TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto

TUTCRIS

Julkaisut

  1. Julkaistu

    Magnetic origin of the chemical balance in alloyed Fe-Cr stainless steels: First-principles and Ising model study

    Airiskallio, E., Nurmi, E., Väyrynen, I. J., Kokko, K., Ropo, M., Punkkinen, M. P. J., Johansson, B. & Vitos, L., 2014, julkaisussa : Computational Materials Science. 92, s. 135-140 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  2. Revealing differences in gene network inference algorithms on the network level by ensemble methods

    Altay, G. & Emmert-Streib, F., 25 toukokuuta 2010, julkaisussa : Bioinformatics. 26, 14, s. 1738-1744 7 Sivumäärä, btq259.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Optimal energy decay for the wave-heat system on a rectangular domain

    Batty, C., Paunonen, L. & Seifert, D., 2019, julkaisussa : SIAM JOURNAL ON MATHEMATICAL ANALYSIS. 51, 2, s. 808-819 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    The different levels of magneto-mechanical coupling in energy conversion machines and devices

    Belahcen, A., Kouhia, R. & Fonteyn, K., 2011, Proceedings of the 4th International Conference on Computational Methods for Coupled Problems in Science and Engineering, COUPLED PROBLEMS 2011. s. 472-483 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  5. Julkaistu

    Multichannel Blind Sound Source Separation using Spatial Covariance Model with Level and Time Differences and Non-Negative Matrix Factorization

    Carabias Orti, J. J., Nikunen, J., Virtanen, T. & Vera-Candeas, P., syyskuuta 2018, julkaisussa : IEEE/ACM Transactions on Audio Speech and Language Processing. 26, 9, s. 1512-1527

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    Entropy bounds for dendrimers

    Chen, Z., Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Shi, Y., 1 syyskuuta 2014, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 242, s. 462-472 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    Graph distance measures based on topological indices revisited

    Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Shi, Y., 18 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 266, s. 623-633 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  8. A comparative analysis of multidimensional features of objects resembling sets of graphs

    Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Gesell, T., 15 helmikuuta 2008, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 196, 1, s. 221-235 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  9. Julkaistu

    An efficient heuristic approach to detecting graph isomorphism based on combinations of highly discriminating invariants

    Dehmer, M., Grabner, M., Mowshowitz, A. & Emmert-Streib, F., elokuuta 2013, julkaisussa : Advances in Computational Mathematics. 39, 2, s. 311-325 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  10. Structural similarity of directed universal hierarchical graphs: A low computational complexity approach

    Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 joulukuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 194, 1, s. 7-20 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  11. Comparing large graphs efficiently by margins of feature vectors

    Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 15 toukokuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 188, 2, s. 1699-1710 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  12. A similarity measure for graphs with low computational complexity

    Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Kilian, J., 1 marraskuuta 2006, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 182, 1, s. 447-459 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  13. Julkaistu

    On efficient network similarity measures

    Dehmer, M., Chen, Z., Shi, Y., Zhang, Y., Tripathi, S., Ghorbani, M., Mowshowitz, A. & Emmert-Streib, F., 1 joulukuuta 2019, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 362, 124521.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  14. Julkaistu

    Relations and bounds for the zeros of graph polynomials using vertex orbits

    Dehmer, M., Emmert-Streib, F., Mowshowitz, A., Ilić, A., Chen, Z., Yu, G., Feng, L., Ghorbani, M., Varmuza, K. & Tao, J., 1 syyskuuta 2020, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 380, 125239.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    Chipless graphene tag and dual-CP reader for Internet of Things

    Dong, G., Shen, Y., He, H., Virkki, J. & Hu, S., 26 syyskuuta 2017, 2017 International Applied Computational Electromagnetics Society Symposium in China, ACES-China 2017. IEEE

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  16. Julkaistu

    Modeling probability densities with sums of exponentials via polynomial approximation

    Dumitrescu, B., Şicleru, B. C. & Avram, F., 2016, julkaisussa : Journal of Computational and Applied Mathematics. 292, s. 513–525

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Universal construction mechanism for networks from one-dimensional symbol sequences

