TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto

TUTCRIS

Julkaisut

  1. A1 Alkuperäisartikkeli
  2. Julkaistu

    Relations and bounds for the zeros of graph polynomials using vertex orbits

    Dehmer, M., Emmert-Streib, F., Mowshowitz, A., Ilić, A., Chen, Z., Yu, G., Feng, L., Ghorbani, M., Varmuza, K. & Tao, J., 1 syyskuuta 2020, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 380, 125239.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    The watching system as a generalization of identifying code

    Ghorbani, M., Dehmer, M., Maimani, H., Maddah, S., Roozbayani, M. & Emmert-Streib, F., 2020, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 380, 7 Sivumäärä, 125302.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    A novel epidemic model considering demographics and intercity commuting on complex dynamical networks

    Yin, Q., Wang, Z., Xia, C., Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Jin, Z., 2020, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 386, 21 Sivumäärä, 125517.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  5. Julkaistu

    Graph entropy based on the number of spanning forests of c-cyclic graphs

    Wan, P., Tu, J., Dehmer, M., Zhang, S. & Emmert-Streib, F., 15 joulukuuta 2019, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 363, 124616.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    On efficient network similarity measures

    Dehmer, M., Chen, Z., Shi, Y., Zhang, Y., Tripathi, S., Ghorbani, M., Mowshowitz, A. & Emmert-Streib, F., 1 joulukuuta 2019, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 362, 124521.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    Satisfiability of modal inclusion logic: Lax and strict semantics

    Hella, L., Kuusisto, A., Meier, A. & Vollmer, H., 1 lokakuuta 2019, julkaisussa : ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL LOGIC. 21, 1, 7.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  8. Julkaistu

    Sound Event Detection in the DCASE 2017 Challenge

    Mesaros, A., Diment, A., Elizalde, B., Heittola, T., Vincent, E., Raj, B. & Virtanen, T., 1 kesäkuuta 2019, julkaisussa : IEEE/ACM Transactions on Audio Speech and Language Processing. 27, 6, s. 992-1006 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  9. Julkaistu

    Hypermonogenic solutions and plane waves of the Dirac operator in Rp×Rq

    Guzmán Adán, A., Orelma, H. & Sommen, F., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 346, s. 1-14 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  10. Julkaistu

    An automated algorithm for reliable equation of state fitting of magnetic systems

    Levämäki, H., Tian, L-Y., Vitos, L. & Ropo, M., 2019, julkaisussa : Computational Materials Science. 156, s. 121-128 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  11. Hyväksytty/In press

    Cuts for 3-D magnetic scalar potentials: Visualizing unintuitive surfaces arising from trivial knots

    Stockrahm, A., Lahtinen, V., Kangas, J. J. J. & Kotiuga, P. R., 2019, (Hyväksytty/In press) julkaisussa : Computers and Mathematics with Applications.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    Optimal energy decay for the wave-heat system on a rectangular domain

    Batty, C., Paunonen, L. & Seifert, D., 2019, julkaisussa : SIAM JOURNAL ON MATHEMATICAL ANALYSIS. 51, 2, s. 808-819 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  13. Modeling mass transfer in fracture flows with the time domain-random walk method

    Kuva, J., Voutilainen, M. & Mattila, K., 2019, julkaisussa : COMPUTATIONAL GEOSCIENCES.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  14. Julkaistu

    SCIP: a single-cell image processor toolbox

    Martins, L., Neeli-Venkata, R., Oliveira, S. M. D., Häkkinen, A., Ribeiro, A. S. & Fonseca, J. M., 15 joulukuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 24, s. 4318-4320 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    Comparative analysis of tissue reconstruction algorithms for 3D histology

    Kartasalo, K., Latonen, L., Vihinen, J., Visakorpi, T., Nykter, M. & Ruusuvuori, P., 1 syyskuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 17, s. 3013-3021 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  16. Julkaistu

    Multichannel Blind Sound Source Separation using Spatial Covariance Model with Level and Time Differences and Non-Negative Matrix Factorization

