J., Blomqvist, C. & Saarto, T., huhtikuuta 2013, julkaisussa : Anticancer Research. 33, 4, s. 1595-1602 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Resonance assignments of the 56 kDa chimeric avidin in the biotin-bound and free forms

Tossavainen, H., Helppolainen, S. H., Määttä, J. A. E., Pihlajamaa, T., Hytönen, V. P., Kulomaa, M. S. & Permi, P., huhtikuuta 2013, julkaisussa : BIOMOLECULAR NMR ASSIGNMENTS. 7, 1, s. 35-38 4 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Fatty Acid Ethyl Esters Induce Intestinal Epithelial Barrier Dysfunction via a Reactive Oxygen Species-Dependent Mechanism in a Three-Dimensional Cell Culture Model

Elamin, E., Masclee, A., Juuti-Uusitalo, K., van IJzendoorn, S., Troost, F., Pieters, H. J., Dekker, J. & Jonkers, D., 19 maaliskuuta 2013, julkaisussa : PLoS ONE. 8, 3, e58561.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Bcl-2 associated athanogene 5 (Bag5) is overexpressed in prostate cancer and inhibits ER-stress induced apoptosis

Bruchmann, A., Roller, C., Walther, T. V., Schäfer, G., Lehmusvaara, S., Visakorpi, T., Klocker, H., Cato, A. C. B. & Maddalo, D., 1 maaliskuuta 2013, julkaisussa : BMC Cancer. 13, 96.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Use of aspirin, but not other non-steroidal anti-inflammatory drugs is associated with decreased prostate cancer risk at the population level

Veitonmäki, T., Tammela, T. L. J., Auvinen, A. & Murtola, T. J., maaliskuuta 2013, julkaisussa : EUROPEAN JOURNAL OF CANCER. 49, 4, s. 938-945 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Structural Properties and Complexity of a New Network Class: Collatz Step Graphs

Emmert-Streib, F., 19 helmikuuta 2013, julkaisussa : PLoS ONE. 8, 2, e56461.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

An anatomically realistic and adaptable prostate phantom for laser thermotherapy treatment planning

Betrouni, N., Nevoux, P., Leroux, B., Colin, P., Puech, P. & Mordon, S., helmikuuta 2013, julkaisussa : Medical Physics. 40, 2, 022701.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

How the amyloid-β peptide and membranes affect each other: An extensive simulation study

Poojari, C., Kukol, A. & Strodel, B., helmikuuta 2013, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1828, 2, s. 327-339 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Image-guided laser therapies for prostate cancer

Betrouni, N., Colin, P., Bozzini, G. & Mordon, S., helmikuuta 2013, julkaisussa : IRBM. 34, 1, s. 28-32 5 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Visualizing functional motions of membrane transporters with molecular dynamics simulations

Shaikh, S. A., Li, J., Enkavi, G., Wen, P. C., Huang, Z. & Tajkhorshid, E., 29 tammikuuta 2013, julkaisussa : Biochemistry. 52, 4, s. 569-587 19 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Gene ontology annotations and resources

Blake, J. A., Dolan, M., Drabkin, H., Hill, D. P., Ni, L., Sitnikov, D., Bridges, S., Burgess, S., Buza, T., McCarthy, F., Peddinti, D., Pillai, L., Carbon, S., Dietze, H., Ireland, A., Lewis, S. E., Mungall, C. J., Gaudet, P., Chisholm, R. L., Fey, P., Kibbe, W. A., Basu, S., Siegele, D. A., McIntosh, B. K., Renfro, D. P., Zweifel, A. E., Hu, J. C., Brown, N. H., Tweedie, S., Alam-Faruque, Y., Apweiler, R., Auchinchloss, A., Axelsen, K., Bely, B., Blatter, M. C., Bonilla, C., Bougueleret, L., Boutet, E., Breuza, L., Bridge, A., Chan, W. M., Chavali, G., Coudert, E., Dimmer, E., Estreicher, A., Famiglietti, L., Feuermann, M., Gos, A., Gruaz-Gumowski, N., Hieta, R., Hinz, U., Hulo, C., Huntley, R., James, J., Jungo, F., Keller, G., Laiho, K., Legge, D., Lemercier, P., Lieberherr, D., Magrane, M., Martin, M. J., Masson, P., Mutowo-Muellenet, P., O'Donovan, C., Pedruzzi, I., Pichler, K., Poggioli, D., Porras Millan, P., Poux, S., Rivoire, C., Roechert, B., Sawford, T., Schneider, M., Stutz, A., Sundaram, S., Tognolli, M., Xenarios, I., Foulger, R., Lomax, J., Roncaglia, P., Khodiyar, V. K., Lovering, R. C., Talmud, P. J., Chibucos, M., Gwinn Giglio, M., Chang, H. Y., Hunter, S., McAnulla, C., Mitchell, A., Sangrador, A., Stephan, R., Harris, M. A., Oliver, S. G., Rutherford, K., Wood, V., Bahler, J., Lock, A., Kersey, P. J., McDowall, M. D., Staines, D. M., Dwinell, M., Shimoyama, M., Laulederkind, S., Hayman, T., Wang, S. J., Petri, V., Lowry, T., D'Eustachio, P., Matthews, L., Balakrishnan, R., Binkley, G., Cherry, J. M., Costanzo, M. C., Dwight, S. S., Engel, S. R., Fisk, D. G., Hitz, B. C., Hong, E. L., Karra, K., Miyasato, S. R., Nash, R. S., Park, J., Skrzypek, M. S., Weng, S., Wong, E. D., Berardini, T. Z., Li, D., Huala, E., Mi, H., Thomas, P. D., Chan, J., Kishore, R., Sternberg, P., Van Auken, K., Howe, D. & Westerfield, M., 1 tammikuuta 2013, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 41, D1

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Update on activities at the Universal Protein Resource (UniProt) in 2013

Apweiler, R., Martin, M. J., O'Donovan, C., Magrane, M., Alam-Faruque, Y., Alpi, E., Antunes, R., Arganiska, J., Casanova, E. B., Bely, B., Bingley, M., Bonilla, C., Britto, R., Bursteinas, B., Chan, W. M., Chavali, G., Cibrian-Uhalte, E., Da Silva, A., De Giorgi, M., Dimmer, E., Fazzini, F., Gane, P., Fedotov, A., Castro, L. G., Garmiri, P., Hatton-Ellis, E., Hieta, R., Huntley, R., Jacobsen, J., Jones, R., Legge, D., Liu, W., Luo, J., MacDougall, A., Mutowo, P., Nightingale, A., Orchard, S., Patient, S., Pichler, K., Poggioli, D., Pundir, S., Pureza, L., Qi, G., Rosanoff, S., Sawford, T., Sehra, H., Turner, E., Volynkin, V., Wardell, T., Watkins, X., Zellner, H., Corbett, M., Donnelly, M., Van Rensburg, P., Goujon, M., McWilliam, H., Lopez, R., Xenarios, I., Bougueleret, L., Bridge, A., Poux, S., Redaschi, N., Auchincloss, A., Axelsen, K., Bansal, P., Baratin, D., Binz, P. A., Blatter, M. C., Boeckmann, B., Bolleman, J., Boutet, E., Breuza, L., De Castro, E., Cerutti, L., Coudert, E., Cuche, B., Doche, M., Dornevil, D., Duvaud, S., Estreicher, A., Famiglietti, L., Feuermann, M., Gasteiger, E., Gehant, S., Gerritsen, V., Gos, A., Gruaz-Gumowski, N., Hinz, U., Hulo, C., James, J., Jungo, F., Keller, G., Lara, V., Lemercier, P., Lew, J., Lieberherr, D., Martin, X., Masson, P., Morgat, A., Neto, T., Paesano, S., Pedruzzi, I., Pilbout, S., Pozzato, M., Pruess, M., Rivoire, C., Roechert, B., Schneider, M., Sigrist, C., Sonesson, K., Staehli, S., Stutz, A., Sundaram, S., Tognolli, M., Verbregue, L., Veuthey, A. L., Zerara, M., Wu, C. H., Arighi, C. N., Arminski, L., Chen, C., Chen, Y., Huang, H., Kukreja, A., Laiho, K., McGarvey, P., Natale, D. A., Natarajan, T. G., Roberts, N. V., Suzek, B. E., Vinayaka, C. R., Wang, Q., Wang, Y., Yeh, L. S., Yerramalla, M. S. & Zhang, J., 1 tammikuuta 2013, julkaisussa : Nucleic Acids Research. 41, D1

