TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto



  1. 1995
  2. Synthesis of chlorinated 5-hydroxy 4-methyl-2(5H)-furanones and mucochloric acid

    Franzén, R. & Kronberg, L., 29 toukokuuta 1995, julkaisussa : Tetrahedron Letters. 36, 22, s. 3905-3908 4 Sivumäärä


  3. 1996
  4. Solution structure of nodularin: An inhibitor of serine/threonine- specific protein phosphatases

    Annila, A., Lehtimäki, J., Mattila, K., Eriksson, J. E., Sivonen, K., Rantala, T. T. & Drakenberg, T., 1996, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 271, 28, s. 16695-16702 8 Sivumäärä


  5. 2000
  6. Utilization of Grignard reagents in solid-phase synthesis: A review of the literature

    Franzén, R. G., 28 tammikuuta 2000, julkaisussa : Tetrahedron. 56, 5, s. 685-691 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

  7. Preparation of 5-substituted 2-carboxyindoles on solid support

    Tois, J., Franzén, R., Aitio, O., Huikko, K. & Taskinen, J., 1 huhtikuuta 2000, julkaisussa : Tetrahedron Letters. 41, 14, s. 2443-2446 4 Sivumäärä


  8. 2003
  9. Modeling of anaerobic degradation of solid slaughterhouse waste: Inhibition effects of long-chain fatty acids or ammonia

    Lokshina, L. Y., Vavilin, V. A., Salminen, E. & Rintala, J., huhtikuuta 2003, julkaisussa : Applied Biochemistry and Biotechnology. 109, 1-3, s. 15-32 18 Sivumäärä


  10. 2007
  11. Responses of methane oxidation to temperature and water content in cover soil of a boreal landfill

    Einola, J. K. M., Kettunen, R. H. & Rintala, J. A., toukokuuta 2007, julkaisussa : Soil Biology and Biochemistry. 39, 5, s. 1156-1164 9 Sivumäärä


  12. 2008
  13. Structural information content of networks: Graph entropy based on local vertex functionals

    Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., huhtikuuta 2008, julkaisussa : Computational Biology and Chemistry. 32, 2, s. 131-138 8 Sivumäärä


  14. 2009
  15. Unite and conquer: Univariate and multivariate approaches for finding differentially expressed gene sets

    Glazko, G. V. & Emmert-Streib, F., syyskuuta 2009, julkaisussa : Bioinformatics. 25, 18, s. 2348-2354 7 Sivumäärä


  16. 2010
  17. Julkaistu

    Surface science analysis and surface modification methods for biomaterials research

    Kanninen, L., Jokinen, N., Lahtonen, K., Jussila, P., Ali-Löytty, H., Hirsimäki, M., Leppiniemi, J., Hytönen, V., Kulomaa, M., Ahola, N., Paakinaho, K., Kellomäki, M. & Valden, M., 1 tammikuuta 2010, julkaisussa : European Cells and Materials. 20, SUPPL. 3, s. 133 1 Sivumäärä


  18. Revealing differences in gene network inference algorithms on the network level by ensemble methods

    Altay, G. & Emmert-Streib, F., 25 toukokuuta 2010, julkaisussa : Bioinformatics. 26, 14, s. 1738-1744 7 Sivumäärä, btq259.


  19. Efficient production of NV colour centres in nanodiamonds using high-energy electron irradiation

    Dantelle, G., Slablab, A., Rondin, L., Lainé, F., Carrel, F., Bergonzo, P., Perruchas, S., Gacoin, T., Treussart, F. & Roch, J. F., syyskuuta 2010, julkaisussa : Journal of Luminescence. 130, 9, s. 1655-1658 4 Sivumäärä


  20. 2011
  21. Julkaistu

    The identity of the transient proton loading site of the proton-pumping mechanism of cytochrome c oxidase

    Kaila, V. R. I., Sharma, V. & Wikström, M., tammikuuta 2011, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1807, 1, s. 80-84 5 Sivumäärä


  22. Julkaistu

    Detection of DNA hybridisation in a diluted serum matrix by surface plasmon resonance and film bulk acoustic resonators

    Auer, S., Nirschl, M., Schreiter, M. & Vikholm-Lundin, I., toukokuuta 2011, julkaisussa : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 400, 5, s. 1387-1396 10 Sivumäärä


  23. Julkaistu

    Trans-interaction of nephrin and Neph1/Neph3 induces cell adhesion that associates with decreased tyrosine phosphorylation of nephrin

    Heikkilä, E., Ristola, M., Havana, M., Jones, N., Holthöfer, H. & Lehtonen, S., 1 toukokuuta 2011, julkaisussa : BIOCHEMICAL JOURNAL. 435, 3, s. 619-628 10 Sivumäärä


  24. Julkaistu

    BACOM: In silico detection of genomic deletion types and correction of normal cell contamination in copy number data

    Yu, G., Zhang, B., Bova, G. S., Xu, J., Shih, I. M. & Wang, Y., kesäkuuta 2011, julkaisussa : Bioinformatics. 27, 11, s. 1473-1480 8 Sivumäärä, btr183.


