TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto

TUTCRIS

Julkaisut

  1. Vertaisarvioitu
  2. Julkaistu

    Biophysics of lipid bilayers containing oxidatively modified phospholipids: Insights from fluorescence and EPR experiments and from MD simulations

    Jurkiewicz, P., Olzyńska, A., Cwiklik, L., Conte, E., Jungwirth, P., Megli, F. M. & Hof, M., lokakuuta 2012, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1818, 10, s. 2388-2402 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Endocrine prevention and treatment of prostate cancer

    Tammela, T. L. J., 5 syyskuuta 2012, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 360, 1-2, s. 59-67 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    Lipid hydration and mobility: An interplay between fluorescence solvent relaxation experiments and molecular dynamics simulations

    Jurkiewicz, P., Cwiklik, L., Jungwirth, P. & Hof, M., tammikuuta 2012, julkaisussa : Biochimie. 94, 1, s. 26-32 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  5. Julkaistu

    Modification of olivomycin A at the side chain of the aglycon yields the derivative with perspective antitumor characteristics

    Tevyashova, A. N., Shtil, A. A., Olsufyeva, E. N., Luzikov, Y. N., Reznikova, M. I., Dezhenkova, L. G., Isakova, E. B., Bukhman, V. M., Durandin, N. A., Vinogradov, A. M., Kuzmin, V. A. & Preobrazhenskaya, M. N., 15 joulukuuta 2011, julkaisussa : BIOORGANIC AND MEDICINAL CHEMISTRY. 19, 24, s. 7387-7393 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    Non-coding RNAs in DNA damage and repair

    Sharma, V. & Misteli, T., 27 kesäkuuta 2013, julkaisussa : FEBS Letters. 587, 13, s. 1832-1839 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    Understanding the Role of Lipids in Signaling Through Atomistic and Multiscale Simulations of Cell Membranes

    Manna, M., Nieminen, T. & Vattulainen, I., 6 toukokuuta 2019, julkaisussa : ANNUAL REVIEW OF BIOPHYSICS. 48, s. 421-439 19 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  8. Julkaistu

    Advances in Human Stem Cell-Derived Neuronal Cell Culturing and Analysis

    Ylä-Outinen, L., Tanskanen, J. M. A., Kapucu, F. E., Hyysalo, A., Hyttinen, J. A. K. & Narkilahti, S., 2019, In Vitro Neuronal Networks: From Culturing Methods to Neuro-Technological Applications. Springer New York LLC, s. 299-329 31 Sivumäärä (Advances in Neurobiology; painos 22).

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  9. Julkaistu

    Lipid membranes: Theory and simulations bridged to experiments

    Vattulainen, I. & Róg, T., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2251-2253 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  10. Katsausartikkeli › Vertaisarvioitu
  11. Julkaistu

    Non-Brownian diffusion in lipid membranes: Experiments and simulations

    Metzler, R., Jeon, J. H. & Cherstvy, A. G., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 215, s. 173–185

    Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

  12. Utilization of Grignard reagents in solid-phase synthesis: A review of the literature

    Franzén, R. G., 28 tammikuuta 2000, julkaisussa : Tetrahedron. 56, 5, s. 685-691 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

  13. Vertaisarvioitu
  14. Julkaistu

    A Bioscreening Technique for Ultraviolet Irradiation Protective Natural Substances

    Tienaho, J., Poikulainen, E., Sarjala, T., Muilu-Mäkelä, R., Santala, V. & Karp, M., 2018, julkaisussa : Photochemistry and Photobiology. 94, 6, s. 1273-1280

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    A BRCA1-interacting lncRNA regulates homologous recombination

    Sharma, V., Khurana, S., Kubben, N., Abdelmohsen, K., Oberdoerffer, P., Gorospe, M. & Misteli, T., 1 marraskuuta 2015, julkaisussa : EMBO REPORTS. 16, 11, s. 1520-1534 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  16. A concise synthesis of carbasugars isolated from Streptomyces lincolnensis

    Holmstedt, S. & Candeias, N. R., 2020, julkaisussa : Tetrahedron. 131346.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Acquiring respiration rate from photoplethysmographic signal by recursive bayesian tracking of intrinsic modes in time-frequency spectra

    Pirhonen, M., Peltokangas, M. & Vehkaoja, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Sensors. 18, 6, 1693.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  18. Julkaistu

    Alpha radiation-induced luminescence by am-241 in aqueous nitric acid solution

    Kerst, T., Malmbeck, R., lal Banik, N. L. & Toivonen, J., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 7, 1602.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  19. Julkaistu