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

A meta-analysis of genome-wide association studies to identify prostate cancer susceptibility loci associated with aggressive and non-aggressive disease

Al Olama, A. A., Kote-Jarai, Z., Schumacher, F. R., Wiklund, F., Berndt, S. I., Benlloch, S., Giles, G. G., Severi, G., Neal, D. E., Hamdy, F. C., Donovan, J. L., Hunter, D. J., Henderson, B. E., Thun, M. J., Gaziano, M., Giovannucci, E. L., Siddiq, A., Travis, R. C., Cox, D. G., Canzian, F., Riboli, E., Key, T. J., Andriole, G., Albanes, D., Hayes, R. B., Schleutker, J., Auvinen, A., Tammela, T. L. J., Weischer, M., Stanford, J. L., Ostrander, E. A., Cybulski, C., Lubinski, J., Thibodeau, S. N., Schaid, D. J., Sorensen, K. D., Batra, J., Clements, J. A., Chambers, S., Aitken, J., Gardiner, R. A., Maier, C., Vogel, W., Dörk, T., Brenner, H., Habuchi, T., Ingles, S., John, E. M., Dickinson, J. L., Cannon-Albright, L., Teixeira, M. R., Kaneva, R., Zhang, H. W., Lu, Y. J., Park, J. Y., Cooney, K. A., Muir, K. R., Leongamornlert, D. A., Saunders, E., Tymrakiewicz, M., Mahmud, N., Guy, M., Govindasami, K., O'Brien, L. T., Wilkinson, R. A., Hall, A. L., Sawyer, E. J., Dadaev, T., Morrison, J., Dearnaley, D. P., Horwich, A., Huddart, R. A., Khoo, V. S., Parker, C. C., Van As, N., Woodhouse, C. J., Thompson, A., Dudderidge, T., Ogden, C., Cooper, C. S., Lophatonanon, A., Southey, M. C., Hopper, J. L., English, D., Virtamo, J., Marchand, L. L., Campa, D., Kaaks, R., Lindstrom, S., Diver, W. R., Gapstur, S., Yeager, M., Cox, A., Stern, M. C., Corral, R., Aly, M., Isaacs, W., Adolfsson, J., Xu, J., Zheng, S. L., Wahlfors, T., Taari, K., Kujala, P., Klarskov, P., Nordestgaard, B. G., Røder, M. A., Frikke-Schmidt, R., Bojesen, S. E., FitzGerald, L. M., Kolb, S., Kwon, E. M., Karyadi, D. M., Orntoft, T. F., Borre, M., Rinckleb, A., Luedeke, M., Herkommer, K., Meyer, A., Serth, J. R., Marthick, J. R., Patterson, B., Wokolorczyk, D., Spurdle, A., Lose, F., McDonnell, S. K., Joshi, A. D., Shahabi, A., Pinto, P., Santos, J., Ray, A., Sellers, T. A., Lin, H. Y., Stephenson, R. A., Teerlink, C., Muller, H., Rothenbacher, D., Tsuchiya, N., Narita, S., Cao, G. W., Slavov, C., Mitev, V., Chanock, S., Gronberg, H., Haiman, C. A., Kraft, P., Easton, D. F. & Eeles, R. A., tammikuuta 2013, julkaisussa : HUMAN MOLECULAR GENETICS. 22, 2, s. 408-415 8 Sivumäärä, dds425.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

HOXB13 is a susceptibility gene for prostate cancer: Results from the International Consortium for Prostate Cancer Genetics (ICPCG)

