TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto

TUTCRIS

Julkaisut

  1. 2019
  2. Julkaistu

    Statistical evaluation of barkhausen noise testing (BNT) for ground samples

    Tomkowski, R., Sorsa, A., Santa-Aho, S., Lundin, P. & Vippola, M., 1 marraskuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 21, 4716.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Improved water services cooperation through clarification of rules and roles

    Inha, L. M., Katko, T. S. & Rajala, R. P., 19 lokakuuta 2019, julkaisussa : Water (Switzerland). 11, 10, 2172.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    Controlled Orientations of Neighboring Tetracene Units by Mixed Self-Assembled Monolayers on Gold Nanoclusters for High-Yield and Long-Lived Triplet Excited States through Singlet Fission

    Saegusa, T., Sakai, H., Nagashima, H., Kobori, Y., Tkachenko, N. V. & Hasobe, T., 18 syyskuuta 2019, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 141, 37, s. 14720-14727 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  5. Julkaistu

    An efficient auxin-inducible degron system with low basal degradation in human cells

    Li, S., Prasanna, X., Salo, V. T., Vattulainen, I. & Ikonen, E., 1 syyskuuta 2019, julkaisussa : Nature Methods. 16, 9, s. 866-869 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    Behavior of the DPH fluorescence probe in membranes perturbed by drugs

    Poojari, C., Wilkosz, N., Lira, R. B., Dimova, R., Jurkiewicz, P., Petka, R., Kepczynski, M. & Róg, T., 1 syyskuuta 2019, julkaisussa : Chemistry and Physics of Lipids. 223, 104784.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    Influence of ions to modulate hydrazone and oxime reaction kinetics to obtain dynamically cross-linked hyaluronic acid hydrogels

    Wang, S., Nawale, G. N., Oommen, O. P., Hilborn, J. & Varghese, O. P., 21 elokuuta 2019, julkaisussa : Polymer Chemistry. 10, 31, s. 4322-4327 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  8. Julkaistu

    Characterisation and in vitro and in vivo evaluation of supercritical-CO2-foamed β-TCP/PLCL composites for bone applications

    Pitkänen, S., Paakinaho, K., Pihlman, H., Ahola, N., Hannula, M., Asikainen, S., Manninen, M., Morelius, M., Keränen, P., Hyttinen, J., Kellomäki, M., Laitinen-Vapaavuori, O. & Miettinen, S., 5 elokuuta 2019, julkaisussa : European cells & materials. 38, s. 35-50 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  9. Julkaistu

    An architectural understanding of natural sway frequencies in trees

    Jackson, T., Shenkin, A., Moore, J., Bunce, A., van Emmerik, T., Kane, B., Burcham, D., James, K., Selker, J., Calders, K., Origo, N., Disney, M., Burt, A., Wilkes, P., Raumonen, P., Gonzalez de Tanago Menaca, J., Lau, A., Herold, M., Goodman, R. C., Fourcaud, T. & Malhi, Y., 28 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Journal of the Royal Society. Interface. 16, 155, 1 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  10. Julkaistu

    Methods for simultaneous robot-world-hand–eye calibration: A comparative study

    Ali, I., Suominen, O., Gotchev, A. & Morales, E. R., 2 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 12, 2837.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  11. Julkaistu

    Connection of Collimation, Asymmetric Beaming, and Independent Transmission-Reflection Processes in Concentric-Groove Gratings Supporting Spoof Surface Plasmons

    Habib, M., Serebryannikov, A. E., Caglayan, H., Vandenbosch, G. A. E. & Ozbay, E., kesäkuuta 2019, julkaisussa : Plasmonics. 14, 3, s. 721-729 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    Bioimpedance Sensor Array for Long-Term Monitoring of Wound Healing from Beneath the Primary Dressings and Controlled Formation of H2O2 Using Low-Intensity Direct Current

    Kekonen, A., Bergelin, M., Johansson, M., Kumar Joon, N., Bobacka, J. & Viik, J., 31 toukokuuta 2019, julkaisussa : Sensors. 19, 11

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  13. Julkaistu

    Understanding the Role of Lipids in Signaling Through Atomistic and Multiscale Simulations of Cell Membranes

