TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto

TUTCRIS

Julkaisut

  1. 2017
  2. Julkaistu

    sgnesR: An R package for simulating gene expression data from an underlying real gene network structure considering delay parameters

    Tripathi, S., Lloyd-Price, J., Ribeiro, A., Yli-Harja, O., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 4 heinäkuuta 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, 1, 325.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    GSAR: Bioconductor package for Gene Set analysis in R

    Rahmatallah, Y., Zybailov, B., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 24 tammikuuta 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, 1, 61.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  4. 2016
  5. Julkaistu

    Effects of σ factor competition are promoter initiation kinetics dependent

    Kandavalli, V. K., Tran, H. & Ribeiro, A. S., 1 lokakuuta 2016, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta: Gene Regulatory Mechanisms. 1859, 10, s. 1281-1288 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  6. 2015
  7. Julkaistu

    Biogenesis of Nascent High Density Lipoprotein Particles

    Koivuniemi, A. & Vattulainen, I., 9 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Structure. 23, 7, s. 1153-1154 2 Sivumäärä, 3212.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  8. Julkaistu

    Urothelial cancer gene regulatory networks inferred from large-scale RNAseq, Bead and Oligo gene expression data

    Matos Simoes, R. D., Dalleau, S., Williamson, K. E. & Emmert-Streib, F., 14 toukokuuta 2015, julkaisussa : BMC Systems Biology. 9, 21.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  9. Julkaistu

    A Bayesian approach for suppression of limited angular sampling artifacts in single particle 3D reconstruction

    Moriya, T., Acar, E., Cheng, R. H. & Ruotsalainen, U., 3 huhtikuuta 2015, julkaisussa : Journal of Structural Biology. 191, 3, s. 318–331 14 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  10. 2014
  11. Julkaistu

    Comparative evaluation of gene set analysis approaches for RNA-Seq data

    Rahmatallah, Y., Emmert-Streib, F. & Glazko, G., 5 joulukuuta 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, 1, 397.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    AROS has a context-dependent effect on SIRT1

    Kokkola, T., Suuronen, T., Molnár, F., Määttä, J., Salminen, A., Jarho, E. M. & Lahtela-Kakkonen, M., 2 toukokuuta 2014, julkaisussa : FEBS Letters. 588, 9, s. 1523-1528 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  13. Julkaistu

    Investigating the binding behaviour of two avidin-based testosterone binders using molecular recognition force spectroscopy

    Rangl, M., Leitner, M., Riihimäki, T., Lehtonen, S., Hytönen, V. P., Gruber, H. J., Kulomaa, M., Hinterdorfer, P. & Ebner, A., helmikuuta 2014, julkaisussa : Journal of Molecular Recognition. 27, 2, s. 92-97 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  14. Julkaistu

    Functional and genetic analysis of the colon cancer network.

    Emmert-Streib, F., de Matos Simoes, R., Glazko, G., McDade, S., Haibe-Kains, B., Holzinger, A., Dehmer, M. & Campbell, F., 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, Suppl 6, S6.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu