TUTCRIS - Tampereen teknillinen yliopisto

TUTCRIS

Julkaisut

  1. 2020
  2. Julkaistu

    Utilizing Gelatinized Starchy Waste from Rice Noodle Factory as Substrate for L(+)-Lactic Acid Production by Amylolytic Lactic Acid Bacterium Enterococcus faecium K-1

    Unban, K., Khanongnuch, R., Kanpiengjai, A., Shetty, K. & Khanongnuch, C., toukokuuta 2020, julkaisussa : Applied Biochemistry and Biotechnology.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  3. Julkaistu

    Differential mobility spectrometry classification of bacteria

    Hokkinen, L., Kesti, A., Lepomäki, J., Anttalainen, O., Kontunen, A., Karjalainen, M., Aittoniemi, J., Vuento, R., Lehtimäki, T., Oksala, N. & Roine, A., 1 maaliskuuta 2020, julkaisussa : FUTURE MICROBIOLOGY. 15, 4, s. 233-240 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  4. Formation and use of biogenic jarosite carrier for high-rate iron oxidising biofilms

    Ahoranta, S., Hulkkonen, H., Salminen, T., Kuula, P., Puhakka, J. A. & Lakaniemi, A. M., 2020, julkaisussa : Research in Microbiology. 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  5. Julkaistu

    Reduced expiratory variability index (EVI) is associated with controller medication withdrawal and symptoms in wheezy children aged 1-5 years

    Seppä, V-P., Paassilta, M., Kivistö, J., Hult, A., Viik, J., Gracia-Tabuenca, J. & Karjalainen, J., 2020, julkaisussa : PEDIATRIC ALLERGY AND IMMUNOLOGY. 31, 5, s. 489-495 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  6. Julkaistu

    Spatial variations in bacterial and archaeal abundance and community composition in boreal forest pine mycorrhizospheres

    Rinta-Kanto, J. M. & Timonen, S., 2020, julkaisussa : EUROPEAN JOURNAL OF SOIL BIOLOGY. 97, 7 Sivumäärä, 103168.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  7. 2019
  8. Julkaistu

    Estimating RNA numbers in single cells by RNA fluorescent tagging and flow cytometry

    Bahrudeen, M. N. M., Chauhan, V., Palma, C. S. D., Oliveira, S. M. D., Kandavalli, V. K. & Ribeiro, A. S., 22 lokakuuta 2019, julkaisussa : Journal of Microbiological Methods. 166, 105745.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  9. Julkaistu

    Similar temperature sensitivity of soil mineral-associated organic carbon regardless of age

    Karhu, K., Hilasvuori, E., Järvenpää, M., Arppe, L., Christensen, B. T., Fritze, H., Kulmala, L., Oinonen, M., Pitkänen, J. M., Vanhala, P., Heinonsalo, J. & Liski, J., 1 syyskuuta 2019, julkaisussa : Soil Biology and Biochemistry. 136, 107527.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  10. Julkaistu

    Temporal variation in indoor transfer of dirt-associated environmental bacteria in agricultural and urban areas

    Hui, N., Parajuli, A., Puhakka, R., Grönroos, M., Roslund, M. I., Vari, H. K., Selonen, V. A. O., Yan, G., Siter, N., Nurminen, N., Oikarinen, S., Laitinen, O., Rajaniemi, J., Hyöty, H. & Sinkkonen, A., 7 elokuuta 2019, julkaisussa : Environment International. 132, November 2019, 9 Sivumäärä, 105069.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  11. Julkaistu

    Alkane and wax ester production from lignin-related aromatic compounds

    Salmela, M., Lehtinen, T., Efimova, E., Santala, S. & Santala, V., 1 elokuuta 2019, julkaisussa : Biotechnology and Bioengineering. 116, 8, s. 1934-1945 12 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  12. Julkaistu

    Synthetic metabolic pathway for the production of 1-alkenes from lignin-derived molecules