Xu, J., Lange, E. M., Lu, L., Zheng, S. L., Wang, Z., Thibodeau, S. N., Cannon-Albright, L. A., Teerlink, C. C., Camp, N. J., Johnson, A. M., Zuhlke, K. A., Stanford, J. L., Ostrander, E. A., Wiley, K. E., Isaacs, S. D., Walsh, P. C., Maier, C., Luedeke, M., Vogel, W., Schleutker, J., Wahlfors, T., Tammela, T., Schaid, D., McDonnell, S. K., Derycke, M. S., Cancel-Tassin, G., Cussenot, O., Wiklund, F., Grönberg, H., Eeles, R., Easton, D., Kote-Jarai, Z., Whittemore, A. S., Hsieh, C. L., Giles, G. G., Hopper, J. L., Severi, G., Catalona, W. J., Mandal, D., Ledet, E., Foulkes, W. D., Hamel, N., Mahle, L., Moller, P., Powell, I., Bailey-Wilson, J. E., Carpten, J. D., Seminara, D., Cooney, K. A. & Isaacs, W. B., tammikuuta 2013, julkaisussa : HUMAN GENETICS. 132, 1, s. 5-14 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Silencing of the arp2/3 complex disturbs pancreatic cancer cell migration

Rauhala, H. E., Teppo, S., Niemelä, S. & Kallioniemi, A., tammikuuta 2013, julkaisussa : Anticancer Research. 33, 1, s. 45-52 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

2D and 3D self-assembling nanofiber hydrogels for cardiomyocyte culture

Ikonen, L., Kerkelä, E., Metselaar, G., Stuart, M. C. A., De Jong, M. R. & Aalto-Setälä, K., 2013, julkaisussa : BioMed Research International. 2013, 285678.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

B-cell lymphoma gene regulatory networks: Biological consistency among inference methods

Simoes, R. D. M., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 2013, julkaisussa : Frontiers in Genetics. 4, DEC, 00281.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

CIP2A expression and prognostic role in patients with esophageal adenocarcinoma

Rantanen, T., Kauttu, T., Åkerla, J., Honkanen, T., Krogerus, L., Salo, J., Paavonen, T. & Oksala, N., 2013, julkaisussa : MEDICAL ONCOLOGY. 30, 3, 684.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Comparative analysis of targeted differentiation of human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) and human embryonic stem cells reveals variability associated with incomplete transgene silencing in retrovirally derived hiPSCs lines

Toivonen, S., Ojala, M., Hyysalo, A., Ilmarinen, T., Rajala, K., Pekkanen-Mattila, M., Äänismaa, R., Lundin, K., Palgi, J., Weltner, J., Trokovic, R., Silvennoinen, O., Skottman, H., Narkilahti, S., Aalto-Setälä, K. & Otonkoski, T., 2013, julkaisussa : Stem Cells Translational Medicine. 2, 2, s. 83-93 11 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

DBComposer: An R package for integrative analysis and management of gene expression microarray data

Kong, L., Aho, K. L., Granberg, K., Roos, C. & Autio, R., 2013, 2013 IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics, GENSIPS 2013 - Proceedings. s. 92-93 2 Sivumäärä 6735944

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Development of fully defined xeno-free culture system for the preparation and propagation of cell therapy-compliant human adipose stem cells

Patrikoski, M., Juntunen, M., Boucher, S., Campbell, A., Vemuri, M. C., Mannerström, B. & Miettinen, S., 2013, julkaisussa : STEM CELL RESEARCH & THERAPY. 4, 2, 27.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effects of different serum conditions on osteogenic differentiation of human adipose stem cells in vitro

Kyllönen, L., Haimi, S., Mannerström, B., Huhtala, H., Rajala, K. M., Skottman, H., Sándor, G. K. & Miettinen, S., 2013, julkaisussa : STEM CELL RESEARCH & THERAPY. 4, 1, 17.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Epithelium percentage estimation facilitates epithelial quantitative protein measurement in tissue specimens

Chen, J., Eshghi, S. T., Bova, G. S., Li, Q. K., Li, X. & Zhang, H., 2013, julkaisussa : CLINICAL PROTEOMICS. 10, 1, 18.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Genetic and QTL analyses of yield and a set of physiological traits in pepper

Alimi, N. A., Bink, M. C. A. M., Dieleman, J. A., Nicolaï, M., Wubs, M., Heuvelink, E., Magan, J., Voorrips, R. E., Jansen, J., Rodrigues, P. C., van der Heijden, G. W. A. M., Vercauteren, A., Vuylsteke, M., Song, Y., Glasbey, C., Barocsi, A., Lefebvre, V., Palloix, A. & van Eeuwijk, F. A., 2013, julkaisussa : EUPHYTICA. 190, 2, s. 181-201 21 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Hollow fibers of poly(lactide-co-glycolide) and poly(ε-caprolactone) blends for vascular tissue engineering applications