    Manna, M., Nieminen, T. & Vattulainen, I., 6 toukokuuta 2019, julkaisussa : ANNUAL REVIEW OF BIOPHYSICS. 48, s. 421-439 19 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  14. Julkaistu

    Alpha radiation-induced luminescence by am-241 in aqueous nitric acid solution

    Kerst, T., Malmbeck, R., lal Banik, N. L. & Toivonen, J., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 7, 1602.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    Positioning information privacy in intelligent transportation systems: An overview and future perspective

    Ometov, A., Bezzateev, S., Davydov, V., Shchesniak, A., Masek, P., Lohan, E. S. & Koucheryavy, Y., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Sensors. 19, 7, 1603.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  16. Julkaistu

    Iterative unsupervised domain adaptation for generalized cell detection from brightfield z-stacks

    Liimatainen, K., Kananen, L., Latonen, L. & Ruusuvuori, P., 15 helmikuuta 2019, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 20, 1, 80.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Regulation of asymmetries in the kinetics and protein numbers of bacterial gene expression

    Startceva, S., Kandavalli, V. K., Visa, A. & Ribeiro, A. S., 1 helmikuuta 2019, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms. 1862, 2, s. 119-128 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  18. Julkaistu

    Advances in Human Stem Cell-Derived Neuronal Cell Culturing and Analysis

    Ylä-Outinen, L., Tanskanen, J. M. A., Kapucu, F. E., Hyysalo, A., Hyttinen, J. A. K. & Narkilahti, S., 2019, In Vitro Neuronal Networks: From Culturing Methods to Neuro-Technological Applications. Springer New York LLC, s. 299-329 31 Sivumäärä (Advances in Neurobiology; painos 22).

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  19. 2018
  20. Julkaistu

    SCIP: a single-cell image processor toolbox

    Martins, L., Neeli-Venkata, R., Oliveira, S. M. D., Häkkinen, A., Ribeiro, A. S. & Fonseca, J. M., 15 joulukuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 24, s. 4318-4320 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  21. Julkaistu

    M2M Communication Assessment in Energy-Harvesting and Wake-Up Radio Assisted Scenarios Using Practical Components

    Rinne, J., Keskinen, J., Berger, P. R., Lupo, D. & Valkama, M., 16 marraskuuta 2018, julkaisussa : Sensors (Basel, Switzerland). 18, 11

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    Molecular-Scale Ligand Effects in Small Gold-Thiolate Nanoclusters

    Chevrier, D. M., Raich, L., Rovira, C., Das, A., Luo, Z., Yao, Q., Chatt, A., Xie, J., Jin, R., Akola, J. & Zhang, P., 14 marraskuuta 2018, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 140, 45, s. 15430-15436 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    How to minimize dye-induced perturbations while studying biomembrane structure and dynamics: PEG linkers as a rational alternative

    Mobarak, E., Javanainen, M., Kulig, W., Honigmann, A., Sezgin, E., Aho, N., Eggeling, C., Rog, T. & Vattulainen, I., marraskuuta 2018, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 1860, 11, s. 2436-2445

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    Alzheimer's disease and alpha-synuclein pathology in the olfactory bulbs of infants, children, teens and adults ≤ 40 years in Metropolitan Mexico City. APOE4 carriers at higher risk of suicide accelerate their olfactory bulb pathology

    Calderón-Garcidueñas, L., González-Maciel, A., Reynoso-Robles, R., Kulesza, R. J., Mukherjee, P. S., Torres-Jardón, R., Rönkkö, T. & Doty, R. L., 1 lokakuuta 2018, julkaisussa : Environmental Research. 166, s. 348-362 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  25. Julkaistu

    Comparative analysis of tissue reconstruction algorithms for 3D histology

    Kartasalo, K., Latonen, L., Vihinen, J., Visakorpi, T., Nykter, M. & Ruusuvuori, P., 1 syyskuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 17, s. 3013-3021 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  26. Julkaistu

    Physiologically-relevant levels of sphingomyelin, but not GM1, induces a β-sheet-rich structure in the amyloid-β(1-42) monomer