  25. Julkaistu

    Stabilization of the peroxy intermediate in the oxygen splitting reaction of cytochrome cbb3

    Sharma, V., Wikström, M. & Kaila, V. R. I., heinäkuuta 2011, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1807, 7, s. 813-818 6 Sivumäärä


  26. Julkaistu

    Laser-induced primary and secondary hemostasis dynamics and mechanisms in relation to selective photothermolysis of port wine stains

    Heger, M., Salles, I. I., Bezemer, R., Cloos, M. A., Mordon, S. R., Bégu, S., Deckmyn, H. & Beek, J. F., syyskuuta 2011, julkaisussa : JOURNAL OF DERMATOLOGICAL SCIENCE. 63, 3, s. 139-147 9 Sivumäärä


  27. Julkaistu

    Modification of olivomycin A at the side chain of the aglycon yields the derivative with perspective antitumor characteristics

    Tevyashova, A. N., Shtil, A. A., Olsufyeva, E. N., Luzikov, Y. N., Reznikova, M. I., Dezhenkova, L. G., Isakova, E. B., Bukhman, V. M., Durandin, N. A., Vinogradov, A. M., Kuzmin, V. A. & Preobrazhenskaya, M. N., 15 joulukuuta 2011, julkaisussa : BIOORGANIC AND MEDICINAL CHEMISTRY. 19, 24, s. 7387-7393 7 Sivumäärä


  28. Julkaistu

    Structural Measures for Network Biology Using QuACN

    Mueller, L. A. J., Kugler, K. G., Graber, A., Emmert-Streib, F. & Dehmer, M., 24 joulukuuta 2011, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 12, 1, 492.


  29. 2012
  30. Julkaistu

    Osteogenic medium is superior to growth factors in differentiation of human adipose stem cells towards boneforming cells in 3D culture

    Tirkkonen, L., Haimi, S., Huttunen, S., Wolff, J., Pirhonen, E., Sándor, G. K. & Miettinen, S., 2012, julkaisussa : European Cells and Materials. 25, s. 144-158 15 Sivumäärä


  31. Julkaistu

    Structure-function analysis indicates that sumoylation modulates DNA-binding activity of STAT1

    Grönholm, J., Vanhatupa, S., Ungureanu, D., Väliaho, J., Laitinen, T., Valjakka, J. & Silvennoinen, O., 2012, julkaisussa : BMC BIOCHEMISTRY. 13, 1, 20.


  32. Julkaistu

    Lipid hydration and mobility: An interplay between fluorescence solvent relaxation experiments and molecular dynamics simulations

    Jurkiewicz, P., Cwiklik, L., Jungwirth, P. & Hof, M., tammikuuta 2012, julkaisussa : Biochimie. 94, 1, s. 26-32 7 Sivumäärä


  33. Julkaistu

    Human adipose tissue extract induces angiogenesis and adipogenesis in vitro

    Sarkanen, J. R., Kaila, V., Mannerström, B., Räty, S., Kuokkanen, H., Miettinen, S. & Ylikomi, T., 1 tammikuuta 2012, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 18, 1-2, s. 17-25 9 Sivumäärä


  34. Julkaistu

    Production of l-xylose from l-xylulose using Escherichia coli l-fucose isomerase

    Usvalampi, A., Turunen, O., Valjakka, J., Pastinen, O., Leisola, M. & Nyyssölä, A., 5 tammikuuta 2012, julkaisussa : ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY. 50, 1, s. 71-76 6 Sivumäärä


  35. Julkaistu

    Counterion condensation in short cationic peptides: Limiting mobilities beyond the Onsager-Fuoss theory

    Wernersson, E., Heyda, J., Kubíčková, A., Křížek, T., Coufal, P. & Jungwirth, P., maaliskuuta 2012, julkaisussa : ELECTROPHORESIS. 33, 6, s. 981-989 9 Sivumäärä


  36. Julkaistu

    Histone H2B ubiquitin ligases RNF20 and RNF40 in androgen signaling and prostate cancer cell growth