    Alzheimer's disease and alpha-synuclein pathology in the olfactory bulbs of infants, children, teens and adults ≤ 40 years in Metropolitan Mexico City. APOE4 carriers at higher risk of suicide accelerate their olfactory bulb pathology

    Calderón-Garcidueñas, L., González-Maciel, A., Reynoso-Robles, R., Kulesza, R. J., Mukherjee, P. S., Torres-Jardón, R., Rönkkö, T. & Doty, R. L., 1 lokakuuta 2018, julkaisussa : Environmental Research. 166, s. 348-362 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  20. Julkaistu

    An activity recognition framework deploying the random forest classifier and a single optical heart rate monitoring and triaxial accelerometer wrist-band

    Mehrang, S., Pietilä, J. & Korhonen, I., 22 helmikuuta 2018, julkaisussa : Sensors. 18, 2, 613.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  21. Julkaistu

    Analysis of free, mono- and diacetylated polyamines from human urine by LC-MS/MS

    Häkkinen, M. R., Roine, A., Auriola, S., Tuokko, A., Veskimäe, E., Keinänen, T. A., Lehtimäki, T., Oksala, N. & Vepsäläinen, J., 15 joulukuuta 2013, julkaisussa : JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY B: ANALYTICAL TECHNOLOGIES IN THE BIOMEDICAL AND LIFE SCIENCES. 941, s. 81-89 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    An architectural understanding of natural sway frequencies in trees

    Jackson, T., Shenkin, A., Moore, J., Bunce, A., van Emmerik, T., Kane, B., Burcham, D., James, K., Selker, J., Calders, K., Origo, N., Disney, M., Burt, A., Wilkes, P., Raumonen, P., Gonzalez de Tanago Menaca, J., Lau, A., Herold, M., Goodman, R. C., Fourcaud, T. & Malhi, Y., 28 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Journal of the Royal Society. Interface. 16, 155, 1 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    An efficient auxin-inducible degron system with low basal degradation in human cells

    Li, S., Prasanna, X., Salo, V. T., Vattulainen, I. & Ikonen, E., 1 syyskuuta 2019, julkaisussa : Nature Methods. 16, 9, s. 866-869 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    Antioxidant supplementation reduces genomic aberrations in human induced pluripotent stem cells

    Ji, J., Sharma, V., Qi, S., Guarch, M. E., Zhao, P., Luo, Z., Fan, W., Wang, Y., Mbabaali, F., Neculai, D., Esteban, M. A., McPherson, J. D. & Batada, N. N., 14 tammikuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 2, 1, s. 44-51 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  25. Julkaistu

    Apolipoprotein A-I mimetic peptide 4F blocks sphingomyelinase-induced LDL aggregation

    Nguyen, S. D., Javanainen, M., Rissanen, S., Zhao, H., Huusko, J., Kivelä, A. M., Ylä-Herttuala, S., Navab, M., Fogelman, A. M., Vattulainen, I., Kovanen, P. T. & Öörni, K., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Journal of Lipid Research. 56, 6, s. 1206-1221 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  26. Julkaistu

    A robust AMMI model for the analysis of genotype-by-environment data

    Rodrigues, P. C., Monteiro, A. & Lourenço, V. M., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 1, s. 58-66 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    AROS has a context-dependent effect on SIRT1

    Kokkola, T., Suuronen, T., Molnár, F., Määttä, J., Salminen, A., Jarho, E. M. & Lahtela-Kakkonen, M., 2 toukokuuta 2014, julkaisussa : FEBS Letters. 588, 9, s. 1523-1528 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    Atomistic Molecular Dynamics Simulations of Mitochondrial DNA Polymerase γ: Novel Mechanisms of Function and Pathogenesis

    Euro, L., Haapanen, O., Róg, T., Vattulainen, I., Suomalainen, A. & Sharma, V., 7 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Biochemistry. 56, 9, s. 1227-1238 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Azopolymer photopatterning for directional control of angiogenesis

    Fedele, C., De Gregorio, M., Netti, P. A., Cavalli, S. & Attanasio, C., 1 marraskuuta 2017, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 63, s. 317-325 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    BACOM: In silico detection of genomic deletion types and correction of normal cell contamination in copy number data

    Yu, G., Zhang, B., Bova, G. S., Xu, J., Shih, I. M. & Wang, Y., kesäkuuta 2011, julkaisussa : Bioinformatics. 27, 11, s. 1473-1480 8 Sivumäärä, btr183.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    Behavior of the DPH fluorescence probe in membranes perturbed by drugs