Diban, N., Haimi, S., Bolhuis-Versteeg, L., Teixeira, S., Miettinen, S., Poot, A., Grijpma, D. & Stamatialis, D., 2013, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 9, 5, s. 6450-6458 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Influence of the experimental design of gene expression studies on the inference of gene regulatory networks: Environmental factors

Emmert-Streib, F., 2013, julkaisussa : PeerJ. 2013, 1, e10.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Molecular mechanism of T-cell protein tyrosine phosphatase (TCPTP) activation by mitoxantrone

Ylilauri, M., Mattila, E., Nurminen, E. M., Käpylä, J., Niinivehmas, S. P., Määttä, J. A., Pentikäinen, U., Ivaska, J. & Pentikäinen, O. T., 2013, julkaisussa : Biochimica et biophysica acta: proteins and proteomics. 1834, 10, s. 1988-1997 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Molecular modeling of the PEGylated bilayer as a model for the PEGylated liposome surface in the bloodstream

Magarkar, A., Stepniewski, M., Karakas, E., Rog, T., Yliperttula, M., Urtti, A. & Bunker, A., 2013, Technical Proceedings of the 2013 NSTI Nanotechnology Conference and Expo, NSTI-Nanotech 2013. Vuosikerta 2. s. 576-578 3 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Multiple approaches and participation rate for a community based smoking cessation intervention trial in rural Kerala, India

Jayakrishnan, R., Mathew, A., Uutela, A., Auvinen, A. & Sebastian, P., 2013, julkaisussa : ASIAN PACIFIC JOURNAL OF CANCER PREVENTION. 14, 5, s. 2891-2896 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Optimal molecular profiling of tissue and tissue components: De fining the best processing and microdissection methods for biomedical applications

Rodriguez-Canales, J., Hanson, J. C., Hipp, J. D., Balis, U. J., Tangrea, M. A., Emmert-Buck, M. R. & Bova, G. S., 2013, Pancreatic Cancer: Methods and Protocols. HUMANA PRESS INC, Vuosikerta 980. s. 61-120 60 Sivumäärä (Methods in Molecular Biology; painos 980).

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Personalized medicine: Has it started yet? A reconstruction of the early history

Emmert-Streib, F., 2013, julkaisussa : Frontiers in Genetics. 3, JAN, Article 313.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Person identification from actions based on Artificial Neural Networks

Iosifidis, A., Tefas, A. & Pitas, I., 2013, IEEE Workshop on Computational Intelligence in Biometrics and Identity Management, CIBIM. s. 7-13 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Person identification from actions based on dynemes and discriminant learning

Iosifidis, A., Tefas, A. & Pitas, I., 2013, 2013 International Workshop on Biometrics and Forensics, IWBF 2013.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Roll-to-roll atomic layer deposition for flexible substrates

Lahtinen, K., Maydannik, P., Kääriäinen, T., Seppänen, T., Cameron, D. C., Johansson, P., Kraft, M. & Kuusipalo, J., 2013, TAPPI International Conference on Nanotechnology 2013. TAPPI Press, s. 726-739 14 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Smoking cessation intervention in Rural Kerala, India: Findings of a randomised controlled trial

Jayakrishnan, R., Uutela, A., Mathew, A., Auvinen, A., Mathew, P. S. & Sebastian, P., 2013, julkaisussa : ASIAN PACIFIC JOURNAL OF CANCER PREVENTION. 14, 11, s. 6797-6802 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Undercut edges for robust capillary self-alignment in hybrid microassembly

Liimatainen, V., Sariola, V. & Zhou, Q., 2013, 8th Annual IEEE International Conference on Nano/Micro Engineered and Molecular Systems, IEEE NEMS 2013. s. 1088-1091 4 Sivumäärä 6559911

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Wear resistance of nanoparticle coatings on paperboard