    Jääskeläinen, T., Makkonen, H., Visakorpi, T., Kim, J., Roeder, R. G. & Palvimo, J. J., 5 maaliskuuta 2012, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 350, 1, s. 87-98 12 Sivumäärä


  37. Julkaistu

    Neuroprotective effect of RO-20-1724-a phosphodiesterase4 inhibitor against intracerebroventricular streptozotocin induced cognitive deficit and oxidative stress in rats

    Sharma, V., Bala, A., Deshmukh, R., Bedi, K. L. & Sharma, P. L., huhtikuuta 2012, julkaisussa : PHARMACOLOGY BIOCHEMISTRY AND BEHAVIOR. 101, 2, s. 239-245 7 Sivumäärä


  38. Julkaistu

    Molecular mechanisms of ion-specific effects on proteins

    Rembert, K. B., Paterová, J., Heyda, J., Hilty, C., Jungwirth, P. & Cremer, P. S., 20 kesäkuuta 2012, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 134, 24, s. 10039-10046 8 Sivumäärä


  39. Julkaistu

    Endocrine prevention and treatment of prostate cancer

    Tammela, T. L. J., 5 syyskuuta 2012, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 360, 1-2, s. 59-67 9 Sivumäärä


  40. Julkaistu

    Biophysics of lipid bilayers containing oxidatively modified phospholipids: Insights from fluorescence and EPR experiments and from MD simulations

    Jurkiewicz, P., Olzyńska, A., Cwiklik, L., Conte, E., Jungwirth, P., Megli, F. M. & Hof, M., lokakuuta 2012, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1818, 10, s. 2388-2402 15 Sivumäärä


  41. Julkaistu

    Gene set analysis for self-contained tests: Complex null and specific alternative hypotheses

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., joulukuuta 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 23, s. 3073-3080 8 Sivumäärä


  42. 2013
  43. Julkaistu

    Hollow fibers of poly(lactide-co-glycolide) and poly(ε-caprolactone) blends for vascular tissue engineering applications

    Diban, N., Haimi, S., Bolhuis-Versteeg, L., Teixeira, S., Miettinen, S., Poot, A., Grijpma, D. & Stamatialis, D., 2013, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 9, 5, s. 6450-6458 9 Sivumäärä


  44. Julkaistu

    Molecular mechanism of T-cell protein tyrosine phosphatase (TCPTP) activation by mitoxantrone

    Ylilauri, M., Mattila, E., Nurminen, E. M., Käpylä, J., Niinivehmas, S. P., Määttä, J. A., Pentikäinen, U., Ivaska, J. & Pentikäinen, O. T., 2013, julkaisussa : Biochimica et biophysica acta: proteins and proteomics. 1834, 10, s. 1988-1997 10 Sivumäärä


  45. Julkaistu

    Visualizing functional motions of membrane transporters with molecular dynamics simulations

    Shaikh, S. A., Li, J., Enkavi, G., Wen, P. C., Huang, Z. & Tajkhorshid, E., 29 tammikuuta 2013, julkaisussa : Biochemistry. 52, 4, s. 569-587 19 Sivumäärä


  46. Julkaistu

    How the amyloid-β peptide and membranes affect each other: An extensive simulation study

    Poojari, C., Kukol, A. & Strodel, B., helmikuuta 2013, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1828, 2, s. 327-339 13 Sivumäärä


  47. Julkaistu

    Resonance assignments of the 56 kDa chimeric avidin in the biotin-bound and free forms

    Tossavainen, H., Helppolainen, S. H., Määttä, J. A. E., Pihlajamaa, T., Hytönen, V. P., Kulomaa, M. S. & Permi, P., huhtikuuta 2013, julkaisussa : BIOMOLECULAR NMR ASSIGNMENTS. 7, 1, s. 35-38 4 Sivumäärä


  48. Julkaistu

    Non-coding RNAs in DNA damage and repair

    Sharma, V. & Misteli, T., 27 kesäkuuta 2013, julkaisussa : FEBS Letters. 587, 13, s. 1832-1839 8 Sivumäärä


  49. Julkaistu

    The highly dynamic oligomeric structure of bradavidin II is unique among avidin proteins

    Leppiniemi, J., Meir, A., Kahkonen, N., Kukkurainen, S., Maatta, J. A., Ojanen, M., Janis, J., Kulomaa, M. S., Livnah, O. & Hytonen, V. P., heinäkuuta 2013, julkaisussa : PROTEIN SCIENCE. 22, 7, s. 980-994 15 Sivumäärä


  50. Julkaistu

    Development and characterization of poly(ε-caprolactone) hollow fiber membranes for vascular tissue engineering