    Luo, J., Lehtinen, T., Efimova, E., Santala, V. & Santala, S., 11 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Microbial Cell Factories. 18, 1, 13 Sivumäärä, 48.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  13. Julkaistu

    Vertical stratification of bacteria and archaea in sediments of a small boreal humic lake

    Rissanen, A. J., Peura, S., Mpamah, P. A., Taipale, S., Tiirola, M., Biasi, C., Mäki, A. & Nykänen, H., 1 maaliskuuta 2019, julkaisussa : FEMS Microbiology Letters. 366, 5

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  14. Mechanical impact stimulation platform tailored for high-resolution light microscopy

    Halonen, H. T., Hyttinen, J. A. K. & Ihalainen, T. O., 2019, julkaisussa : HEALTH AND TECHNOLOGY.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  15. 2018
  16. Julkaistu

    Production of alkanes from CO2 by engineered bacteria

    Lehtinen, T., Virtanen, H., Santala, S. & Santala, V., 21 elokuuta 2018, julkaisussa : Biotechnology for Biofuels. 11, 228.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  17. Julkaistu

    Metabolic pairing of aerobic and anaerobic production in a one-pot batch cultivation

    Salmela, M., Lehtinen, T., Efimova, E., Santala, S. & Mangayil, R., 3 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Biotechnology for Biofuels. 11, 1, 187.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  18. Julkaistu

    Improved fatty aldehyde and wax ester production by overexpression of fatty acyl-CoA reductases

    Lehtinen, T., Efimova, E., Santala, S. & Santala, V., 8 helmikuuta 2018, julkaisussa : Microbial Cell Factories. 17, 1, 19.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  19. Julkaistu

    Archaea are prominent members of the prokaryotic communities colonizing common forest mushrooms

    Rinta-Kanto, J. M., Pehkonen, K., Sinkko, H., Tamminen, M. V. & Timonen, S., 2018, julkaisussa : Canadian Journal of Microbiology. 64, 10, s. 716-726 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  20. Julkaistu

    Crawling-induced floor dust resuspension affects the microbiota of the infant breathing zone

    Hyytiäinen, H. K., Jayaprakash, B., Kirjavainen, P. V., Saari, S. E., Holopainen, R., Keskinen, J., Hämeri, K., Hyvärinen, A., Boor, B. E. & Täubel, M., 2018, julkaisussa : Microbiome. 6, 1, 25.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  21. Julkaistu

    Effect of N/S ratio on anoxic thiosulfate oxidation in a fluidized bed reactor: Experimental and artificial neural network model analysis

    Khanongnuch, R., Di Capua, F., Lakaniemi, A-M., Rene, E. R. & Lens, P. N. L., 2018, julkaisussa : Process Biochemistry. 68, s. 171-181

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  22. Julkaistu

    Microbiological, chemical and sensory spoilage analysis of raw Atlantic cod (Gadus morhua) stored under modified atmospheres

    Kuuliala, L., Al Hage, Y., Ioannidis, A. G., Sader, M., Kerckhof, F. M., Vanderroost, M., Boon, N., De Baets, B., De Meulenaer, B., Ragaert, P. & Devlieghere, F., 2018, julkaisussa : Food Microbiology. 70, s. 232-244 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  23. Julkaistu

    Resistant ammonia-oxidizing archaea endure, but adapting ammonia-oxidizing bacteria thrive in boreal lake sediments receiving nutrient-rich effluents

    Aalto, S. L., Saarenheimo, J., Mikkonen, A., Rissanen, A. J. & Tiirola, M., 2018, julkaisussa : Environmental Microbiology. 20, 10, s. 3616-3628 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  24. 2017
  25. Julkaistu

    Understanding selenium biogeochemistry in engineered ecosystems: Transformation and analytical methods

    Jain, R., Van Hullebusch, E. D., Lenz, M. & Farges, F., 2 syyskuuta 2017, Bioremediation of Selenium Contaminated Wastewater. Springer International Publishing, s. 33-56 24 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  26. Julkaistu

