TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto

TUTCRIS

Julkaisut

  1. Julkaistu

    Non-intersecting leaf insertion algorithm for tree structure models

    Åkerblom, M., Raumonen, P., Casella, E., Disney, M. I., Danson, F. M., Gaulton, R., Schofield, L. A. & Kaasalainen, M., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170045.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  2. Interaction with serum albumin as a factor of the photodynamic efficacy of novel bacteriopurpurinimide derivatives

    Akimova, A. V., Rychkov, G. N., Grin, M. A., Filippova, N. A., Golovina, G. V., Durandin, N. A., Vinogradov, A. M., Kokrashvili, T. A., Mironov, A. F., Shtil, A. A. & Kuzmin, V. A., 2015, julkaisussa : ACTA NATURAE. 7, 1, s. 109-116 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Novel derivatives of bacteriochlorophyll a: Complex formation with albumin and the mechanism of tumor cell photodamage

    Akimova, A. V., Grin, M. A., Golovina, G. V., Kokrashvili, T. A., Vinogradov, A. M., Mironov, A. F., Rychkov, G. N., Shtil, A. A., Kuzmin, V. A. & Durandin, N. A., 2014, julkaisussa : DOKLADY BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS. 454, 1, s. 17-20 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  4. Julkaistu

    Methods for simultaneous robot-world-hand–eye calibration: A comparative study

    Ali, I., Suominen, O., Gotchev, A. & Morales, E. R., 2 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 12, 2837.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  5. Revealing differences in gene network inference algorithms on the network level by ensemble methods

    Altay, G. & Emmert-Streib, F., 25 toukokuuta 2010, julkaisussa : Bioinformatics. 26, 14, s. 1738-1744 7 Sivumäärä, btq259.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  6. Solution structure of nodularin: An inhibitor of serine/threonine- specific protein phosphatases

    Annila, A., Lehtimäki, J., Mattila, K., Eriksson, J. E., Sivonen, K., Rantala, T. T. & Drakenberg, T., 1996, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 271, 28, s. 16695-16702 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  7. Julkaistu

    Detection of DNA hybridisation in a diluted serum matrix by surface plasmon resonance and film bulk acoustic resonators

    Auer, S., Nirschl, M., Schreiter, M. & Vikholm-Lundin, I., toukokuuta 2011, julkaisussa : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 400, 5, s. 1387-1396 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  8. Julkaistu

    Polarization resolved photoluminescence in GaAs1−xBix/GaAs quantum wells

    Balanta, M. A. G., Orsi Gordo, V., Carvalho, A. R. H., Puustinen, J., Alghamdi, H. M., Henini, M., Galeti, H. V. A., Guina, M. & Galvão Gobato, Y., helmikuuta 2017, julkaisussa : Journal of Luminescence. 182, s. 49-52 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  9. Julkaistu

    Calcium Directly Regulates Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Headgroup Conformation and Recognition

    Bilkova, E., Pleskot, R., Rissanen, S., Sun, S., Czogalla, A., Cwiklik, L., Róg, T., Vattulainen, I., Cremer, P. S., Jungwirth, P. & Coskun, Ü., 22 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 139, 11, s. 4019-4024 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  10. Julkaistu

    Alzheimer's disease and alpha-synuclein pathology in the olfactory bulbs of infants, children, teens and adults ≤ 40 years in Metropolitan Mexico City. APOE4 carriers at higher risk of suicide accelerate their olfactory bulb pathology

    Calderón-Garcidueñas, L., González-Maciel, A., Reynoso-Robles, R., Kulesza, R. J., Mukherjee, P. S., Torres-Jardón, R., Rönkkö, T. & Doty, R. L., 1 lokakuuta 2018, julkaisussa : Environmental Research. 166, s. 348-362 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  11. Julkaistu

    Identification, prioritization, and evaluation of glycoproteins for aggressive prostate cancer using quantitative glycoproteomics and antibody-based assays on tissue specimens

    Chen, J., Xi, J., Tian, Y., Bova, G. S. & Zhang, H., elokuuta 2013, julkaisussa : Proteomics. 13, 15, s. 2268-2277 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    Molecular-Scale Ligand Effects in Small Gold-Thiolate Nanoclusters

    Chevrier, D. M., Raich, L., Rovira, C., Das, A., Luo, Z., Yao, Q., Chatt, A., Xie, J., Jin, R., Akola, J. & Zhang, P., 14 marraskuuta 2018, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 140, 45, s. 15430-15436 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  13. Efficient production of NV colour centres in nanodiamonds using high-energy electron irradiation

    Dantelle, G., Slablab, A., Rondin, L., Lainé, F., Carrel, F., Bergonzo, P., Perruchas, S., Gacoin, T., Treussart, F. & Roch, J. F., syyskuuta 2010, julkaisussa : Journal of Luminescence. 130, 9, s. 1655-1658 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  14. Structural information content of networks: Graph entropy based on local vertex functionals

    Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., huhtikuuta 2008, julkaisussa : Computational Biology and Chemistry. 32, 2, s. 131-138 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  15. Julkaistu

    Global analysis of human nonreceptor tyrosine kinase specificity using high-density peptide microarrays

    Deng, Y., Alicea-Velázquez, N. L., Bannwarth, L., Lehtonen, S. I., Boggon, T. J., Cheng, H. C., Hytönen, V. P. & Turk, B. E., 3 lokakuuta 2014, julkaisussa : Journal of Proteome Research. 13, 10, s. 4339-4346 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  16. Julkaistu

    Development and characterization of poly(ε-caprolactone) hollow fiber membranes for vascular tissue engineering

    Diban, N., Haimi, S., Bolhuis-Versteeg, L., Teixeira, S., Miettinen, S., Poot, A., Grijpma, D. & Stamatialis, D., 1 heinäkuuta 2013, julkaisussa : Journal of Membrane Science. 438, s. 29-37 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Hollow fibers of poly(lactide-co-glycolide) and poly(ε-caprolactone) blends for vascular tissue engineering applications