    Carabias Orti, J. J., Nikunen, J., Virtanen, T. & Vera-Candeas, P., syyskuuta 2018, julkaisussa : IEEE/ACM Transactions on Audio Speech and Language Processing. 26, 9, s. 1512-1527

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Hypermonogenic Functions of Two Vector Variables

    Eriksson, S. L., Orelma, H. & Vieira, N., 2018, julkaisussa : Complex Analysis and Operator Theory. 12, 2, s. 555–570 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  18. Julkaistu

    Integral kernels for k-hypermonogenic functions

    Vuojamo, V. & Eriksson, S-L., 2017, julkaisussa : Complex Variables and Elliptic Equations. 62, 9, s. 1-12 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  19. Julkaistu

    Homogeneous (α,k)-Polynomial Solutions of the Fractional Riesz System in Hyperbolic Space

    Orelma, H. & Vieira, N., 2017, julkaisussa : Complex Analysis and Operator Theory. 11, 5, s. 1253–1267 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  20. Julkaistu

    SamExploreR: Exploring reproducibility and robustness of RNA-seq results based on SAM files

    Stupnikov, A., Tripathi, S., De Matos Simoes, R., McArt, D., Salto-Tellez, M., Glazko, G., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 21, s. 3345-3347 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  21. Julkaistu

    Introducing libeemd: a program package for performing the ensemble empirical mode decomposition

    Luukko, P. J. J., Helske, J. & Räsänen, E., 1 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Computational Statistics. 31, 2, s. 545-557 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    Characterizing rate limiting steps in transcription from RNA production times in live cells

    Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 toukokuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 9, s. 1346-1352 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    On k-Hypermonogenic Functions and Their Mean Value Properties

    Eriksson, S-L. & Orelma, H., 2016, julkaisussa : Complex Analysis and Operator Theory. 10, 2, s. 311-325 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    Modeling probability densities with sums of exponentials via polynomial approximation

    Dumitrescu, B., Şicleru, B. C. & Avram, F., 2016, julkaisussa : Journal of Computational and Applied Mathematics. 292, s. 513–525

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  25. Julkaistu

    A robust AMMI model for the analysis of genotype-by-environment data

    Rodrigues, P. C., Monteiro, A. & Lourenço, V. M., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 1, s. 58-66 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  26. Julkaistu

    Graph distance measures based on topological indices revisited

    Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Shi, Y., 18 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 266, s. 623-633 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal fluorescence intensity data

    Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 tammikuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 31, 1, s. 69-75 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    Van der Waals interactions are critical in Car-Parrinello molecular dynamics simulations of porphyrin-fullerene dyads

    Karilainen, T., Cramariuc, O., Kuisma, M., Tappura, K. & Hukka, T. I., 2015, julkaisussa : Journal of Computational Chemistry. 36, 9, s. 612-621 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Entropy bounds for dendrimers

    Chen, Z., Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Shi, Y., 1 syyskuuta 2014, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 242, s. 462-472 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    NetBioV: An R package for visualizing large network data in biology and medicine

    Tripathi, S., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 2 huhtikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 19, s. 2834-2836 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    Gene Sets Net Correlations Analysis (GSNCA): A multivariate differential coexpression test for gene sets

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 1 helmikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 3, s. 360-368 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  32. Julkaistu

    A microscopic view of the mechanisms of active transport across the cellular membrane

    Enkavi, G., Li, J., Wen, P., Thangapandian, S., Moradi, M., Jiang, T., Han, W. & Tajkhorshid, E., 2014, julkaisussa : Annual Reports in Computational Chemistry. 10, s. 77-125 49 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    A full-potential linearized augmented plane wave study of the interaction of CO2 with α-Pu (020) surface nanolayers

    Wang, J. & Ray, A. K., 2014, julkaisussa : Journal of Computational and Theoretical Nanoscience. 11, 7, s. 1710-1717 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  34. Julkaistu

    Magnetic origin of the chemical balance in alloyed Fe-Cr stainless steels: First-principles and Ising model study