    Emmert-Streib, F., 15 lokakuuta 2012, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 219, 3, s. 1020-1030 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  18. Julkaistu

    Evolutionary dynamics of the spatial Prisoner's Dilemma with self-inhibition

    Emmert-Streib, F., 5 helmikuuta 2012, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 218, 11, s. 6482-6488 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  19. Topological mappings between graphs, trees and generalized trees

    Emmert-Streib, F. & Dehmer, M., 15 maaliskuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 186, 2, s. 1326-1333 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  20. Information theoretic measures of UHG graphs with low computational complexity

    Emmert-Streib, F. & Dehmer, M., 15 heinäkuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 190, 2, s. 1783-1794 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  21. Algorithmic computation of knot polynomials of secondary structure elements of proteins

    Emmert-Streib, F., 1 lokakuuta 2006, julkaisussa : Journal of Computational Biology. 13, 8, s. 1503-1512 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    A microscopic view of the mechanisms of active transport across the cellular membrane

    Enkavi, G., Li, J., Wen, P., Thangapandian, S., Moradi, M., Jiang, T., Han, W. & Tajkhorshid, E., 2014, julkaisussa : Annual Reports in Computational Chemistry. 10, s. 77-125 49 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    On k-Hypermonogenic Functions and Their Mean Value Properties

    Eriksson, S-L. & Orelma, H., 2016, julkaisussa : Complex Analysis and Operator Theory. 10, 2, s. 311-325 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    Hypermonogenic Functions of Two Vector Variables

    Eriksson, S. L., Orelma, H. & Vieira, N., 2018, julkaisussa : Complex Analysis and Operator Theory. 12, 2, s. 555–570 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  25. Julkaistu

    The watching system as a generalization of identifying code

    Ghorbani, M., Dehmer, M., Maimani, H., Maddah, S., Roozbayani, M. & Emmert-Streib, F., 2020, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 380, 7 Sivumäärä, 125302.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  26. Unite and conquer: Univariate and multivariate approaches for finding differentially expressed gene sets

    Glazko, G. V. & Emmert-Streib, F., syyskuuta 2009, julkaisussa : Bioinformatics. 25, 18, s. 2348-2354 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    Resilient Cooperative Voltage Control for Distribution Network with High Penetration Distributed Energy Resources

    Gusrialdi, A., Xu, Y., Qu, Z. & Simaan, M. A., 2020, European Control Conference 2020, ECC 2020. IEEE, s. 1533-1539 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    Hypermonogenic solutions and plane waves of the Dirac operator in Rp×Rq

    Guzmán Adán, A., Orelma, H. & Sommen, F., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 346, s. 1-14 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal fluorescence intensity data

    Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 tammikuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 31, 1, s. 69-75 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Characterizing rate limiting steps in transcription from RNA production times in live cells

    Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 toukokuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 9, s. 1346-1352 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    Satisfiability of modal inclusion logic: Lax and strict semantics

    Hella, L., Kuusisto, A., Meier, A. & Vollmer, H., 1 lokakuuta 2019, julkaisussa : ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL LOGIC. 21, 1, 7.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  32. Julkaistu

    Van der Waals interactions are critical in Car-Parrinello molecular dynamics simulations of porphyrin-fullerene dyads

    Karilainen, T., Cramariuc, O., Kuisma, M., Tappura, K. & Hukka, T. I., 2015, julkaisussa : Journal of Computational Chemistry. 36, 9, s. 612-621 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    Comparative analysis of tissue reconstruction algorithms for 3D histology

    Kartasalo, K., Latonen, L., Vihinen, J., Visakorpi, T., Nykter, M. & Ruusuvuori, P., 1 syyskuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 17, s. 3013-3021 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  34. Julkaistu

    Circularly Polarized Textile Tag Antenna for Wearable Passive UHF RFID Systems

    Kuang, Y., Ma, S., Ukkonen, L., Virkki, J. & Björninen, T., 18 maaliskuuta 2019, 2018 International Applied Computational Electromagnetics Society Symposium in China, ACES-China 2018. IEEE