    Diban, N., Haimi, S., Bolhuis-Versteeg, L., Teixeira, S., Miettinen, S., Poot, A., Grijpma, D. & Stamatialis, D., 2013, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 9, 5, s. 6450-6458 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  18. Julkaistu

    Weighing trees with lasers: Advances, challenges and opportunities

    Disney, M. I., Boni Vicari, M., Burt, A., Calders, K., Lewis, S. L., Raumonen, P. & Wilkes, P., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170048.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  19. Julkaistu

    Phosphorylation of NFATC1 at PIM1 target sites is essential for its ability to promote prostate cancer cell migration and invasion

    Eerola, S. K., Santio, N. M., Rinne, S., Kouvonen, P., Corthals, G. L., Scaravilli, M., Scala, G., Serra, A., Greco, D., Ruusuvuori, P., Latonen, L., Rainio, E. M., Visakorpi, T. & Koskinen, P. J., 15 marraskuuta 2019, julkaisussa : CELL COMMUNICATION AND SIGNALING. 17, 1, 148.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  20. Responses of methane oxidation to temperature and water content in cover soil of a boreal landfill

    Einola, J. K. M., Kettunen, R. H. & Rintala, J. A., toukokuuta 2007, julkaisussa : Soil Biology and Biochemistry. 39, 5, s. 1156-1164 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  21. Julkaistu

    Report from the 2nd Summer School in Computational Biology organized by the Queen's University of Belfast

    Emmert-Streib, F., Zhang, S. D. & Hamilton, P., 2014, julkaisussa : Genomics Data. 2, s. 37-39 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    Functional and genetic analysis of the colon cancer network.

    Emmert-Streib, F., de Matos Simoes, R., Glazko, G., McDade, S., Haibe-Kains, B., Holzinger, A., Dehmer, M. & Campbell, F., 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, Suppl 6, S6.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    Atomistic Molecular Dynamics Simulations of Mitochondrial DNA Polymerase γ: Novel Mechanisms of Function and Pathogenesis

    Euro, L., Haapanen, O., Róg, T., Vattulainen, I., Suomalainen, A. & Sharma, V., 7 maaliskuuta 2017, julkaisussa : Biochemistry. 56, 9, s. 1227-1238 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  24. Julkaistu

    Azopolymer photopatterning for directional control of angiogenesis

    Fedele, C., De Gregorio, M., Netti, P. A., Cavalli, S. & Attanasio, C., 1 marraskuuta 2017, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 63, s. 317-325 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  25. Julkaistu

    Comparison of different coating techniques on the properties of FucoPol films

    Ferreira, A. R. V., Haapanen, J., Mäkelä, J. M., Bratvold, J. E., Nilsen, O., Tuominen, M., Alves, V. D. & Coelhoso, I. M., 1 lokakuuta 2017, julkaisussa : International Journal of Biological Macromolecules. 103, s. 268-274 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  26. Utilization of Grignard reagents in solid-phase synthesis: A review of the literature

    Franzén, R. G., 28 tammikuuta 2000, julkaisussa : Tetrahedron. 56, 5, s. 685-691 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

  27. Synthesis of chlorinated 5-hydroxy 4-methyl-2(5H)-furanones and mucochloric acid

    Franzén, R. & Kronberg, L., 29 toukokuuta 1995, julkaisussa : Tetrahedron Letters. 36, 22, s. 3905-3908 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    Photo-antimicrobial efficacy of zinc complexes of porphyrin and phthalocyanine activated by inexpensive consumer LED lamp

    George, L., Hiltunen, A., Santala, V. & Efimov, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Journal of Inorganic Biochemistry. 183, s. 94-100 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  29. Unite and conquer: Univariate and multivariate approaches for finding differentially expressed gene sets

    Glazko, G. V. & Emmert-Streib, F., syyskuuta 2009, julkaisussa : Bioinformatics. 25, 18, s. 2348-2354 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Dynamics and energetics of the mammalian phosphatidylinositol transfer protein phospholipid exchange cycle

    Grabon, A., Orłowski, A., Tripathi, A., Vuorio, J., Javanainen, M., Róg, T., Lönnfors, M., McDermott, M. I., Siebert, G., Somerharju, P., Vattulainen, I. & Bankaitis, V. A., 2017, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 292, 35, s. 14438-14455 18 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  31. Julkaistu

    Structure-function analysis indicates that sumoylation modulates DNA-binding activity of STAT1

    Grönholm, J., Vanhatupa, S., Ungureanu, D., Väliaho, J., Laitinen, T., Valjakka, J. & Silvennoinen, O., 2012, julkaisussa : BMC BIOCHEMISTRY. 13, 1, 20.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  32. Julkaistu

    Connection of Collimation, Asymmetric Beaming, and Independent Transmission-Reflection Processes in Concentric-Groove Gratings Supporting Spoof Surface Plasmons

    Habib, M., Serebryannikov, A. E., Caglayan, H., Vandenbosch, G. A. E. & Ozbay, E., kesäkuuta 2019, julkaisussa : Plasmonics. 14, 3, s. 721-729 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    Recurrent thyroid cancers have more peritumoural lymphatic vasculature than nonrecurrent thyroid cancers

    Hakala, T., Sand, J., Kellokumpu-Lehtinen, P. L., Huhtala, H., Leinonen, R. & Kholová, I., 2014, julkaisussa : European Journal of Clinical Investigation. 44, 9, s. 825-832 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  34. Julkaistu

    Molecular mechanism for inhibition of twinfilin by phosphoinositides

    Hakala, M., Kalimeri, M., Enkavi, G., Vattulainen, I. & Lappalainen, P., 1 tammikuuta 2018, julkaisussa : Journal of Biological Chemistry. 293, 13, s. 4818-4829 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  35. Julkaistu

    Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal fluorescence intensity data

    Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 tammikuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 31, 1, s. 69-75 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    Characterizing rate limiting steps in transcription from RNA production times in live cells

    Häkkinen, A. & Ribeiro, A. S., 1 toukokuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 9, s. 1346-1352 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    Analysis of free, mono- and diacetylated polyamines from human urine by LC-MS/MS

    Häkkinen, M. R., Roine, A., Auriola, S., Tuokko, A., Veskimäe, E., Keinänen, T. A., Lehtimäki, T., Oksala, N. & Vepsäläinen, J., 15 joulukuuta 2013, julkaisussa : JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY B: ANALYTICAL TECHNOLOGIES IN THE BIOMEDICAL AND LIFE SCIENCES. 941, s. 81-89 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  38. Julkaistu

    Laser-induced primary and secondary hemostasis dynamics and mechanisms in relation to selective photothermolysis of port wine stains

    Heger, M., Salles, I. I., Bezemer, R., Cloos, M. A., Mordon, S. R., Bégu, S., Deckmyn, H. & Beek, J. F., syyskuuta 2011, julkaisussa : JOURNAL OF DERMATOLOGICAL SCIENCE. 63, 3, s. 139-147 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  39. Julkaistu

    Trans-interaction of nephrin and Neph1/Neph3 induces cell adhesion that associates with decreased tyrosine phosphorylation of nephrin

    Heikkilä, E., Ristola, M., Havana, M., Jones, N., Holthöfer, H. & Lehtonen, S., 1 toukokuuta 2011, julkaisussa : BIOCHEMICAL JOURNAL. 435, 3, s. 619-628 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  40. Julkaistu

    Hexaphyrin as a Potential Theranostic Dye for Photothermal Therapy and 19F Magnetic Resonance Imaging

    Higashino, T., Nakatsuji, H., Fukuda, R., Okamoto, H., Imai, H., Matsuda, T., Tochio, H., Shirakawa, M., Tkachenko, N. V., Hashida, M., Murakami, T. & Imahori, H., 24 maaliskuuta 2017, julkaisussa : ChemBioChem. 18, 10, s. 951-959 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  41. Julkaistu

    Improved water services cooperation through clarification of rules and roles

    Inha, L. M., Katko, T. S. & Rajala, R. P., 19 lokakuuta 2019, julkaisussa : Water (Switzerland). 11, 10, 2172.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    Histone H2B ubiquitin ligases RNF20 and RNF40 in androgen signaling and prostate cancer cell growth

    Jääskeläinen, T., Makkonen, H., Visakorpi, T., Kim, J., Roeder, R. G. & Palvimo, J. J., 5 maaliskuuta 2012, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 350, 1, s. 87-98 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  43. Julkaistu

    An architectural understanding of natural sway frequencies in trees

    Jackson, T., Shenkin, A., Moore, J., Bunce, A., van Emmerik, T., Kane, B., Burcham, D., James, K., Selker, J., Calders, K., Origo, N., Disney, M., Burt, A., Wilkes, P., Raumonen, P., Gonzalez de Tanago Menaca, J., Lau, A., Herold, M., Goodman, R. C., Fourcaud, T. & Malhi, Y., 28 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Journal of the Royal Society. Interface. 16, 155, 1 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    Efficient preparation and analysis of membrane and membrane protein systems

    Javanainen, M. & Martinez-Seara, H., lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2468-2482

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Antioxidant supplementation reduces genomic aberrations in human induced pluripotent stem cells

    Ji, J., Sharma, V., Qi, S., Guarch, M. E., Zhao, P., Luo, Z., Fan, W., Wang, Y., Mbabaali, F., Neculai, D., Esteban, M. A., McPherson, J. D. & Batada, N. N., 14 tammikuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 2, 1, s. 44-51 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    Gene expression analysis upon lncRNA DDSR1 knockdown in human fibroblasts

    Jia, L., Sun, Z., Wu, X., Misteli, T. & Sharma, V., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Genomics Data. 6, s. 277-279 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  47. Julkaistu

    Biophysics of lipid bilayers containing oxidatively modified phospholipids: Insights from fluorescence and EPR experiments and from MD simulations

    Jurkiewicz, P., Olzyńska, A., Cwiklik, L., Conte, E., Jungwirth, P., Megli, F. M. & Hof, M., lokakuuta 2012, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1818, 10, s. 2388-2402 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  48. Julkaistu

    Lipid hydration and mobility: An interplay between fluorescence solvent relaxation experiments and molecular dynamics simulations

    Jurkiewicz, P., Cwiklik, L., Jungwirth, P. & Hof, M., tammikuuta 2012, julkaisussa : Biochimie. 94, 1, s. 26-32 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  49. Julkaistu

    Uncertainty in multispectral lidar signals caused by incidence angle effects

    Kaasalainen, S., Åkerblom, M., Nevalainen, O., Hakala, T. & Kaasalainen, M., 6 huhtikuuta 2018, julkaisussa : Interface Focus. 8, 2, 20170033.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  50. Tunable Plasmonic Silver Nanodomes for Surface-Enhanced Raman Scattering

    Kahraman, M., Ozbay, A., Yuksel, H., Solmaz, R., Demir, B. & Caglayan, H., 5 huhtikuuta 2017, (Hyväksytty/In press) julkaisussa : Plasmonics. s. 1-11 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  51. Julkaistu

    The identity of the transient proton loading site of the proton-pumping mechanism of cytochrome c oxidase

    Kaila, V. R. I., Sharma, V. & Wikström, M., tammikuuta 2011, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1807, 1, s. 80-84 5 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  52. Julkaistu

    Effects of σ factor competition are promoter initiation kinetics dependent

    Kandavalli, V. K., Tran, H. & Ribeiro, A. S., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Gene Regulatory Mechanisms. 1859, 10, s. 1281-1288 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  53. Julkaistu