Stepien, M., Chinga-Carrasco, G., Saarinen, J. J., Teisala, H., Tuominen, M., Aromaa, M., Haapanen, J., Kuusipalo, J., Mäkelä, J. M. & Toivakka, M., 2013, TAPPI International Conference on Nanotechnology 2013. TAPPI Press, s. 821-829 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Standardization of Diagnostic Biomarker Concentrations in Urine: The Hematuria Caveat

Reid, C. N., Stevenson, M., Abogunrin, F., Ruddock, M. W., Emmert-Streib, F., Lamont, J. V. & Williamson, K. E., 31 joulukuuta 2012, julkaisussa : PLoS ONE. 7, 12, e53354.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Aerobic Fitness Does Not Modify the Effect of FTO Variation on Body Composition Traits

Huuskonen, A., Lappalainen, J., Oksala, N., Santtila, M., Häkkinen, K., Kyröläinen, H. & Atalay, M., 17 joulukuuta 2012, julkaisussa : PLoS ONE. 7, 12, e51635.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cancer incidence among Nordic airline cabin crew

Pukkala, E., Helminen, M., Haldorsen, T., Hammar, N., Kojo, K., Linnersjö, A., Rafnsson, V., Tulinius, H., Tveten, U. & Auvinen, A., 15 joulukuuta 2012, julkaisussa : International Journal of Cancer. 131, 12, s. 2886-2897 12 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Harnessing the complexity of gene expression data from cancer: From single gene to structural pathway methods

Emmert-Streib, F., Tripathi, S. & Matos Simoes, R. D., 10 joulukuuta 2012, julkaisussa : Biology Direct. 7, 44.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Gene set analysis for self-contained tests: Complex null and specific alternative hypotheses

Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., joulukuuta 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 23, s. 3073-3080 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Characteristics of complex formation between monomeric and dimeric bisbenzimidazoles and AT-containing polynucleotide

Lisitsyna, E. S., Durandin, N. A., Ivanov, A. A., Streltsov, S. A., Susova, O. Y., Shtil, A. A., Zhuze, A. L. & Kuzmin, V. A., marraskuuta 2012, julkaisussa : MOLECULAR BIOLOGY. 46, 6, s. 823-827 5 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Culture Conditions Affect Cardiac Differentiation Potential of Human Pluripotent Stem Cells

Ojala, M., Rajala, K., Pekkanen-Mattila, M., Miettinen, M., Huhtala, H. & Aalto-Setälä, K., 31 lokakuuta 2012, julkaisussa : PLoS ONE. 7, 10, e48659.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

GFP's Mechanical Intermediate States

Saeger, J., Hytönen, V. P., Klotzsch, E. & Vogel, V., 31 lokakuuta 2012, julkaisussa : PLoS ONE. 7, 10, e46962.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Biophysics of lipid bilayers containing oxidatively modified phospholipids: Insights from fluorescence and EPR experiments and from MD simulations

Jurkiewicz, P., Olzyńska, A., Cwiklik, L., Conte, E., Jungwirth, P., Megli, F. M. & Hof, M., lokakuuta 2012, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1818, 10, s. 2388-2402 15 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Number of screens for overdetection as an indicator of absolute risk of overdiagnosis in prostate cancer screening

Wu, G. H. M., Auvinen, A., Määttänen, L., Tammela, T. L. J., Stenman, U. H., Hakama, M., Yen, A. M. F. & Chen, H. H., 15 syyskuuta 2012, julkaisussa : International Journal of Cancer. 131, 6, s. 1367-1375 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Sarcopenia during androgen-deprivation therapy for prostate cancer

Smith, M. R., Saad, F., Egerdie, B., Sieber, P. R., Tammela, T. L. J., Ke, C., Leder, B. Z. & Goessl, C., 10 syyskuuta 2012, julkaisussa : Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology. 30, 26, s. 3271-3276 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Loss of SUFU function in familial multiple meningioma

Aavikko, M., Li, S. P., Saarinen, S., Alhopuro, P., Kaasinen, E., Morgunova, E., Li, Y., Vesanen, K., Smith, M. J., Evans, D. G. R., Pöyhönen, M., Kiuru, A., Auvinen, A., Aaltonen, L. A., Taipale, J. & Vahteristo, P., 7 syyskuuta 2012, julkaisussa : AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS. 91, 3, s. 520-526 7 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Endocrine prevention and treatment of prostate cancer