    Owen, M. C., Kulig, W., Poojari, C., Rog, T. & Strodel, B., syyskuuta 2018, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 1860, 9, s. 1709-1720

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    Acquiring respiration rate from photoplethysmographic signal by recursive bayesian tracking of intrinsic modes in time-frequency spectra

    Pirhonen, M., Peltokangas, M. & Vehkaoja, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Sensors. 18, 6, 1693.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    Evaluation of dry electrodes in canine heart rate monitoring

    Virtanen, J., Somppi, S., Törnqvist, H., Jeyhani, V., Fiedler, P., Gizatdinova, Y., Majaranta, P., Väätäjä, H., Cardó, A. V., Lekkala, J., Tuukkanen, S., Surakka, V., Vainio, O. & Vehkaoja, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Sensors. 18, 6, 1757.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Photo-antimicrobial efficacy of zinc complexes of porphyrin and phthalocyanine activated by inexpensive consumer LED lamp

    George, L., Hiltunen, A., Santala, V. & Efimov, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Journal of Inorganic Biochemistry. 183, s. 94-100 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Non-intersecting leaf insertion algorithm for tree structure models

    Åkerblom, M., Raumonen, P., Casella, E., Disney, M. I., Danson, F. M., Gaulton, R., Schofield, L. A. & Kaasalainen, M., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170045.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    Uncertainty in multispectral lidar signals caused by incidence angle effects

    Kaasalainen, S., Åkerblom, M., Nevalainen, O., Hakala, T. & Kaasalainen, M., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170033.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  32. Julkaistu

    Weighing trees with lasers: Advances, challenges and opportunities

    Disney, M. I., Boni Vicari, M., Burt, A., Calders, K., Lewis, S. L., Raumonen, P. & Wilkes, P., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170048.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    Soft hydrazone crosslinked hyaluronan- and alginate-based hydrogels as 3D supportive matrices for human pluripotent stem cell-derived neuronal cells

    Karvinen, J., Joki, T., Ylä-Outinen, L., Koivisto, J. T., Narkilahti, S. & Kellomäki, M., 1 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Reactive and Functional Polymers. 124, s. 29-39 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  34. Julkaistu
  35. Julkaistu

    Molecular mechanism for inhibition of twinfilin by phosphoinositides

    Hakala, M., Kalimeri, M., Enkavi, G., Vattulainen, I. & Lappalainen, P., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 293, 13, s. 4818-4829 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    A Bioscreening Technique for Ultraviolet Irradiation Protective Natural Substances

    Tienaho, J., Poikulainen, E., Sarjala, T., Muilu-Mäkelä, R., Santala, V. & Karp, M., 2018, julkaisussa : Photochemistry and Photobiology. 94, 6, s. 1273-1280

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    Bioactive glass induced osteogenic differentiation of human adipose stem cells is dependent on cell attachment mechanism and mitogen-activated protein kinases

    Ojansivu, M., Wang, X., Hyväri, L., Kellomäki, M., Hupa, L., Vanhatupa, S. & Miettinen, S., 2018, julkaisussa : European Cells and Materials. 35, s. 53-71 19 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  38. Julkaistu

    Effect of N/S ratio on anoxic thiosulfate oxidation in a fluidized bed reactor: Experimental and artificial neural network model analysis

    Khanongnuch, R., Di Capua, F., Lakaniemi, A-M., Rene, E. R. & Lens, P. N. L., 2018, julkaisussa : Process Biochemistry. 68, s. 171-181

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  39. Julkaistu

    Gloriosa superba Mediated Synthesis of Platinum and Palladium Nanoparticles for Induction of Apoptosis in Breast Cancer

    Rokade, S. S., Joshi, K. A., Mahajan, K., Patil, S., Tomar, G., Dubal, D. S., Parihar, V. S., Kitture, R., Bellare, J. R. & Ghosh, S., 2018, julkaisussa : Bioinorganic Chemistry and Applications. 2018, 4924186.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  40. 2017
  41. Julkaistu

    Azopolymer photopatterning for directional control of angiogenesis

    Fedele, C., De Gregorio, M., Netti, P. A., Cavalli, S. & Attanasio, C., 1 marraskuuta 2017, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 63, s. 317-325 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    Comparison of different coating techniques on the properties of FucoPol films