    Diban, N., Haimi, S., Bolhuis-Versteeg, L., Teixeira, S., Miettinen, S., Poot, A., Grijpma, D. & Stamatialis, D., 1 heinäkuuta 2013, julkaisussa : Journal of Membrane Science. 438, s. 29-37 9 Sivumäärä


  51. Julkaistu

    Identification, prioritization, and evaluation of glycoproteins for aggressive prostate cancer using quantitative glycoproteomics and antibody-based assays on tissue specimens

    Chen, J., Xi, J., Tian, Y., Bova, G. S. & Zhang, H., elokuuta 2013, julkaisussa : Proteomics. 13, 15, s. 2268-2277 10 Sivumäärä


  52. Julkaistu

    Mechanisms of acceleration and retardation of water dynamics by ions

    Stirnemann, G., Wernersson, E., Jungwirth, P. & Laage, D., 14 elokuuta 2013, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 135, 32, s. 11824-11831 8 Sivumäärä


  53. Julkaistu

    Analysis of free, mono- and diacetylated polyamines from human urine by LC-MS/MS

    Häkkinen, M. R., Roine, A., Auriola, S., Tuokko, A., Veskimäe, E., Keinänen, T. A., Lehtimäki, T., Oksala, N. & Vepsäläinen, J., 15 joulukuuta 2013, julkaisussa : JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY B: ANALYTICAL TECHNOLOGIES IN THE BIOMEDICAL AND LIFE SCIENCES. 941, s. 81-89 9 Sivumäärä


  54. 2014
  55. Julkaistu

    Electrophoretic mobilities of neutral analytes and electroosmotic flow markers in aqueous solutions of Hofmeister salts

    Křížek, T., Kubíčková, A., Hladílková, J., Coufal, P., Heyda, J. & Jungwirth, P., 2014, julkaisussa : ELECTROPHORESIS. 35, 5, s. 617-624 8 Sivumäärä


  56. Julkaistu

    Functional and genetic analysis of the colon cancer network.

    Emmert-Streib, F., de Matos Simoes, R., Glazko, G., McDade, S., Haibe-Kains, B., Holzinger, A., Dehmer, M. & Campbell, F., 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, Suppl 6, S6.


  57. Julkaistu

    Kinetics of bioconjugate nanoparticle label binding in a sandwich-type immunoassay

    Näreoja, T., Ebner, A., Gruber, H. J., Taskinen, B., Kienberger, F., Hänninen, P. E., Hytönen, V. P., Hinterdorfer, P. & Härmä, H., 2014, julkaisussa : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 406, 2, s. 493-503 11 Sivumäärä


  58. Julkaistu

    Novel derivatives of bacteriochlorophyll a: Complex formation with albumin and the mechanism of tumor cell photodamage

    Akimova, A. V., Grin, M. A., Golovina, G. V., Kokrashvili, T. A., Vinogradov, A. M., Mironov, A. F., Rychkov, G. N., Shtil, A. A., Kuzmin, V. A. & Durandin, N. A., 2014, julkaisussa : DOKLADY BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS. 454, 1, s. 17-20 4 Sivumäärä


  59. Julkaistu

    Recurrent thyroid cancers have more peritumoural lymphatic vasculature than nonrecurrent thyroid cancers

    Hakala, T., Sand, J., Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Huhtala, H., Leinonen, R. & Kholová, I., 2014, julkaisussa : European Journal of Clinical Investigation. 44, 9, s. 825-832 8 Sivumäärä


  60. Julkaistu

    Report from the 2nd Summer School in Computational Biology organized by the Queen's University of Belfast

    Emmert-Streib, F., Zhang, S. D. & Hamilton, P., 2014, julkaisussa : Genomics Data. 2, s. 37-39 3 Sivumäärä


  61. Julkaistu

    Shiga-like toxin binds with high avidity to multivalent O-linked blood group P1 determinants on mucin-type fusion proteins

    Maria Cherian, R., Gaunitz, S., Nilsson, A., Liu, J., Karlsson, N. G. & Holgersson, J., tammikuuta 2014, julkaisussa : GLYCOBIOLOGY. 24, 1, s. 26-38 13 Sivumäärä


  62. Julkaistu

    Natural thermal adaptation increases heat shock protein levels and decreases oxidative stress

    Oksala, N. K. J., Ekmekçi, F. G., Özsoy, E., Kirankaya, Ş., Kokkola, T., Emecen, G., Lappalainen, J., Kaarniranta, K. & Atalay, M., 1 tammikuuta 2014, julkaisussa : REDOX BIOLOGY. 3, s. 25-28 4 Sivumäärä


Edellinen 1 2 3 4 Seuraava