    Twin-layer biosensor for real-time monitoring of alkane metabolism

    Lehtinen, T., Santala, V. & Santala, S., 1 maaliskuuta 2017, julkaisussa : FEMS Microbiology Letters. 364, 6, fnx053.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  27. Julkaistu

    The use of mathematical modeling for the development of a low cost fuzzy gain schedule neutralization control system

    Sislian, R., da Silva, F. V., Gedraite, R., Jokinen, H. & Rajan, D. K., 4 helmikuuta 2017, Transactions on Engineering Technologies: World Congress on Engineering and Computer Science 2015. Springer Singapore, s. 525-539 15 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  28. Julkaistu

    Echovirus 1 internalization negatively regulates epidermal growth factor receptor downregulation

    Huttunen, M., Turkki, P., Mäki, A., Paavolainen, L., Ruusuvuori, P. & Marjomäki, V., 2017, julkaisussa : Cellular Microbiology. 19, 3, e12671.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  29. Julkaistu

    Fate of metallic engineered nanomaterials in constructed wetlands: prospection and future research perspectives

    Auvinen, H., Gagnon, V., Rousseau, D. P. L. & du Laing, G., 2017, julkaisussa : Reviews in Environmental Science and Bio-Technology. 16, 2, s. 207–222 16 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  30. Julkaistu

    Transcription Initiation Controls Skewness of the Distribution of Intervals Between RNA Productions

    Kandavalli, V., Startceva, S. & Sanches Ribeiro, A., 2017, 31st European Simulation and Modelling Conference: ESM'2017. Paulo J.S, G. (toim.). Portugal: EUROSIS, s. 397-403

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  31. 2016
  32. Julkaistu

    Bioluminescence-based system for rapid detection of natural transformation

    Santala, V., Karp, M. & Santala, S., 1 heinäkuuta 2016, julkaisussa : FEMS Microbiology Letters. 363, 13, fnw125.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  33. Julkaistu

    Robustness of the process of nucleoid exclusion of protein aggregates in Escherichia coli

    Neeli-Venkata, R., Martikainen, A., Gupta, A., Goncalves, N., Fonseca, J. & Ribeiro, A. S., 2016, julkaisussa : Journal of Bacteriology. 198, 6, s. 898-906 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  34. 2015
  35. Julkaistu

    Metabolic engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for removal of Clostridium butyricum growth inhibitors produced from lignocellulosic hydrolysates

    Kannisto, M. S., Mangayil, R. K., Shrivastava-Bhattacharya, A., Pletschke, B. I., Karp, M. T. & Santala, V. P., 1 joulukuuta 2015, julkaisussa : Biotechnology for Biofuels. 8, 1, 198.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  36. Julkaistu

    Elevated levels of soluble CD26 and CD30 in multiple sclerosis

    Basnyat, P., Natarajan, R., Vistbakka, J., Lehtikangas, M., Airas, L., Matinlauri, I., Elovaara, I. & Hagman, S., 1 marraskuuta 2015, julkaisussa : Clinical and Experimental Neuroimmunology. 6, 4, s. 419-425 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  37. Julkaistu

    Changes in global gene expression of Vibrio parahaemolyticus induced by cold- and heat-stress

    Urmersbach, S., Aho, T., Alter, T., Hassan, S. S., Autio, R. & Huehn, S., 23 lokakuuta 2015, julkaisussa : BMC Microbiology. 15, 1, 229.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  38. Julkaistu

    Gene expression profiles of Vibrio parahaemolyticus in the early stationary phase

    Meng, L., Alter, T., Aho, T. & Huehn, S., 1 syyskuuta 2015, julkaisussa : Letters in Applied Microbiology. 61, 3, s. 231-237 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  39. Julkaistu

    Non-structural proteins P17 and P33 are involved in the assembly of the internal membrane-containing virus PRD1