    Ferreira, A. R. V., Haapanen, J., Mäkelä, J. M., Bratvold, J. E., Nilsen, O., Tuominen, M., Alves, V. D. & Coelhoso, I. M., 1 lokakuuta 2017, julkaisussa : International Journal of Biological Macromolecules. 103, s. 268-274 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  43. Julkaistu

    Inhibition of Aβ Amyloid Growth and Toxicity by Silybins: The Crucial Role of Stereochemistry

    Sciacca, M. F. M., Romanucci, V., Zarrelli, A., Monaco, I., Lolicato, F., Spinella, N., Galati, C., Grasso, G., D'Urso, L., Romeo, M., Diomede, L., Salmona, M., Bongiorno, C., Di Fabio, G., La Rosa, C. & Milardi, D., 16 elokuuta 2017, julkaisussa : ACS Chemical Neuroscience. 8, 8, s. 1767-1778 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    sgnesR: An R package for simulating gene expression data from an underlying real gene network structure considering delay parameters

    Tripathi, S., Lloyd-Price, J., Ribeiro, A., Yli-Harja, O., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 4 heinäkuuta 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, 1, 325.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Dynamics of a True Moving Bed separation process: Linear model identification and advanced process control

    Nogueira, I. B. R., Ribeiro, A. M., Martins, M. A. F., Rodrigues, A. E., Koivisto, H. & Loureiro, J. M., 30 kesäkuuta 2017, julkaisussa : Journal of Chromatography A. 1504

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    Calcium Assists Dopamine Release by Preventing Aggregation on the Inner Leaflet of Presynaptic Vesicles

    Mokkila, S., Postila, P. A., Rissanen, S., Juhola, H., Vattulainen, I. & Róg, T., 21 kesäkuuta 2017, julkaisussa : ACS Chemical Neuroscience. 8, 6, s. 1242-1250 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  47. Julkaistu

    Long-chain GM1 gangliosides alter transmembrane domain registration through interdigitation

    Manna, M., Javanainen, M., Martinez-Seara Monne, H., Gabius, H-J., Rog, T. & Vattulainen, I., 1 toukokuuta 2017, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1859, 5, s. 870-878 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  48. Tunable Plasmonic Silver Nanodomes for Surface-Enhanced Raman Scattering

    Kahraman, M., Ozbay, A., Yuksel, H., Solmaz, R., Demir, B. & Caglayan, H., 5 huhtikuuta 2017, (Hyväksytty/In press) julkaisussa : Plasmonics. s. 1-11 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  49. Julkaistu

    Hexaphyrin as a Potential Theranostic Dye for Photothermal Therapy and 19F Magnetic Resonance Imaging

    Higashino, T., Nakatsuji, H., Fukuda, R., Okamoto, H., Imai, H., Matsuda, T., Tochio, H., Shirakawa, M., Tkachenko, N. V., Hashida, M., Murakami, T. & Imahori, H., 24 maaliskuuta 2017, julkaisussa : ChemBioChem. 18, 10, s. 951-959 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  50. Julkaistu

    Calcium Directly Regulates Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Headgroup Conformation and Recognition

    Bilkova, E., Pleskot, R., Rissanen, S., Sun, S., Czogalla, A., Cwiklik, L., Róg, T., Vattulainen, I., Cremer, P. S., Jungwirth, P. & Coskun, Ü., 22 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 139, 11, s. 4019-4024 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  51. Julkaistu

    Hierarchical Self-Assembly of Halogen-Bonded Block Copolymer Complexes into Upright Cylindrical Domains

    Milani, R., Houbenov, N., Fernandez-Palacio, F., Cavallo, G., Luzio, A., Haataja, J., Giancane, G., Saccone, M., Priimägi, A., Metrangolo, P. & Ikkala, O., 9 maaliskuuta 2017, julkaisussa : CheM. 2, 3, s. 417-426 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  52. Julkaistu

    Atomistic Molecular Dynamics Simulations of Mitochondrial DNA Polymerase γ: Novel Mechanisms of Function and Pathogenesis