    Surface science analysis and surface modification methods for biomaterials research

    Kanninen, L., Jokinen, N., Lahtonen, K., Jussila, P., Ali-Löytty, H., Hirsimäki, M., Leppiniemi, J., Hytönen, V., Kulomaa, M., Ahola, N., Paakinaho, K., Kellomäki, M. & Valden, M., 1 tammikuuta 2010, julkaisussa : European Cells and Materials. 20, SUPPL. 3, s. 133 1 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  54. Julkaistu

    Comparative analysis of tissue reconstruction algorithms for 3D histology

    Kartasalo, K., Latonen, L., Vihinen, J., Visakorpi, T., Nykter, M. & Ruusuvuori, P., 1 syyskuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 17, s. 3013-3021 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  55. Julkaistu

    Soft hydrazone crosslinked hyaluronan- and alginate-based hydrogels as 3D supportive matrices for human pluripotent stem cell-derived neuronal cells

    Karvinen, J., Joki, T., Ylä-Outinen, L., Koivisto, J. T., Narkilahti, S. & Kellomäki, M., 1 maaliskuuta 2018, julkaisussa : Reactive and Functional Polymers. 124, s. 29-39 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  56. Julkaistu

    Distribution and dynamics of quinones in the lipid bilayer mimicking the inner membrane of mitochondria

    Kaurola, P., Sharma, V., Vonk, A., Vattulainen, I. & Róg, T., 1 syyskuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 9, s. 2116-2122 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  57. Julkaistu

    Bioimpedance Sensor Array for Long-Term Monitoring of Wound Healing from Beneath the Primary Dressings and Controlled Formation of H2O2 Using Low-Intensity Direct Current

    Kekonen, A., Bergelin, M., Johansson, M., Kumar Joon, N., Bobacka, J. & Viik, J., 31 toukokuuta 2019, julkaisussa : Sensors. 19, 11

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  58. Julkaistu

    Functionalized lipids and surfactants for specific applications

    Kepczynski, M. & Róg, T., lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 10, s. 2362-2379

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  59. Julkaistu

    Alpha radiation-induced luminescence by am-241 in aqueous nitric acid solution

    Kerst, T., Malmbeck, R., lal Banik, N. L. & Toivonen, J., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 7, 1602.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  60. Julkaistu

    Effect of N/S ratio on anoxic thiosulfate oxidation in a fluidized bed reactor: Experimental and artificial neural network model analysis

    Khanongnuch, R., Di Capua, F., Lakaniemi, A-M., Rene, E. R. & Lens, P. N. L., 2018, julkaisussa : Process Biochemistry. 68, s. 171-181

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  61. Julkaistu

    AROS has a context-dependent effect on SIRT1

    Kokkola, T., Suuronen, T., Molnár, F., Määttä, J., Salminen, A., Jarho, E. M. & Lahtela-Kakkonen, M., 2 toukokuuta 2014, julkaisussa : FEBS Letters. 588, 9, s. 1523-1528 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  62. Julkaistu

    Light-fuelled transport of large dendrimers and proteins

    Koskela, J. E., Liljeström, V., Lim, J., Simanek, E. E., Ras, R. H. A., Priimagi, A. & Kostiainen, M. A., 14 toukokuuta 2014, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 136, 19, s. 6850-6853 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  63. Julkaistu

    Electrophoretic mobilities of neutral analytes and electroosmotic flow markers in aqueous solutions of Hofmeister salts

    Křížek, T., Kubíčková, A., Hladílková, J., Coufal, P., Heyda, J. & Jungwirth, P., 2014, julkaisussa : ELECTROPHORESIS. 35, 5, s. 617-624 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  64. Julkaistu

    Identifying involvement of Lys251/Asp252 pair in electron transfer and associated proton transfer at the quinone reduction site of Rhodobacter capsulatus cytochrome bc1

    Kuleta, P., Sarewicz, M., Postila, P., Róg, T. & Osyczka, A., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1857, 10, s. 1661-1668 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  65. Julkaistu

    Cholesterol under oxidative stress: How lipid membranes sense oxidation as cholesterol is being replaced by oxysterols

    Kulig, W., Olzyńska, A., Jurkiewicz, P., Kantola, A. M., Komulainen, S., Manna, M., Pourmousa, M., Vazdar, M., Cwiklik, L., Rog, T., Khelashvili, G., Harries, D., Telkki, V. V., Hof, M., Vattulainen, I. & Jungwirth, P., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Free Radical Biology and Medicine. 84, s. 30-41 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  66. Julkaistu

    Experimental determination and computational interpretation of biophysical properties of lipid bilayers enriched by cholesteryl hemisuccinate

    Kulig, W., Jurkiewicz, P., Olzyńska, A., Tynkkynen, J., Javanainen, M., Manna, M., Rog, T., Hof, M., Vattulainen, I. & Jungwirth, P., 2015, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1848, 2, s. 422-432 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  67. Julkaistu

    Cholesterol oxidation products and their biological importance

    Kulig, W., Cwiklik, L., Jurkiewicz, P., Rog, T. & Vattulainen, I., 2016, julkaisussa : Chemistry and Physics of Lipids. 199, s. 144-160 17 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  68. Julkaistu

    Synthesis, Structural Characterization, Hirshfeld Surface and Antioxidant Activity Analysis of a Novel Organic Cation Antimonate Complex

    Lahbib, I., Valkonen, A., Rzaigui, M. & Smirani, W., 2017, julkaisussa : Journal of Cluster Science. 28, 4, s. 2239–2252 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  69. Julkaistu

    Efficient preparation of shuffled DNA libraries through recombination (Gateway) cloning

    Lehtonen, S. I., Taskinen, B., Ojala, E., Kukkurainen, S., Rahikainen, R., Riihimäki, T. A., Laitinen, O. H., Kulomaa, M. S. & Hytönen, V. P., 2015, julkaisussa : Protein Engineering Design and Selection. 28, 1, s. 23-28 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  70. Julkaistu