    Poojari, C., Wilkosz, N., Lira, R. B., Dimova, R., Jurkiewicz, P., Petka, R., Kepczynski, M. & Róg, T., 1 syyskuuta 2019, julkaisussa : Chemistry and Physics of Lipids. 223, 104784.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  32. Julkaistu

    Bioactive glass induced osteogenic differentiation of human adipose stem cells is dependent on cell attachment mechanism and mitogen-activated protein kinases

    Ojansivu, M., Wang, X., Hyväri, L., Kellomäki, M., Hupa, L., Vanhatupa, S. & Miettinen, S., 2018, julkaisussa : European Cells and Materials. 35, s. 53-71 19 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    Bioactive glass ions as strong enhancers of osteogenic differentiation in human adipose stem cells

    Ojansivu, M., Vanhatupa, S., Björkvik, L., Häkkänen, H., Kellomäki, M., Autio, R., Ihalainen, J. A., Hupa, L. & Miettinen, S., 15 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 21, s. 190-203 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  34. Julkaistu

    Bioimpedance Sensor Array for Long-Term Monitoring of Wound Healing from Beneath the Primary Dressings and Controlled Formation of H2O2 Using Low-Intensity Direct Current

    Kekonen, A., Bergelin, M., Johansson, M., Kumar Joon, N., Bobacka, J. & Viik, J., 31 toukokuuta 2019, julkaisussa : Sensors. 19, 11

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  35. Julkaistu

    Blood microRNA profile associates with the levels of serum lipids and metabolites associated with glucose metabolism and insulin resistance and pinpoints pathways underlying metabolic syndrome. The cardiovascular risk in Young Finns Study.

    Raitoharju, E., Seppälä, I., Oksala, N., Lyytikäinen, L. P., Raitakari, O., Viikari, J., Ala-Korpela, M., Soininen, P., Kangas, A. J., Waldenberger, M., Klopp, N., Illig, T., Leiviskä, J., Loo, B. M., Hutri-Kähönen, N., Kähönen, M., Laaksonen, R. & Lehtimäki, T., 25 kesäkuuta 2014, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 391, 1-2, s. 41-49 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    Calcium Assists Dopamine Release by Preventing Aggregation on the Inner Leaflet of Presynaptic Vesicles

    Mokkila, S., Postila, P. A., Rissanen, S., Juhola, H., Vattulainen, I. & Róg, T., 21 kesäkuuta 2017, julkaisussa : ACS Chemical Neuroscience. 8, 6, s. 1242-1250 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    Calcium Directly Regulates Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Headgroup Conformation and Recognition

    Bilkova, E., Pleskot, R., Rissanen, S., Sun, S., Czogalla, A., Cwiklik, L., Róg, T., Vattulainen, I., Cremer, P. S., Jungwirth, P. & Coskun, Ü., 22 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 139, 11, s. 4019-4024 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  38. Julkaistu

    Calcium transients closely reflect prolonged action potentials in iPSC models of inherited cardiac arrhythmia

    Spencer, C. I., Baba, S., Nakamura, K., Hua, E. A., Sears, M. A. F., Fu, C. C., Zhang, J., Balijepalli, S., Tomoda, K., Hayashi, Y., Lizarraga, P., Wojciak, J., Scheinman, M. M., Aalto-Setälä, K., Makielski, J. C., January, C. T., Healy, K. E., Kamp, T. J., Yamanaka, S. & Conklin, B. R., 12 elokuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 3, 2, s. 269-281 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  39. Julkaistu

    Cancer incidence and mortality in patients treated either with RAI or thyroidectomy for hyperthyroidism

    Ryödi, E., Metso, S., Jaatinen, P., Huhtala, H., Saaristo, R., Välimäki, M. & Auvinen, A., 1 lokakuuta 2015, julkaisussa : Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 100, 10, s. 3710-3717 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  40. Julkaistu

    Characterisation and in vitro and in vivo evaluation of supercritical-CO2-foamed β-TCP/PLCL composites for bone applications

    Pitkänen, S., Paakinaho, K., Pihlman, H., Ahola, N., Hannula, M., Asikainen, S., Manninen, M., Morelius, M., Keränen, P., Hyttinen, J., Kellomäki, M., Laitinen-Vapaavuori, O. & Miettinen, S., 5 elokuuta 2019, julkaisussa : European cells & materials. 38, s. 35-50 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  41. Julkaistu