    Euro, L., Haapanen, O., Róg, T., Vattulainen, I., Suomalainen, A. & Sharma, V., 7 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Biochemistry. 56, 9, s. 1227-1238 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  53. Julkaistu

    Polarization resolved photoluminescence in GaAs1−xBix/GaAs quantum wells

    Balanta, M. A. G., Orsi Gordo, V., Carvalho, A. R. H., Puustinen, J., Alghamdi, H. M., Henini, M., Galeti, H. V. A., Guina, M. & Galvão Gobato, Y., helmikuuta 2017, julkaisussa : Journal of Luminescence. 182, s. 49-52 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  54. Julkaistu

    GSAR: Bioconductor package for Gene Set analysis in R

    Rahmatallah, Y., Zybailov, B., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 24 tammikuuta 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, 1, 61.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  55. Julkaistu

    Dynamics and energetics of the mammalian phosphatidylinositol transfer protein phospholipid exchange cycle

    Grabon, A., Orłowski, A., Tripathi, A., Vuorio, J., Javanainen, M., Róg, T., Lönnfors, M., McDermott, M. I., Siebert, G., Somerharju, P., Vattulainen, I. & Bankaitis, V. A., 2017, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 292, 35, s. 14438-14455 18 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  56. Julkaistu

    Synthesis, Structural Characterization, Hirshfeld Surface and Antioxidant Activity Analysis of a Novel Organic Cation Antimonate Complex

    Lahbib, I., Valkonen, A., Rzaigui, M. & Smirani, W., 2017, julkaisussa : Journal of Cluster Science. 28, 4, s. 2239–2252 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  57. 2016
  58. Julkaistu

    SamExploreR: Exploring reproducibility and robustness of RNA-seq results based on SAM files

    Stupnikov, A., Tripathi, S., De Matos Simoes, R., McArt, D., Salto-Tellez, M., Glazko, G., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 21, s. 3345-3347 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  59. Julkaistu

    Effects of σ factor competition are promoter initiation kinetics dependent

    Kandavalli, V. K., Tran, H. & Ribeiro, A. S., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Gene Regulatory Mechanisms. 1859, 10, s. 1281-1288 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  60. Julkaistu

    Identifying involvement of Lys251/Asp252 pair in electron transfer and associated proton transfer at the quinone reduction site of Rhodobacter capsulatus cytochrome bc1

    Kuleta, P., Sarewicz, M., Postila, P., Róg, T. & Osyczka, A., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1857, 10, s. 1661-1668 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  61. Julkaistu

    Lipid membranes: Theory and simulations bridged to experiments

    Vattulainen, I. & Róg, T., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2251-2253 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  62. Julkaistu

    Efficient preparation and analysis of membrane and membrane protein systems

    Javanainen, M. & Martinez-Seara, H., lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2468-2482

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  63. Julkaistu

    Functionalized lipids and surfactants for specific applications

    Kepczynski, M. & Róg, T., lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2362-2379

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  64. Julkaistu

    Distribution and dynamics of quinones in the lipid bilayer mimicking the inner membrane of mitochondria

    Kaurola, P., Sharma, V., Vonk, A., Vattulainen, I. & Róg, T., 1 syyskuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 9, s. 2116-2122 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  65. Julkaistu

    The role of the K-channel and the active-site tyrosine in the catalytic mechanism of cytochrome c oxidase

    Sharma, V. & Wikström, M., elokuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1857, 8, s. 1111-1115

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  66. Julkaistu

    Robust statistical approaches for RSS-based floor detection in indoor localization

    Razavi, A., Valkama, M. & Lohan, E. S., 1 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Sensors. 16, 6, 793.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  67. Julkaistu

    Characterizing rate limiting steps in transcription from RNA production times in live cells

    Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 toukokuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 9, s. 1346-1352 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  68. Julkaistu

    Human Adipose Stem Cells Differentiated on Braided Polylactide Scaffolds is a Potential Approach for Tendon Tissue Engineering

    Vuornos, K., Björninen, M., Talvitie, E., Paakinaho, K., Kellomäki, M., Huhtala, H., Miettinen, S., Seppänen-Kaijansinkko, R. & Haimi, S., 1 maaliskuuta 2016, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 22, 5-6, s. 513-523 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  69. Julkaistu