    Karttunen, J., Mäntynen, S., Ihalainen, T. O., Bamford, J. K. H. & Oksanen, H. M., 1 elokuuta 2015, julkaisussa : VIROLOGY. 482, s. 225-233 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  40. Julkaistu

    Bioluminescent whole-cell reporter gene assays as screening tools in the identification of antimicrobial natural product extracts

    Nybond, S., Karp, M., Yrjönen, T. & Tammela, P., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Journal of Microbiological Methods. 114, s. 54-56 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  41. Julkaistu

    Podocyte apoptosis is prevented by blocking the Toll-like receptor pathway

    Saurus, P., Kuusela, S., Lehtonen, E., Hyvönen, M. E., Ristola, M., Fogarty, C. L., Tienari, J., Lassenius, M. I., Forsblom, C., Lehto, M., Saleem, M. A., Groop, P. H., Holthöfer, H. & Lehtonen, S., 1 toukokuuta 2015, julkaisussa : CELL DEATH AND DISEASE. 6, 5, e1752.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  42. Julkaistu

    O-glycan repertoires on a mucin-type reporter protein expressed in CHO cell pools transiently transfected with O-glycan core enzyme cDNAs

    Liu, J., Jin, C., Cherian, R. M., Karlsson, N. G. & Holgersson, J., 1 huhtikuuta 2015, julkaisussa : Journal of Biotechnology. 199, s. 77-89 13 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  43. Julkaistu

    Analysis of apoptosis-related genes in patients with clinically isolated syndrome and their association with conversion to multiple sclerosis

    Hagman, S., Kolasa, M., Basnyat, P., Helminen, M., Kähönen, M., Dastidar, P., Lehtimäki, T. & Elovaara, I., 15 maaliskuuta 2015, julkaisussa : JOURNAL OF NEUROIMMUNOLOGY. 280, s. 43-48 6 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  44. Julkaistu

    Human parechovirus as a minor cause of acute otitis media in children

    Sillanpää, S., Oikarinen, S., Sipilä, M., Seppälä, E., Nurminen, N., Rautiainen, M., Laranne, J. & Hyöty, H., 1 tammikuuta 2015, julkaisussa : JOURNAL OF CLINICAL VIROLOGY. 62, s. 106-109 4 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  45. Julkaistu

    Adaptive autoregressive model for reduction of noise in SPECT

    Takalo, R., Hytti, H., Ihalainen, H. & Sohlberg, A., 2015, julkaisussa : Computational and Mathematical Methods in Medicine. 2015, 494691.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  46. Julkaistu

    Method with high-throughput screening potential for antioxidative substances using Escherichia coli biosensor katG'::lux

    Tienaho, J., Sarjala, T., Franzén, R. & Karp, M., 2015, julkaisussa : Journal of Microbiological Methods. 118, s. 78-80 3 Sivumäärä, 4723.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  47. Julkaistu

    Reorganization of nuclear pore complexes and the lamina in late-stage parvovirus infection

    Mäntylä, E., Niskanen, E. A., Ihalainen, T. O. & Vihinen-Ranta, M., 2015, julkaisussa : Journal of Virology. 89, 22, s. 11706-11710 5 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  48. Julkaistu

    The minor capsid protein VP11 of thermophilic bacteriophage P23-77 facilitates virus assembly by using lipid-protein interactions

    Pawlowski, A., Moilanen, A. M., Rissanen, I. A., Määttä, J. A. E., Hytönen, V. P., Ihalainen, J. A. & Bamford, J. K. H., 2015, julkaisussa : Journal of Virology. 89, 15, s. 7593-7603 11 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  49. 2014
  50. Julkaistu

    Beta carbonic anhydrases: Novel targets for pesticides and anti-parasitic agents in agriculture and livestock husbandry

    Zolfaghari Emameh, R., Barker, H., Hytönen, V. P., Tolvanen, M. E. E. & Parkkila, S., 29 elokuuta 2014, julkaisussa : Parasites and Vectors. 7, 1, 403.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  51. Julkaistu