    The highly dynamic oligomeric structure of bradavidin II is unique among avidin proteins

    Leppiniemi, J., Meir, A., Kahkonen, N., Kukkurainen, S., Maatta, J. A., Ojanen, M., Janis, J., Kulomaa, M. S., Livnah, O. & Hytonen, V. P., heinäkuuta 2013, julkaisussa : PROTEIN SCIENCE. 22, 7, s. 980-994 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  71. Julkaistu

    An efficient auxin-inducible degron system with low basal degradation in human cells

    Li, S., Prasanna, X., Salo, V. T., Vattulainen, I. & Ikonen, E., 1 syyskuuta 2019, julkaisussa : Nature Methods. 16, 9, s. 866-869 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  72. Julkaistu

    Iterative unsupervised domain adaptation for generalized cell detection from brightfield z-stacks

    Liimatainen, K., Kananen, L., Latonen, L. & Ruusuvuori, P., 15 helmikuuta 2019, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 20, 1, 80.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  73. Modeling of anaerobic degradation of solid slaughterhouse waste: Inhibition effects of long-chain fatty acids or ammonia

    Lokshina, L. Y., Vavilin, V. A., Salminen, E. & Rintala, J., huhtikuuta 2003, julkaisussa : Applied Biochemistry and Biotechnology. 109, 1-3, s. 15-32 18 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  74. Julkaistu

    Long-chain GM1 gangliosides alter transmembrane domain registration through interdigitation

    Manna, M., Javanainen, M., Martinez-Seara Monne, H., Gabius, H-J., Rog, T. & Vattulainen, I., 1 toukokuuta 2017, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1859, 5, s. 870-878 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  75. Julkaistu

    Understanding the Role of Lipids in Signaling Through Atomistic and Multiscale Simulations of Cell Membranes

    Manna, M., Nieminen, T. & Vattulainen, I., 6 toukokuuta 2019, julkaisussa : ANNUAL REVIEW OF BIOPHYSICS. 48, s. 421-439 19 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  76. Julkaistu

    Shiga-like toxin binds with high avidity to multivalent O-linked blood group P1 determinants on mucin-type fusion proteins

    Maria Cherian, R., Gaunitz, S., Nilsson, A., Liu, J., Karlsson, N. G. & Holgersson, J., tammikuuta 2014, julkaisussa : GLYCOBIOLOGY. 24, 1, s. 26-38 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  77. Julkaistu

    SCIP: a single-cell image processor toolbox

    Martins, L., Neeli-Venkata, R., Oliveira, S. M. D., Häkkinen, A., Ribeiro, A. S. & Fonseca, J. M., 15 joulukuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 24, s. 4318-4320 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  78. Julkaistu
  79. Julkaistu

    Non-Brownian diffusion in lipid membranes: Experiments and simulations

    Metzler, R., Jeon, J. H. & Cherstvy, A. G., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 215, s. 173–185

    Tutkimustuotos: Katsausartikkelivertaisarvioitu

  80. Julkaistu

    Small-molecule induction promotes corneal epithelial cell differentiation from human induced pluripotent stem cells

    Mikhailova, A., Ilmarinen, T., Uusitalo, H. & Skottman, H., 11 helmikuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 2, 2, s. 219-231 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  81. Julkaistu

    Hierarchical Self-Assembly of Halogen-Bonded Block Copolymer Complexes into Upright Cylindrical Domains

    Milani, R., Houbenov, N., Fernandez-Palacio, F., Cavallo, G., Luzio, A., Haataja, J., Giancane, G., Saccone, M., Priimägi, A., Metrangolo, P. & Ikkala, O., 9 maaliskuuta 2017, julkaisussa : CheM. 2, 3, s. 417-426 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  82. Julkaistu

    How to minimize dye-induced perturbations while studying biomembrane structure and dynamics: PEG linkers as a rational alternative

    Mobarak, E., Javanainen, M., Kulig, W., Honigmann, A., Sezgin, E., Aho, N., Eggeling, C., Rog, T. & Vattulainen, I., marraskuuta 2018, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 1860, 11, s. 2436-2445

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  83. Julkaistu

    Calcium Assists Dopamine Release by Preventing Aggregation on the Inner Leaflet of Presynaptic Vesicles

    Mokkila, S., Postila, P. A., Rissanen, S., Juhola, H., Vattulainen, I. & Róg, T., 21 kesäkuuta 2017, julkaisussa : ACS Chemical Neuroscience. 8, 6, s. 1242-1250 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  84. Julkaistu

    Structural Measures for Network Biology Using QuACN

    Mueller, L. A. J., Kugler, K. G., Graber, A., Emmert-Streib, F. & Dehmer, M., 24 joulukuuta 2011, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 12, 1, 492.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  85. Julkaistu

    Kinetics of bioconjugate nanoparticle label binding in a sandwich-type immunoassay

    Näreoja, T., Ebner, A., Gruber, H. J., Taskinen, B., Kienberger, F., Hänninen, P. E., Hytönen, V. P., Hinterdorfer, P. & Härmä, H., 2014, julkaisussa : Analytical and Bioanalytical Chemistry. 406, 2, s. 493-503 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  86. Julkaistu

    Apolipoprotein A-I mimetic peptide 4F blocks sphingomyelinase-induced LDL aggregation

    Nguyen, S. D., Javanainen, M., Rissanen, S., Zhao, H., Huusko, J., Kivelä, A. M., Ylä-Herttuala, S., Navab, M., Fogelman, A. M., Vattulainen, I., Kovanen, P. T. & Öörni, K., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Journal of Lipid Research. 56, 6, s. 1206-1221 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  87. Julkaistu

    Dynamics of a True Moving Bed separation process: Linear model identification and advanced process control