Tammela, T. L. J., 5 syyskuuta 2012, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 360, 1-2, s. 59-67 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cell Model of Catecholaminergic Polymorphic Ventricular Tachycardia Reveals Early and Delayed Afterdepolarizations

Kujala, K., Paavola, J., Lahti, A., Larsson, K., Pekkanen-Mattila, M., Viitasalo, M., Lahtinen, A. M., Toivonen, L., Kontula, K., Swan, H., Laine, M., Silvennoinen, O. & Aalto-Setälä, K., 4 syyskuuta 2012, julkaisussa : PLoS ONE. 7, 9, e44660.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effectiveness of a 12-month exercise program on physical performance and quality of life of breast cancer survivors

Saarto, T., Penttinen, H. M., Sievänen, H., Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Hakamies-Blomqvist, L., Nikander, R., Huovinen, R., Luoto, R., Kautiainen, H., Järvenpää, S., Idman, I., Utriainen, M., Vehmanen, L., Jääskeläinen, A. S., Elme, A., Ruohola, J., Palva, T., Vertio, H., Rautalahti, M., Fogelholm, M., Blomqvist, C. & Luoma, M. L., syyskuuta 2012, julkaisussa : Anticancer Research. 32, 9, s. 3875-3884 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Effect of exercise on bone structural traits, physical performance and body composition in breast cancer patients - A 12-month RCT

Nikander, R., Sievänen, H., Ojala, K., Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Palva, T., Blomqvist, C., Luoto, R. & Saarto, T., syyskuuta 2012, julkaisussa : Journal of Musculoskeletal and Neuronal Interactions. 12, 3, s. 127-135 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Photodynamic therapy in urology: What can we do now and where are we heading?

Bozzini, G., Colin, P., Betrouni, N., Nevoux, P., Ouzzane, A., Puech, P., Villers, A. & Mordon, S., syyskuuta 2012, julkaisussa : PHOTODIAGNOSIS AND PHOTODYNAMIC THERAPY. 9, 3, s. 261-273 13 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Responder analysis of the effects of denosumab on bone mineral density in men receiving androgen deprivation therapy for prostate cancer

Egerdie, R. B., Saad, F., Smith, M. R., Tammela, T. L. J., Heracek, J., Sieber, P., Ke, C., Leder, B., Dansey, R. & Goessl, C., syyskuuta 2012, julkaisussa : PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES. 15, 3, s. 308-312 5 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Toxicity in patients receiving adjuvant docetaxel hormonal treatment after radical radiotherapy for intermediate or high-risk prostate cancer: A preplanned safety report of the SPCG-13 trial

Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Hjälm-Eriksson, M., Thellenberg-Karlsson, C., Åström, L., Franzen, L., Marttila, T., Seke, M., Taalikka, M. & Ginman, C., syyskuuta 2012, julkaisussa : PROSTATE CANCER AND PROSTATIC DISEASES. 15, 3, s. 303-307 5 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Identification of novel CHD1-associated collaborative alterations of genomic structure and functional assessment of CHD1 in prostate cancer

Liu, W., Lindberg, J., Sui, G., Luo, J., Egevad, L., Li, T., Xie, C., Wan, M., Kim, S. T., Wang, Z., Turner, A. R., Zhang, Z., Feng, J., Yan, Y., Sun, J., Bova, G. S., Ewing, C. M., Yan, G., Gielzak, M., Cramer, S. D., Vessella, R. L., Zheng, S. L., Grönberg, H., Isaacs, W. B. & Xu, J., 30 elokuuta 2012, julkaisussa : Oncogene. 31, 35, s. 3939-3948 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Cytokinesis failure due to derailed integrin traffic induces aneuploidy and oncogenic transformation in vitro and in vivo

Högnäs, G., Tuomi, S., Veltel, S., Mattila, E., Murumägi, A., Edgren, H., Kallioniemi, O. & Ivaska, J., 2 elokuuta 2012, julkaisussa : Oncogene. 31, 31, s. 3597-3606 10 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

No additional benefit of adding ifosfamide to docetaxel in castration-resistant metastatic prostate cancer