    Airiskallio, E., Nurmi, E., Väyrynen, I. J., Kokko, K., Ropo, M., Punkkinen, M. P. J., Johansson, B. & Vitos, L., 2014, julkaisussa : Computational Materials Science. 92, s. 135-140 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  35. Julkaistu

    An efficient heuristic approach to detecting graph isomorphism based on combinations of highly discriminating invariants

    Dehmer, M., Grabner, M., Mowshowitz, A. & Emmert-Streib, F., elokuuta 2013, julkaisussa : Advances in Computational Mathematics. 39, 2, s. 311-325 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    Growth behavior and magnetic properties of spherical uranium oxide nanoclusters

    Ma, L. & Ray, A. K., helmikuuta 2013, julkaisussa : Journal of Computational and Theoretical Nanoscience. 10, 2, s. 334-340 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    Density functional theory study of FePdn (n = 2-14) clusters and interactions with small molecules

    Ma, L., Wang, J., Hao, Y. & Wang, G., helmikuuta 2013, julkaisussa : Computational Materials Science. 68, s. 166-173 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  38. Julkaistu

    Gene set analysis for self-contained tests: Complex null and specific alternative hypotheses

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., joulukuuta 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 23, s. 3073-3080 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  39. Julkaistu

    Universal construction mechanism for networks from one-dimensional symbol sequences

    Emmert-Streib, F., 15 lokakuuta 2012, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 219, 3, s. 1020-1030 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  40. Julkaistu

    Evolutionary dynamics of the spatial Prisoner's Dilemma with self-inhibition

    Emmert-Streib, F., 5 helmikuuta 2012, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 218, 11, s. 6482-6488 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  41. Julkaistu

    BACOM: In silico detection of genomic deletion types and correction of normal cell contamination in copy number data

    Yu, G., Zhang, B., Bova, G. S., Xu, J., Shih, I. M. & Wang, Y., kesäkuuta 2011, julkaisussa : Bioinformatics. 27, 11, s. 1473-1480 8 Sivumäärä, btr183.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  42. Revealing differences in gene network inference algorithms on the network level by ensemble methods

    Altay, G. & Emmert-Streib, F., 25 toukokuuta 2010, julkaisussa : Bioinformatics. 26, 14, s. 1738-1744 7 Sivumäärä, btq259.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  43. Unite and conquer: Univariate and multivariate approaches for finding differentially expressed gene sets

    Glazko, G. V. & Emmert-Streib, F., syyskuuta 2009, julkaisussa : Bioinformatics. 25, 18, s. 2348-2354 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  44. A comparative analysis of multidimensional features of objects resembling sets of graphs

    Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Gesell, T., 15 helmikuuta 2008, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 196, 1, s. 221-235 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  45. Structural similarity of directed universal hierarchical graphs: A low computational complexity approach

    Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 joulukuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 194, 1, s. 7-20 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  46. Information theoretic measures of UHG graphs with low computational complexity

    Emmert-Streib, F. & Dehmer, M., 15 heinäkuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 190, 2, s. 1783-1794 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  47. Comparing large graphs efficiently by margins of feature vectors

    Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 15 toukokuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 188, 2, s. 1699-1710 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  48. Topological mappings between graphs, trees and generalized trees

    Emmert-Streib, F. & Dehmer, M., 15 maaliskuuta 2007, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 186, 2, s. 1326-1333 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  49. A similarity measure for graphs with low computational complexity

    Dehmer, M., Emmert-Streib, F. & Kilian, J., 1 marraskuuta 2006, julkaisussa : Applied Mathematics and Computation. 182, 1, s. 447-459 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  50. Algorithmic computation of knot polynomials of secondary structure elements of proteins

    Emmert-Streib, F., 1 lokakuuta 2006, julkaisussa : Journal of Computational Biology. 13, 8, s. 1503-1512 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  51. A2 Katsausartikkeli
  52. Julkaistu

    Machine learning: How it can help nanocomputing

    Uusitalo, M. A., Peltonen, J. & Ryhänen, T., elokuuta 2011, julkaisussa : Journal of Computational and Theoretical Nanoscience. 8, 8, s. 1347-1363 17 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Edellinen 1 2 Seuraava