    Nogueira, I. B. R., Ribeiro, A. M., Martins, M. A. F., Rodrigues, A. E., Koivisto, H. & Loureiro, J. M., 30 kesäkuuta 2017, julkaisussa : Journal of Chromatography A. 1504

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  88. Julkaistu

    Bioactive glass ions as strong enhancers of osteogenic differentiation in human adipose stem cells

    Ojansivu, M., Vanhatupa, S., Björkvik, L., Häkkänen, H., Kellomäki, M., Autio, R., Ihalainen, J. A., Hupa, L. & Miettinen, S., 15 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Acta Biomaterialia. 21, s. 190-203 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  89. Julkaistu

    Bioactive glass induced osteogenic differentiation of human adipose stem cells is dependent on cell attachment mechanism and mitogen-activated protein kinases

    Ojansivu, M., Wang, X., Hyväri, L., Kellomäki, M., Hupa, L., Vanhatupa, S. & Miettinen, S., 2018, julkaisussa : European Cells and Materials. 35, s. 53-71 19 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  90. Julkaistu

    Natural thermal adaptation increases heat shock protein levels and decreases oxidative stress

    Oksala, N. K. J., Ekmekçi, F. G., Özsoy, E., Kirankaya, Ş., Kokkola, T., Emecen, G., Lappalainen, J., Kaarniranta, K. & Atalay, M., 1 tammikuuta 2014, julkaisussa : REDOX BIOLOGY. 3, s. 25-28 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  91. Julkaistu

    Using shRNA experiments to validate gene regulatory networks

    Olsen, C., Fleming, K., Prendergast, N., Rubio, R., Emmert-Streib, F., Bontempi, G., Quackenbush, J. & Haibe-Kains, B., 1 kesäkuuta 2015, julkaisussa : Genomics Data. 4, s. 123-126 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  92. Julkaistu

    Positioning information privacy in intelligent transportation systems: An overview and future perspective

    Ometov, A., Bezzateev, S., Davydov, V., Shchesniak, A., Masek, P., Lohan, E. S. & Koucheryavy, Y., 1 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Sensors. 19, 7, 1603.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  93. Julkaistu

    Physiologically-relevant levels of sphingomyelin, but not GM1, induces a β-sheet-rich structure in the amyloid-β(1-42) monomer

    Owen, M. C., Kulig, W., Poojari, C., Rog, T. & Strodel, B., syyskuuta 2018, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 1860, 9, s. 1709-1720

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  94. Julkaistu

    Acquiring respiration rate from photoplethysmographic signal by recursive bayesian tracking of intrinsic modes in time-frequency spectra

    Pirhonen, M., Peltokangas, M. & Vehkaoja, A., 1 kesäkuuta 2018, julkaisussa : Sensors. 18, 6, 1693.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  95. Julkaistu

    Characterisation and in vitro and in vivo evaluation of supercritical-CO2-foamed β-TCP/PLCL composites for bone applications

    Pitkänen, S., Paakinaho, K., Pihlman, H., Ahola, N., Hannula, M., Asikainen, S., Manninen, M., Morelius, M., Keränen, P., Hyttinen, J., Kellomäki, M., Laitinen-Vapaavuori, O. & Miettinen, S., 5 elokuuta 2019, julkaisussa : European cells & materials. 38, s. 35-50 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  96. Julkaistu

    How the amyloid-β peptide and membranes affect each other: An extensive simulation study

    Poojari, C., Kukol, A. & Strodel, B., helmikuuta 2013, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1828, 2, s. 327-339 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  97. Julkaistu

    Behavior of the DPH fluorescence probe in membranes perturbed by drugs

    Poojari, C., Wilkosz, N., Lira, R. B., Dimova, R., Jurkiewicz, P., Petka, R., Kepczynski, M. & Róg, T., 1 syyskuuta 2019, julkaisussa : Chemistry and Physics of Lipids. 223, 104784.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  98. Julkaistu

    Multi-stable dynamics of the non-adiabatic repressilator

    Potapov, I., Zhurov, B. & Volkov, E., 6 maaliskuuta 2015, julkaisussa : Journal of the Royal Society. Interface. 12, 104, 20141315.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  99. Julkaistu

    Role of charged lipids in membrane structures: Insight given by simulations

    Pöyry, S. & Vattulainen, I., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. s. 2322–2333 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  100. Julkaistu

    Gene Sets Net Correlations Analysis (GSNCA): A multivariate differential coexpression test for gene sets

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 1 helmikuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 3, s. 360-368 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  101. Julkaistu

    Comparative evaluation of gene set analysis approaches for RNA-Seq data

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 5 joulukuuta 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, 1, 397.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  102. Julkaistu

    Gene set analysis for self-contained tests: Complex null and specific alternative hypotheses

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., joulukuuta 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 23, s. 3073-3080 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  103. Julkaistu

    GSAR: Bioconductor package for Gene Set analysis in R

    Rahmatallah, Y., Zybailov, B., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 24 tammikuuta 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, 1, 61.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  104. Julkaistu

    Blood microRNA profile associates with the levels of serum lipids and metabolites associated with glucose metabolism and insulin resistance and pinpoints pathways underlying metabolic syndrome. The cardiovascular risk in Young Finns Study.