    Characterizing rate limiting steps in transcription from RNA production times in live cells

    Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 toukokuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 9, s. 1346-1352 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    Cholesterol oxidation products and their biological importance

    Kulig, W., Cwiklik, L., Jurkiewicz, P., Rog, T. & Vattulainen, I., 2016, julkaisussa : Chemistry and Physics of Lipids. 199, s. 144-160 17 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  43. Julkaistu

    Cholesterol under oxidative stress: How lipid membranes sense oxidation as cholesterol is being replaced by oxysterols

    Kulig, W., Olzyńska, A., Jurkiewicz, P., Kantola, A. M., Komulainen, S., Manna, M., Pourmousa, M., Vazdar, M., Cwiklik, L., Rog, T., Khelashvili, G., Harries, D., Telkki, V. V., Hof, M., Vattulainen, I. & Jungwirth, P., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Free Radical Biology and Medicine. 84, s. 30-41 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    Co-culture of human induced pluripotent stem cell-derived retinal pigment epithelial cells and endothelial cells on double collagen-coated honeycomb films

    Rebelo Calejo, T., Vuorenpää, H., Vuorimaa-Laukkanen, E., Kallio, P., Aalto-Setälä, K., Miettinen, S., Skottman, H., Kellomäki, M. & Juuti-Uusitalo, K., 2020, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 101, s. 327-343 17 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Comparative analysis of tissue reconstruction algorithms for 3D histology

    Kartasalo, K., Latonen, L., Vihinen, J., Visakorpi, T., Nykter, M. & Ruusuvuori, P., 1 syyskuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 17, s. 3013-3021 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    Comparative evaluation of gene set analysis approaches for RNA-Seq data

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 5 joulukuuta 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, 1, 397.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  47. Julkaistu

    Comparison of different coating techniques on the properties of FucoPol films

    Ferreira, A. R. V., Haapanen, J., Mäkelä, J. M., Bratvold, J. E., Nilsen, O., Tuominen, M., Alves, V. D. & Coelhoso, I. M., 1 lokakuuta 2017, julkaisussa : International Journal of Biological Macromolecules. 103, s. 268-274 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  48. Julkaistu

    Connection between absorption properties and conformational changes in Deinococcus radiodurans phytochrome

    Takala, H., Lehtivuori, H., Hammarén, H., Hytönen, V. P. & Ihalainen, J. A., 18 marraskuuta 2014, julkaisussa : Biochemistry. 53, 45, s. 7076-7085 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  49. Julkaistu

    Connection of Collimation, Asymmetric Beaming, and Independent Transmission-Reflection Processes in Concentric-Groove Gratings Supporting Spoof Surface Plasmons

    Habib, M., Serebryannikov, A. E., Caglayan, H., Vandenbosch, G. A. E. & Ozbay, E., kesäkuuta 2019, julkaisussa : Plasmonics. 14, 3, s. 721-729 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  50. Julkaistu

    Controlled Orientations of Neighboring Tetracene Units by Mixed Self-Assembled Monolayers on Gold Nanoclusters for High-Yield and Long-Lived Triplet Excited States through Singlet Fission

    Saegusa, T., Sakai, H., Nagashima, H., Kobori, Y., Tkachenko, N. V. & Hasobe, T., 18 syyskuuta 2019, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 141, 37, s. 14720-14727 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  51. Julkaistu

    Counterion condensation in short cationic peptides: Limiting mobilities beyond the Onsager-Fuoss theory

    Wernersson, E., Heyda, J., Kubíčková, A., Křížek, T., Coufal, P. & Jungwirth, P., maaliskuuta 2012, julkaisussa : ELECTROPHORESIS. 33, 6, s. 981-989 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  52. Julkaistu

    Detection of DNA hybridisation in a diluted serum matrix by surface plasmon resonance and film bulk acoustic resonators

    Auer, S., Nirschl, M., Schreiter, M. & Vikholm-Lundin, I., toukokuuta 2011, julkaisussa : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 400, 5, s. 1387-1396 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  53. Julkaistu

    Development and characterization of poly(ε-caprolactone) hollow fiber membranes for vascular tissue engineering

    Diban, N., Haimi, S., Bolhuis-Versteeg, L., Teixeira, S., Miettinen, S., Poot, A., Grijpma, D. & Stamatialis, D., 1 heinäkuuta 2013, julkaisussa : Journal of Membrane Science. 438, s. 29-37 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Edellinen 1 2 3 4 Seuraava