Hervonen, P., Tulijoki, T. & Kellokumpu-Lehtinen, P., elokuuta 2012, julkaisussa : Anticancer Research. 32, 8, s. 3305-3310 6 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Novel Loci for Metabolic Networks and Multi-Tissue Expression Studies Reveal Genes for Atherosclerosis

Inouye, M., Ripatti, S., Kettunen, J., Lyytikäinen, L. P., Oksala, N., Laurila, P. P., Kangas, A. J., Soininen, P., Savolainen, M. J., Viikari, J., Kähönen, M., Perola, M., Salomaa, V., Raitakari, O., Lehtimäki, T., Taskinen, M. R., Järvelin, M. R., Ala-Korpela, M., Palotie, A. & de Bakker, P. I. W., elokuuta 2012, julkaisussa : PLOS GENETICS. 8, 8, e1002907.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Validation of prostate cancer risk-related loci identified from genome-wide association studies using family-based association analysis: Evidence from the International Consortium for Prostate Cancer Genetics (ICPCG)

Jin, G., Lu, L., Cooney, K. A., Ray, A. M., Zuhlke, K. A., Lange, E. M., Cannon-Albright, L. A., Camp, N. J., Teerlink, C. C., Fitzgerald, L. M., Stanford, J. L., Wiley, K. E., Isaacs, S. D., Walsh, P. C., Foulkes, W. D., Giles, G. G., Hopper, J. L., Severi, G., Eeles, R., Easton, D., Kote-Jarai, Z., Guy, M., Rinckleb, A., Maier, C., Vogel, W., Cancel-Tassin, G., Egrot, C., Cussenot, O., Thibodeau, S. N., McDonnell, S. K., Schaid, D. J., Wiklund, F., Grönberg, H., Emanuelsson, M., Whittemore, A. S., Oakley-Girvan, I., Hsieh, C. L., Wahlfors, T., Tammela, T., Schleutker, J., Catalona, W. J., Zheng, S. L., Ostrander, E. A., Isaacs, W. B. & Xu, J., heinäkuuta 2012, julkaisussa : HUMAN GENETICS. 131, 7, s. 1095-1103 9 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

The importance of LDL and Cholesterol metabolism for prostate epithelial cell growth

Murtola, T. J., Syvälä, H., Pennanen, P., Bläuer, M., Solakivi, T., Ylikomi, T. & Tammela, T. L. J., 27 kesäkuuta 2012, julkaisussa : PLoS ONE. 7, 6, e39445.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Molecular mechanisms of ion-specific effects on proteins

Rembert, K. B., Paterová, J., Heyda, J., Hilty, C., Jungwirth, P. & Cremer, P. S., 20 kesäkuuta 2012, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 134, 24, s. 10039-10046 8 Sivumäärä

Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Analysis of Xq27-28 linkage in the international consortium for prostate cancer genetics (ICPCG) families

Bailey-Wilson, J. E., Childs, E. J., Cropp, C. D., Schaid, D. J., Xu, J., Camp, N. J., Cannon-Albright, L. A., Farnham, J. M., George, A., Powell, I., Carpten, J. D., Giles, G. G., Hopper, J. L., Severi, G., English, D. R., Foulkes, W. D., Mæhle, L., Møller, P., Eeles, R., Easton, D., Guy, M., Edwards, S., Badzioch, M. D., Whittemore, A. S., Oakley-Girvan, I., Hsieh, C. L., Dimitrov, L., Stanford, J. L., Karyadi, D. M., Deutsch, K., McIntosh, L., Ostrander, E. A., Wiley, K. E., Isaacs, S. D., Walsh, P. C., Thibodeau, S. N., McDonnell, S. K., Hebbring, S., Lange, E. M., Cooney, K. A., Tammela, T. L. J., Schleutker, J., Maier, C., Bochum, S., Hoegel, J., Grönberg, H., Wiklund, F., Emanuelsson, M., Cancel-Tassin, G., Valeri, A., Cussenot, O. & Isaacs, W. B., 19 kesäkuuta 2012, julkaisussa : BMC MEDICAL GENETICS. 13, 46.

Tutkimustuotosvertaisarvioitu