    Cholesterol oxidation products and their biological importance

    Kulig, W., Cwiklik, L., Jurkiewicz, P., Rog, T. & Vattulainen, I., 2016, julkaisussa : Chemistry and Physics of Lipids. 199, s. 144-160 17 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  70. Julkaistu

    Morphological Differentiation Towards Neuronal Phenotype of SH-SY5Y Neuroblastoma Cells by Estradiol, Retinoic Acid and Cholesterol

    Teppola, H., Sarkanen, J. R., Jalonen, T. O. & Linne, M-L., 2016, julkaisussa : Neurochemical Research. 41, 4, s. 731-747

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  71. Julkaistu

    Non-Brownian diffusion in lipid membranes: Experiments and simulations

    Metzler, R., Jeon, J. H. & Cherstvy, A. G., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 215, s. 173–185

    Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

  72. Julkaistu

    Role of charged lipids in membrane structures: Insight given by simulations

    Pöyry, S. & Vattulainen, I., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. s. 2322–2333 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  73. Julkaistu

    The biophysical properties of ethanolamine plasmalogens revealed by atomistic molecular dynamics simulations

    Rog, T. & Koivuniemi, A., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 1, s. 97-103 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  74. 2015
  75. Julkaistu

    Gene expression analysis upon lncRNA DDSR1 knockdown in human fibroblasts

    Jia, L., Sun, Z., Wu, X., Misteli, T. & Sharma, V., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Genomics Data. 6, s. 277-279 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  76. Julkaistu

    Tuning the Plasmonic Extinction Resonances of Hexagonal Arrays of Ag Nanoparticles

    Ravi, A., Luthra, A., Teixeira, F. L., Berger, P. R. & Coe, J. V., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Plasmonics. 10, 6, s. 1505-1512 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  77. Julkaistu

    A BRCA1-interacting lncRNA regulates homologous recombination

    Sharma, V., Khurana, S., Kubben, N., Abdelmohsen, K., Oberdoerffer, P., Gorospe, M. & Misteli, T., 1 marraskuuta 2015, julkaisussa : EMBO REPORTS. 16, 11, s. 1520-1534 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  78. Julkaistu

    Submolecular Plasticization Induced by Photons in Azobenzene Materials

    Vapaavuori, J., Laventure, A., Bazuin, C. G., Lebel, O. & Pellerin, C., 28 lokakuuta 2015, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 137, 42, s. 13510-13517 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  79. Julkaistu

    Cancer incidence and mortality in patients treated either with RAI or thyroidectomy for hyperthyroidism

    Ryödi, E., Metso, S., Jaatinen, P., Huhtala, H., Saaristo, R., Välimäki, M. & Auvinen, A., 1 lokakuuta 2015, julkaisussa : Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 100, 10, s. 3710-3717 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  80. Julkaistu

    Surface Modified Biodegradable Electrospun Membranes as a Carrier for Human Embryonic Stem Cell-Derived Retinal Pigment Epithelial Cells

    Sorkio, A., Porter, P. J., Juuti-Uusitalo, K., Meenan, B. J., Skottman, H. & Burke, G. A., 1 syyskuuta 2015, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 21, 17-18, s. 2301-2314 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  81. Julkaistu

    Bioactive glass ions as strong enhancers of osteogenic differentiation in human adipose stem cells

    Ojansivu, M., Vanhatupa, S., Björkvik, L., Häkkänen, H., Kellomäki, M., Autio, R., Ihalainen, J. A., Hupa, L. & Miettinen, S., 15 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 21, s. 190-203 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  82. Julkaistu

    A robust AMMI model for the analysis of genotype-by-environment data

    Rodrigues, P. C., Monteiro, A. & Lourenço, V. M., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 1, s. 58-66 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  83. Julkaistu

    Cholesterol under oxidative stress: How lipid membranes sense oxidation as cholesterol is being replaced by oxysterols