    Coxsackievirus B3 VLPs purified by ion exchange chromatography elicit strong immune responses in mice

    Koho, T., Koivunen, M. R. L., Oikarinen, S., Kummola, L., Mäkinen, S., Mähönen, A. J., Sioofy-Khojine, A., Marjomäki, V., Kazmertsuk, A., Junttila, I., Kulomaa, M. S., Hyöty, H., Hytönen, V. P. & Laitinen, O. H., huhtikuuta 2014, julkaisussa : ANTIVIRAL RESEARCH. 104, 1, s. 93-101 9 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  52. Julkaistu

    Assessment of metabolic flux distribution in the thermophilic hydrogen producer Caloramator celer as affected by external pH and hydrogen partial pressure

    Ciranna, A., Pawar, S. S., Santala, V., Karp, M. & van Niel, E. W. J., 28 maaliskuuta 2014, julkaisussa : Microbial Cell Factories. 13, 1, 48.

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  53. Julkaistu

    Chlorpyrifos-induced changes in the antioxidants and fatty acid compositions of Chroococcus turgidus NTMS12

    Kumar, M. S., Praveenkumar, R., Jeon, B. H. & Thajuddin, N., 2014, julkaisussa : Letters in Applied Microbiology. s. 535-541

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  54. Julkaistu

    Metabolic engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for improved growth on gluconate and glucose

    Kannisto, M., Aho, T., Karp, M. & Santala, V., 2014, julkaisussa : Applied and Environmental Microbiology. 80, 22, s. 7021-7027 7 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  55. Julkaistu

    Murein lytic enzyme TgaA of Bifidobacterium bifidum MIMBb75 modulates dendritic cell maturation through its cysteine- and histidine-dependent amidohydrolase/peptidase (CHAP) amidase domain

    Guglielmetti, S., Zanoni, I., Balzaretti, S., Miriani, M., Taverniti, V., de Noni, I., Presti, I., Stuknyte, M., Scarafoni, A., Arioli, S., Iametti, S., Bonomi, F., Mora, D., Karp, M. & Granucci, F., 2014, julkaisussa : Applied and Environmental Microbiology. 80, 17, s. 5170-5177 8 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  56. Julkaistu

    Origins and functional consequences of somatic mitochondrial DNA mutations in human cancer

    Ju, Y. S. E., Alexandrov, L. B., Gerstung, M., Martincorena, I., Nik-Zainal, S., Ramakrishna, M., Davies, H. R., Papaemmanuil, E., Gundem, G., Shlien, A., Bolli, N., Behjati, S., Tarpey, P. S., Nangalia, J., Massie, C. E., Butler, A. P., Teague, J. W., Vassiliou, G. S., Green, A. R., Du, M. Q., Unnikrishnan, A., Pimanda, J. E., Teh, B. T. E., Munshi, N., Greaves, M., Vyas, P., El-Naggar, A. K., Santarius, T., Collins, V. P., Grundy, R., Taylor, J. A., Hayes, D. N., Malkin, D., Foster, C. S., Warren, A. Y., Whitaker, H. C., Brewer, D., Eeles, R., Cooper, C., Neal, D., Visakorpi, T., Isaacs, W. B., Bova, G. S., Flanagan, A. M., Futreal, P. A., Lynch, A. G., Chinnery, P. F., McDermott, U., Stratton, M. R. & Campbell, P. J., 2014, julkaisussa : eLIFE. 3

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

  57. Julkaistu

    Positive association between biotin and the abundance of root-feeding nematodes

    Sinkkonen, A., Laitinen, O. H., Leppiniemi, J., Vauramo, S., Hytönen, V. P. & Setälä, H., 2014, julkaisussa : Soil Biology and Biochemistry. 73, s. 93-95 3 Sivumäärä

    Tutkimustuotosvertaisarvioitu

Edellinen 1 2 Seuraava