    Raitoharju, E., Seppälä, I., Oksala, N., Lyytikäinen, L. P., Raitakari, O., Viikari, J., Ala-Korpela, M., Soininen, P., Kangas, A. J., Waldenberger, M., Klopp, N., Illig, T., Leiviskä, J., Loo, B. M., Hutri-Kähönen, N., Kähönen, M., Laaksonen, R. & Lehtimäki, T., 25 kesäkuuta 2014, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 391, 1-2, s. 41-49 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  105. Julkaistu

    Tuning the Plasmonic Extinction Resonances of Hexagonal Arrays of Ag Nanoparticles

    Ravi, A., Luthra, A., Teixeira, F. L., Berger, P. R. & Coe, J. V., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Plasmonics. 10, 6, s. 1505-1512 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  106. Julkaistu

    Robust statistical approaches for RSS-based floor detection in indoor localization

    Razavi, A., Valkama, M. & Lohan, E. S., 1 kesäkuuta 2016, julkaisussa : Sensors. 16, 6, 793.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  107. Julkaistu

    Molecular mechanisms of ion-specific effects on proteins

    Rembert, K. B., Paterová, J., Heyda, J., Hilty, C., Jungwirth, P. & Cremer, P. S., 20 kesäkuuta 2012, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 134, 24, s. 10039-10046 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  108. Julkaistu

    M2M Communication Assessment in Energy-Harvesting and Wake-Up Radio Assisted Scenarios Using Practical Components

    Rinne, J., Keskinen, J., Berger, P. R., Lupo, D. & Valkama, M., 16 marraskuuta 2018, julkaisussa : Sensors (Basel, Switzerland). 18, 11

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  109. Julkaistu

    A robust AMMI model for the analysis of genotype-by-environment data

    Rodrigues, P. C., Monteiro, A. & Lourenço, V. M., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 1, s. 58-66 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  110. Julkaistu

    The biophysical properties of ethanolamine plasmalogens revealed by atomistic molecular dynamics simulations

    Rog, T. & Koivuniemi, A., 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Biomembranes. 1858, 1, s. 97-103 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  111. Julkaistu

    Gloriosa superba Mediated Synthesis of Platinum and Palladium Nanoparticles for Induction of Apoptosis in Breast Cancer

    Rokade, S. S., Joshi, K. A., Mahajan, K., Patil, S., Tomar, G., Dubal, D. S., Parihar, V. S., Kitture, R., Bellare, J. R. & Ghosh, S., 2018, julkaisussa : Bioinorganic Chemistry and Applications. 2018, 4924186.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  112. Julkaistu

    Cancer incidence and mortality in patients treated either with RAI or thyroidectomy for hyperthyroidism

    Ryödi, E., Metso, S., Jaatinen, P., Huhtala, H., Saaristo, R., Välimäki, M. & Auvinen, A., 1 lokakuuta 2015, julkaisussa : Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 100, 10, s. 3710-3717 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  113. Julkaistu

    Controlled Orientations of Neighboring Tetracene Units by Mixed Self-Assembled Monolayers on Gold Nanoclusters for High-Yield and Long-Lived Triplet Excited States through Singlet Fission

    Saegusa, T., Sakai, H., Nagashima, H., Kobori, Y., Tkachenko, N. V. & Hasobe, T., 18 syyskuuta 2019, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 141, 37, s. 14720-14727 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  114. Julkaistu

    Human adipose tissue extract induces angiogenesis and adipogenesis in vitro

    Sarkanen, J. R., Kaila, V., Mannerström, B., Räty, S., Kuokkanen, H., Miettinen, S. & Ylikomi, T., 1 tammikuuta 2012, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 18, 1-2, s. 17-25 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  115. Julkaistu

    Oxidation half-reaction of aqueous nucleosides and nucleotides via photoelectron spectroscopy augmented by ab initio calculations

    Schroeder, C. A., Pluharová, E., Seidel, R., Schroeder, W. P., Faubel, M., Slavíçek, P., Winter, B., Jungwirth, P. & Bradforth, S. E., 14 tammikuuta 2015, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 137, 1, s. 201-209 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  116. Julkaistu

    Inhibition of Aβ Amyloid Growth and Toxicity by Silybins: The Crucial Role of Stereochemistry

    Sciacca, M. F. M., Romanucci, V., Zarrelli, A., Monaco, I., Lolicato, F., Spinella, N., Galati, C., Grasso, G., D'Urso, L., Romeo, M., Diomede, L., Salmona, M., Bongiorno, C., Di Fabio, G., La Rosa, C. & Milardi, D., 16 elokuuta 2017, julkaisussa : ACS Chemical Neuroscience. 8, 8, s. 1767-1778 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  117. Julkaistu

    Visualizing functional motions of membrane transporters with molecular dynamics simulations

    Shaikh, S. A., Li, J., Enkavi, G., Wen, P. C., Huang, Z. & Tajkhorshid, E., 29 tammikuuta 2013, julkaisussa : Biochemistry. 52, 4, s. 569-587 19 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  118. Julkaistu

    Role of subunit III and its lipids in the molecular mechanism of cytochrome c oxidase

    Sharma, V., Ala-Vannesluoma, P., Vattulainen, I., Wikström, M. & Róg, T., 17 huhtikuuta 2015, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1847, 8, s. 690-697 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  119. Julkaistu

    The role of the K-channel and the active-site tyrosine in the catalytic mechanism of cytochrome c oxidase

    Sharma, V. & Wikström, M., elokuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1857, 8, s. 1111-1115

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  120. Julkaistu

    A BRCA1-interacting lncRNA regulates homologous recombination

    Sharma, V., Khurana, S., Kubben, N., Abdelmohsen, K., Oberdoerffer, P., Gorospe, M. & Misteli, T., 1 marraskuuta 2015, julkaisussa : EMBO REPORTS. 16, 11, s. 1520-1534 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  121. Julkaistu

    Non-coding RNAs in DNA damage and repair

    Sharma, V. & Misteli, T., 27 kesäkuuta 2013, julkaisussa : FEBS Letters. 587, 13, s. 1832-1839 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  122. Julkaistu

    Neuroprotective effect of RO-20-1724-a phosphodiesterase4 inhibitor against intracerebroventricular streptozotocin induced cognitive deficit and oxidative stress in rats

    Sharma, V., Bala, A., Deshmukh, R., Bedi, K. L. & Sharma, P. L., huhtikuuta 2012, julkaisussa : PHARMACOLOGY BIOCHEMISTRY AND BEHAVIOR. 101, 2, s. 239-245 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  123. Julkaistu

    Stabilization of the peroxy intermediate in the oxygen splitting reaction of cytochrome cbb3