    Kulig, W., Olzyńska, A., Jurkiewicz, P., Kantola, A. M., Komulainen, S., Manna, M., Pourmousa, M., Vazdar, M., Cwiklik, L., Rog, T., Khelashvili, G., Harries, D., Telkki, V. V., Hof, M., Vattulainen, I. & Jungwirth, P., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Free Radical Biology and Medicine. 84, s. 30-41 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  84. Julkaistu

    Apolipoprotein A-I mimetic peptide 4F blocks sphingomyelinase-induced LDL aggregation

    Nguyen, S. D., Javanainen, M., Rissanen, S., Zhao, H., Huusko, J., Kivelä, A. M., Ylä-Herttuala, S., Navab, M., Fogelman, A. M., Vattulainen, I., Kovanen, P. T. & Öörni, K., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Journal of Lipid Research. 56, 6, s. 1206-1221 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  85. Julkaistu

    Using shRNA experiments to validate gene regulatory networks

    Olsen, C., Fleming, K., Prendergast, N., Rubio, R., Emmert-Streib, F., Bontempi, G., Quackenbush, J. & Haibe-Kains, B., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Genomics Data. 4, s. 123-126 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  86. Julkaistu

    Role of subunit III and its lipids in the molecular mechanism of cytochrome c oxidase

    Sharma, V., Ala-Vannesluoma, P., Vattulainen, I., Wikström, M. & Róg, T., 17 huhtikuuta 2015, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1847, 8, s. 690-697 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  87. Julkaistu

    Multi-stable dynamics of the non-adiabatic repressilator

    Potapov, I., Zhurov, B. & Volkov, E., 6 maaliskuuta 2015, julkaisussa : Journal of the Royal Society. Interface. 12, 104, 20141315.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  88. Julkaistu

    Oxidation half-reaction of aqueous nucleosides and nucleotides via photoelectron spectroscopy augmented by ab initio calculations

    Schroeder, C. A., Pluharová, E., Seidel, R., Schroeder, W. P., Faubel, M., Slavíçek, P., Winter, B., Jungwirth, P. & Bradforth, S. E., 14 tammikuuta 2015, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 137, 1, s. 201-209 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  89. Julkaistu

    Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal fluorescence intensity data

    Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 tammikuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 31, 1, s. 69-75 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  90. Julkaistu

    Efficient preparation of shuffled DNA libraries through recombination (Gateway) cloning

    Lehtonen, S. I., Taskinen, B., Ojala, E., Kukkurainen, S., Rahikainen, R., Riihimäki, T. A., Laitinen, O. H., Kulomaa, M. S. & Hytönen, V. P., 2015, julkaisussa : Protein Engineering Design and Selection. 28, 1, s. 23-28 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  91. Julkaistu

    Experimental determination and computational interpretation of biophysical properties of lipid bilayers enriched by cholesteryl hemisuccinate

    Kulig, W., Jurkiewicz, P., Olzyńska, A., Tynkkynen, J., Javanainen, M., Manna, M., Rog, T., Hof, M., Vattulainen, I. & Jungwirth, P., 2015, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1848, 2, s. 422-432 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  92. Interaction with serum albumin as a factor of the photodynamic efficacy of novel bacteriopurpurinimide derivatives

    Akimova, A. V., Rychkov, G. N., Grin, M. A., Filippova, N. A., Golovina, G. V., Durandin, N. A., Vinogradov, A. M., Kokrashvili, T. A., Mironov, A. F., Shtil, A. A. & Kuzmin, V. A., 2015, julkaisussa : ACTA NATURAE. 7, 1, s. 109-116 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  93. 2014
  94. Julkaistu

    Comparative evaluation of gene set analysis approaches for RNA-Seq data

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 5 joulukuuta 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, 1, 397.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  95. Julkaistu

    Connection between absorption properties and conformational changes in Deinococcus radiodurans phytochrome

    Takala, H., Lehtivuori, H., Hammarén, H., Hytönen, V. P. & Ihalainen, J. A., 18 marraskuuta 2014, julkaisussa : Biochemistry. 53, 45, s. 7076-7085 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  96. Julkaistu

    Global analysis of human nonreceptor tyrosine kinase specificity using high-density peptide microarrays