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  35. Modeling mass transfer in fracture flows with the time domain-random walk method

    Kuva, J., Voutilainen, M. & Mattila, K., 2019, julkaisussa : COMPUTATIONAL GEOSCIENCES.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    An automated algorithm for reliable equation of state fitting of magnetic systems

    Levämäki, H., Tian, L-Y., Vitos, L. & Ropo, M., 2019, julkaisussa : Computational Materials Science. 156, s. 121-128 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    Introducing libeemd: a program package for performing the ensemble empirical mode decomposition

    Luukko, P. J. J., Helske, J. & Räsänen, E., 1 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Computational Statistics. 31, 2, s. 545-557 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  38. Julkaistu

    Growth behavior and magnetic properties of spherical uranium oxide nanoclusters

    Ma, L. & Ray, A. K., helmikuuta 2013, julkaisussa : Journal of Computational and Theoretical Nanoscience. 10, 2, s. 334-340 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  39. Julkaistu

    Density functional theory study of FePdn (n = 2-14) clusters and interactions with small molecules

    Ma, L., Wang, J., Hao, Y. & Wang, G., helmikuuta 2013, julkaisussa : Computational Materials Science. 68, s. 166-173 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  40. Julkaistu

    Comparison of Human Head Phantoms with Different Complexities for Implantable Antenna Development

    Ma, S., Ukkonen, L., Sydänheimo, L. & Björninen, T., 18 maaliskuuta 2019, 2018 International Applied Computational Electromagnetics Society (ACES) Symposium: 29 July-1 Aug. 2018, China. IEEE

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  41. Julkaistu

    SCIP: a single-cell image processor toolbox

    Martins, L., Neeli-Venkata, R., Oliveira, S. M. D., Häkkinen, A., Ribeiro, A. S. & Fonseca, J. M., 15 joulukuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 24, s. 4318-4320 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    Sound Event Detection in the DCASE 2017 Challenge

    Mesaros, A., Diment, A., Elizalde, B., Heittola, T., Vincent, E., Raj, B. & Virtanen, T., 1 kesäkuuta 2019, julkaisussa : IEEE/ACM Transactions on Audio Speech and Language Processing. 27, 6, s. 992-1006 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  43. Julkaistu

    Homogeneous (α,k)-Polynomial Solutions of the Fractional Riesz System in Hyperbolic Space

    Orelma, H. & Vieira, N., 2017, julkaisussa : Complex Analysis and Operator Theory. 11, 5, s. 1253–1267 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    Gene Sets Net Correlations Analysis (GSNCA): A multivariate differential coexpression test for gene sets

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 1 helmikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 3, s. 360-368 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Gene set analysis for self-contained tests: Complex null and specific alternative hypotheses

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., joulukuuta 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 23, s. 3073-3080 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    A robust AMMI model for the analysis of genotype-by-environment data

    Rodrigues, P. C., Monteiro, A. & Lourenço, V. M., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 1, s. 58-66 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  47. Julkaistu

    Introducing Multi-Convexity in Path Constrained Trajectory Optimization for Mobile Manipulators

    Singh, A. K., Ahonen, A., Ghabcheloo, R. & Mueller, A., 2020, European Control Conference 2020, ECC 2020. IEEE, s. 1178-1185 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  48. Hyväksytty/In press

    Cuts for 3-D magnetic scalar potentials: Visualizing unintuitive surfaces arising from trivial knots

    Stockrahm, A., Lahtinen, V., Kangas, J. J. J. & Kotiuga, P. R., 2019, (Hyväksytty/In press) julkaisussa : Computers and Mathematics with Applications.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  49. Julkaistu

    SamExploreR: Exploring reproducibility and robustness of RNA-seq results based on SAM files

    Stupnikov, A., Tripathi, S., De Matos Simoes, R., McArt, D., Salto-Tellez, M., Glazko, G., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 21, s. 3345-3347 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  50. Julkaistu

    NetBioV: An R package for visualizing large network data in biology and medicine

    Tripathi, S., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 2 huhtikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 19, s. 2834-2836 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Edellinen 1 2 Seuraava