    Sharma, V., Wikström, M. & Kaila, V. R. I., heinäkuuta 2011, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Bioenergetics. 1807, 7, s. 813-818 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  124. Julkaistu

    Surface Modified Biodegradable Electrospun Membranes as a Carrier for Human Embryonic Stem Cell-Derived Retinal Pigment Epithelial Cells

    Sorkio, A., Porter, P. J., Juuti-Uusitalo, K., Meenan, B. J., Skottman, H. & Burke, G. A., 1 syyskuuta 2015, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 21, 17-18, s. 2301-2314 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  125. Julkaistu

    Structure and barrier properties of human embryonic stem cell-derived retinal pigment epithelial cells are affected by extracellular matrix protein coating

    Sorkio, A., Hongisto, H., Kaarniranta, K., Uusitalo, H., Juuti-Uusitalo, K. & Skottman, H., 1 helmikuuta 2014, julkaisussa : Tissue Engineering Part A. 20, 3-4, s. 622-634 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  126. Julkaistu

    Calcium transients closely reflect prolonged action potentials in iPSC models of inherited cardiac arrhythmia

    Spencer, C. I., Baba, S., Nakamura, K., Hua, E. A., Sears, M. A. F., Fu, C. C., Zhang, J., Balijepalli, S., Tomoda, K., Hayashi, Y., Lizarraga, P., Wojciak, J., Scheinman, M. M., Aalto-Setälä, K., Makielski, J. C., January, C. T., Healy, K. E., Kamp, T. J., Yamanaka, S. & Conklin, B. R., 12 elokuuta 2014, julkaisussa : Stem Cell Reports. 3, 2, s. 269-281 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  127. Julkaistu

    Regulation of asymmetries in the kinetics and protein numbers of bacterial gene expression

    Startceva, S., Kandavalli, V. K., Visa, A. & Ribeiro, A. S., 1 helmikuuta 2019, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms. 1862, 2, s. 119-128 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  128. Julkaistu

    Mechanisms of acceleration and retardation of water dynamics by ions

    Stirnemann, G., Wernersson, E., Jungwirth, P. & Laage, D., 14 elokuuta 2013, julkaisussa : Journal of the American Chemical Society. 135, 32, s. 11824-11831 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  129. Julkaistu

    SamExploreR: Exploring reproducibility and robustness of RNA-seq results based on SAM files

    Stupnikov, A., Tripathi, S., De Matos Simoes, R., McArt, D., Salto-Tellez, M., Glazko, G., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 1 marraskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 21, s. 3345-3347 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  130. Julkaistu

    Connection between absorption properties and conformational changes in Deinococcus radiodurans phytochrome

    Takala, H., Lehtivuori, H., Hammarén, H., Hytönen, V. P. & Ihalainen, J. A., 18 marraskuuta 2014, julkaisussa : Biochemistry. 53, 45, s. 7076-7085 10 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  131. Julkaistu

    Endocrine prevention and treatment of prostate cancer

    Tammela, T. L. J., 5 syyskuuta 2012, julkaisussa : Molecular and Cellular Endocrinology. 360, 1-2, s. 59-67 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  132. Julkaistu

    Morphological Differentiation Towards Neuronal Phenotype of SH-SY5Y Neuroblastoma Cells by Estradiol, Retinoic Acid and Cholesterol

    Teppola, H., Sarkanen, J. R., Jalonen, T. O. & Linne, M-L., 2016, julkaisussa : Neurochemical Research. 41, 4, s. 731-747

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  133. Julkaistu

    Modification of olivomycin A at the side chain of the aglycon yields the derivative with perspective antitumor characteristics

    Tevyashova, A. N., Shtil, A. A., Olsufyeva, E. N., Luzikov, Y. N., Reznikova, M. I., Dezhenkova, L. G., Isakova, E. B., Bukhman, V. M., Durandin, N. A., Vinogradov, A. M., Kuzmin, V. A. & Preobrazhenskaya, M. N., 15 joulukuuta 2011, julkaisussa : BIOORGANIC AND MEDICINAL CHEMISTRY. 19, 24, s. 7387-7393 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  134. Julkaistu

    A Bioscreening Technique for Ultraviolet Irradiation Protective Natural Substances

    Tienaho, J., Poikulainen, E., Sarjala, T., Muilu-Mäkelä, R., Santala, V. & Karp, M., 2018, julkaisussa : Photochemistry and Photobiology. 94, 6, s. 1273-1280

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  135. Julkaistu

    Osteogenic medium is superior to growth factors in differentiation of human adipose stem cells towards boneforming cells in 3D culture

    Tirkkonen, L., Haimi, S., Huttunen, S., Wolff, J., Pirhonen, E., Sándor, G. K. & Miettinen, S., 2012, julkaisussa : European Cells and Materials. 25, s. 144-158 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  136. Preparation of 5-substituted 2-carboxyindoles on solid support

    Tois, J., Franzén, R., Aitio, O., Huikko, K. & Taskinen, J., 1 huhtikuuta 2000, julkaisussa : Tetrahedron Letters. 41, 14, s. 2443-2446 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  137. Julkaistu

    Statistical evaluation of barkhausen noise testing (BNT) for ground samples

    Tomkowski, R., Sorsa, A., Santa-Aho, S., Lundin, P. & Vippola, M., 1 marraskuuta 2019, julkaisussa : Sensors (Switzerland). 19, 21, 4716.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  138. Julkaistu

    Resonance assignments of the 56 kDa chimeric avidin in the biotin-bound and free forms

    Tossavainen, H., Helppolainen, S. H., Määttä, J. A. E., Pihlajamaa, T., Hytönen, V. P., Kulomaa, M. S. & Permi, P., huhtikuuta 2013, julkaisussa : BIOMOLECULAR NMR ASSIGNMENTS. 7, 1, s. 35-38 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  139. Julkaistu