    Deng, Y., Alicea-Velázquez, N. L., Bannwarth, L., Lehtonen, S. I., Boggon, T. J., Cheng, H. C., Hytönen, V. P. & Turk, B. E., 3 lokakuuta 2014, julkaisussa : Journal of Proteome Research. 13, 10, s. 4339-4346 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  97. Julkaistu

    Calcium transients closely reflect prolonged action potentials in iPSC models of inherited cardiac arrhythmia

    Spencer, C. I., Baba, S., Nakamura, K., Hua, E. A., Sears, M. A. F., Fu, C. C., Zhang, J., Balijepalli, S., Tomoda, K., Hayashi, Y., Lizarraga, P., Wojciak, J., Scheinman, M. M., Aalto-Setälä, K., Makielski, J. C., January, C. T., Healy, K. E., Kamp, T. J., Yamanaka, S. & Conklin, B. R., 12 elokuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 3, 2, s. 269-281 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  98. Julkaistu

    Blood microRNA profile associates with the levels of serum lipids and metabolites associated with glucose metabolism and insulin resistance and pinpoints pathways underlying metabolic syndrome. The cardiovascular risk in Young Finns Study.

    Raitoharju, E., Seppälä, I., Oksala, N., Lyytikäinen, L. P., Raitakari, O., Viikari, J., Ala-Korpela, M., Soininen, P., Kangas, A. J., Waldenberger, M., Klopp, N., Illig, T., Leiviskä, J., Loo, B. M., Hutri-Kähönen, N., Kähönen, M., Laaksonen, R. & Lehtimäki, T., 25 kesäkuuta 2014, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 391, 1-2, s. 41-49 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  99. Julkaistu

    Light-fuelled transport of large dendrimers and proteins

    Koskela, J. E., Liljeström, V., Lim, J., Simanek, E. E., Ras, R. H. A., Priimagi, A. & Kostiainen, M. A., 14 toukokuuta 2014, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 136, 19, s. 6850-6853 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  100. Julkaistu

    AROS has a context-dependent effect on SIRT1

    Kokkola, T., Suuronen, T., Molnár, F., Määttä, J., Salminen, A., Jarho, E. M. & Lahtela-Kakkonen, M., 2 toukokuuta 2014, julkaisussa : FEBS Letters. 588, 9, s. 1523-1528 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  101. Julkaistu

    NetBioV: An R package for visualizing large network data in biology and medicine

    Tripathi, S., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 2 huhtikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 19, s. 2834-2836 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  102. Julkaistu

    Small-molecule induction promotes corneal epithelial cell differentiation from human induced pluripotent stem cells

    Mikhailova, A., Ilmarinen, T., Uusitalo, H. & Skottman, H., 11 helmikuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 2, 2, s. 219-231 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  103. Julkaistu

    Gene Sets Net Correlations Analysis (GSNCA): A multivariate differential coexpression test for gene sets

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 1 helmikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 3, s. 360-368 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  104. Julkaistu

    Structure and barrier properties of human embryonic stem cell-derived retinal pigment epithelial cells are affected by extracellular matrix protein coating

    Sorkio, A., Hongisto, H., Kaarniranta, K., Uusitalo, H., Juuti-Uusitalo, K. & Skottman, H., 1 helmikuuta 2014, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 20, 3-4, s. 622-634 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  105. Julkaistu

    Antioxidant supplementation reduces genomic aberrations in human induced pluripotent stem cells

    Ji, J., Sharma, V., Qi, S., Guarch, M. E., Zhao, P., Luo, Z., Fan, W., Wang, Y., Mbabaali, F., Neculai, D., Esteban, M. A., McPherson, J. D. & Batada, N. N., 14 tammikuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 2, 1, s. 44-51 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  106. Julkaistu

    Natural thermal adaptation increases heat shock protein levels and decreases oxidative stress

    Oksala, N. K. J., Ekmekçi, F. G., Özsoy, E., Kirankaya, Ş., Kokkola, T., Emecen, G., Lappalainen, J., Kaarniranta, K. & Atalay, M., 1 tammikuuta 2014, julkaisussa : REDOX BIOLOGY. 3, s. 25-28 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Edellinen 1 2 Seuraava